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单核苷酸多态性(SNP)分析

单核苷酸多态性(SNP)实验

单核苷酸多态性(SNP)实验 SNP (Single Nucleotide Polymorphism)即单核苷酸多态性,是由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态性(Polymorphism)。据估计,在人类基因组中,大约每千个碱基中有一个SNP,无论是比较于度多态性(RFLP)分析还是微卫星标记(STR),都要广泛得多。 实验方法原理: SNP (Single Nucleotide Polymorphism)即单核苷酸多态性,是由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态性(Polymorphism)。据估计,在人类基因组中,大约每千个碱基中有一个SNP,无论是比较于限制性片段长度多态性(RFLP)分析还是微卫星标记(STR),都要广泛得多。SNP是我们考察遗传变异的最小单位,据估计,人类的所有群体中大约存在一千万个SNP位点。一般认为,相邻的SNPs倾向于一起遗传给后代。于是,我们把位于染色体上某一区域的一组相关联的SNP等位位点称作单体型(haplotype)。大多数染色体区域只有少数几个常见的单体型(每个具有至少5%的频率),它们代表了一个群体中人与人之间的大部分多态性。一个染色体区域可以有很多SNP位点,但是我们一旦掌握了这个区域的单体型,就可以只使用少数几个标签SNPs(tagSNP)来进行基因分型,获取大部分的遗传多态模式。 实验材料: 组织样品 试剂、试剂盒: 液氮、PBS、GA缓冲液、GB缓冲液、蛋白酶K、无水乙醇、蛋白液、漂洗液等 仪器、耗材: 离心管、离心机、废液收集管、吸附柱、水浴锅、分光光度计、低温冰箱等 实验步骤:

一、DNA抽提 1. 取新鲜肌肉组织约100 mg,PBS漂洗干净,置于1.5 ml离心管中,加入液氮,迅速磨碎。 2. 加200 μl 缓冲液GA,震荡至彻底悬浮。加入20 μl 蛋白酶K(20 mg/ml)溶液,混匀。 3. 加220 μl 缓冲液GB,充分混匀,37℃消化过夜,溶液变清亮。加220 μl 无水乙醇,充分混匀,此时可能会出现絮状沉淀。 4. 将上述一步所得溶液和絮状沉淀都加入一个吸附柱CB 中,(吸附柱放入废液收集管中)12 000 rpm 离心30 秒,弃掉废液。 5. 加入500 μl 去蛋白液GD(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),12 000 rpm 离心30 秒,弃掉废液。 6. 加入700 μl 漂洗液GW(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),12 000 rpm离心30 秒,弃掉废液。加入500 μl 漂洗液GW,12 000 rpm 离心30 秒,弃掉废液。将吸附柱CB 放回废液收集管中,12 000 rpm 离心2 分钟,尽量除去漂洗液。 7. 将吸附柱CB 转入一个干净的离心管中,加入100 μl 洗脱缓冲液(洗脱缓冲液应在60-70℃水浴预热),混匀,室温放置15 分钟,12 000 rpm 离心30 秒。洗脱第二次,将洗脱缓冲液50 μl 加入吸附柱中,室温放置15 分钟,12 000 rpm 离心30 秒。 8. 采用Beckman DU 640 spectrophotometer 检测提取到的基因组DNA 浓度,在OD260 处有显著吸收峰。同时检测纯度,OD260/280 的值应为为1.7-1.9。 9. 从原液中取出相应体积DNA 溶液,稀释致50 ng/ul,原液置于-70℃保存,稀释液置于-20℃保存。 二、PCR扩增目的片段

JAVA复习题 有答案

复习题 一、选择题 1、下列Java标志符中合法的是:() A H3_sum B -name C student# D 9_Hello123 2.Java源文件和编译后的文件扩展名分别为() A. .class和.java B. .java和.class C. .class和.class D. .java和.java 3.对于同一消息,对象可以产生不同的行为,这称为类的什么特性?()A)继承性B)封装性C)多态性D)抽象性 4、用来引入包语句的关键词是:() A)import B)abstract C)package D)extends 5.对于小程序,当离开包含Applet的主页后又再返回时将调用()方法。A)start( ) B)init( ) C)destroy( ) D)stop( ) 6.下列对Java中的继承描述错误的说法是() A.子类只能有一个父类 B.子类可作为另一个子类的父类 C.子类可以访问父类的私有属性 D.子类继承父类的方法访问权限保持不变 7.哪种循环在条件表达式被计算之前至少执行循环体语句一次?( ) A)do-while循环B)for循环C)while循环D)以上都不是 8.定义数组String[] a={"ab","abc","abcd","abcde"},数组中a[1]指的是()。 A.ab B.abc C.abcde D.数组越界 9.如果希望组件从左往右,从上到下自动布局界面,应使用哪种布局?()A)没有B)BorderLayout C)FlowLayout D)GridLayout 10.下列说法正确的是() A. 最终类在特殊情况下可以有子类 B. 抽象类只能有一个子类 C. 多态可以通过方法重写和方法重载实现 D. 抽象类不可以声明成员变量和成员方法,只能声明抽象方法 11.下列语句中访问类的方法正确的是:() A)https://www.sodocs.net/doc/6615341283.html, B)https://www.sodocs.net/doc/6615341283.html,( ) C)book->name D)book_name 12.下列选项中哪个是类Pen的构造方法() A)public void Pen() {} B)public static Pen() {} C)public Pen() {} D)public static void Pen() {} 13.单击菜单触发的事件是?() A. ActionEvent B.ItemEvent C.MouseEvent D. KeyEvent 14.关于try/catch/finally结构的异常捕获和处理,说法错误的是()A)try部分是必须的B)catch部分也是必须的 C)可以有多个catch部分D)finally部分也是必须的

一个内含子长度多态性标记与栽培稻F_1花粉育性基因座连锁

分子植物育种,2006年,第4卷,第3期,第323-328页 MolecularPlantBreeding,2006,Vol.4,No.3,323-328 研究报告 ResearchReport 一个内含子长度多态性标记与栽培稻F 1 花粉育性基因座连锁 吴海滨1,2朱汝财1李迪1赵德刚2*白羊年1* 1海南省热带农业资源开发利用研究所,三亚,572025;2贵州省农业生物工程重点实验室,贵州大学,贵阳,550025 *共同通讯作者,degangzhao@yahoo.com;baiyangnian@hitar.org 摘要本研究利用两份栽培稻(OryzasativaL.)种质HITAR005和IRGC20509杂交建立了含有500个单 株的F 2群体,采用内含子长度多态性标记对F 2 群体中的117株进行了标记基因型分析。研究发现一个内含 子长度多态性标记,RI01594,其标记座位上与父本(IRGC20509)相同基因型的纯合植株完全消失,且母本纯合基因型植株与杂合基因型植株的比率符合1:1(!2 C =0.90,"2C<X20.05),表现出一种明显的偏分离现象。分析该分子标记所在的目的序列,RI01954标记所位于的基因含有3个内含子是一个功能未知的转录因子,粳稻Nipponbare(日本晴)在该基因的第3个内含子序列与籼稻9311的序列相比有24个碱基的缺失。进一步分析RI01954标记的PCR产物表明,发现消失的纯合植株基因型偏向于粳稻Nipponbare(日本晴)。结合供试 的F 2群体的花粉育性检测结果,初步表明RI01594标记与栽培稻F 1 花粉育性基因座连锁,与F 1 花粉不育基 因座连锁的遗传距离小于0.5cM,推测与RI01954标记连锁的栽培稻的F 1 花粉不育性基因座是一个新的杂种不育位点。 关键词栽培稻,内含子长度多态性,F1花粉育性,偏分离 AnILPMarkerCloseLinkingwiththeTentativeNovelF1PollenSterileLocusinCultivatedRice WuHaibin1,2ZhuRucai1LiDi1ZhaoDegang2*BaiYangnian1* 1HainanInstituteofTropicalAgriculturalResources,Sanya,572025;2GuizhouKeyLaboratoryofAgriculturalBioengineering,GuizhouUniversity,Guiyang,550025 *Co-correspondingauthor,degangzhao@yahoo.com;baiyangnian@hitar.org AbstractTheF2populationcontaining500individualswasdevelopedusingtwocultivatedricegermplasms(O-ryzasativaL.),HITAR005asfemaleparentfromHITARandIRGC20509asmaleparentfromIRRI,andtheILP(intronlengthpolymorphism)markerswereemployedtogenotypethe117individualsoftheF2population.RI01954,anILPmarkermappedinthe3rdchromosome,wasfoundthatitshomozygouslocusformaleparentwerecompletelyabsentinthe117individualsandtheratioofRI01954locusbetweenhomozygousoffemaleparentandheterozygouswas1:1(#2C=0.90,$2C<X20.05),whichshowedobviouslydistortedsegregationintheF2population.ThesequenceconferringRI01954wasdeeplyanalyzedthatitisunknownfunctionaltranscriptfactorcontainingthreeintrons.Thereis24bpdeletionofthe3rdintroninJaponicaNipponbarecomparingwithIndica9311.AnalysisofPCRproductsamplifiedbyprimersofRI01954showedthatthebandsformaleparentdisappearedwereidenticaltoJaponicaNipponbare.CombiningtheresultofpollenfertilityanalysisintheF2population,itwasprimarycon-cludedthatRI01954markercloselylinkedtothephenotypeoftheF1pollensterilitylocusandthegeneticdistancesbetweenthemwasestimatedlessthan0.5cM.AndalsoitsuggestedthatthelocuslinkedwithRI01954wasanov-elF1pollensterilelocusinthecultivatedrice. KeywordsCultivatedrice(OryzasativaL.),Intronlengthpolymorphism(ILP),Hybridsterility,Distortedsegregation

c练习题带答案

c练习题带答案集团标准化工作小组 #Q8QGGQT-GX8G08Q8-

一、选择题 1.C++语言属于( C )。 A)自然语言 B)机器语言 C)面向对象语言 D)汇编语言2.下面选项中不属于面向对象程序设计特征的是(C) 。 A)继承性 B)多态性 C)相似性 D)封装性 3.可用作C++语言用户标识符的一组标识符是( B )。 A) void define +WORD B) a3_b3 _123 YN C) for -abc Case D) 2a DO sizeof 4.假定一个二维数组的定义语句为“int a[3][4]={{3,4},{2,8,6}};”,则元素 a[2][1]的值为(A)。 A) 0 B) 4 C) 8 D) 6 5.下列情况中,哪一种情况不会调用拷贝构造函数( B ) A)用派生类的对象去初始化基类对象时 B)将类的一个对象赋值给该类的另一个对象时 C)函数的形参是类的对象,调用函数进行形参和实参结合时 D)函数的返回值是类的对象,函数执行返回调用者时 6.以下哪一关键字可用于重载函数的区分(C) A)extern B)static C)const D)virtual 7.下列有关数组的叙述中,正确的是( B ) A)C++中数组的存储方式为列优先存储 B)数组名可以作为实参赋值给指针类型的形参 C)数组下标索引从1开始,至数组长度n结束 D)数组指针的语法形式为:类型名 *数组名[下标表达式]; 8.下列有关继承和派生的叙述中,正确的是( C ) A)派生类不能访问通过私有继承的基类的保护成员 B)多继承的虚基类不能够实例化 C)如果基类没有默认构造函数,派生类就应当声明带形参的构造函数 D)基类的析构函数和虚函数都不能够被继承,需要在派生类中重新实现 9.实现运行时多态的机制是( A ) A)虚函数B)重载函数C)静态函数D)模版函数 10.若有下面的函数调用: fun(a+b, 3, max(n-1, b)); 其中实参的个数是( A) A)3 B)4 C)5 D)6 11.下列关于this指针的说法正确的是( B)

动物DNA限制性片段长度多态性分析

动物DNA限制性片段长度多态性分析 9.1 动物DNA限制性片段长度多态性基本概况 DNA限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,简称RFLP)是进行动物物种分化和群体遗传多样性研究的一项重要经典技术,而线粒体DNA和核糖体DNA 则是动物RFLP研究中最为常用的两种遗传标记(Nei,Tajima 1981)。 动物线粒体DNA是一种共价闭环的环状双链DNA,具有严格的母系遗传方式,每个细胞中有 1 000~10 000个拷贝,容易从组织中分离、提纯(Brown等 1979;Avise等 1983;Lansman 1983)。提取线粒体DNA的实验技术比较简单,且重复性好(王文,施立明 1993)。mtDNA的基因结构比较简单、稳定,分子量小(15.7~19.5kb),处于限制性内切酶分析范围,因此易于进行结果分析(Brown 1979)。在脊椎动物中,mtDNA无组织特异性,即个体内的线粒体DNA具有高度的均一性(Avise等 1983),这就有利于限制性内切酶分析。更为重要的是,mtDNA进化速度快,是单拷贝核DNA的5~10倍,因而是进行近缘种间和种内群体间分化关系研究的良好遗传标记(Brown等 1979,1983;Wilson 1985;Avise 1986;Harrison 1989)。生物多样性研究中基本保护单元----进化显著性单元(evolutionary significant units,简称ESUs)(Ryder 1989)的确定,就极大地依赖于不同动物群体线粒体DNA单倍型的系统发育关系(Moritz 1994)。 ESUs的定义为:在mtDNA单倍型上互为单系群(monophyly)、在核基因座位上等位基因频率有显著差别的群体即称为ESUs。强调mtDNA的互为单系群,不仅因为它在进化上的重要性,而且因为理论上和模拟实验均说明隔离群体在一定时间后能达到这种状态。生物ESUs已被证明是一个在保护中很有用的概念标准。例如,在我们最近的一项研究中,发现广西的白头叶猴(Trachypithecus francoisi leucocephalus)和黑叶猴(T.f.francoisi)在mtDNA序列上严格地互为单系群(Wang等 1996),这明确地说明了白头叶猴是保护中应受到重视的一个ESU S。 核糖体DNA(ribosomal DNA,简称rDNA)是一类中等重复的核内DNA序列,每个重复单元(repetype)由非转录间隔区(non-transcribed spacer,简称 NTS)、转录间隔区(internal transcribed spacer,简称 ITS)和3种RNA(18S RNA,5.8S RNA,28S RNA)基因编码区 组成。这3个区域的DNA序列有不同的进化速率,编码区非常保守,适合于构建生命系统树的基部分枝;转录间隔区则中度保守,适合于推断50×106年前左右的事件;非转录间隔区则进化速度较快,适合于种间和已有隔离的群体间关系的研究(Appels, Honeycutt 1986; Hillis,Davis 1986;Suzuki等 1990)。此外,rDNA以一种协同的方式进化,在个体内和群体内有着较好的均质性(homoplasmy)。因此,有人认为,少量个体的抽样就能有效地代表 本章作者:王 文,陈永久,兰宏

基因多态性分析

. 人基因多态性分析 一、实验目的 1. 了解基因多态性在阐明人体对疾病、毒物的易感性与耐受性、疾病临床表现的多样性以及对药物治疗的反应性中的重要作用。 2. 了解分析基因多态性的基本原理和研究方法。 二、实验原理 基因多态性(gene polymorphism)是指在一个生物群体中,同时存在两种及以上的变异型或基因型或等位基因,也称为遗传多态性(genetic polymorphism)。人类基因多态性对于阐明人体对疾病的易感性、毒物的耐受性、药物代谢差异及遗传性疾病的分子机制有重大意义;与致病基因连锁的多态性位点可作为遗传病的诊断标记,并为分离克隆致病基因提供依据;病因未知的疾病与候选基因多态性的相关性分析,可用于辅助筛选致病易感基因。 聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction—Restriction Fragment Length Polymorphism,PCR-RFLP)分析是一种常用的DNA分子标记。原理是通过PCR扩增获得目的基因。若目的基因存在等位变异(多态性),且变异正好发生在某种限制性内切酶识别位点上,使酶切位点增加或者消失,则酶切结果就会产生大小不同的片段,即片段长度多态性,再利用琼脂糖凝胶电泳分离,可呈现出多态性电泳图谱。若将患者与正常的多态性图谱比较,可确定是否变异。应用PCR-RFLP,可检测某一致病基因已知的点突变,进行直接基因诊断,也可以此为遗传标记进行连锁分析进行间接基因诊断。 三、器材与试剂 1. 器材 ⑴离心机。 ⑵DNA扩增仪。 ⑶电泳仪。 ⑷水平电泳槽。 ⑸紫外检测仪。 ⑹移液器。 2. 试剂 . . ⑴口腔拭子DNA抽提试剂盒。 ⑵琼脂糖。 ⑶1×TAE电泳缓冲液:980ml蒸馏水中加入50×TAE母液20ml。 ⑷50×TAE母液:Tris 121g,0.5M EDTA(pH8.0)50ml,冰醋酸28.55ml,定容至500ml。

北大青鸟推荐:Java精选笔试题(含答案解析)

北大青鸟推荐:Java精选笔试题(含答案解析)如果你是计算机专业出生,但是还没有找到工作的话,你就得补补技术了,一些关于面试、笔试的题要多刷一刷。有可能你知道答案,但是由于语言组织能力有所欠缺,所以面试官的印象不是很好,下面分享一些Java精选的鄙视题,希望对面试这者有帮助。 1,volatile关键字是否能保证线程安全?() 答案:否 volatile关键字用在多线程同步中,可保证读取的可见性,JVM只是保证从主内存加载到线程工作内存的值是最新的读取值,而非cache中。但多个线程对volatile的写操作,无法保证线程安全。 假如线程1,线程2 在进行read,load 操作中,发现主内存中count的值都是5,那么都会加载这个最新的值,在线程1对count进行修改之后,会write到主内存中,主内存中的count变量就会变为6;线程2由于已经进行read,load操作,在进行运算之后,也会更新主内存count的变量值为6;导致两个线程及时volatile关键字修改之后,还是会存在并发的情况。 2,下面哪个流类属于面向字符的输入流( ) A、BufferedWriter B、FileInputStream C、ObjectInputStream D、InputStreamReader 答案:D Java的IO操作中有面向字节(Byte)和面向字符(Character)两种方式。

面向字节的操作为以8位为单位对二进制的数据进行操作,对数据不进行转换,这些类都是InputStream和OutputStream的子类。 面向字符的操作为以字符为单位对数据进行操作,在读的时候将二进制数据转为字符,在写的时候将字符转为二进制数据,这些类都是Reader和Writer的子类。 3,Java能不能不通过构造函数创建对象() A、能 B、不能 答案:A Java创建对象的几种方式: (1) 用new语句创建对象,这是最常见的创建对象的方法。 (2) 运用反射手段,调用https://www.sodocs.net/doc/6615341283.html,ng.Class或者https://www.sodocs.net/doc/6615341283.html,ng.reflect.Constructor类的newInstance()实例方法。 (3) 调用对象的clone()方法。 (4) 运用反序列化手段,调用java.io.ObjectInputStream对象的readObject()方法。 (1)和(2)都会明确的显式的调用构造函数;(3)是在内存上对已有对象的影印,所以不会调用构造函数;(4)是从文件中还原类的对象,也不会调用构造函数。 4,下列哪个叙述是正确的() A.子类继承父类的构造方法。 B.abstract类的子类必须是非abstract类。 C.子类继承的方法只能操作子类继承和隐藏的成员变量。 D.子类重写或新增的方法也能直接操作被子类隐藏的成员变量。 答案:C 子类是不继承父类的构造方法的,而是必须调用其父类的构造方法。

特发性卵巢早衰患者AMH,AMHR—Ⅱ基因多态性分析

特发性卵巢早衰患者AMH,AMHR—Ⅱ基因多态性分析 目的探讨特发性卵巢早衰与AMH,AMHR-Ⅱ的基因多态性。方法选择2015年6月~2017年3月在我院诊断的特发性卵巢早衰患者50例为POF组。另选择健康体检者100例为对照组。PCR方法测定两组AMH,AMHR-Ⅱ基因多态性。结果POF组AMH基因突变位点基因型及等位基因频率与对照组比较差异无统计学意义(P>0.05)。POF组AMHR-Ⅱ c.49+10T>G 基因位点GG基因型比例显著高于对照组,G等位基因频率显著高于对照组,c.622-2C>T基因位点TT基因型比例显著高于对照组,T等位基因频率显著高于对照组,c.622-24C>A 基因位点AA基因型比例显著高于对照组,A等位基因频率显著高于对照组,c.1038G>T基因位点TT基因型比例显著高于对照组,T等位基因频率显著高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论AMHR-Ⅱ基因多态性可能是特发性卵巢早衰的重要的发病机制。 [Abstract] Objective To discuss polymorphism analysis of AMH,AMHR-Ⅱgene in patients with idiopathic premature ovarian failure. Methods 50 cases with idiopathic premature ovarian failure from Jun 2015 to Mar 2017 were selected as POF group. And 100 cases for physical examination were selected as control group. Polymorphismof AMH,AMHR- II gene of two groups was detected by PCR. Results Genotype and allele frequency of AMH gene mutation sites of POF group showed no significant difference with the control group(P>0.05). The proportion of GG genotype in AMHR- loci II,c.49+10T>G of POF group was higher than that of the control group,and G allele frequency was higher than that of the control group;The proportion ofTTgenotype inc.622-2C>Tof POF group was higher than that of the control group,and Tallele frequency was higher than that of the control group;The proportion ofAAgenotype inc.622-24C>Aof POF group was higher than that of the control group,and Aallele frequency was higher than that of the control group;The proportion ofTTgenotype inc.1038G>Tof POF group was higher than that of the control group,and Tallele frequency was higher than that of the control group;The difference showed significant difference(P<0.05). Conclusion Polymorphism of AMHR-Ⅱgene may be an important pathogenesis of idiopathic premature ovarian failure. [Key words] Idiopathic premature ovarian failure;AMH;AMHR-Ⅱ;Gene polymorphism 特發性卵巢早衰是指無精确原因的,自身免疫抗体正常的,染色体核型正常的女性在40周岁之前出现的性器官萎缩、持续性闭经,伴有卵泡雌激素、黄体生成素升高,雌激素下降的一种综合征[1-2]。我国卵巢早衰的发病率相对较高,而其中有80%为特发性卵巢早衰,患者主要表现为月经紊乱,血管 舒缩功能不稳定,容易出汗、潮热、情绪波动等。目前特发性卵巢早衰的发病机制还不十分明确,可能与遗传、自身免疫因素、感染、代谢异常、环境等有

Java接口多态实验(修正版带实验答案)

实验9:接口、多态性 一、实验目的与要求 1、多态性的概念、技术基础 2、构造方法的调用顺序 3、总结接口的应用 二、内容概要 1、多态性概念 是指不同类型的对象可以响应相同的消息。从相同的基类派生出来的多个类型可被当作同一种类型对待,可对这些不同的类型进行同样的处理,由于多态性,这些不同派生类对象响应同一方法时的行为是有所差别的。 例如 ●Cat行为是吃鱼,Dog行为是吃骨头 ●所有的Object类的对象都响应toString()方法 2、多态性的技术基础 ●向上塑型技术:一个父类的引用变量可以指向不同的子类对象 ●动态绑定技术:运行时根据父类引用变量所指对象的实际类型执行相应的子类方法,从 而实现多态性 3、多态性的好处 应用程序不必为每一个派生类(子类)编写功能调用,只要对基类(特别是抽象基类)或接口处理即可,“以不变应万变”,大大提高程序的可复用性。 例如:下面代码Waiter类中的callPersonEat方法参数是Person 类型,所以利用向上塑性技术可以给其传参数China和USA类型。而该方法体p.eat(); ,利用动态邦定技术运行时候根据p引用的具体对象调用创建对象时所属类的eat方法 interface Person{ public void eat(); } class China implements Person{ public void eat(){ System.out.println("chinese use chopsticks"); } } class USA implements Person{ public void eat(){ System.out.println("usa use forks"); } } class Waiter{ static void callPersonEat(Person p){ p.eat(); //实例方法调用,动态绑定 } public static void main(String a[]){

扩增片段长度多态性

扩增片段长度多态性(AFLP,Amplified restriction fragment polymorphism),是1993年荷兰科学家Zabeau和Vos发展起来的一种检测DNA多态性的分子标记技术。文章主要讲述该技术的原理、流程及特点,并从以下三个方面讲述该技术的应用情况:动物学方面,讲述其在动物遗传学,动物系统学,性别鉴定与繁殖行为研究上的应用;植物学方面,讲述其在种质资源鉴定,作物育种上的应用;医学方面,讲述其在肿瘤,遗传病,流行病学方面的进展。文章还分析了AFLP技术的优缺点并展望了其应用前景。 关键词:AFLP,分子标记技术,应用 目前遗传标记主要有4种类型,即形态标记(Morphological Markers)、细胞标记(Cytological Markers)、生化标记(Biochemical Markers)和分子标记(Mo1ecular Markers) [1]。分子标记一般指DNA标记。分子标记依据所用的分子生物学技术,大致分为三大类:(Ⅰ)以电泳技术 (Ⅱ)和分子杂交技术为核心,其代表性技术有RFLP和DNA指纹技术(DNA Fingerprinting) 。 以电泳技术和PCR技术为核心,其代表性技术有RAPD( Random amplified polymorphism DNA) 、SSLP(Simple sequence length polymorphism ,或称Sequence-tagged microsatellitesite, STMS)和AFLP。(Ⅲ)基于DNA芯片技术的分子标记,即SNP[ 2-4 ]。其中,扩增片段长度多态性(AFLP,Amplified restriction fragment polymorphism),是1993年荷兰科学家Zabeau和Vos发展起来的一种检测DNA多态性的方法,已获欧洲专利局的发明专利。该技术具有多态性丰富、灵敏度高、稳定性好、可靠性高、不易受环境影响等优点,近年来广泛应用于生命科学各项研究中。 1. AFLP分子标记技术原理、流程及特点 1.1. AFLP分子标记技术原理 AFLP技术是基于PCR反应的一种选择性扩增限制性片段的方法。由于不同物种的基因组DNA大小不同,基因组DNA经限制性内切酶酶切后,产生分子量大小不同的限制性片段。使用特定的双链接头与酶切DNA片段连接作为扩增反应的模板,用含有选择性碱基的引物对模板DNA进行扩增,选择性碱基的种类、数目和顺序决定了扩增片段的特殊性,只有那些限制性位点侧翼的核苷酸与引物的选择性碱基相匹配的限制性片段才可被扩增。扩增产物经放射性同位素标记、聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,然后根据凝胶上DNA指纹的有无来检验多态性[5]。Vos等(1995)曾对AFLP的反应原理进行了验证,结果检测到的酶切片段数与预测到的酶切片段数完全一致,充分证明了AFLP技术原理的可靠性。

基因多态性分析

人基因多态性分析 一、实验目的 1. 了解基因多态性在阐明人体对疾病、毒物的易感性与耐受性、疾病临床表现的多样性以及对药物治疗的反应性中的重要作用。 2. 了解分析基因多态性的基本原理和研究方法。 二、实验原理 基因多态性(gene polymorphism)是指在一个生物群体中,同时存在两种及以上的变异型或基因型或等位基因,也称为遗传多态性(genetic polymorphism)。人类基因多态性对于阐明人体对疾病的易感性、毒物的耐受性、药物代谢差异及遗传性疾病的分子机制有重大意义;与致病基因连锁的多态性位点可作为遗传病的诊断标记,并为分离克隆致病基因提供依据;病因未知的疾病与候选基因多态性的相关性分析,可用于辅助筛选致病易感基因。 聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction—Restriction Fragment Length Polymorphism,PCR-RFLP)分析是一种常用的DNA分子标记。原理是通过PCR扩增获得目的基因。若目的基因存在等位变异(多态性),且变异正好发生在某种限制性内切酶识别位点上,使酶切位点增加或者消失,则酶切结果就会产生大小不同的片段,即片段长度多态性,再利用琼脂糖凝胶电泳分离,可呈现出多态性电泳图谱。若将患者与正常的多态性图谱比较,可确定是否变异。应用PCR-RFLP,可检测某一致病基因已知的点突变,进行直接基因诊断,也可以此为遗传标记进行连锁分析进行间接基因诊断。 三、器材与试剂 1. 器材 ⑴离心机。 ⑵DNA扩增仪。 ⑶电泳仪。 ⑷水平电泳槽。 ⑸紫外检测仪。 ⑹移液器。 2. 试剂

C++试题及答案 (五)

C++程序设计模拟试卷(五) 一、单项选择题(本大题共20小题,每小题1分,共20分)在每小题列出的四个备选项中 只有一个是符合题目要求的,请将其代码填写在题后的括号内。错选、多选或未选均无 分。 1. 静态成员函数没有() A. 返回值 B. this指针 C. 指针参数 D. 返回类型 答案:B 解析:静态成员函数是普通的函数前加入static,它具有函数的所有的特征:返回类型、 形参,所以使用静态成员函数,指针可以作为形参,也具有返回值。静态成员是类具有的 属性,不是对象的特征,而this表示的是隐藏的对象的指针,因此静态成员函数没有this 指针。静态成员函数当在类外定义时,要注意不能使用static关键字作为前缀。由于静态成员函数在类中只有一个拷贝(副本),因此它访问对象的成员时要受到一些限制:静态成员函数可以直接访问类中说明的静态成员,但不能直接访问类中说明的非静态成员;若要访问非静态成员时,必须通过参数传递的方式得到相应的对象,再通过对象来访问。 2. 在类的定义中,用于为对象分配内存空间,对类的数据成员进行初始化并执行其他内部管 理操作的函数是() A. 友元函数 B. 虚函数 C. 构造函数 D. 析构函数 答案:C 解析:定义构造函数作用就是初始化对象,而析构函数释放对象空间。虚函数用于完成多 态性,友元增加访问方便性。 3. 所有在函数中定义的变量,都是() A. 全局变量 B. 局部变量 C. 静态变量 D. 寄存器变量 答案:B 解析:变量存储类可分为两类:全局变量和局部变量。 (1)全局变量:在函数外部定义的变量称为全局变量,其作用域为:从定义变量的位置开始 到源程序结束。全局变量增加了函数之间数据联系的渠道,全局变量作用域内的函数,均可使用、修改该全局变量的值,但是使用全局变量降低了程序的可理解性,软件工程学提倡尽量避免使用全局变量。 (2)局部变量:在函数内部定义的变量称为局部变量,其作用域为:从定义变量的位置开始 到函数结束。局部变量包含自动变量(auto)静态变量(static)以及函数参数。 auto变量意味着变量的存储空间的分配与释放是自动进行的。说明符auto可以省略。函数中 的局部变量存放在栈空间。在函数开始运行时,局部变量被分配内存单元,函数结束时,局部变量释放内存单元。因此,任两个函数中的局部变量可以同名,因其占有不同的内存单元而不影响使用。这有利于实现软件开发的模块化。 static变量是定义在函数体内的变量,存放在静态存储区,不用栈空间存储,其值并不随存 储空间的释放而消失。 4. 假定AB为一个类,则执行“AB a(2), b[3],*p[4];”语句时调用该类构造函数的次数 为() A. 3 B. 4 C. 5 D. 9 答案:B 解析: a(2)调用1次带参数的构造函数,b[3]调用3次无参数的构造函数,指针没有给它 分配空间,没有调用构造函数。所以共调用构造函数的次数为4。 5. 如果表达式++a中的“++”是作为成员函数重载的运算符,若采用运算符函数调用格式,则可表示为() A. a.operator++(1) B. operator++(a) C. operator++(a,1) D. a.operator++() 答案:D 解析:运算符的重载,前缀先让变量变化。调用++a,等价为a.operator++(),注意无参 的形式。后缀的话a++,等价于a.operator(0),带形参,形参名可省。 6. 已知f1和f2是同一类的两个成员函数,但f1不能直接调用f2,这说明() A. f1和f2都是静态函数 B. f1不是静态函数,f2是静态函数 C. f1是静态函数,f2不是静态函数

末端限制性酶切片段长度多态性分析技术进展_李红

末端限制性酶切片段长度多态性分析技术进展 李 红 (安庆市卫生学校,安徽安庆 246011) 摘 要:末端限制性酶切片段长度多态性分析(T erminal Restriction Frag ment Leng th Polymorphism,T -RFLP)是近年来发展起来的、不依赖于培养的微生物群落分析方法之一.由于 其在微生物群落结构分析方面的特点,包括分辨率高、易于实现自动化及互联网海量数据共享等优 势,自1997年最先被报道以来得到了广泛的应用,成为环境微生物群落分析的最强有力的工具之 一.类似于其他的分子微生物生态学技术,T -RFLP 也有自身的缺陷,本文详细介绍了T -RFLP 技术的原理及其解析环境微生物群落的基本流程,简述了近年来T -RFLP 技术在群落分析中的 研究进展,重点讨论了该技术的局限性及相应的解决办法. 关键词:微生物群落;末端限制性片段长度多态性分析;分子微生物生态学;生物多样性 中图分类号:O657.1 文献标识码:A 文章编号:1001-2443(2006)06-0582-04 引 言 环境中的微生物都不是单独存在的,总是通过各种作用形成微生物群落.分析微生物的群落结构,了解其与环境相互作用关系,有助于从种群和群落水平上深入理解环境中的微生物;了解环境污染物迁移转化的微生物学基础;更深刻地认识各种生物处理工艺的微观机理,从而为调控和优化微生物群落、提高处理效果提供理论指导. 传统的微生物群落分析方法建立在微生物纯种培养分离的基础上.而环境中微生物群落结构非常复杂、多样性极高,因此传统方法存在致命缺陷:无法培养自然界中所有微生物[1],也无法反映自然条件下微生物群落的真实情况[2].所以,有必要研究不依赖微生物培养的环境微生物群落分析方法.1986年Pace 等人利用核酸序列分析技术研究微生物的生态和进化以来,分子生物学技术已被广泛地应用于微生物群落分析,研究方法也层出不穷,包括荧光原位杂交法(Fluorescence In Situ Hybridization ,FISH )[3]、限制性酶切片段长度多态性分析法(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP) [4]、变性梯度凝胶电泳法(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis,DGGE)[5]等. 末端限制性酶切片段长度多态性分析(Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism,T -RFLP)是RFLP 基础上发展起来的新技术,相对于其它分子生物学技术具有分辨率高、易于实现自动化等特点,是分析复杂环境微生物群落的强有力的工具之一[6,7]. 1 T-RFLP 技术的基本原理 T -RFLP 技术以分子系统学原理为基础,综合运用了PCR 、限制性酶切、荧光标记和DNA 序列分析等技术,通过对特定核酸片段长度多态性的测定来分析微生物群落结构和功能.首先根据比较基因组学原理选取一段具有系统进化标记特征的DNA 序列作为目标分析序列.从原理上讲,微生物群落中任何具有特异性的DNA 片段都可以作为目标分析序列,包括微生物核糖体小亚基(SSU)16S rRNA(原核生物)和18S rRNA (真核生物)的基因序列[8] ,以及一些保守的功能基因序列等.之后根据目标基因序列的保守区设计引物,荧光标记.提取总DNA,PCR 扩增片段一端带有荧光标记.限制性内切酶对扩增的DNA 消化,产生长度不同的片段.电泳分离、荧光检测,检测带荧光标记的片段(Terminal Restriction Fragment,T -RF).通过分析,揭收稿日期:2006-03-16 作者简介:李红(1966-),女,安徽安庆人,讲师,硕士.第29卷6期 2006年12月 安徽师范大学学报(自然科学版)Journal of Anhui Normal University (Natural Science)Vol.29No.6Dec .2006

对多态性和继承的理解

C#中的继承符合下列规则: 1、继承是可传递的。如果C从B中派生,B又从A中派生,那么C不仅继承了B中声明的成员,同样也继承了A中的成员。Object 类作为所有类的基类。 2、派生类应当是对基类的扩展。派生类可以添加新的成员,但不能除去已经继承的成员的定义。 3、构造函数和析构函数不能被继承。除此以外的其它成员,不论对它们定义了怎样的访问方式,都能被继承。基类中成员的访问方式 只能决定派生类能否访问它们。 4、派生类如果定义了与继承而来的成员同名的新成员,就可以覆盖已继承的成员。但这并不因为这派生类删除了这些成员,只是不能再 访问这些成员。 5、类可以定义虚方法、虚属性以及虚索引指示器,它的派生类能够重载这些成员,从而实现类可以展示出多态性。 6、派生类只能从一个类中继承,可以通过接吕实现多重继承。 多态性 在C#中,多态性的定义是:同一操作作用于不同的类的实例,不同的类将进行不同的解释,最后产生不同的执行结果。C#支持两种类型的多态性: ●编译时的多态性 编译时的多态性是通过重载来实现的。对于非虚的成员来说,系统在编译时,根据传递的参数、返回的类型等信息决定实现何种操作。 ●运行时的多态性 运行时的多态性就是指直到系统运行时,才根据实际情况决定实现何种操

作。C#中,运行时的多态性通过虚成员实现。 编译时的多态性为我们提供了运行速度快的特点,而运行时的多态性则带来了高度灵活和抽象的特点。 2、实现多态 多态性是类为方法(这些方法以相同的名称调用)提供不同实现方式的能力。多态性允许对类的某个方法进行调用而无需考虑该方法所提供的特定实现。可以用不同的方式实现组件中的多态性: ●接口多态性。 ●继承多态性。 ●通过抽象类实现的多态性。 接口多态性 多个类可实现相同的“接口”,而单个类可以实现一个或多个接口。接口本质上是类需要如何响应的定义。接口描述类需要实现的方法、属性和事件,以及每个成员需要接收和返回的参数类型,但将这些成员的特定实现留给实现类去完成。组件编程中的一项强大技术是能够在一个对象上实现多个接口。每个接口由一小部分紧密联系的方法、属性和事件组成。通过实现接口,组件可以为要求该接口的任何其他组件提供功能,而无需考虑其中所包含的特定功能。这使后续组件的版本得以包含不同的功能而不会干扰核心功能。其他开发人员最常使用的组件功能自然是组件类本身的成员。然而,包含大量成员的组件使用起来可能比较困难。可以考虑将组件的某些功能分解出来,作为私下实现的单独接口。 根据接口来定义功能的另一个好处是,可以通过定义和实现附加接口增量地将功能添加到组件中。优点包括:

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