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(完整版)IPP使用教程

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Image pro-Plus6.0 使用教程

目录

一、入门 (2)

二、AOI技巧(1) (9)

三、AOI技巧(2) (14)

补充:不规则区域计数 (20)

四、编制宏 (23)

五、计数 (27)

六、校正标尺 (33)

七、几何测量 (41)

八、图象分析策略 (43)

九、其他有趣功能 (45)

十、光密度 (51)

十一、免疫组化光密度测量 (56)

十二、macro (58)

十三、荧光强度测量 (64)

感谢丁香园战友:hbchendl 提供教程

畅想先锋-整理

2010.07.01

一、入门

既然是处理图片,当然是先要打开一张要处理的图片嘛。在你开始学习使用IPP 之前,我假定你是会初步使用office 及photoshop 等常用程序的。如果一点电脑常识也没有,那还是先学点简单的程序再回来玩IPP。

因此我跳过了打开图片,copy 、paste、象素的概念之类最基础的知识与操作。这些用不着我来讲。

这张照片中的黄色部分是免疫组化染色的阳性表达成分。处理目标是通过测量图片中黄色部分的"黄"度来反映相应蛋白表达的的"量"。

对该图片进行观察,可以看到图片中主要有三种主要颜色,一是染成蓝色的细胞核,二是呈现出黄色的胞浆,三是细胞间的空隙区域,呈现出浅蓝色,是为背景。

所以首先要把图片中呈现黄色的区域给挑选出来,然后才是测量这些挑出来的区域的各种测量参数,如面积、平均半径、周长、光密度等等。这部分需要挑出来进行测量的区域是我们最感兴趣的地方,叫作AOI(area of interest)。AOI 是IPP 中最有用最重要的概念。如何能够准确地选取AOI 就是使用IPP 的关键操作。一旦准确地选取了AOI,下面的测量分析就好办了。在其他的测量软件中,选择这种不规则的区域一般只能用手拖着鼠标来画,而在IPP 程序里,可以通过设置颜色范围让电脑来帮助你选择这些不规则区域,这样的选择就准确多了。可以说,使用IPP 的要点就是灵活地使用各种AOI 工具准确地把那些需要测量的区域给挑选出来。

对不同的图片,需灵活地使用各种适当的AOI 工具,先用最简单的,当然,简单的工具只能作简单的事,就这张图片来说,用简单工具选黄色有点困难,我们先用它来选择蓝色的细胞核吧。

点击measure---count/size,弹出分类测量窗口。

在窗口中选中manual,再点击select color,弹出颜色选择窗口segmentation,这个工具是IPP 最有特色的颜色选取工具之一。用好这个工具是使用IPP 的要点。

对于目标颜色鲜明的图片,用吸管工具是最简单的。点一下吸管图标,在目标区域点一下,就可以选中该点的颜色,当然一下是不可能完全选中所需要指定的全部区域,可以在未选中的地方接着再点,这样多次选取,直到把想选中的区域全部选中为止。

在这张示例图中,选中的蓝色细胞核部分被标上了红色。

用红框圈起来的四个工具按纽分别是:吸管、撒消上一步操作、橡皮擦、全部清除。下在的小方框里则是吸管位置的选取颜色。

图片中被标上红色的区域被定义为一个class,其中每一个独立的小区块被定义为这个class 中的一个object。以此图为例,图中深蓝色的部分是细胞核,因此所有的细胞核都被选中成一个class,其中每一个细胞核就是一个object。

选取完AOI 后,点击close 回到count/size 窗口,下一步就可以对选中的object 进行测量操作了。

点击count/size 窗口中的measure 菜单,点select measure,这是选择要进行何种测量操作,在弹出的测量选择窗口左侧列出了各种可用的测量选项,最常用的测量有:

area 面积

density(mean)平均光密度

diameter 直径

IOD(integrated optical density)累积光密度

在相应的项目上点一下,该测量项目就被选到中间的窗口中了,同时关于该测量的详细说明会显示在最右边。如果想取消某个已选中的测量项目,则在左边窗口中该项目上再点击一下就可以了。

选好了待测量的区域,也指定了测量项目,就可以进行测量统计了,点击一下测量选择窗口的OK 纽,关闭这个窗口,就回到了count/size 窗口,再点击一下count 按纽,就可以看到程序在进行测量,稍等几秒钟即可读取测量数据。

分别点击count/size 窗口中view 菜单中的measurement data 和statistics,就分别弹出这两个数据窗口。前者是这个calss 中每一个object 的测量数据,后者是这些测量数据的统计参数,如总数、平均值、累加、标准差等。本例中得到的就是每个细胞核的面积、平均光密度值、直径、累积光密度值。统计数据则可得到这张图片中所有细胞核的平均面积、平均光密度值,平均直径、累积光密度值,当然还有细胞核的数目,就是所有object 的数目。

测量数据转入EXCEL 处理起来最方便。只要在数据菜单中点file - DDE to EXCEL。数据就传到EXCEL 的sheet1 里去了。

在这个示例图片的统计数据中

samples 为图中所有细胞核的个数。

第一列为area,其中的Mean 值为各个核的平均面积,后面就是平均灰度、平均直径,这些是有意义的测量统计数值。但IOD 却是SUM 值更有意义。

订正:

在上述操作中漏掉了一个重要步骤,就是要转换图象intensity 格式。

在默认的intensity 格式中,是图片灰度,越黑数值越小,越白数值越大。而实际上我们测量的染色强度是光密度,染色越深,光密度值越大。

如果不进行光密度单位的转换,测量的数值将完全是错误的。

转换光密度单位的方法如下:

点击:measure--carliberation--intensity,调出intensity 校正窗口。

然后在窗口中点new 按纽,再点一下下面的std optical density 选项,这时可以看到窗口中的直线变成了反向的曲线。

然后还要点一下最上面的system 按纽。

最后点close 关闭窗口。

这样就把程序系统的灰度单位转换成了光密度单位。

关于光密度较正的详细内容请参见第十帖及第十一帖。

校正光密度单位的操作要在打开第一张图片后立即进行。将光密度单位设定为system 之后就不必再对后面的每一张照片都进行光密度校正了。

整个分析测量过程就是这样。当然,光知道这一点是远远不够的。在以上所述各个步骤中有许多技巧和方法能使测量数据更加准确合理。本人将另发帖子分别详细叙述。欢迎大家提问。此主题到此结束。

IOD=density(mean) * Area

density 反映了阳性蛋白的浓度或强度,但IOD 能反映选定区域的蛋白表达总量。

一个典型的示例是:阳性样品切片中有大片的黄色区域,而阴性切片上只有少量的黄色区域,但是两者的黄色都很深。这样测量的阴性切片与阳性切片的黄色区域的density mean 就没有差异,差异在于其黄色区域的面

积上。

如果是一个不典型的图片呢:一个黄色深但面积较小,另一个黄色浅却面积较大,那一个蛋白表达更强?这时用IOD 就更准确了。

二、AOI技巧(1)

在IPP 中,最有特色,最有用处的工具有两个。一个就是我们已经看过的segmentation 工具,另一个是irregular

工具。

我们先看irregular 工具。

这是一个用来描绘不规则孤立对象边界的工具。图中一个个棕黄色形状是免疫组化染色的贴壁培养细胞,为了计算每个细胞的面积及蛋白表达,首先就是要选取每个细胞的边界线。这就可以用到irregular 工具了。在工具栏上点一下那个不规则园形的按纽,就调出了irregular 工具条。

这个工具的标题叫Magic wand,就是photoshop 中的魔棒呀。将鼠标移至图中一个细胞的中间,光标就变成魔棒了,在一个位置左键点一下,就选中了这个位置及其周围灰度相似的区域。这里"相似"的定量范围由Range 的值来决定。较大的值为较大的灰度范围,点一下能选中一大片区域。较小的range 值则为较小的灰度范围。在一个区域上多点几下,就能选中这个区域的整个边界了。最后点一下右键,就确定了一个不规则形状的选定区域。点一下左边的问号,就能看到相应的使用说明。smooth 值是用来平滑区域边界的。一般不需要平滑,因此默认值为零。

选中一个区域后如果还要在同一张图片上再选另一个区域,不能直接点选,要先点击一下工具栏上的Multiple AOI 按纽,再点击add,接下去就可以到另一个选择区域点选。选好一个新的区域后再回去点Multiple AOI--add 确认,再继续下一个,直到选取完所有的AOI。最后在图片上任一处点一下右键结束选择操作。结束后如果又想再增加选择区域,只要再点一下newAOI 按纽,就可以调出工具条继续增加选择区域。

这个irregular 工具还有另一个操作方式,在问号旁边有个trace 按纽,点一下它,工具条就变成另一个样子了。这种操作方式是沿着孤立图像的边缘寻迹,从而画出一个沿着孤立形状边缘围成的一个AOI。

第一种是手画法。确认工具条右边的Auto 选项没有打勾,将光标移至目标图形处按住左键拖出一个闭合图形,点右键结束。

用鼠标画当然是不会准确的。实在没别的招了才会出此下策。

第二种方法是自动寻迹。

把那个Auto 给选上,speed 值给减到1(慢速看得清楚),在目标图形的边缘处左键点一下鼠标,然后沿着边缘稍移动一下鼠标后再点击一下左键,这是给程序指明一个寻迹的方向,马上就能看到光标自动沿着边界走起来了,一直会走到起点处才会停止。这样就自动围成了一个闭合区域,点一下右键就确认了这个AOI。重复选取多个AOI 的方法与楼上一样。

如果目标图形边界清晰,那么这个工具是非常管用的。可惜的是在许多情况下边界是模糊不清的,光标走到此处时会乱走一气。这时就要及时先点一下鼠标使光标暂停下来,然后在期望的方向延长再点一下左键,给程序指明一下前进的方向,如此多次,直到光标回到起点为止。最后点一下右键围成一个闭合的AOI。围好的AOI 边界是绿色框。

自动寻迹挺好玩吧?不过别忘了我们的目的。选好了一个个的AOI 后当然是要测量每个区域的几何尺寸及光密度啦。下面该怎么作呢?

点开count/size 窗口,点菜单EDIT---convert AOI to Objects.这样就把刚才选中的一个个AOI 变成了要测量的object 了,那些小区域的颜色也由AOI 绿色外框线变成了object 的标记了。

object 的标记类型是可以自己设定的。在count/size 窗口右边有一个option 按纽,点开它就能设定object 标记的外观了。在option 窗口中,outline style 可以选outline(轮廓线)或filled(填充class 颜色)。label style 可以选择为object 序号或测量值。再下面是label 的文字颜色。

右上角还有一个class 的颜色选择按纽。估计大家自己试一下都会用的。

下一步是点measure 菜单下的select measurements。选上要测量的项目。

注意,选完后要点击这个菜单中的measure 按纽(而不是count/size 窗口中的count 按纽)。然后是OK 按纽关闭measure 窗口,点开view 菜单下的measurement date 和statistics 数据窗口。几个object 的测量数据就已经在里面了。

如果你还想继续增加objcet,可以直接用irregular 工具画AOI,然后点convert AOI to object。这期间把数据窗口留着不关闭,可以看到新增的object 测量数据会立即被更新。

三、AOI技巧(2)

在上一主题中讨论的主要是irregular 工具,它对于大个的孤立图形对象的选取是有用的。而面对组织切片中密密麻麻的细胞,就得用本主题讨论的segmentation 工具了。

实际上,在第一部分入门中所用的就是segmentation 工具,在那里我用颜色吸管选取了图片中蓝色的细胞核,但是如果仔细观察一下选取的效果就会发现,有一些挨在一起的两个以上的细胞核被识别成了一个,另有一些蓝色的杂质颗粒被错误地识别成了细胞核。

如果你试着用吸管工具选取一下图中黄色的免疫反应表达区域,就会发现因为黄色很浅,很不容易准确地选取。所以对于segmentation 工具还需要有更多的应用技巧。火锅在我之前已经介绍了不少,我在这里班门弄斧是为了保持我这个系列主题的内容完整。同时也是系统地整理一下这个工具的使用方法。

让我们还是从打开图片并调出count/size 窗口开始吧。

对这种色彩饱和度低,各种成分颜色区别很小的图片来说,用吸管是很难准确选择到正确的颜色区域的。

在count/size 窗口里选中manual,并点select color 调出segmentation 窗口。窗口里有两个表单,一个是color cube based,另一个是histogram based。如果你测量的对象颜色单一,色彩对比大,则使用color cube based 中的吸管就可以方便地选择到需测量的区域。而对于那些有颜色深浅及亮度不同的测量区域,我们要选取后者,并且使用HSI 颜色格式来进行分色选择。当切换到HSI 时,会弹出一个窗口提示你会reset 颜色选择,是否继续?当然是OK 啦。这时的颜色选择全部重置为0-255。

在HSI 颜色格式中,H 为色调,就是我们眼睛所看到的红橙黄绿青蓝紫等。S 为色饱和度,I 为强度。在选择AOI 时,首先保持S、I 为最大范围,从H 中选择黄色部分。使用这个颜色格式的好处是,选择的颜色能包括这种颜色的不同深浅及亮度。最适合于测量免疫组化图片。

点一下H,直方图显示就是图片各象素H 值的分布,在直方图的两边各有一根线,这就是选择线,先将右边的线用鼠标左键向里面拉,拉一点停一下看看效果,可以看到最开始时是选中了全部画面,然后是蓝色的区域慢慢显露出来,并且越显越多,选择线的位置也在下面的窗口中有显示,是0-255 之间的数,共有两个窗口,左边是取值下限,右边是取值上限,先不断减小上限值使得非黄色区域不断地显露出来,再不断增加下限值让另一部分非黄色的区域也显露出来。

这张照片中黄色区域为H:0-33。

色饱和度S 与强度I 都直接设为0-255。这就是说,只要是黄色,就被认为是阳性表达的区域。

选好了颜色范围,点close 关闭segmentation 窗口,回到count/size 窗口,点measure 的select measurement ,选中area, density(mean),IOD。坏事了,这个窗口的measure 按纽是灰色的,不能用。回到count/size 窗口,按count 纽,也一样不好用!!!或者点count 后计算的区域根本就不是刚才选取的正确区域。

这是使用HSI 选色时最常犯的错误:只是操作顺序不对。正确的操作顺序是:

先打开select measurement,选择好各个测量项目,再回到count/size 中点select color 进行颜色选取,再回到count/size 窗口中点count 计数。

这样操作结束后仔细观察一下计算的区域,正是刚才正确选取的区域了。

这样选取的区域还是有一点不准确。图片中被选中的区域有许多很小的选点,显然这是各种杂质,并不是成片的蛋白表达区域。对这些杂质小点有一个有效的方法来去除,就是测量过滤。(filter)

打开select measurement 窗口,点一下中间被选中测量项目中的area 项,使其加亮。这时下面的start 与end 选项就变黑可调了。对area 来说,默认值一般是0,意思是不管区域有多小,都被计入测量范围内。现在我们把它改为50,也就是说,忽略了象素点小于50 的杂质点,不予计算在内。

改完后点一下旁边的Filter 按纽,再点measure 按纽。或者回到count/size 窗口内把Apply Filter Ranges in Range 前面的选项给勾上,再点count 按纽。这回就把小杂质点全给过滤掉了。

过滤是一种很有效的选取AOI 的手段,除了定义面积范围进行过滤以外,还可以选取BOX X/Y 测量项目,这是object 外切长方形的长宽比,如果是园形的object,这个值应该是1,在作园形的细胞计数统计时,把这个值的范围设定在0.5 到2.0 之间,就可以滤掉长条形的杂质Object,当然同时也可以设面积过滤范围。把那些通过颜色选择不能排除的object 给进一步排除掉。类似的测量选项还有Radius Ratio 等,通过这些测量值的过滤,可使得AOI 选得更加准确。

显微镜图象千差万别,每一次进行分析都需根据具体的图像情况来选择AOI 方法。前面所述的各种技巧需交替应用。

凡是玩电脑都必会有一个reset 键。不管作错了什么事,按一下reset 键就可以全部重新来。选AOI 也是这样,如果选得不合心意,想全部重新来的话,按count/size 窗口中的delete 键,就可以把刚才作的一切都给全部推倒重来了。

另外还有一个是反向选择。在选文件夹与word 的edit 菜单里都有这项功能。segmentation 里也有这个哟。在前面的图象里,选好颜色后,点一下用红圈标注的那个按纽,就实现了反向选择。

凡是玩电脑都必会有一个reset 键。不管作错了什么事,按一下reset 键就可以全部重新来。选AOI 也是这样,如果选得不合心意,想全部重新来的话,按count/size 窗口中的delete 键,就可以把刚才作的一切都给全部推倒重来了。

另外还有一个是反向选择。在选文件夹与word 的edit 菜单里都有这项功能。segmentation 里也有这个哟。在前面的图象里,选好颜色后,点一下用红圈标注的那个按纽,就实现了反向选择。

关于segmentation 窗口中其他一些按纽的用处,大家可以从帮助文件中查找。尽管帮助文件是英文的,看起来有点困难,但中文的帮助文件翻译得不准确,有时比英文的还难懂呢。

总结一下segmentation 工具的用法,有两种,一种是在color cube based 模式中用颜色吸管来选取目标颜色。另一种是在Histogram Based 模式中利用HSI 范围来选取目标颜色。二种方法各有其优点,其共同之处就是把图片中相同颜色的区域给定义成一个class,以便对它们进行分析处理。

在segmentation 窗口的下方还有一些有用的功能。

在priview 框中,上面一个选项是对选择的区域标注ckass 颜色的,可以选择不标色,只标当前class 颜色(current class)或者所有class 颜色。

下面一个选项则是对选中区域与非选中区域分别标上不同颜色的选择,我一般选择class color on transparent。这样在选择颜色时能观察尚未被选中的部分。如果把一部分选成black,其效果就等于把这一部分从图象中抠去,这个处理也是很有用的。标注上了class 颜色的图象可以点creat priview image 按纽来另存成一个新图片,

窗口最下方的file 按纽是用来保存颜色选取参数的。这个颜色参数文件非常有用。在处理一组多个图片的时候,不能每个图片都选择一次颜色,这样各个图片的选择标准不一致,而且费时间。先处理一张典型的图片,把颜色选择参数保存成一个文件,在处理下一张图片时,只要把这个文件再调出来就行了。这个操作在使用宏操作时是必须的。

segmentation 工具与irregular 工具在count/size 中可以灵活应用。

1.单独使用irregular 工具画一个或几个孤立区域,只测量它们几个的各种参数。

2.单独使用segmentation 工具,对颜色对比明显的区域可简单使用吸管选色,对颜色不明显的图片用HSI 格式来选择同样色调的区域。

3.同时使用irregular 与segmentation 工具,前者可以限制图片上的一个测量范围,后者则选择了这个范围内的特定颜色区域。具体作法请看下面几楼super270 的跟帖。这可是高级的IPP 技术呀。相比之下,实际上我讲的都是基本的,初级的使用方法。

4.在选色窗口中还有一个class1 的下拉对话框,就是说,我们可以分别选择两种以上颜色,然后同时计算它们的各种参数。例如,我们可以先选择蓝色的细胞核并给它们标上紫色的标记色,再新建一个class2,选择黄色的免疫组化染色区域,并给它们标上红色。有时候我们会不得不使用这个技术:有的照片照得偏蓝色。这样在使用segmentation 选择黄色的区域时会发现,一部分黄色的HSI 值在0-30,而另一部分黄色区域的HSI 值却在230-255 之间。这时就不得不分别选择两个class,分别计算其IOD 及area 之后再把它们相加起来。

这大概也算是高级一点的技术吧。

补充:不规则区域计数

1.使用不规则AOI 工具划出感兴趣的区域。

C#常用数据库操作方法整理

C#常用操作数据方法整理 using System.Data.SqlClient; //导入sql数据库命名空间,这样可以用sql数据库操作相关类 String ConnectionStr = "server=.;database=数据库名;uid=sa;pwd=123456;"; //数据库连接字符串,server确定数据库服务器名,database定义数据库名,uid定义数据库使用者用户名,pwd为密码。 SqlConnection conn = new SqlConnection(ConnectionStr); //建立数据库连接,只有建立连接了才能操作数据。 //也可以合在一起:SqlConnection conn = new SqlConnection(“server=.;database=数据库名; uid=sa;pwd=123456;”); String SQLString=“”; //数据操作语句放在双引号中,语句有增,删,改,查操作。 SqlCommand comm = new SqlCommand(SQLString, conn); //建立数据库命令,确定sql数据操作语句,和数据库连接。 //也可以合并,SqlCommand comm = new SqlCommand(“数据库操作语句”, conn); conn.Open(); //打开数据库,只有打开数据库,数据库命令才能被执行。 int rows = comm.ExecuteNonQuery(); SqlDataReader dr = comm.ExecuteReader(); //专门用于读取数据库数据 Object result= comm. ExecuteScalar(); //或string result= Cmd. ExecuteScalar().Tostring(); //执行数据库命令: //ExecuteNonQuery()用于增,删,改操作,返回受影响的行数; //ExecuteReader()用于查操作,返回一个SqlDataReader类的对象; //comm.ExecuteScalar()执行查找,返回从数据表中查询结果的第一行第一个单元格的数据。conn.Close();

数据库的使用说明

数据库的使用说明 一、登录 ●在Windows“开始”、“程序”中找到SQL Server 2000的程序项,运行查询分析器。 ●在“连接到SQL Server”对话框中选择“使用SQL Server身份验证”,输入登录名和 密码,服务器中填入“Server”,按“确定”即可使查询分析器客户端连上服务器。 用户帐号为pb05207,密码为pb05207。 ●在查询分析器的工具栏中可以选择当前要操作的数据库,在编辑窗口中写入SQL 语句后,就可以在“查询”菜单中或工具栏中选择“执行”,即可将输入的SQL语 句交给Server执行; ●在左边的树形视图中可以看到当前可以操作的数据库的结构。 ●更详细的使用可以查看帮助文件,帮助文件在 C:\Program Files\Microsoft SQL Server\Books下。 其中部分帮助文件的简要说明如下: qryanlzr.chm 查询分析器的帮助 tsqlref.chm Transact SQL语言的帮助 createdb.chm 创建和管理数据库、表、视图的帮助 acdata.chm 查询和更改数据库 dtswizrd.chm DTS导入/导出向导帮助 二、关于数据库的操作说明 登录后首先建立一个自己的数据库,以自己的学号作为数据库名; 然后进入自己的库中进行SQL语言的各种操作练习,例如建表,插入数据,删除表等等。

三、 查询分析器的一些使用说明 对象结构 模板工具 执行 数据库选择 查询窗口 打开新的查 询窗口, 系统根据选 择的菜单项, 自动地给出 相应的SQL 脚本

四、数据的导入和导出 ●运行SQL Server 2000的导入和导出数据。(其帮助信息参见dtswizrd.chm) ●选择数据源。如某表要插入的数据存放在文件中,则选择数据源的类型为“文本文 件”,操作如下: ●选择文件格式。如数据文件中每一行表示一条记录,列之间通过TAB键分隔,字 符串以单引号限定,则作如下设置:

国外数据库的使用方法介绍

一、美国 (1)Wiley InterScience(英文文献期刊) Wiley InterScience是John Wiely & Sons 公司创建的动态在线内容服务,1997年开始在网上开通。通过InterScience,Wiley公司以许可协议形式向用户提供在线访问全文内容的服务。Wiley InterScience收录了360多种科学、工程技术、医疗领域及相关专业期刊、30多种大型专业参考书、13种实验室手册的全文和500多个题目的Wiley学术图书的全文。其中被SCI 收录的核心期刊近200种。期刊具体学科划分为:Business, Finance & Management (商业、金融和管理)、Chemistry (化学)、Computer Science (计算机科学)、Earth Science (地球科学)、Education (教育学)、Engineering (工程学)、Law (法律)、Life and Medical Sciences (生命科学与医学)、Mathematics and Statistics (数学统计学)、Physics (物理)、Psychology (心理学)。 [转帖]如何用代理注册自己的wiley interscience密码 忘记了是在哪里看到的了,不过的确是好用,我已经注册了一个,介绍给大家,大家不妨也注册一个。wiley interscience原来的确验证方法已经失效,大家不妨用SD代理试试看,一般来说定了SD的确图书馆大多也定了wiley interscience。 注意:(1)必须进入代理后进行注册,否则没有相应的权限,注册后要击活,方法是:进入代理后(2)当你手上有INTERSCIENCE的密码时,不要忘记去看看过期了没有!inTERSCIENCE的PWD 用90天左右,必须续用!(据说不必须进入代理就右进行续用)方法是快到期之前点MYPROFILE--------点ActivateRoaming Access-----点LICENSE SOURCES、REFRESH ROAMING ACCESS即可。 =============================================== (2)美国IEEE (英文文献期刊) IEEE(Institute of Electrical & Electronics Engineers)是电子信息领域最著名的跨国性学术团体,其会员分布在世界150多个国家和地区。据IEEE统计,IEEE会员总数2001年比2000年增加3.1%,达到377342人,其中学生会员为65669人,增长12.6%。 随着人们的信息越来越多地来自Internet,IEEE需要为会员提供更加完善和全面的电子信息产品和服务。IEEE应成为IEEE会员获得信息的首选之地。IEEE必须识别正确的信息,并提供对它们的访问方法。实现这个目标的重要一步是通过IEEE Xplore与IEEE/IEE Electronic Library (IEL)连接。IEL包括了1988年以来IEEE和IEE的所有期刊杂志和会议录,以及IEEE的标准,可以通过题目、关键词和摘要进行查阅。 IEEE密码 =============================================== (3)美国EBSCO(英文文献期刊) https://www.sodocs.net/doc/b58101662.html, 登陆-----点MYPROFILE--------点ActivateRoaming Access即可。 数据库简介: EBSCO公司从1986年开始出版电子出版物,共收集了4000多种索引和文摘型期刊和2000多种全文电子期刊。该公司含有Business Source Premier (商业资源电子文献库)、Academic Search Elite(学术期刊全文数据库)等多个数据库。500XK6 Business Source Premier收录了三千多种索引、文摘型期刊和报纸,其中近三千种全文

ACCESS数据库使用方法和技巧

关于Access数据库的说明: Microsoft Access是Microsoft Office中的一个套件,如果您的电脑中安装了Microsoft Office,那么一般来说您的电脑中就安装了Microsoft Access,因为Microsoft Access是Microsoft Office默认的安装套件。有了Microsoft Access你就可以用它来打开扩展名为MDB 的Access数据库文件了。 我们提供的Access数据库需要用Microsoft Access2000(或者Microsoft Access XP或者Microsoft Access2003,Microsoft Access97可能打不开),因此如果您的电脑中是Microsoft Access97,那么您需要将您的Microsoft Office升级到2000或者更高版本。 Access数据库文件必须用Microsoft Access来打开,如果您的电脑中没有Microsoft Access,那么您可能需要安装Microsoft Office2000或者更高版本;如果您的电脑中已有Microsoft Office,但没有Microsoft Access,那么您可能需要插入Microsoft Office光盘,安装Microsoft Access套件。 1、打开光盘,将ACCESS数据库复制到硬盘; 2、双击打开ACCESS数据库文件; 3、关闭ACCESS数据库窗口; 4、打开“工具”--“数据库实用工具”—“转换数据库”—“到当前ACCESS数据库版本; 5、选中ACCESS数据库文件--“转换” 6、重新命名ACCESS BD1文件即完成。 1、双击打开ACCESS数据库文件; 2、在“对象”选卡中点击“查询”—选取“企业名录查询”; 3、单击“设计”进入选择查询界面; 4、确定您需要检索的字段,如“企业名称”、“通讯地址”、“邮政编码”、“经营范围”、“行 业名录”等; 5、按字段检索时,请在“准则”表格中填入Like“*深圳*” 注意:“深圳”就是关键字,改变一下关键字就是您要设定的检索了,Like“*深圳*”就是检索命令。 6、点击“保存”即完成查询。

KEGG数据库的使用方法与介绍 (转)

KEGG数据库的使用方法与介绍(转) KEGG的数据KEGG中的pathway是根据相关知识手绘的,这里的手绘的意思可能是指人工以特定的语言格式来确定通路各组件的联系;基因组信息主要是从NCBI 等数据库中得到的,除了有完整的基因序列外,还有没完成的草图;另外KEGG中有一个“专有名词”KO(KEGG Orthology),它是蛋白质(酶)的一个分类体系,序列高度相似,并且在同一条通路上有相似功能的蛋白质被归为一组,然后打上KO(或K)标签。下面就首先来讲一下KEGG orthology。任找一个代谢通路图,在上方有pathway meue | payhway entry | Show(Hide) description | 这3个选项,点击pathwayentry, 出现了一个页面,这个随时被连接出来的页面相信大家一定再熟悉不过了。在这个页面中的pathway map项中点击按钮状的链接Ortholog table 。就进入了Ortholog table如下的页面:在这个表中,行与物种对应,3个字母都是相应物中的英文单词缩写,比如has 表示Homo sapiens,mcc表示Macaca mulatta;列就表示相应的Ortholog分类,比如K00844就表示生物体内的己糖激酶hexokinase 这一类序列和功能相似的蛋白质类(酶类)。如上图has后有3101,3098,3099这3个条目,它表示在人类细胞中中存在3中不同的己糖激酶,它们分别由以上这3

组数字代表的基因所编码,这3组数字应该是这3个基因的登录号。空白则表示在该物种中不存在这种酶。点击K00844则这一KO分类信息及成员列表都可显示出来;点击has则链接到物种(人类)基因组去了;点击P,则显示相应的代谢通路。下面我们点击3101,如下: 如上图,就是我们常见的一个页面,3101是KEGG中的基因ID(登录号),H.sapiens表示物种,然后是基因的名称,表达的酶,属于哪个KO分类以及参与哪些代谢途径;下面还有结构、序列信息等等。所以从Ortholog table 中可以很容易地知道一张代谢通路上有哪些KO分类(酶类),并且这些酶类的成员在各物种中分配存在的情况以及特定的名称。怎么看KEGG中代谢通路图比如以上这个图,方框一般就是酶,方框里面的5.4.2.2不是IP 而是EC编号;小圆圈代表代谢物,你把鼠标放上去,(别放我这上面,放KEGG中去)会出现C00668的东西,C代表compound,00668是这种化合物在KEGG中的编号,一般在KEGG中数据条目都是这样的,前面一个标志,后面一个五位数编号;大的圆方块,就表示是另一个代谢图了,所以就不展开了。但是:为什么这个图上有的小框框是绿色呢?(这是绿色吧?我蓝绿不分的,下同)因为这是一张特定物种(S. cere. 酿酒酵母)的代谢图,蓝色的框框表示专属于这个物种。在KEGG中有两种代谢图,一

数据库基本操作

例题解析 1、在Access的数据库对象中,不包括的是()。 A、表 B、窗体 C、向导 D、模块 2、关闭数据库的方法有()种。 A、2 B、3 C、4 D、5 3、数据库管理系统位于()。 A、硬件与操作系统之间 B、用户与操作系统之间 C、用户与硬件之间 D、操作系统与应用程序之间 4、打开Access数据库时,应打开扩展名为()的文件。 A、ACCDB B、MDB C、ACCDE D、DBF 典型试题 一、单项选择题 1、下列不属于Office系列办公应用程序套件的软件是()。 A、Access B、Word C、Excel D、SQL Sever 2、在Access2010数据库文件的默认的扩展名是()。 A、DOC B、DOT C、XLS D、ACCDB 3、Access2010关系数据库中包含()对象。 A、5 B、6 C、7 D、8 4、关于Access提供的两种创建数据库的方法描述正确的是()。 A、用模板比较简单快捷,也最为灵活 B、用模板比较麻烦,但最为灵活 C、先创建一个空数据库,再添加表、查询等比较简单快捷 D、先创建一个空数据库,再添加表、查询等比较麻烦但最为灵活 5、Access中表和数据库的关系是()。 A、一个数据库可以包含多个表 B、一个表只能包含两个数据库 C、一个表可以包含多个数据库 D、一个数据库只能包含一个表 6、在Access中,空数据库是指()。 A、没有基本表的数据库 B、没有窗体、报表的数据库 C、没有任何数据库对象的数据库 D、数据库中数据是空的 7、创建数据库有两种方法:第一种方法是先建立一个空数据库,然后向其中添加数据库对象,第二种方法是()。 A、使用“数据库视图” B、使用“数据库向导” C、使用“数据库模板” D、使用“数据库导入” 8、若使打开的数据库文件能为网上其他用户共享,但只能浏览数据,要选择打开数据库文件的方式为()。 A、以只读方式打开 B、以独占只读方式打开 C、以独占方式打开 D、打开 9、数据库文件打开的方式是()。 A、使用“文件”选项卡中的“打开”命令 B、“文件”选项卡的“最近使用文件”命令 C、在Windows资源管理器中,进入文件夹中用鼠标双击数据库文件 D、以上都可以 10、Access 2010是一个()系统。 A、人事管理 B、数据库 C、数据库管理 D、账务管理

SQL数据库使用说明

SQL数据库使用说明 一、安装SQL数据库之前,需先重启计算机。在安装过程中,必须先设定好登入的账号 和密码,账号一般默认为sa,密码由自己任意设定,设定好后记录下来。 二、安装完后,重启计算机。这时,打开SQL Server Management Studio运行程序,会出 现如下登录窗口: 这时在Authentication中选择SQL Server Authentication项,下面输入你安装时建立的账号和密码,就进入SQL数据库了,如下:

建立我们所需要的数据库就可以了。点击“Database”,右键选择New Database…:

在弹出的对话框中,输入你建立的数据库名称,输入所有者(最好为你登录SQL时的账号),点击“OK”就建立好了。 四、数据库建立完后,我们就可以关闭数据库了。这时,我们开始配置INTOUCH所连接 的数据库,首先在开始菜单中,打开Alarm DB Logger Manager应用程序,如下:

会弹出如下窗口: 点击设置,弹出如下窗口: 这时候,输入所在服务器名(注意自己修改计算机名),输入你所建立的数据库名称,输入登录数据库的用户名和密码,点击测试连接,如下:

如果显示“连接成功”说明数据库和INTOUCH已经连接可以使用了,如果显示“连接失败”则根据具体情况检查,比如:数据库名是不是正确,服务器名是不是正确,用户名和密码是不是正确。 然后在点击“创建”,创建“数据库表”,再点击“下一步”,直到“完成”: 五、配置完后,点击开始,将“Alarm DB Logger Manager”,缩小到右边任务栏中,注意: 不要关闭。然后,打开Intouch WindowMaker,找到历史报警窗口并打开:

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