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生物信息学在医学领域的应用前沿

生物信息学在医学领域的应用前沿
生物信息学在医学领域的应用前沿

生物信息学在医学领域的应用前沿

摘要:生物信息学是有生命科学、信息学、数学、物理、化学等学科相互交融而形成的新兴学科。生物信息数据库几乎覆盖了生命科学的各个领域,截止至2010年,总数已达1230个。生物信息学已不断渗透到医学领域的研究中。生物信息学在医学领域中主要应用于医学基础研究、临床医学、药物研发和建立与医学有关的生物信息学数据库。

关键词:生物信息学;医学;基因;应用

生物信息学是20世纪80年代以来随着人类基因组生命科学与信息科学以及数学、物理、化学等学科相互交融而形成的新兴学科,是当今最具发展前途的学科之一。人类基因组计划的顺利推进产生了海量基因数据,这些数据中蕴藏着丰富的生物学内涵,如果能充分挖掘并加以利用,可能揭示出很多对人类有用的信息。生物信息学已经成为生物学、医学、农学、遗传学、细胞生物学等学科发展的强大推动力量。随着生物信息学研究的深入与发展,它已不断渗透到医学领域的研究中。近年来,伴随着对基因组的研究不断深入,部分应用领域取得了令人瞩目的突破,其潜在的经济利益更是吸引了众多国家、企业及大量科研人员投入到相关研究中,生物信息学得到了迅猛的发展。

一、主要数据库

数据库是生物信息学的主要内容,各种数据库几乎覆盖了生命科学的各个领域。截止至2010年,生物信息数据库总数已达1230个。生物信息数据可可分为一级数据库和二级数据库。一级数据库的数据都直接来源于实验获得的原始数据,只经过简单的归类整理和注释,如Genbank数据库、SWISS-PROT数据库;二级数据库是在一级数据库、实验数据和理论分析的基础上针对特定目标衍生而来,是对生物学知识和信息的进一步整理,如人类基因组图谱库GDB。

在医学领域中常用的生物信息数据库主要有:核酸类数据库,如NCBI核苷酸序列数据库(Gen Bank )、欧洲核苷酸序列数据库(EMBL)、日本DNA 数据库(DDB)等;蛋白相关数据库,如蛋白质数据库(SWISS-PROT)、蛋白质信息资源库(HR)、Entrez 的蛋白三维结构数据库(MMDB)、蛋白质交互作用数据库(DIP)等;疾病相关数据库,包括综合临床数据库,如NCBI疾病基因数据库、Gene Cards等;遗传性疾病数据库,如遗传性疾病数据库(GDB)、人类遗传性疾病数据库(Gene Dis)等;肿瘤相关数据库,如肿瘤基因组解剖工程(CGAP)等;心血管疾病相关数据库,如心血管疾病相关生物医学数据库(Cardio)、心脏疾病计划及临床决策支持系统(HDP &CDM)等;免疫性疾病数据库,如免疫功能分子数据库( HMM)、免疫缺陷资源库(IDR)等;药物相关数据库,如药物和疾病数据库(Drugs)、FDA药品评审与研究中心(CDER)等。

二、生物信息学在医学领域的应用

2.1 生物信息学在医学基础研究中的应用

2.1.1 新基因的发现与鉴定

疾病的发生发展与特异基因的改变有关,鉴定与疾病相关的基因是科学家在积极探索的一个方向,对治疗某些疑难杂症带来新的契机。发现新基因是当前国际上基因组研究的热点,使用生物信息学的方法是发现新基因的重要手段。现在很多疾病的致病基因已经发现,包括癌症、肥胖、哮喘、心脑血管病等,其中与癌症相关的原癌基因约有1000个,抑癌基因约有100个。

目前发现新基因的主要方法有以下3种:①通过多序列比对从基因组DNA序列中预测新基因,其本质是把基因组中编码蛋白质的区域和非编码蛋白质的区域区分开来。②基因的电子克隆,即以计算机和互联网为手段,通过发展新算法,对生物信息数据库中存储的表达序列标签进行修正、聚类、拼接和组装,获得完整的基因序列,以期发现新基因。③发现单核苷酸多态性。

例如,2010年我国学者通过生物信息学EST 拼接技术,RT-PCR等技术,克隆出30个人类未知功能的新基因,并通过生物信息学分析该基因

NCBI: NM_145315.3,其cDNA 全长为2 262bp,有13个外显子和12个内含子组成,主要定位于人6号染色体,该基因定位于细胞质中,MTT结果显示该基因能明显抑制细胞增值。

2.1.2 蛋白质结构、功能的预测

蛋白质结构的预测有演绎法和归纳法两种途径。前者主要是从一些基本原理或假设出发来预测和研究蛋白质的结构和折叠过程,如分子力学和分子动力学。后者主要是从观察和总结已知结构的蛋白质结构规律出发来预测未知蛋白质的结构,如同源模建和指认方法。随着功能基因组及蛋白质组学研究技术的发展,产生了许多蛋白相关数据库及分析软件,如ExPASy。它能根据氨基酸组成辨识蛋白质,提供氨基酸组成,蛋白质的名称、等电点和相对分子质量以及它们的估算误差,所属物种或物种种类或全部标准蛋白的氨基酸组成等信息。对于蛋白质结构和功能,尽管可以通过实验的方法来实现,但由于目前的蛋白检测的技术水平还远跟不上涌现如潮的基因的数量,蛋白结构、功能的预测研究现状还远远不能满足实际需要。

2.2 生物信息学在临床医学中的应用

诺贝尔生理学医学奖获得者利根川进指出:人类的一切疾病都与基因受损有关。疾病发生和转归的本质是遗传信息在一定环境条件下的外在表达。随着人类基因组计划的深入研究,当明确了人类全部基因在染色体上的位置、序列特征(包括单核苷酸多态性sin—gle—nucleotide polymorphisms,SNPs)以及他们的表达规律和产物(RNA和蛋白质)特征以后,人们就可以有效地了解各种疾病发生的分子机制,进而发展适宜的诊断和治疗手段。

基因诊断又称DNA诊断或分子诊断,通过分子生物学和分子遗传学的技术,直接检测出分子结构水平和表达水平是否异常,从而对疾病做出判断。基因诊断常用的方法有斑点杂交法、Southern印迹法、人工合成探针的直接探测法等。例如血友病A 的基因诊断,可直接检测FⅧ基因突变,以及用间接基因诊断法对DNA多态性标志进行连锁分析,不仅可以揭示HA的致病机制,还可用于携带者检出及产前诊断。目前,基因诊断已在感染性疾病、遗传病、肿瘤中应用,如人乳头瘤病毒(HPV)、乙肝病毒(HBV)、结核杆菌、HIV的检测,杜氏肌营养不良症的诊断,肿瘤的诊断、残留癌细胞的识别检测。

2.3 生物信息学在药物研发中的应用

传统的药物研发方法具有耗时长、成本高等缺点。创新药物的研究具有巨大的社会效益和经济效益。目前生物信息学已经成为生物药物研究的重要工具和手段,以基因为基础的新药开发,已成为新药开发的关键方面。生物信息学方法可以为药物研制提供了更多的、潜在的靶标。而人类基因组计划和蛋白组计划的实施、大量疾病相关基因及作用靶点的发现、生物信息学的兴起、为新药设计提供新的理论和思路。

寻找先导化合物是新药物研发的关键,药物作用的基础是先导化合物与靶蛋白的结合进而阻断靶蛋白的功能或改变其功能状态。生物信息学方法在这方面的作用越来越受到重视,常用的方法有:①三维结构搜寻:又称数据库搜寻法或数据库算法,即利用计算机人工智能的模式识别技术,把三维结构数据库中的小分子数据逐一地与搜寻标准(即提问结构)进行匹配计算,寻找符合特定性质和三维结构形状的分子,从而发现合适的药物分子。②分子对接:首先要建立大量化合物的三维结构数据库,然后依次在数据库中搜索小分子配体使其与受体的活性位点结合,并通过优化取向和构象,使得配体与受体的形状和相互作用最佳匹配。最开始的分子对接方法是刚性的分子对接法,后来又发展为柔性的对接方法。③三维结构生成:又称从头设计,即让计算机自动设计出与受体活性部位的几何形状和化学性质相匹配的结构新颖的药物分子。部分药物的应用获得了丰厚的市场回报,其潜在的经济利益更使得以企业为主体的相关研究乐此不疲。但值得注意的是,因为应用范围有限、应用时间偏短、对有关代谢作用机制仍不十分清楚等原因,这些药物的临床缺陷尚掩盖在其前所未有的治疗效果中。因此,基因药物的发展及应用必须适应生物信息学相关研究的发展,任何超前或草率的行为,都有可能产生竟想不到的负面影响。

2.4 建立与医学有关的生物信息学数据库

随着对人类疾病基因研究的深入,一些与医学有关的生物信息学数据库相继建立。如人类遗传性疾病数据库(GeneDis)、心脏疾病计划及临床决策支持系统(HDP&CDM)、转基因/靶基因突变数据库(TBASE)、FDA药品评审与研究中心(CDER)。如肿瘤及血液病的遗传和细胞遗传学数据库(Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haema

tology),这个数据库收集了癌症及易于进展为癌症的疾病的基因、细胞遗传学和临床特征等信息,主要服务于细胞遗传学、分子生物学、肿瘤学、血液病学和病理学的研究人员和临床医师。由法国波瓦第尔大学( Poitiers University )、法国肿瘤细胞遗传学协会等机构创办,其中信息由研究人员在线提交并由专家审核后入库。

三、总结与展望

目前,一些生物信息学工具已经应用于临床,为临床诊断、预防、治疗、临床疗效评估提供了有力的武器。作为人类基因组计划的生物信息学分析成果,更多疾病相关基因将被发现和鉴定,同时新的药物分子靶点将被发现和确立。生物信息学将有助于鉴定疾病易感基因、阐明疾病发生的分子机理,从而有机会发展针对疾病关键发生途径的治疗手段。

生物信息学不仅能推动医学领域未来的发展,对未来农业、食品、化妆品、环保、能源等众多领域也将产生深远的影响。而从生物信息学的研究结果来看,其不仅具有重要的理论价值,更重要的是具有实际的应用价值,其产生的效益将是相当惊人。我们有充分理由相信,生物信息学将在21世纪里继续得到迅速的发展,其对推动生物科学的发展、增进人类对自身的了解、增进人类对大自然的了解,所起的作用将是不可估量的。

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医学前沿:糖尿病治疗新突破

系列一(产品版) 战后经济迅速崛起的日本一直是糖尿病高发国家,可富士山区竟无糖尿病病例记载。研究发现,当地居民都保留着两千年来大量喝桑叶茶的习惯。难道桑叶里有什么奇特的物质,能预防糖尿病吗?这里面究竟蕴藏着什么神秘的“天机”呢? 医学前沿:糖尿病治疗新突破! 20世纪80年代,日本著名医学专家野尻博士和他的攻关小组开始了对桑叶长达20多年的研究,他们意外发现:富士山区居民特别长寿,百岁老人比比皆是,在显微镜下观察他们的血液非常干净,血管壁光滑且富有弹性、心脏、大脑充满活力。 而这些神秘现象,都与桑叶中含有的一种神奇物质有关。经证实:这种物质可以抑制动脉硬化和降低胆固醇,最重要的是它可以抑制小肠对糖分的吸收,降低餐后血糖的峰值。 该研究成果在东京召开的《日本动脉硬化学会》上发表,震惊了医学界。这种神奇物质被命名为1-脱氧野尻霉素(以野尻博士命名)又称DNJ。 DNJ在十几年里帮助许多的日本糖尿病患者摆脱了疾病困扰,在日本糖尿病患者中流传着:有“不死癌症”之称的糖尿病,将有望被治愈!的传说。 当日本医学界为这个惊天发现兴奋不已的时候,中国的一位权威内分泌专家却不以为然,他指出:“自古以来中医就已经将桑叶作为治疗消渴症(即现代医学糖尿病)应用于临床。在《本草纲目》中就曾记载:桑叶“汁煎代茗,能止消渴”,所以桑叶能治疗糖尿病根本算不上什么新闻。” 既然,桑叶具有这么神奇的降血糖功效和丰富的营养价值,食用安全性也没有问题,为什么迄今为止人们对桑叶的应用并不普遍,原因何在呢? 原来,DNJ的提取工艺极其复杂。20公斤桑叶才能提取1克DNJ,比黄金还要珍贵!目前,全世界也只有日本等少数几个国家掌握,还无法大规模用于临床。 不久前有媒体报道:地恩基(中国)国际医学研究院与日本神奈川大学桑叶研究中心共同研究的桑叶DNJ提取技术取得重大突破,使DNJ在中国大规模应用成为现实; 同年,地恩基(中国)国际医学研究院在安徽建成了亚洲最大的DNJ专用杂交桑叶种植基地;成为国内唯一有能力提取高纯度DNJ的科研机构。看来再过不久中国的糖尿病患者将有望摆脱糖尿病困扰,过上正常人生活!详情浏览官方网站:https://www.sodocs.net/doc/6b3302871.html, (文/菲儿)

国内外生物医药前沿科技发展趋势

国内外生物医药前沿科技发展趋势 王萍姚恒美 上海图书馆上海科学技术情报研究所 2005 年全球生物技术产业总产值达到633 . 1 亿美元,研发投入达到232 亿美元,年增长率为11%。其中生物医药依然是生物技术中最引人注目的领域。研究人员在药物设计、疫苗研究、抗体工程、新型药物输送技术等方面已取得众多突破。尽管目前我国在生物医药产业规模上仍落后于欧美等发达国家,但近年来在癌症治疗、蛋白质、免疫学等生物医药研究领域取得了长足的进步,成果屡次登上《科学》、《自然》等顶级国际权威期刊,并受到生物医药企业的高度关注。 一、国内外生物医药前沿技术发展趋势 药物设计 以核酸为靶的药物设计重要研发领域主要涉及两个方面:一方面是反义核酸、核酶与三链DNA的设计及其在医药领域的应用;另一方面是以核酸为靶的小分子药物研发。 目前全球约有20 余家公司在从事反义核苷酸的研究与开发,其中有23 种试用于临床,其中 4 种已进入三期临床试验阶段。反义核酸药物主要研发方向包括抗癌抑癌、抗耐药、免疫类、细胞因子类、抗病毒等。目前,反义药物方面己取得重大进展,第一代产品(Eyetech 公司用于抑制老年人眼疾的Macugen )己有上市,第二代反义产品也己形成。核酶具有高度特异性,作为抗病毒基因治疗的新型分子,受到了广泛的重视,被认为是抗病毒基因治疗方案设计中重要探索方向。2004 年 6 月,美国宾夕法尼亚州立医学院开发出了一种抗乙肝病毒的SNIPAA盒式微型载体。该类研究在国内已有开展,中科院微生物研究所自2001 年起开展“核酶介导的果树抗类病毒基因工程”的研究。R 卜A干扰不仅可以深入揭示细胞内基因沉默的机制,而且还可以作为后基因时代基因功能分析的有力工具,广泛用于包括功能基因学、药物靶点筛选、细胞信号传导通路分析、疾病治疗等等,近年来已成为遗传学、药理学的重要研究手段。目前中国科学家也己纷纷开展了该项研究,国家自然科学基金等已立项支持。 疫苗研究 以美国为例,疫苗的需求每年增长8 . 6 % ,到2008 年时市值将达74 亿美元,到2013 年疫苗市值将达91 亿美元。其中先进技术应用趋向包括异质基础加强结种技术、蛋白质调控技术、类病毒技术、转基因技术等。美国细胞基因系统工程公司应用基因技术研制出一种新型的肺癌疫苗G 一V AX ,被视为运用修改过基因的活体细胞治疗癌症上的一个重要突破。 抗体工程 抗体分子是生物学和医学领域用途最为广泛的蛋白分子,通过细胞工程、基因工程等技术制备的多克隆抗体、单克隆抗体、基因工程抗体可广泛应用在疾病诊断、治疗及科学研究等领

最新生物信息学考试复习

——古A.名词解释 1. 生物信息学:广义是指从事对基因组研究相关的生物信息的获取,加工,储存,分配,分析和解释。狭义是指综合应用信息科学,数学理论,方法和技术,管理、分析和利用生物分子数据的科学。 2. 基因芯片:将大量已知或未知序列的DNA片段点在固相载体上,通过物理吸附达到固定化(cDNA芯片),也可以在固相表面直接化学合成,得到寡聚核苷酸芯片。再将待研究的样品与芯片杂交,经过计算机扫描和数据处理,进行定性定量的分析。可以反映大量基因在不同组织或同一组织不同发育时期或不同生理条件下的表达调控情况。 3. NCBI:National Center for Biotechnology Information.是隶属于美国国立医学图书馆(NLM)的综合性数据库,提供生物信息学方面的研究和服务。 4. EMBL:European Molecular Biology Laboratory.EBI为其一部分,是综合性数据库,提供生物信息学方面的研究和服务。 5. 简并引物:PCR引物的某一碱基位置有多种可能的多种引物的混合体。 6. 序列比对:为确定两个或多个序列之间的相似性以至于同源性,而将它们按照一定的规律排列。

7. BLAST:Basic Local Alignment Search Tool.是通过比对(alignment)在数据库中寻找和查询序列(query)相似度很高的序列的工具。 8. ORF:Open Reading Frame.由起始密码子开始,到终止密码子结束可以翻译成蛋白质的核酸序列,一个未知的基因,理论上具有6个ORF。 9. 启动子:是RNA聚合酶识别、结合并开始转录所必须的一段DNA序列。原核生物启动子由上游调控元件和核心启动子组成,核心启动子包括-35区(Sextama box)TTGACA,-10区(Pribnow Box)TATAAT,以及+1区。真核生物启动子包括远上游序列和启动子基本元件构成,启动子基本元件包括启动子上游元件(GC岛,CAAT盒),核心启动子(TATA Box,+1区帽子位点)组成。 10. motif:模体,基序,是序列中局部的保守区域,或者是一组序列中共有的一小段序列模式。 11. 分子进化树:通过比较生物大分子序列的差异的数值重建的进化树。 12. 相似性:序列比对过程中用来描述检测序列和目标序列之间相似DNA碱基或氨基酸残基序列所占的比例。 13. 同源性:两个基因或蛋白质序列具有共同祖先的结论。

现代生物技术研究进展

现代生物技术研究进展 luojuan 摘要:生物技术是21世纪最具有发展前景和活力的学科,世界各国都将生物技术视为一项高新技术,生物技术在相关领域中的应用也成为应用技术研究中的热点。生物技术又叫生物工程,是综合运用生物学、细胞生物学、微生物学、生物化学等基础科学和生化工程等原理和技术而形成的一门综合性的科学技术。 关键词:现代生物技术细胞工程酶工程发酵工程基因工程蛋白质工程研究进展 一、现代生物技术概述[1] 生物技术包括传统生物技术和现代生物技术。传统生物技术主要是自然发酵技术和自然杂交育种技术。现代生物技术是指以现代生物学研究成果为基础,以基因工程为核心的新兴学科。现代生物技术主要包括:细胞工程、酶工程、发酵工程、基因工程、蛋白质工程。 二、细胞工程研究进展[2] 细胞工程的概念及其基本操作细胞工程属于广义的遗传工程,是将一种生物细胞中携带的全套遗传信息的基因或染色体整个导入另一种生物细胞,从而改变细胞的遗传性,创造新的生物类型。它包括细胞融合、细胞重组、染色体工程、细胞器移植、原生质体诱变及细胞和组织培养技术。 近年来,在该领域的研究最引人注目的是细胞融合技术和细胞杂交,并取得一些突破性研究进展。应用细胞融合技术可以培育新型生物物种。可实现种间育种。 1975年英国科学家研制成功了淋巴细胞杂交瘤技术,由此技术获得的单克隆抗体很快应用于临床实践,被称为20世纪80年代的“生物导弹”。目前单克隆抗体技术已用于治疗诊断癌症、艾滋病等多种疑难疾病,及快熟诊断人类、动物和农作物病害等方面,成为细胞工程在医学上最重要的成就之一。 日本秋田生物技术公司和遗传资源开发利用中心联合采用细胞工程的原生质体突变,将“秋田小町”稻育成“新秋田小町”新品种。该稻试种过程中,产量大大提高,取得了明显的经济效益。我国科学家利用细胞工程的原生质体育种在世界上首创了食用菌属间原生质体杂交。这种属间杂交新品种,既有香菇的独特香味和优良品质,又有平菇的高产量、生长周期短、易栽培、抗逆性强等特性。 随着细胞工程技术的不断发展,植物细胞和组织培养这一细胞工程技术也无例外地得到发展,目前已在许多植物上,特别是在农林生产实践中得到了广泛应用。尤其在林木优良品种和无性系的快速繁殖方面进展较快。 细胞工程已成为当代社会经济重要支柱性技术之一。 三、酶工程的研究进展[3] 酶工程就是在一定的生物反应装置中,利用酶的催化功能,将相应的原料转化成有用物质的一门技术。 化学酶工程又称初级酶工程,主要由酶学与化学工程技术相互结合而形成。在开发自然酶制剂方面,大规模生产和应用的商品酶只有数十种,如水解酶、凝乳酶、果胶酶等。在食品工业中的应用主要是淀粉加工,其次是乳品加工、果汁加工、食品烘烤及啤酒发酵;在轻化工业中的应用主要包括洗涤剂制造、毛皮工业、明胶制造、胶原纤维制造、牙膏和化妆品的生产、造纸、废水废物处理和饲料加工等;在能源开发上的应用主要是利用微生物或酶工程技术从生物体中生产燃料,也可利用微生物作为石油勘探、二

医学微生物学考试试卷(附答案)

医学微生物学考试试卷( A ) (临床医学本科、影像医学本科、中医药学本科、实验技术本科、预防医学本科)班级学号姓名 注意事项: 1.在试卷上写上姓名、班级。在答题卡上填上学号,将相应的数字涂黑,并写上班级、姓名和试卷类型( A 卷 /B 卷)。交卷时必须将答题卡与试卷一起上交,否则以零分计算! 2.本份试卷由基础知识题和病例分析题组成,共150 个选择题,请按题目要求,在备选答案中选择一个最佳答案,并在答题卡上将相应的字母涂黑,做在试卷上无效。 3.考试时请严格遵守考场纪律,原则上不允许上厕所。 第一部分、A型选择题 (由一题干和5个备选答案组成,请选出一个最佳答案。共90 个选择题) 1. 哪种疾病的病原体属于非细胞型微生物: A. 疯牛病C. 结核病E.体癣 B.梅毒D.沙眼 2. 细菌属于原核细胞型微生物的主要依据是: A. 单细胞 C.对抗生素敏感B.二分裂方式繁殖 D.有由肽聚糖组成的细胞壁 E.仅有原始核结构,无核膜 3. 革兰阳性菌细胞壁: A. 肽聚糖含量少C.对溶菌酶敏感 B.缺乏五肽交联桥 D.所含脂多糖与致病性有关 E.有蛋白糖脂外膜 4. 青霉素杀菌机制是: A. 干扰细胞壁的合成C. 影响核酸复制E.损伤细胞膜 B.与核糖体 D.与核糖体 50S 亚基结合,干扰蛋白质合成 30S 亚基结合,干扰蛋白质合成 5.有关“细菌鞭毛”的叙述,哪一项是错误的: A.与细菌的运动能力有关 B.许多革兰阳性菌和阴性菌均有鞭毛 C.在普通光学显微镜下不能直接观察到 D.可用于细菌的鉴定 E.将细菌接种在固体培养中有助于鉴别细菌有无鞭毛(半固体 ) 6.有关“芽胞”的叙述,错误的是 : A. 革兰阳性菌和阴性菌均可产生(都是阳性) B. 不直接引起疾病 C. 对热有强大的抵抗力 D.代谢不活跃 7.E.通常在细菌处于不利环境下形成 :用普通光学显微镜油镜观察细菌形态时,总放大倍数为 A.10 倍 B.100 倍 C.400 倍 D.900~ 1000 倍 E.10000 倍 8.脑膜炎奈瑟菌和肺炎链球菌经结晶紫初染、碘液媒染、95%乙醇脱色后,菌体分别呈 : A. 红色和紫色 B.紫色和紫色 C. 紫色和无色 D.无色和无色 E.无色和紫色

2020年版科技核心医学类期刊

2019-2020年版最新科技核心医学类期刊目录 (中国科技核心期刊) 《2019年版中国科技期刊引证报告(核心版)自然科学卷》以《中国科技论文与引文数据库(CSTPCD)》为基础,采用科学客观的研究方法与评价形式,遴选中国自然科学领域各个学科分类的重要期刊作为统计来源期刊。《2019年版中国科技期刊引证报告(核心版)自然科学卷》收录了在中国(不含港澳台地区)正式出版的1933种中文期刊和116种英文期刊,共2049种“中国科技核心期刊(中国科技论文统计源期刊)”。《2019年版中国科技期刊引证报告(核心版)自然科学卷》共收录医学领域41类学科700余种期刊,并有10种医学类期刊新入选(见下表)。2019年新入选中国科技核心期刊——医学类(10种)JOURNAL OF ACUPUNCTURE AND TUINA SCIENCE 1.陕西中医 2.重庆医学 3.中华老年骨科与康复电子杂志 4.分子影像学杂志 5.中华医院感染学杂志 6.肝癌电子杂志 7.中华重症医学电子杂志 8.国际流行病学传染学杂志 9.中医药学报

42种医学综合类期刊平均影响因子为,其中《FRONTIERS OF MEDICINE》《解放军医学杂志》《解放军医药杂志》《医学研究生学报》《中华医学杂志》共5种期刊影响因子超过1。 2019年中国科技核心期刊——医学综合类(42种) 期刊名称影响因子 CHINESE MEDICAL JOURNAL 武警医学 CHINESE MEDICAL SCIENCES JOURNAL 西部医学 FRONTIERS OF MEDICINE 西南国防医药 安徽医学 现代生物医学进展 安徽医药 现代医学 北京医学 协和医学杂志 东南国防医药 新医学 广西医学 医学研究生学报 海军医学杂志

医学微生物学复习要点、重点难点总结

医学微生物学复习要点 第1章绪论细菌的形态与结构 名词解释 微生物:是一类肉眼不能直接看见,必须借助光学或电子显微镜放大几百或几万倍才能观察到的微小生物的总称。 医学微生物学:是研究与人类疾病有关的病原微生物的基本生物学特性、致病性、免疫性、微生物学检查及特异性防治原则的一门学科。 中介体:是细菌细胞膜向内凹陷,折叠、卷曲成的囊状结构,扩大膜功能,又称拟线粒体。多见于革兰阳性菌。 质粒:是染色体外的遗传物质,为双股环状闭合DNA,控制着细菌的某些特定的遗传性状。 异染颗粒:用美兰染色此颗粒着色较深呈紫色,故名。用于鉴别细菌。 荚膜:某些细菌在其细胞壁外包绕的一层粘液性物质。 鞭毛:细菌菌体上附有细长呈波浪弯曲的丝状物。鞭毛染色后光镜可见。菌毛:菌体表面较鞭毛更短、更细、而直硬的丝状物。电镜可见。 芽胞:某些细菌在一定的环境条件下,胞质脱水浓缩,在菌体内形成一个圆形或椭圆形的小体。 简答题 1.简述微生物的种类。 细胞类型特点种类 非细胞型微生物无典型细胞结构、在 活细胞内增殖 病毒 原细胞型微生物仅有原始细胞的核、 缺乏完整细胞器 细菌、放线菌、衣原 体、支原体、立克次 体 真核细胞型微生物有完整上的核、有完 整的细胞器 真菌 2.简述细菌的大小与形态。 大小:测量单位为微米(μm) 1μm = 1/1000mm 球菌:直径1μm 杆菌:长2~3μm 宽0.3~0.5μm 螺形菌:2~3μm 或3~6μm 形态:球形、杆形、螺形,分为球菌、杆菌、螺形菌。3.分析G+菌、G-菌细胞壁结构与组成特点及其医学意义。细菌细胞壁构造比较 G+菌G-菌 粘肽组成 聚糖骨架 四肽侧链 五肽交联桥 同左 同左 无 特点三维立体框架结构,强 度高 二维单层平面网络,强度 差 含量多,50层少,1~2层 其他成分磷壁酸外膜:脂蛋白、脂质双层、 脂多糖 医学意义: 1、染色性:G染色紫色(G+)红色(G-) 2、抗原性:G+:磷壁酸G-:特异性多糖(O抗原/菌体抗原) 3、致病性:G+:外毒素、磷壁酸G-:内毒素(脂多糖) 4、治疗:G+:青霉素、溶菌酶有效G-:青霉素、溶菌酶无效 4.简述L型菌的特性。 1、法国Lister研究院首先发现命名。 2、高度多形性,不易着色,革兰阴性。 3、高渗低琼脂血清培养基2-7天荷包蛋样、颗粒、丝状菌落。 4、具致病性,常在应用某些抗生素(青霉素、头孢)治疗中发生,且易复发。 5、临床症状明显但常规细菌培养(-),予以考虑L型菌感染 5.分析溶菌酶、青霉素、链霉素、红霉素的杀菌机制。 溶菌酶:裂解 -1,4糖苷键,破坏聚糖骨架。 青霉素:竞争转肽酶,抑制四肽侧链和五肽交联桥的连接。 以上两者主要是抑制G+菌。 链霉素:与细菌核糖体的30S亚基结合,干扰蛋白质合成。 红霉素:与细菌核糖体的50S亚基结合,干扰蛋白质合成。 6.为什么G-菌的L型菌比G+菌的L型菌更能抵抗低渗环境? G+菌细胞壁缺陷形成的原生质体,由于菌体内渗透压很高,可达20—25个大气压,故在普通培养基中很容易胀裂死亡,必须保存在高渗环境中。G-菌细胞壁中肽聚糖含量较少,菌体内的渗透压(5—6个大气压)亦比G+菌低,细胞壁缺陷形成的原生质球在低渗环境中仍有一定的抵抗力。 7.叙述细菌的特殊结构及其医学意义。 荚膜:a、抗吞噬作用——为重要毒力因子 b、黏附作用——形成生物膜 c、抗有害物质的损伤作用 鞭毛:a、细菌的运动器官 b、鉴别细菌(有无鞭毛、数目、位置) c、抗原性——H抗原,细菌分型 d、与致病性有关(粘附、运动趋向性) 菌毛:普通菌毛:粘附结构,可与宿主细胞表面受体特异性结合,与细菌的致病性密切相关。 性菌毛:a、传递遗传物质,为遗传物质的传递通道。 b、作为噬菌体的受体 芽胞:a、鉴别细菌(有无芽胞、位置、大小、形状) b、灭菌指标(指导灭菌,以杀灭芽胞为标准) 8.分析细菌芽胞抵抗力强的原因。 1、含水量少(约40%)—繁殖体则占80% 2、含大量的DPA(吡啶二羧酸) 3、多层致密膜结构 第2章细菌的生理 名词解释 热原质:热原质(致热源),是细菌合成的一种注入人体或动物体内能引起发热反应的物质。产生热致源的细菌大都为格兰阴性菌,热原质即其细胞壁的脂多糖。 菌落:单个细菌分裂繁殖成肉眼可见的细菌集团。分为三型: 1.光滑型菌落 2.粗糙型菌落

最新生物信息学复习题及答案(陶士珩)

生物信息学复习题 一、名词解释 生物信息学, 二级数据库, FASTA序列格式, genbank序列格式, Entrez,BLAST,查询序列(query),打分矩阵(scoring matrix),空位(gap),空位罚分,E 值, 低复杂度区域,点矩阵(dot matrix),多序列比对,分子钟,系统发育(phylogeny),进化树的二歧分叉结构,直系同源,旁系同源,外类群,有根树,除权配对算法(UPGMA),邻接法构树,最大简约法构树,最大似然法构树,一致 树(consensus tree),bootstrap,开放阅读框(ORF),密码子偏性(codon bias),基因预测的从头分析法,结构域(domain),超家族,模体(motif),序列表谱(profile),PAM矩阵,BLOSUM,PSI-BLAST,RefSeq,PDB数据库,GenPept, 折叠子,TrEMBL,MMDB,SCOP,PROSITE,Gene Ontology Consortium,表谱(profile)。 二、问答题 1)生物信息学与计算生物学有什么区别与联系? 2)试述生物信息学研究的基本方法。 3)试述生物学与生物信息学的相互关系。 4)美国国家生物技术信息中心(NCBI)的主要工作是什么?请列举3个以上NCBI 维护的数据库。 5)序列的相似性与同源性有什么区别与联系? 6)BLAST套件的blastn、blastp、blastx、tblastn和tblastx子工具的用途 什么? 7)简述BLAST搜索的算法。 8)什么是物种的标记序列? 9)什么是多序列比对过程的三个步骤? 10)简述构建进化树的步骤。 11)简述除权配对法(UPGMA)的算法思想。 12)简述邻接法(NJ)的算法思想。 13)简述最大简约法(MP)的算法思想。 14)简述最大似然法(ML)的算法思想。 15)UPGMA构树法不精确的原因是什么? 16)在MEGA2软件中,提供了多种碱基替换距离模型,试列举其中2种,解释其 含义。 17)试述DNA序列分析的流程及代表性分析工具。 18)如何用BLAST发现新基因? 19)试述SCOP蛋白质分类方案。 20)试述SWISS-PROT中的数据来源。 21)TrEMBL哪两个部分? 22)试述PSI-BLAST 搜索的5个步骤。 三、操作与计算题 1)如何获取访问号为U49845的genbank文件?解释如下genbank文件的LOCUS行提供的信息: LOCUS SCU49845 5028 bp DNA linear PLN 21-JUN-1999 2)利用Entrez检索系统,对核酸数据搜索,输入如下信息,将获得什

基础医学前沿进展

读书笔记1 Induction of pluripotent stem cells from primary human fibroblasts with only Oct4 and Sox2 From:NATURE BIOTECHNOLOGY, VOLUME 26, NUMBER 11, NOVEMBER 2008 这篇文章主要讲述如何用两因子--Oct4、Sox2来诱导成纤维细胞成为iPS多能干细胞的,其中,VPA(valproic acid)是一种组蛋白去乙酰化的抑制剂,能使成纤维细胞在无原癌基因c-Myc 或Klf4的情况下,只需要Oct4、Sox2就能诱导产生iPS细胞。 首先,作者回顾了一下iPS细胞的发展历程。科学家首先发现卵母细胞中存在可使体细胞重编程为具有多种分化潜能的多能性细胞;后来人们可以用OCT4, SOX2, KLF4 和c-MYC这四个因子或另一组四因子OCT4, SOX2, NANOG and LIN28使人体细胞诱导成为多能性的iPS细胞。但是,这种方法产生的IPS细胞存在缺陷:(1)重编程效率低,(2)原癌基因KLF4 和c-MYC以及转录所用的病毒载体系统都可能致瘤;以上两种缺陷导致了iPS的应用受到限制,应运而生的是三因子诱导法--OCT4, SOX2 和KLF4,将致瘤性强的的c-MYC 去除,但发现效率低下。 本实验中,作者发现VPA可以大幅度提高人成纤维细胞重编程为多能分化细胞的效率,除此之外,VPA可以使人的成纤维细胞在只有OCT4, SOX2存在下,就能重编程为iPS细胞。而在此之前,无人报道过只用两因子就可获得iPS细胞,这也是本实验的创新之处;本实

医学微生物学期末考试复习重点表格

医学微生物学期末考试复习重点表格 公司内部编号:(GOOD-TMMT-MMUT-UUPTY-UUYY-DTTI-

M e d i c a l M i c r o b i o l o g y 医学微生物学 球菌(一)——革兰阳性化脓菌属 金黄色葡萄球菌A群链球菌肺炎链球菌 形态与染色G+,葡萄串珠状排 列,会发生L型转 换(变成G—)G+,链状排列,早 期有荚膜(后期消 失) G+,矛头状,成双排列,宽端相 对,尖端向外 培养基普通培养基血液、葡萄糖培养 基,血清肉汤培养 基 血液、血清培养基 菌落特点光滑,边缘整齐, 不透明,金黄色, 有β溶血环灰白色,表面光 滑,边缘整齐,有 较宽的β溶血环 (血平板) 草绿色α溶血环,菌落中央下 陷,有自溶酶分泌 生化反应分解甘露醇,触酶 (+),血浆凝固 酶(+)不分解葡萄糖,不 被胆汁溶解,触酶 (—) 被胆汁溶解 抗原葡萄球菌A蛋白与 IgG结合抗吞噬, 荚膜多糖,多糖抗 原多糖抗原,菌毛样 M蛋白抗原、P抗 原 荚膜多糖、C多糖、M蛋白 抵抗力抵抗力较强,耐热 耐盐,耐干燥,易 发生耐药性不耐热、耐干燥, 对一般消毒剂、抗 生素敏感 有荚膜株耐干燥,抵抗力一般较 弱 致病物凝固酶(使血液凝 固),葡萄球菌溶 素(插入破坏细 胞),肠毒素(引 起食物中毒),表 皮剥脱毒素(引起 剥脱性皮炎),毒 性休克综合征毒素 -1黏附素、抗吞噬M 蛋白、肽聚糖、致 热外毒素、链球菌 溶素(抗O试 验)、透明质酸 酶、链激酶、链道 酶 荚膜、肺炎链球菌溶素O、脂磷 壁酸、神经氨酸酶 致病化脓感染、食物中 毒、烫伤样皮炎综 合征、毒性休克综 合征化脓感染、猩红 热、风湿热、急性 肾小球肾炎 (机会致病)大叶性肺炎、支气 管炎、败血症、继发炎症

最新生物信息学名词解释(个人整理)

一、名词解释: 1.生物信息学:研究大量生物数据复杂关系的学科,其特征是多学科交叉,以互联网为媒介,数据库为载体。利用数学知识建立各种数学模型; 利用计算机为工具对实验所得大量生物学数据进行储存、检索、处理及分析,并以生物学知识对结果进行解释。 2.二级数据库:在一级数据库、实验数据和理论分析的基础上针对特定目标衍生而来,是对生物学知识和信息的进一步的整理。 3.FASTA序列格式:是将DNA或者蛋白质序列表示为一个带有一些标记的核苷酸或者氨基酸字符串,大于号(>)表示一个新文件的开始,其他无特殊要求。 4.genbank序列格式:是GenBank 数据库的基本信息单位,是最为广泛的生物信息学序列格式之一。该文件格式按域划分为4个部分:第一部分包含整个记录的信息(描述符);第二部分包含注释;第三部分是引文区,提供了这个记录的科学依据;第四部分是核苷酸序列本身,以“//”结尾。 5.Entrez检索系统:是NCBI开发的核心检索系统,集成了NCBI的各种数据库,具有链接的数据库多,使用方便,能够进行交叉索引等特点。 6.BLAST:基本局部比对搜索工具,用于相似性搜索的工具,对需要进行检索的序列与数据库中的每个序列做相似性比较。P94 7.查询序列(query sequence):也称被检索序列,用来在数据库中检索并进行相似性比较的序列。P98 8.打分矩阵(scoring matrix):在相似性检索中对序列两两比对的质量评估方法。包括基于理论(如考虑核酸和氨基酸之间的类似性)和实际进化距离(如PAM)两类方法。P29 9.空位(gap):在序列比对时,由于序列长度不同,需要插入一个或几个位点以取得最佳比对结果,这样在其中一序列上产生中断现象,这些中断的位点称为空位。P29 10.空位罚分:空位罚分是为了补偿插入和缺失对序列相似性的影响,序列中的空位的引入不代表真正的进化事件,所以要对其进行罚分,空位罚分的多少直接影响对比的结果。P37 11.E值:衡量序列之间相似性是否显著的期望值。E值大小说明了可以找到与查询序列(query)相匹配的随机或无关序列的概率,E值越接近零,越不可能找到其他匹配序列,E 值越小意味着序列的相似性偶然发生的机会越小,也即相似性越能反映真实的生物学意义。P95 12.低复杂度区域:BLAST搜索的过滤选项。指序列中包含的重复度高的区域,如poly(A)。 13.点矩阵(dot matrix):构建一个二维矩阵,其X轴是一条序列,Y轴是另一个序列,然后在2个序列相同碱基的对应位置(x,y)加点,如果两条序列完全相同则会形成一条主对角线,如果两条序列相似则会出现一条或者几条直线;如果完全没有相似性则不能连成直线。 14.多序列比对:通过序列的相似性检索得到许多相似性序列,将这些序列做一个总体的比对,以观察它们在结构上的异同,来回答大量的生物学问题。 15.分子钟:认为分子进化速率是恒定的或者几乎恒定的假说,从而可以通过分子进化推断出物种起源的时间。 16.系统发育分析:通过一组相关的基因或者蛋白质的多序列比对或其他性状,可以研究推断不同物种或基因之间的进化关系。 17.进化树的二歧分叉结构:指在进化树上任何一个分支节点,一个父分支都只能被分成两个子分支。 系统发育图:用枝长表示进化时间的系统树称为系统发育图,是引入时间概念的支序图。 18.直系同源:指由于物种形成事件来自一个共同祖先的不同物种中的同源序列,具有相似或不同的功能。(书:在缺乏任何基因复制证据的情况下,具有共同祖先和相同功能的同源基因。)

现代生物制药技术的现状和发展趋势

现代生物制药技术的现状和发展趋势 发表时间:2018-07-27T14:27:35.610Z 来源:《中国蒙医药》2018年第5期作者:李秋杰刘长富 [导读] 它是以生物信息学、功能抗原学、组合化学等高科技作为依托,融合了医学、生物学、药物学等先进技术。 哈尔滨三联药业股份有限公司 【摘要】近些年,随着科学技术的不断地发展,使社会发生了翻天覆地的变化,在各个领域都进行变革,改变了我们如今的社会。尤其在生物制药领域表现得更为明显,环境的不断的破坏使得人们的身体健康受到了严重的威胁,这对于相关的医学研究面临着严峻的挑战。目前,高发病症包括脑血栓、癌症、肿瘤等,并且近几年发病率呈上升趋势,迫切要求开发新的治疗手段。生物制药行业是高技术含量的朝阳行业,生物制药技术的研究和开发,必将改善人类生活的质量,延长人类的寿命,同时为社会和经济的发展做出贡献。 【关键词】生物制药;现状;发展趋势 引言: 生物技术药物(biotech drugs)又称为生物药物。它是以生物信息学、功能抗原学、组合化学等高科技作为依托,融合了医学、生物学、药物学等先进技术,依靠突破分子生物、生物物理、分子遗传学等基础学科而形成的产业。当今,世界生物制药技术产业正处于投资收获期,得到了迅速发展。生物技术药品在医药、日化产品、保健食品等领域得到广泛的应用。特别是在改造传统制药产业发挥重要作用,在新药物的开发研究和生产过程中广泛的运用,现代生物制药技术成为当今最为重要的技术手段之一。 1.生物技术药物的分类 第一代重组药物是一级结构与天然产物完全一致的药物,第二代生物技术药物是应用蛋白质工程技术制造的自然界不存在的新的重组药物。自1982年第一个重组药物人体注入式胰岛素上市以来,第二代生物技术药物正在取代第一代多肽、蛋白质类替代治疗剂;重组蛋白质和重组多肽药物。即利用DNA重组技术,将重组对象的基因插入载体,拼接后转入新的宿主细胞,构建成工程菌(或细胞),实现遗传物质的重新组合,并使目的基因在工程菌内进行复制和表达,最后,将表达的目的产物纯化并做成制剂,得到重组多肽、蛋白质类药物;重组DNA药物。基因治疗是指向靶细胞或组织中引入外源基因DNA或RNA 片断,以纠正或补偿基因的缺陷,关闭或抑制异常表达的基因,刺激产生相应的抗体,从而达到治疗和预防疾病的目的。 2.现代生物制药技术的应用 2.1肿瘤药物 据相关报道,近十年,全世界由于肿瘤而死亡的人群数量在不断増多,一些西方国家被诊断肿瘤的患者中,死亡率达到40%以上。基于此,相关部门要对其发展机理和病变问题予以分析。一般而言,肿瘤主要是在致癌因素作用下形成失控生长的细胞因子,正是这些细胞因子的集聚,会最终形成病变问题。目前,医学界只能借助诊断和化疗进行处理,在制药产业不断发展的背景下,整合研究机制和深度管理结构,利用导向IL-2受体和毒素进行融合治疗肿瘤,成为了基因治疗的发展趋势。另外,还有一种基质金属蛋白酶抑制剂能有效抑制肿瘤血管的不断再生,一定程度上阻止肿瘤生长以及转移的情况,成为一部分制药企业主攻的方向。 2.2神经退化性疾病 所谓神经退化性疾病主要是指一些老年病,其中设计老年痴呆、脑中风、帕金森以及退化性心脏疾病等,这些成为困扰现代医学的主要难题。当前,已经有部分国家开始从事这方面的研究,主要是进行生物技术药物治疗工作,利用胰岛素生长因子对相关问题进行处理和抑制,从而保证整体临床管理工序的完整性。另外,将神经生长因子和脑源神经营养因子结合在一起,主要能对末梢神经炎症以及肌肉的萎缩问题进行处理,确保具体治疗效果能最终符合临床试验要求。 2.3自身免疫性疾病 近几年,亚健康问题逐渐増多,伴随着医学技术的不断发展和进步,整合相关技术管理模型和发现机理,对一些没有发现的疾病进行识别,从而更好地应对自身免疫疾病问题。免疫系统出现问题,从个人角度,会对人们的日常生活造成制约和影响。其中,要根据过敏源等问题进行集中规避,从安全角度分析,会直接影响人们的生命安全,最为重要的就是哮喘病,严重影响人们的生活和身体健康。这也成为世界各国医生主要研究的项目,利用新药攻克医疗难题。 2.4冠心病问题 冠心病对于老年人来说尤为致命,基于此,多数研究者在生物制药方面寻找突破,要积极建构完整的证据链条。目前,单克隆抗体应用在冠心病治疗方面,主要是有效防治患者出现心绞痛,从而一定程度有效恢复患者的心脏功能,提高患者的生活质量。 3.生物制药展望 随着人类基因组计划的完成,对结构基因组、蛋白质组、功能基因组等研究迅速兴起。这些给生物技术的发展带来新的机遇。各国都十分重视生物技术,并把这一产业的发展作为新的国家经济发展增长点。生物学的革命除了依靠于生物技术和生物科学的发展,同时与众多的相关领域的技术走向紧密相连,例如:微机处理系统、材料开发、图像处理和传感器技术等。虽然生物技术发展迅速,人们很难对其做精准的预测,对于基因组图谱测绘、生物医学工程、克隆技术、遗传工程技术和药物开发方面肯定会取得重大突破。 3.1利用遗传学技术 生物技术可以在改进预防和治疗疾病等方面取得进步,运用新疗法能阻止病原体进入人体同时削弱其进行传播的能力,让病原体变得脆弱同时引导人体免疫功系统对新的病原体迅速反应。这些手段可以解决病原体对抗生素日益增强的耐受性。现在不仅在研究克服传统的病毒和细菌问题,同时正在积极开发克服化学不平衡以及化学成分积累问题的新疗法。如:研究之中的抗体能攻击人类体内的可卡因,未来能治疗毒品成瘾问题。这一方法除了可以改善瘾君子的状况,同时有助于解决全球性非法毒品贸易问题。 3.2新技术的出现可以加快新药物的开发过程 把计算机模拟技术和图像分子处理技术互相结合,能极大的提高具有特定功能属性分子的设计能力,提高药物开发和药物设计的效率。利用模拟系统处理药物与用药后的系统相互作用,可以更好的研究药效和提高药物的安全性。到本世纪中叶,使用生物技术药物的种

医学微生物学名词解释及简答题重点大全

名词解释:1.微生物:是存在于自然界的一大群体型微小、结构简单、肉眼直接看不见,必须借助光学显微镜或电子显微镜放大数百倍数千倍甚至数万倍才能观察到的微小生物的总称.2.非细胞型微生物:无典型的细胞结构,是最微小的一类微生物.无产生能量的酶系统,只能在活细胞内生长增殖.核酸只有一种类型RNA或DNA,如病毒.3.原核细胞型微生物:细胞核分化程度较低,具备原始细胞核,呈裸露DNA环状结构,无核膜、核仁.细胞器很不完善,只有核糖体.4.真核细胞型微生物:细胞核分化程度较高,有核膜和核仁,细胞器完整.5.致病微生物(病原微生物):能够引起人类和动植物发生疾病的微生物.6.条件致病微生物:在正常情况下不致病,只有在特定情况下导致疾病的一类微生物.7.菌落:菌落是细菌在固体培养基上生长,由单个细菌分裂繁殖成一堆肉眼可见的细菌集团.8.质粒:质粒是染色体外的遗传物质,存在于细胞质中,为闭合环状的双链DNA,带有遗传信息.控制细菌的某些遗传性状,可独立复制,不是细菌生长必不可少的,失去质粒的细菌仍然能正常生活.9.芽胞:芽胞是某些细菌在一定条件下,在菌体内部形成一个圆形或椭圆形小体,是细菌的休眠形式.10.细菌L型:细菌的细胞壁的肽聚糖结构受到理化或生物因素的直接破坏或合成被抑制,这种细胞壁受损的细菌在高渗环境下仍可存活者,称细菌细胞壁缺陷型或细菌L型.11.中介体:中介体是细菌部分细胞膜内陷、折叠、卷曲形成的囊状物,多见于革兰阳性菌.它能有效的扩大细胞膜的面积,相应的增加了呼吸酶的含量,可为细菌提供大量的能量.功能类似于真核细胞线粒体,又称为拟线粒体.12.普通菌毛:普通菌毛是遍布于某些细菌表面的很细、很短、直而硬的丝状物,每菌可达数百根,为细菌粘附结构,能与宿主细胞表面的特异性受体结合.与细菌的致病性密切相关.13.性菌毛:性菌毛比普通菌毛长而粗,呈中空管状结构.由致育因子F质粒编码.14.菌毛:菌毛是某些细菌表面存在着的一种直的、比鞭毛更细、更短的丝状物.与细菌的运动无关.由菌毛蛋白组成,具有抗原性.15.鞭毛:鞭毛是在许多细菌的菌体上附有的细长并呈波状弯曲的丝状物,为细菌的运动器官.16.荚膜:荚膜是某些细菌在细胞壁外包绕一层粘液性物质,为多糖或蛋白质的多聚体,用理化方法去除后并不影响菌细胞的生命活动.凡粘液性物质牢固地狱细胞壁结合,厚度≥0.2μm,边界明显者为荚膜.17.微荚膜:微荚膜是某些细菌在一定的环境条件下其细胞壁外包绕的一层粘液性物质,厚度<0.2μm者为微荚膜.18.异养菌:异养菌必须以多种有机物为原料,如蛋白质、糖类等,才能合成菌体成分并获得能量.包括腐生菌和寄生菌.所有病原菌都是异养菌,大部分属于寄生菌.19.热原质:热原质是细菌合成的一种极微量的注入人体或动物体内能引起发热反应的物质.为细胞壁的脂多糖结构,故大多源于革兰阴性菌.20.细菌素:细菌素是某些菌株产生的一类具有抗菌作用的蛋白质.其作用范围窄,仅对有近缘关系的细菌有杀伤作用.可用于细菌分型和流行病学调查.21.培养基:培养基是由人工方法配制而成的,专供微生物生长繁殖使用的混合营养制品.22.消毒:消毒是指杀死物体上病原微生物的方法,并不一定杀死芽胞和非病原微生物.23.灭菌:灭菌是指杀灭物体上所有微生物的方法,包括病原微生物的繁殖体,芽胞和非病原微生物.24.无菌和无菌操作:无菌是指不存在活菌.无菌操作指防止细菌进入人体或其他物品的操作技术.25.防腐:防腐是防止或抑制细菌生长繁殖的方法.26.滤过除菌法:滤过除菌法是用物理阻留的方法将

最新生物信息学学习心得

生物信息学学习心得 第一篇:生物信息学 生物信息学是上世纪90年代初人类基因组计划(hgp)依赖,随着基因组学、蛋白组学等新兴学科的建立,逐渐发展起来的生物学、数学和计算机信息科学的一门交叉应用学科。目前生物信息学的研究领域主要包括基于生物序列数据的整理和注释、生物信息挖掘工具开发及利用这些工具揭示生物学基础理论知识等领域。生物信息学作为新型交叉应用学科,可以依托本校已有的计算机科学、信息学、生物学和数学等学科优势,充分展现投入少、见效快、起点高的特色,推动学校学科建设和本科教学水平。 本实验指导书中的8个实验均设计为综合性开发实验,面向生物信息学院全体本科学生和研究生,以及全校对生物信息学感兴趣的其他专业学生开放。生物信息学实验室将提供系统的保障,包括采用mail服务器和linux帐号管理等进行实验过程管理和支持。限选《生物信息学及实验》的生物技术专业本科生至少选择其中5个实验,并不少于8个学时,即为课程要求的0.5个学分。其他选修者按照课时和学校相关规定计算创新学分。实验一熟悉生物信息学网站及其数据的生物学意义 实验目的:

培养学生利用互联网资源获取生物信息学研究前沿和相关数据的能力,熟悉生物信息学相关的一些重要国内外网站,及其核酸序列、蛋白质序列及代谢途径等功能相关数据库,学会下载生物相关的信息数据,了解不同的数据文件格式和其中重要的生物学意义。 实验原理: 利用互联网资源检索相关的国内外生物信息学相关网站,如:ncbi、sanger、tigr、kegg、sble、中科院北京基因组研究所、北大生物信息 学中心等,下载其中相关的数据,如fasta、genbank格式的核算和蛋白质序列、pathatdb格式化库文件,并输入blast命令进行计算,获得结果文件。 实验内容: 1. 向网上blast服务器提交序列,得到匹配结果; 2. 本地使用blast,格式化库文件,输入命令行得到匹配结果;

《现代妇女·医学前沿》期刊官网投稿

《现代妇女·医学前沿》 产品参数: 期刊周期:月刊 期刊级别:省级 国际刊号:ISSN 1007—4244 国内刊号:CN 62—1004/C 主办单位:现代妇女杂志社《医学前沿》编辑部 主管单位:甘肃省妇女联合会、甘肃省卫生厅 安徽林业科技杂志社简介 现代妇女医学前沿杂志是经中华人民共和国新闻出版总署正式批准,系甘肃省妇女联合会、甘肃省卫生厅主管,现代妇女杂志社《医学前沿》编辑部主办,中华医学会健康管理学分会、中国医学科学院健康科普研究中心协办,南京医药股份有限公司合作,由中国健康教育中心健康传播部、《健康管理》杂志社、《西部中医药》杂志社提供学术支持的海内外公开发行的省级医学类期刊。国际标准刊号:ISSN1007—4244;国内标准刊号:CN62—1004/C;国内邮发代号:54—47;国外发行代号:6271M。(投稿加微信:LSN2020)现代妇女医学前沿是医学综合学术性科技期刊,是“中国生物医学期刊引文数据库 -CMCI收录期刊”,“中国生物医学期刊文献数据库-CMCC收录期刊”并加入“中国科技论文与引文数据库”,是中国核心期刊来源期刊,中国期刊方阵双效期刊、中国北方优秀期刊、中国出版研究院中文期刊网络传播TOP排行四连冠期刊、甘肃省一级期刊,中国学术期刊网络出版总库(CNKI)系列数据库、中国核心期刊(遴选)数据库等收录期刊,是中国期刊协会指定的全国百家阅览室、重点医院图书资料室赠送期刊。现面向各级各类医药卫生专业技术人员、管理人员、教学人员及医学生等征稿。

栏目设置 专家论坛、论著、文献综述、护理天地、医院管理、实验研究、临床研究、短篇及个案报告、教育园地、病例报告、经验交流、法治园地、专题研究、中医研究、妇科、儿科、产科 投稿须知 1.论文要求:主题突出、内容充实、观点明确、资料翔实、论证严密、逻辑清晰、语言文字合乎规范,有独到见解,有一定的学术价值或实践借鉴价值(来稿一律采用电子版本word 文档); 2.文章的格式要求为:在题目下边写明作者姓名、工作单位、省份、城市、邮编,然后是摘要、关键词、正文;很多作来者稿署名时须征得其他作者同意,排好先后次序,接到录用通知后不再改动(附个人联系方式); 3.文中如有计量单位,一律采用国际标准,来稿中的数理、计量和统计内容务请作者仔细验证,慎重推导,反复核实; 4.文中如有参考文献,应依照引用的先后顺序用阿拉伯数字加方括号在右上角标出,并在文尾按照引用的先后顺序标注出引用参考文献的作者名、引用文题名、出版处及出版日期; 5.所投文稿必须附写该文200字以内的中文摘要和3~5个关键词; 6.来稿两周内未接到回复者请速来函来电查询;不符合录用条件的文章本刊不退稿件,作者自行处理; 7. 编辑部对来稿有删修权,不同意删修的稿件请在来稿中声明; 8、刊发按来稿先后顺序。切勿抄袭,文责自负。请勿一稿多投。 注:投稿须明确注明作者姓名、单位、邮编、联系电话和详细地址,E-mail,以便及时投寄录用通知。

生物科学前沿简介

第八讲生物科学前沿简介 一、20世纪生物科学发展的历史回顾 记者:匡先生,在展望生物学绚丽的发展前景之前,您能否简要的回顾20世纪生物学领域所取得的引人注目的成就呢? 匡廷云院士:由于19世纪以来,物理学、化学、地学以及技术科学的理论成就和技术进步,为生物学家认识生物发展规律提供了许多新的手段、方法。所以19世纪末20世纪初,生命科学取得了巨大的发展。在20世纪在生命科学领域有两次革命性的突破。第一次是孟德尔遗传学的再认识和摩尔根的基因论。孟德尔开创了经典遗传学,揭示了生物遗传现象。摩尔根主要用实验手段证明了基因是有序排列在染色体上的。 到了20世纪中叶,迎来第二次突破性进展,即沃森和克里克发现DNA双螺旋结构。沃森是生物学家,当时刚刚在美国拿到博士学位,研究噬菌体,后来到了英国。而克里克是个物理学家,当时在剑桥读Ph.D,用X射线衍射研究蛋白质晶体结构。沃森的贡献是在于确定DNA 两对特异性碱基的配对。克里克的贡献在于他极力主张建立物理模型,从分子、原子之间的距离和角度就可以得到最大限度的变量和稳定条件。特别有规则的双螺旋结构大大减少了变量数目。物理学家和生物学家完美的结合发现了DNA双螺旋结构。这是第二个突破性的里程碑。 图2 玉米籽粒的孟德尔遗传 图3 DNA 双螺旋

DNA双螺旋结构的建立开辟了生物学的新纪元。在这个基础上产生了基因工程、蛋白质工程。因此生物技术的发展对科技的发展对科技的发展、社会的进步的推动力是巨大的。由于分子生物学的发展、信息科学的发展人类才有可能识破自身的基因。在20世纪末大规模的开展人类基因组计划,破译人类的基因全序列。这个计划与曼哈顿原子弹计划、阿波罗登月计划并称20世纪人类三大科学计划。可以说20世纪生物学是飞速发展,取得了巨大的成就,为21世纪生命科学的腾飞打下了坚实的基础。

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