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PubMed中文使用手册

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(一)PubMed简介:

PubMed是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开

发的、基于WWW的查询系统。

PubMed是NCBI Entrez 数个数据库查询系统下中的一个。

PubMed 是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他相关数据库接入服务,MEDLINE是一个拥有1亿字条的巨大数据库。

PubMed也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生

物学数据,序列中心的数据等等。

PubMed提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务,这个数据库归NCBI所有,其内容包括:DNA与蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线。

(二)页面介绍:(更新很快,但其内容变化一般不大)

在你的浏览器中的URL地址框中健入

https://www.sodocs.net/doc/b813153081.html,/pubmed/

并单击回车键后,你将进入Pubmed的主页面。如图:

1. 主页面左侧框的介绍(注:Cubby和tutorial为最新

加入的)

MeSh Browser你可以用它来分层浏览MesH表

Single Citation Matcher通过填表的形式输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。

Batch Citation Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。

Clinical Queries这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围:治疗、诊断、病原学与预后。

Old PubMed (使用以前的PubMed查询方式)

关于每一项的具体使用方法, 后面将会有详细介绍。

Related Resources

Order Documents提供一种收费性质服务,可以使用户在当地得到文献的全文拷贝(费用与发送方式各不相同)。

Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系统的链接。Grateful Med 也提供MEDLINE的接入,并且还有一些其他的数据库如AIDSLINE、HISTLINE等等。

Consumer Health提供与MEDLINE plus的链接,MEDLINE plus是与消费者健康信息相关的国家医学图书馆的网络节点。

Clinical Alerts此部分的目的是加快NIH资助的临床研究成果的发布。

2. 主页面底部的介绍

Disclaimer 在这里可以得到版权的相关信息,不承诺责任与担保的声明,与NLM下载的相关政策。

Write to the Help Desk发e-mail给NLM消费者服务部。

NCBI|NLM|NIH这里是对创建和维护PubMed的机构网页链接。

下面将举例说明查询的主体部分,也就是页面上部的使用方法。

假如我们这次的工作是查找与gallstone、pain有关的文献。

在对话框中输入查询词。比如我们这次输入的是gallstone pain,然后单击“go”按钮或按回车键,PubMed将会自动开始检索,并将检索到的相关条目显示在屏幕上。

你可以随时向查询框输入查询词,点击“go”按钮开始新的查询。“clear”按钮可以帮你清除查询框中的内容,然后开始一个新的查询。

在查询框前search提示后有一个下拉式菜单,你可

以在这里选择其他的信息资源或NCBI的数据库。

Structure 搜索分子结构数据库

(MMDB)The Molecular Modeling Database,这个数据

库保存的是由X线晶体成像、NMR分光光度法建立的三维

分子结构。

Genome 提供所有基因与染色体纪录与图片的查询服务,这个库中数以百万的基因序列是由庞大的基因排序工作得来的。

PopSet 这个数据库中的内容是由相关种族、人类发展、突变研究得来的人类进化与人种差异的结果。

下面我们将详细介绍查询结果屏幕。

Display Option(显示选项)

在Display后面有一个下拉式菜单,在这里可以选择各种显示选项。

Summary(简要格式):在缺省设置下PubMed采用这种显示格式,他所显示的内容包括以下几项:

作者:纪录中的所有作者都奖杯显示出来。

相关:列出相关内容,如文章、蛋白质、核苷酸等(列出的文章不以摘要格式显示)。

文章题目:英语以外的语种的题目将被翻译成英语,并且加上括号。

来源:提供文献所在期刊名的缩写,出版时间,卷,页数,也包括语种(针对非英语文献),出版类型。没有摘要的文献将显示

“No abstract available”

标识数字:提供PubMed标示(PMID)与MEDLINE唯一标识(UI)。

Brief(简报格式):显示的条目内容包括作者姓名、文献名的前10个字母、PubMed唯一标识。

Abstract(摘要格式):将会显示以下几项内容:文献题目、作者、第一作者单位(地址)、期刊来源(期刊名简写、出版日期、卷、页数)、如果必要加上标注、出版类型、非英语文章加上标注、摘要、备注、PubMed与MEDLINE的唯一标识。

Legend(图例格式):显示文献出处、名称、作者、第一作者单位(地址)、摘要、PubMed与MEDLINE的唯一标识。

Citation(引证格式):提供如下信息:文献出处、文献题目、作者、第一作者单位(地址)、如果必要加上标注、出版类型、摘要、红体显示题目中的错误字串、备注、MeSH词、人名作为主题、(如果存在)化学物质、(如果存在)巨大数字、PubMed与MEDLINE的唯一标识。

MEDLINE格式(MEDLINE):用两字符的形式显示MEDLINE纪录中所有的内容,使用这种格式可以把记录下载到管理书目的软件程序。

Retrieval Summary(查询概要):查询概要显示了查到所有条目的数量,以及需要多少页来显示,缺省情况下20条/页。

Show后的下拉式菜单可以选择相应得每页显示的条目数。

Page(选择页数):PubMed根据你的选择而显示不同页的内容,所选中的页数以红色显示,单击〉〉或〈〈显示其他页码。

Details(详细内容):

1)单击Details按钮可以显示你正在进行的查询方案,包括查询词、MeSH 表映射与PubMed词语索引的映射;错误信息,比如禁用词、截断警告、错误拼

写等;在编辑框中可以编辑一个新的查询方案,然后重新提交;在这里还可以保存查询方案。

2)你可以在Details的对话框中修改查询方案,然后点击“Search”按钮进行新的查询。

3)Result下的数字是查询结果,并且可以链接到现今的查询结果。PubMed 实际上是一个更大数据库PubRef的子集,PubMed的查询一般不包括PubRef中的条目,除非你在编辑框中将“AND notpubref[sb]”删除。

4)在Details中保存一个查询方案:单击URL按钮,PubMed将返回到查询结果窗口,经过修改的查询方案将显示在对话框中,并且查询方案也被嵌入URL 中,然后使用你的浏览器的书签功能将现在的URL保存成一个书签,保存后,可以编辑书签功能将此书签改为比较容易记忆的名字,使用方法与其他的书签相同。

5)定期查找功能:如果你想每隔一段时间进行一次同样的查询,以找到最新的文献,可以这样作:第一步如保存查询方案,通过选择书签的方式重新运行查询方案,然后,在Limit中的Entrezdate下拉菜单将时间限定在搜索范围。

Add to clipboard(加入剪切板)剪切板可以帮你保存察看你在一个或多个查询里所查到的内容;剪切板中最大的保存数目是500条;如果你连续在PubMed或其他Enterz数据库中不进行任何操作达1小时,剪切板中的内容将会消失。要将条目加入剪切板,先将所需要的条目前的复选框选中,然后单击“Add to clipboard”按钮,一旦你将一条内容加入剪切板,纪录数字的颜色将会改变。

Save(保存)功能是保存查询到的条目。如须保存所有的查询结果,先在Display下的下拉菜单中选择所需显示格式,单级“Save”按钮。如果要保存特定的条目,现在条目前的复选框选中,点击“Save”按钮。最大的保存的数量是5000,如果你想保存超过这个书目的内容,PubMed将显示一条提示你修改查询的信息。

Text(文本)使用文本功能可以将条目以纯文本的方式重新显示,把那些Web与HTML的内容去除,当看完纯文本的内容后,按浏览器的“Back”回到以前的Web页面。你可以使用此功能将PubMed侧框与按钮除掉,在用打印机打印。

纯文本版本将会显示你所选中的条目的内容,如果没有选中任何条目,所有的条目内容都江北显示出来。

Order(定购)通过一些中间商得到文献的全文。

3. 特征栏特征栏可以选择一些其他的功能

Limit

单击特征栏上的Limit显示Limit页,这里你可以设定:

i) 将搜索范围设定在一个特定的域。

ii) 将搜索范围设定在特定的年龄组、性别组、人类或动物学范围。

iii)也可以将搜索限定在某一语种出版的或某一特定的文章类型(如综述)。

iv) 设定只搜索包含摘要的文献。

v) 设定搜索Entrez数据库或Publication数据库。

vi) 设定搜索范围为PubMed数据库的某一子数据库(如

Abridged Index Medicus 或AIDS相关的条目)。

下面将逐一进行介绍:

Field Selection(域选择)你可以把搜索词限定在一个特定的域,缺省设置是所有的域;打开下拉菜单选择你所需的域名。

Only items with abstract(只搜索包含摘要的条目)如果将这个复选框选中,将只搜索包含摘要的文献。

Publication Type(出版类型)其后的下拉菜单是常用的出版类型列表。

Language(语言)

将近40种语言列在此菜单里,都是在搜索时经常用到的。

Age(年龄)选择人类学研究的年龄组。

Gender(性别)在此下拉菜单选择人类学研究的性别组。

Human or Animal(人类或动物)在此下拉菜单选择研究对象。

Subset(子集)你可以将自己的搜索限制在下列4个组中的一个条目处理阶段。

Publisher:出版商发送来的原样

PreMEDLINE:正要往MEDLINE中加入的纪录

MEDLINE:所有MeSH表索引的纪录主题词过滤

AIDS:NLM’S AIDS数据库期刊组

AIM:Abridged Index Medicus(120种英文期刊)

Dental:牙医学期看的子集

Nursing:护理学期刊的子集

PubRef:这是一项将搜索词范围扩大的服务,选择此项将会搜索更广范围的科学期刊(如物理、天文等)而不是限定在PubMed中,这个选项也可以帮用户搜索到出版商网址上的文献全文。

Date:(日期) PubMed 中包括自1966年来出版的文献,新条目周二到周四加入。在PubMed中有两种日期表示方式:Entrez日期是条目最初被加入PubMed 的日期,Publication(出版)日期是文献出版时的日期。PubMed已Entrez日期顺序来显示你的查询结果的,最新被加入的纪录第一个被显示出来。

Limiting by Date(日期限定)使用Entrez下拉式菜单,可以把你的搜索范围设定在30天到10年,出版日期下拉菜单有Publication Date 与Entrez Date两项,以确定使用那种日期记法来设定搜索范围。使用From、To 框输入一个时间段;以YYYY/MM/DD的格式输入日期(月和日可不填)Limit IndicatorLimit旁边的复选框如果处于选中状态则表示限定条件生效,如果开始搜索,生效的限定条件将会以黄色框Display按钮的上面。注意再进行其他搜索前将Limit前的复选框去掉,以消除限定条件。

Preview/Index(预览/索引)

使用特征栏的Preview/Index可以做到:

①在显示条目之前显示所查到的文献数。

②随时通过增加查询单词来修改查询方案。

③在特定的搜索域中向方案里加入查询词。

④从Index中查看并选择词语来修改查询方案。

⑤在你修改查询时查看方案。

下面将详细加以介绍:

Preview(预览):使用此功能可以在显示条目之前显示所查到的文献数。在输入框中键入搜索词,然后单击Preview,PubMed返回的信息是条目的数量。

通过增加一个或多个单词来修改查询方案。向查询框中加入另一个词语点击Preview,你可以继续向框中加入多个词语,点击Preview直到你希望得到的内容,当修改查询时可以看到搜索方案与查询结果的数量。Preview显示的是历史记录中最近的三条记录,使用History可以看到最近100次的查询结果。History 中的Clear History按钮也可以清除Preview/Index中的内容。

向下滚动Preview/Index找到“Add to Query or View Index”部分,使用下拉菜单确定一个搜索域,向文本框中加入词语,单击Preview,向查询框中加入词语并且可以看到查询结果。

现在我们向查询框中加入MeSH词Nurse,使用下拉菜单确定一个搜索域,向文本框中填加一个词,单击Preview,你可以一直这样加入单词,单击Preview,直到完成你的搜索方案。Preview自动使用“AND”运算符来将单词合为一体,即要求同时查询包含两个词的文献。

使用布尔运算符按钮。使用布尔运算符将你要查找的词语连接起来,OR代表的是要查找的文献包括第一个搜索词或第二个词,NOT为“否”,包括第一个搜索词而不包括第二个词的文献。每加入一个搜索词都要点击Preview来列出搜索结果的数量。

查询举例:

让我们查找一下有关碳水化合物(Carbohydrate)或大豆(Soybeans)对骨质疏松症影响的文献。使用下拉菜单确定一个搜索域,向文本框中加入一个词语,单击AND按钮,我们可以预览结果或者接续向文本框中填加搜索词,我们想找到有关Soybeans的文献,继续往下作,使用下拉菜单选择一个搜索域,向文本框中加入Soybeans,单击Preview来查看搜索结果。

Index(索引)中选择搜索词:使用索引按钮可以从特定域中选择以索引的单词,并把他们加入查询方案之中。Index(索引)中你可以查看某一个特定搜索域中词语列表。在这里也可以使用布尔运算符来建立一个查询方案。

举例说明:我们在下拉菜单中选择MeSH Terms作为搜索域,键入搜索词Strikes,点击Index按钮,PubMed以字母序显示所选定搜索域中相关的词语,使用滚动条来上下移动列表。在单词右边的括号里显示的是包括此词语的文献的数量。使用Up、Down按钮按页上下翻动列表。

对话框显示了搜索词与搜索域,Result显示了文献的数量。注意:Preview 缺省是AND将查询词语连在一起的。你可以使用布尔运算符按自己的要求将他们结合起来,但你在使用布尔运算符将查询词语输入对话框以后,必须点击Preview才能看到查询结果。

查询举例:

将以Legislation and Jurisprudence为副标题的Strikes Employs与以Statistics and numerical为副标题的Strikes Employs点击高亮显示,单击AND按钮将选择的查询词加入对话框,选择缺省的设置是以OR连接起来的。按住Ctrl键,可以在列表中连续选择多个查询词,当你所有需要的查询词都被高亮显示后,单击AND或OR将他们加入对话框,这时在PubMed的对话框中是这样的内容:“Strikes, employee/legislation and jurisprudence” [MeSH Terms] OR “Strikes, employee/statistics and numerical data” [MeSH Terms]”

让我们使用Index再把这次搜索修改一下,我们想把搜索缩小到有关Nurse 与已设内容范围,在输入框中键入Nurse后点击Index,在索引中选择Nurse并单击AND将其加入对话框中。点击Preview按钮查看查询结果的数量,对话框中显示的是搜索词、搜索域与布尔运算符。

History(历史记录)

历史记录中保存的是你所有的查询方案与查询结果,只有当你运行了一次查询之后,History中才有内容。History屏幕将会显示:你的查询方案、查询时间、查询到的文献数量。

使用History(历史记录)

你可以在查询方案中使用查询序数(the search Statement Number),如#1、#2、#3等等。

例子:#1 AND #2、#7 AND #14。

如上个例子显示的,布尔运算符的字母必须大写。

History的一些小知识:

a) History内所能记录的最大查询数是100

b)一旦查询数量超过100,PubMed会将最早的查询除去,加进最新的一次查询。

c) 如果两次查询内容相同,PubMed会将头一次的去除。

注意:查询序数不能用在Detail中的保存到URL功能中,这是因为尽管查询方案被保存了,但你的History在你1小时没有动作后将会消失,这时你保存的方案中的查询序号也就会失效。

点击Clear History可以将History中的所有内容清除。

Clipboard(剪切板)

剪切板可以帮助你保存或查看在一个后多个查询中选择的条目,然后就可以打印、保存、订购剪切板中的内容了。将条目左边的复选框选中,单击“Add to clipboard”就可以将其加入剪切板中,一旦某条被加入,剪切板的记录号码将会改变颜色。

剪切板使用的小知识

a) 如果你没有用复选框选择任何条目,而去点击Add to clipboard,PubMed将会向其中加入500个条目。

b)剪切板中最大的储存数是500条。

c) 剪切板中的内容如果你一小时没有任何操作将会消失。

使用剪切板

点击特征条上的Clipboard来观看剪切板中的内容,如果想删除剪切板中的某些项目,先将其左面的复选框选中,然后点击Remove from clipboard按钮;要想清空剪切板,不选任何条目,单击Remove from clipboard按钮。

保存剪切板中的内容,首先选择一种显示方式,选中你想要的条目(如果想

保存所有的条目,则哪个也不选),点击Save按钮。

Order(订购)在PubMed中查到的只是有关一篇文献的信息,而真正的文献全文是不提供的。PubMed的Order功能提供的就是通过一些中介机构来获得全文的服务,这项服务通常是收费的。

PubMed检索机制及规则

PubMed检索机制及规则 PubMed的检索功能非常强大,在检索中可实现检索词的自动转换、通配符的使用等功能,也可以进行强制性检索。 1 词汇的自动转换功能 在PubMed主页的检索提问框中输入检索词进行检索时,系统将按顺序自动使用如下3种索引,对检索词进行转换后再进行检索。 1.1 Mesh转换表(MeSH Translation Table) 包括MeSH词、参见词、副主题词、出版类型、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统(UMLS)、补充概念(物质)名称表等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其转换为相应的MeSH词(或其它词表中的词)和Text word词(题名词和文摘词),并用“OR”组配进行检索,同时停止使用其它的索引进行转换。有些词在转换后可能会出现3个词进行检索。例如:键入“blood",系统将其转换成"("blood"[MeSH Subheading] OR "blood"[MeSH Terms]) OR blood[Text Word]"后进行检索。 1.2 刊名转换表(Journal Tanslation Table) 包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN号。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其对应到相应的刊名进行检索。此外,该转换表能把键入的刊名全称转换为MEDLINE缩写后进行检索。如:在检索提问框中键入:“new england journal of medicine”,PubMed将其转换为“N Engl J Med”后进行检索。 1.3 著者索引(Author Index) 如果键入的词语未在上述各表中找到相匹配的词,或者键入的词是一个后面跟有1-2个字母的短语,PubMed 即会自动查找著者索引。
如果仍然查不到相匹配的词,PubMed就会把该词断开后再重复上述自动词汇转换过程,直到找到为止。假如仍然不能找到匹配的词,系统将把各单词用“and”连接,在全部字段中进行查找。 要查看词汇的转换情况,可点击“Details”进行查看。 2 截词检索功能 PubMed 允许使用“*”号作为通配符进行截词检索。如:键入“flavor*”,系统会找到那些前一部分是flavor 的单词(如flavored, flavorful, flavoring等),并对其分别进行检索。如果这类词少于600个,PubMed会逐个词检索,若超过600个(如:ca*),PubMed将显示警告信息,要求增加词汇的开头字母数量。截词功能只限于单词,对词组无效。如:“infection*”包括“infections”,但不包括“infection control”等。 注意:使用截词检索功能时,PubMed系统会自动关闭词汇转换功能。 3 强制检索功能 如上所述,在PubMed主页的检索提问框中键入一个短语后点击“Go”,系统会用自动转换功能查找到相应的匹配词后再进行检索;但是,当键入的词语无匹配词时,PubMed就会将键入的词语断开后再重复上述自动词汇转换过程,若仍然没有匹配词,系统就将短语分解成单词,再用AND联在一起在全部字段中检索。很明显,这样检索的结果是不符合用户要求的。因此,PubMed允许使用双引号(“”)来强制系统进行短语检索。例如,在PubMed主页的检索提问框中键入“Single cell”,并用双引号引起来,然后点击“Go”,系统会将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行检索。
使用双引号检索,会自动关闭词汇转换功能。

常用免费外文全文数据库

常用免费外文全文数据库 1.SpringerLINK数据库 德国施普林格(Springer-Verlag)是世界上著名的科技出版集团, 通过SpringerLink系统提供其学术期刊及电子图书的在线服务。2002年7月开始,Springer公司和EBSCO/Metapress 公司在国内开通了SpringerLink服务。 访问方式:镜像服务器(本校读者无需登录)、国外站点(用户需登录出国并自付国际网络通信费)。 访问权限:校园网IP地址范围。 访问全文:(PDF格式)需要使用Acrobat Reader软件,如需安装,可由此下载Acrobat Reader。 2.EBSCOhost数据库 EBSCO公司通过国际专线提供检索服务,校园网的用户检索、下载无需支付国际网络通信费。采用IP控制访问权限,不需要帐号和口令。 3.WorldSciNet数据库 WorldSciNet为新加坡世界科学出版社(World Scientific Publishing Co.)电子期刊发行网站,该出版社委托EBSCO / MetaPress 公司在清华大学图书馆建立了世界科学出版社全文电子期刊镜像站. 4.Ptics Express Optics Express由美国光学学会创办,刊登光学技术领域方面的报告和新进展。提供1997年创刊以来的全部文献,以平均49天一期的速度出版,并支持彩色图像和多媒体文件。 网站地址:https://www.sodocs.net/doc/b813153081.html,/ 创建者:Optical Society 0f America 5.New Journal 0f Physics New Journal 0fPhysics由英国皇家物理学会和德国物理学会出版,提供1998年创刊以来的全部文献。所有用户可免费获取电子版文章。 网站地址:https://www.sodocs.net/doc/b813153081.html, 创建者:Institute of Physics & German Physical Society 6.The Journal of Machine Learning Research The Journal of Machine Learning Research由麻省理工学院出版,是机械研究领域的优质学术性论文的平台,用户可下载2000年创刊以来的全部文章。 网站地址:https://www.sodocs.net/doc/b813153081.html,/ 创建者:MIT Press 7.Journal of Insect Science Journal of Insect Science由亚利桑那大学图书馆创办。它收集整理网上发布的有关昆虫生物学和节枝动物生态学的论文。可下载从2001年创刊至今的全部文献。 网站地址:https://www.sodocs.net/doc/b813153081.html,/ 创建者:Library of the University of Arizona 8.Geometry & Topology GTP:Geometry&Topology Publication是英国沃里克大学的数学系建立的,GT是国际化的数学类在线期刊,内容涉及几何学、拓扑学及其应用等领域。提供如下三种期刊的所有文献:Geometry&Topology(1997年创刊至今),Geometry&Topology Monographs(1998年

PubMed使用手册

PubMed使用手册 【基本查询方法】 ?一个检索词: 一个单词:在文本框中输入检索词,按GO查询。 含两个单词以上的检索词:需要加双引号,注意是英文输入状态下的双引号。 如:"ultrasonic diagnosis"是正确的,“ultrasonic diagnosis” 是错误的 ?两个以上的检索词:可使用AND、OR 连接各检索词。 如:"three dimensional ultrasound" AND thyroid ?可以在“limit”菜单下限制文献出版的时间、语种等等。 【完全手册】 PubMed 系统的主要特点 1.词汇自动转换功能(Automatic Term Mapping) 在PubMed主页的检索提问框中键入检索词,系统将按顺序使用如下4种表或索引,对检索词进行转换后再检索。 (1)MeSH转换表(MeSH Translation Table),包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord词(题名词和文摘

词)进行检索。例如:键入"Vitamin h",系统将其转换成"Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]"后进行检索。 (2)刊名转换表(Journal Tanslation Table),包括刊名全称、MEDLINE 形式的缩写和ISSN号。该转换表能把键入的刊名全称转换为"MEDLINE缩写[Journal Name]"后进行检索。如:在检索提问框中键入:"new england journal of medicine", PubMed将其转换为"N Engl J Med [Journal Name]"后进行检索。 (3)短语表(Phrase list)。该表中的短语来自MeSH、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统(UMLS: Unified Medical Language System)和补充概念(物质)名称表[Supplementary Concept (Substance) Name]。如果PubMed 系统在MeSH和刊名转换表中未发现与检索词相匹配的词,就会查找短词表。 (4)著者索引(Author Index)。如果键入的词语未在上述各表中找到相匹配的词,或者键入的词是一个后面跟有1~2个字母的短语,PubMed即查著者索引。如果仍然找不到匹配词,PubMed就会把该词断开后再重复上述自动词汇转换过程,直到找到与键入的词语相匹配词语为止。若仍然没有匹配词,单个词会被联一起(用AND)在全部字段中检索。如:"single cell",系统就会自动将其分成两个词:"single"和"cell"检索,其检索表达式为:"single AND cell"。要查验检索词的转换情况,可点击"Details"键。 2.截词检索功能

PubMed使用方法

PubMed检索完全攻略(1) 第一章进入PubMed魔法学校--PubMed概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上3,4个月时间,而你们现在……。"趁他打顿的时候,我告诉他,"快的话,可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如果我们失去PubMed,世界将会怎样。 尽管在因特网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点,正如它的名字(PubMed= Public+Medicine)所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入:https://www.sodocs.net/doc/b813153081.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说,喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH)的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯,不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢? PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代,通常而言,这已经足够早了,很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然,研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed挂钩

PubMed检索原理及途径

PubMed检索原理及途径 1. 检索原理 PubMed具有自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping)。对于输入检索框中的检索词,将按照一定的顺序进行对照、匹配和转换,然后再进行检索。其顺序是:MESH转换表、期刊刊名转换表、短语表、著者索引。此外,还可进行短语检索,即将短语作为一个词组进行检索,可用双引号将其引起,此时系统不进行自动转换匹配,也不进行MeSH词的扩检。 2. 检索途径 ⑴基本检索 PubMed的主界面有一个简单的提问词输入框及辅助工具栏,此外,其左侧栏还提供了几种检索功能:Journals Database , MeSH Database , Single Citation Matcher, Batch Citation Matcher, Clinical Queries, Special Queries, LinkOut, My NCBI (Cubby)。在提问框输入自由词或检索表达式(可直接进行字段限定),点击go 即可进行自由词检索。同样可结合辅助工具栏按钮,进一步检索。 Limits:限定检索。PubMed限制内容较多,可对字段、出版类型、年龄、性别、语言、出版年限、收录进Entrez年限、是否具备摘要、检索范围等进行限制。 History:检索历史。可自动将检索式及结果数量记录到History屏,结合#号进一步检索。#号间可以用布尔逻辑符组佩检索,如#1 AND #2。 例:查找2004年以来的有关胎盘生长(placenta growth)和氧气(oxygen)的英文文献 步骤:PubMed主页→点击limits,限定时间2004;语种为English→页面最下端点击go,在检索词输入框中,输入placenta gr owth AND oxygen→点击go→得到检索结果。 ⑵主题词检索 点击主页左侧栏MeSH Database,或从上面数据库PubMed下拉菜单中选中MeSH, 即可进入MESH检索界面。 输入提问词,点击go。如不是MeSH词,系统则提供相关概念供选择。 选择出现的MeSH词,可察看下面对该MeSH词的注释。 点击该主题词进入副主题词选择,选中需要的副主题词,也可点击进行加权、不扩展检索。 然后从屏幕上方或下方的display行Send to框的下拉菜单中选择发送地方及组配方式,如要检索,发送到Search Box中,在Search Box中将显示检索表达式,可进行修改和继续添加。 最后点击Search PubMed进行检索。

常用外文数据库介绍]

常用外文数据库介绍 SpringerLINK数据库 德国施普林格(Springer-Verlag)是世界上著名的科技出版集团, 通过SpringerLink系统提供其学术期刊及电子图书的在线服务。2002年7月开始,Springer公司和EBSCO/Metapress公司在国内开通了SpringerLink服务。 访问方式:镜像服务器(本校读者无需登录)、国外站点(用户需登录出国并自付国际网络通信费)。 访问权限:校园网IP地址范围。 访问全文:(PDF格式)需要使用Acrobat Reader软件,如需安装,可由此下载Acrobat Reader。 EBSCOhost数据库 EBSCO公司通过国际专线提供检索服务,校园网的用户检索、下载无需支付国际网络通信费。采用IP控制访问权限,不需要帐号和口令。 WorldSciNet数据库 WorldSciNet为新加坡世界科学出版社(World Scientific Publishing Co.)电子期刊发行网站,该出版社委托EBSCO / MetaPress 公司在清华大学图书馆建立了世界科学出版社全文电子期刊镜像站. Ptics Express Optics Express由美国光学学会创办,刊登光学技术领域方面的报告和新进展。提供1997年创刊以来的全部文献,以平均49天一期的速度出版,并支持彩色图像和多媒体文件。 网站地址:https://www.sodocs.net/doc/b813153081.html,/ 创建者:Optical Society 0f America New Journal 0f Physics New Journal 0fPhysics由英国皇家物理学会和德国物理学会出版,提供1998年创刊以来的全部文献。所有用户可免费获取电子版文章。 网站地址:https://www.sodocs.net/doc/b813153081.html, 创建者:Institute of Physics & German Physical Society

pubmed的使用方法

近年来,利用计算机进行文献检索已逐步代替传统的手工检索,随着Internet的普及,我们可以随时随地通过国际互联网来检索获得免费的医学文献,这是一条文献检索新捷径[1],特别是进行MEDLINE检索,既简单又实用[2]。现在有多个机构提供免费的网上MEDLINE检索服务,其中由美国国立医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)建立的PubMed数据更新快[3],检索系统完善,深受广大医务工作者和图书情报人员的欢迎。由于PubMed检索系统在不断完善和加强,要快速、全面、准确地在近4千种医学期刊、1千1百万条数据中检索出符合自己要求的资料[4],并不容易。下面介绍最新版本(2000年9月版)的PubMed使用方法。 1. 进入PubMed 在浏览器的地址栏内输入Pubmed的网址:https://www.sodocs.net/doc/b813153081.html,/PubMed/后按回车键,就进入PubMed的主页,开始检索。 2. 普通检索 在检索式提问框中输入一个或更多的词(例如:vitamin c common cold),然后按回车键或用鼠标点击"Go"按钮,PubMed就会利用"自动词语匹配"功能将重要的词或词组用"AND"组合在一起进行检索(见图1)。输入的词可以是自由词、主题词、或其他指定字段。由于主题词检索的文献更全面、更准确,应尽量使用主题词/副主题词检索。对于某些新的技术词汇、新药、新方法、新疾病等,还没有相应的主题词时,应该用自由词检索。 3. 高级检索 使用逻辑词AND, OR, NOT(例如:vitamin c OR zinc)、指定文献记录字段名称检索、使用医学主题词(MeSH)/副主题词组配格式检索,如neoplasms/diet therapy[mh]。不久返回检索结果,检索提问框仍出现在页面顶端,并显示您刚才输入的检索词。您可以在提问框内、点击"Details"或"Limits"按钮再修改检索词。 3.1 PubMed检索规则和语法 ①布尔运算符AND,OR,NOT必须大写,例如,vitamin c OR zinc; ②PubMed从左至右进行布尔运算。不过,你可以通过加圆括符改变运算顺

外文数据库的比较

Pubmed与MEDLINE的区别 专业:医学信息工程 姓名:黄彦东 学号:112524031 MEDLINE是一个数据库,是美国国立医学图书馆(The National Library of Medicine,NLM)生产的国际性综合生物医学信息书目数据库,是当前国际上最权威的生物医学文献数据库。内容包括美国《医学索引》(Index Medicus,IM)的全部内容和《牙科文献索引》(Index to Dental Literature)、《国际护理索引》(International Nursing Index)的部分内容,涉及基础医学、临床医学、环境医学、营养卫生、职业病学、卫生管理、医疗保健、微生物、药学、社会医学等领域。MEDLINE收录1966年以来世界70多个国家和地区出版的3400余种生物医学期刊的文献,近960万条记录。目前每年递增30-35万条记录,以题录和文摘形式进行报道,其中75%是英文文献,70%-80%文献有英文文摘。 PubMed是一个免费的搜索引擎,是NLM所属的国家生物技术信息中心(NCBI)于2000年4月开发的,基于WEB的生物医学信息检索系统(https://www.sodocs.net/doc/b813153081.html,/pubmed/),提供生物医学方面的论文搜寻以及摘要。它的数据库来源有:MEDLINE、OLDMEDLINE、Record in process、Record supplied by publisher 等,数据类型:期刊论文、综述以及与其他数据库链接。其核心主题为医学,但亦包括其他与医学相关的领域,像是护理学或者其他健康

学科。它同时也提供对于相关生物医学资讯上相当全面的支援,像是生化学与细胞生物学。PubMed的资讯并不包括期刊论文的全文,但可能提供指向全文提供者(付费或免费)的连结。 Pubmed与MEDLINE的异同比较 (1)文献的收录范围 MEDLINE是PubMed系统的最大组成部分。PubMed收录范围包括:①MEDLINE联机数据库;②PREMEDLINE数据库。PREMEDLINE收录那些进入MEDLINE数据库之前正在进行标引处理中的文献记录。这些文献在MEDLINE联机数据库中检索不到;③由出版商直接提供给PubMed 的文献。出版商提供给PubMed的文献,一些在后来进入了MEDLINE 数据库,而另外一些不MEDLINE数据库收录的文献则作为由出版商提供的记录被永久保留在PubMed数据库;④MEDLINE选择性收录期刊中的非生物医学文章和MEDLINE收录时间范围以外的文章;⑤来自于OLDMEDLINE数据库中的一些没有更新主题词的文献记录。与MEDLINE 联机数据库相比,PubMed收录的文献量大、类型全、专业范围广。(2)数据库的更新速度 MEDLINE联机数据库为周更新,而PubMed数据库每天接受来自于PREMEDLINE数据库中的新纪录,出版商则直接将期刊中的文章以电子版的形式提供给PubMed上网运行。所以,PubMed数据库更新速度快、文章新。 (3)检索机制

PubMed数据库与EMBASE数据库的比较

PubMed数据库与Embase数据库的比较 PubMed是一个免费的搜索引擎,是NLM所属的国家生物技术信息中心(NCBI)于2000年4月开发的,基于WEB的生物医学信息检索系统,它面向全世界免费提供最新的生物医学信息。每周5天更新数据,检索功能完善,使用方便。整合在NCBI的统一检索平台Entrez 上,与该平台其他数据库建立无缝链接,可实现跨库检索。PubMed 收录全世界80多个国家5200多种生物医学期刊的文摘及题录数据,绝大部分可回溯至1948年,最早回溯至1865年。累积了1900多万条文献记录,部分文献可直接获取全文,包括:PubMed Central (PMC,收录期刊780余种):NLM开发的免费生物医学数字化期刊全文数据库、开放获取(Open Access,OA)期刊、部分出版商提供的免费文献,与出版商的电子期刊文献同步发布,标注为[Epub ahead of print](先于印刷版期刊发表的电子文献)或Epub。MEDLINE——自1949年至今数据1400万余条,内容每周更新一次,内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和前临床科学等。In Process Citations ——1996年8月开始增加该数据库,只提供基本的引文信息和文摘,每天更新,经过标引以后进入MEDLINE,并从PreMEDLINE 中删除这些记录。Publisher Supplied Citation——接受出版商提供的文献数据,这种数据带有[MEDLINErecord in process]的说明。 Embase数据库全称Exceerpta Medica Database,由荷兰爱思唯尔公司出版,是印刷型检索工具Exceerpta Medica的电子版,也是最重要的生命科学文献书目型数据库之一。Embase收录从1974年以

pubmed数据库使用方法

pubmed数据库的使用方法 本文以 pubmed中的一篇文章 Inhibition of Notch pathway attenuates the progression of human immunodeficiency virus-associated nephropathy. 为例来说明pubmed数据库的使用方法。 在pubmed中检索到该篇文章后,网址是 https://www.sodocs.net/doc/b813153081.html,/pubmed/23389453 在页面左侧稍微靠上的地方,显示有该文章所属的期刊名字,如下图所示: 上图中棕色横线标注处显示的就是收录该文章的期刊的名字(是缩写),鼠标移动到该缩写的期刊名字上后,会弹出提示框显示该期刊的全名。棕色横线标注处同行的后边是这篇文章在该期刊中是哪一年的哪一期以及该文章的doi编号等信息。双击棕色横线标注处的链接,将可以查看该期刊的更多详细信息。 页面的右上角有时候会显示出该篇文章的全文获取链接,如下图所示:

在上图的棕色横线标注处,有时可以看到一个矩形的图标,那就是该篇文献的全文下载链接。点击该链接将来到收录该文章全文的期刊或者数据库的该篇文章的网络下载页面,例如该篇文献的网络下载页面如下图所示:

上图红色链接标注处出现了一个登陆框,要求进行登陆,这表明你没有下载该篇文献的权限。上图中绿色横线标注处是当你有此篇文献下载权限时,点击下载文献全文的位置。没有该篇文献全文下载权限的话,是无法下载到此文献的,如果您是通过seek68数字图书馆提供的pubmed入口来到此页面,则有很大机会直接就具有该篇文献的下载权限,如下图所示:

第四章文献检索常用外文数据库

医学信息检索练习题 主编:华北煤炭医学院医学信息检索教研室 第四章常用外文数据库 一、填空题 1.PubMed数据库中,Clipboard中的记录,可以保存_____小时 2.医学主题词表是______________________研制开发的。 3.MEDLINE的回溯期是_____年,它是一个型生物医学文献数据库。4.PubMed的检索原理中最主要的是。5.辨认题录,Feldman, DE; Spiess, C; Howard, DE; Frydman, J. Tumorigenic mutations in VHL disrupt folding in vivo by interfering with chaperonin binding. Molecular Cell. 2003;12(5):1213–1224. 该题录的期刊名称是。 二、判断题: ()1. OVID检索平台除提供MEDLINE数据库和期刊全文数据库的检索外,还能提供循证医学数据库的检索。 ()2. 在PubMed数据库中可以看到免费全文,因此,PubMed数据库是一个全文型数据库。 ()3. 在"MEDLINE with full text"数据库中,只能检索到文献的全文,不能看到文献的摘要。 ()4. PubMed Central(PMC)是NSTL研制开发的一个免费电子期刊全文数据库。 三、选择题 1. 在PubMed数据库中检索时,三个逻辑运算符在同一检索式中同时出现,其优先运算 顺序为 a. or>and>not b. 按照输入顺序运算 c. and>or>not d. not>and>or 2. 在PubMed数据库中检索期刊,可以输入期刊的 a. 刊名全称 b. 刊名的规范缩写 c. ISSN d. CN

PubMed检索完全讲解

PubMed检索完全攻略----好东西,吐血狂顶!2011-11-21 08:57阅读(4)转载 第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上3,4个月时间,而你们现在……。"趁他打顿的时候,我告诉他,"快的话,可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如果我们失去PubMed,世界将会怎样。 尽管在因特网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点,正如它的名字(PubMed=Public+Medicine)所暗示的, PubMed 是免费向公众开放的。无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入: https://www.sodocs.net/doc/b813153081.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说,喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH)的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯,不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢? PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代,通常而言,这已经足够早了,很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然,研究生物医

PubMed中文使用手册

PubMed中文使用手册 (一)PubMed简介: PubMed是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开 发的、基于WWW的查询系统。 PubMed是NCBI Entrez 数个数据库查询系统下中的一个。 PubMed 是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他相关数据库接入服务,MEDLINE是一个拥有1亿字条的巨大数据库。 PubMed也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生 物学数据,序列中心的数据等等。 PubMed提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务,这个数据库归NCBI所有,其内容包括:DNA与蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线。 (二)页面介绍:(更新很快,但其内容变化一般不大)

在你的浏览器中的URL地址框中健入 https://www.sodocs.net/doc/b813153081.html,/pubmed/ 并单击回车键后,你将进入Pubmed的主页面。如图: 1. 主页面左侧框的介绍(注:Cubby和tutorial为最新 加入的) MeSh Browser你可以用它来分层浏览MesH表 Single Citation Matcher通过填表的形式输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。 Batch Citation Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。 Clinical Queries这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围:治疗、诊断、病原学与预后。 Old PubMed (使用以前的PubMed查询方式) 关于每一项的具体使用方法, 后面将会有详细介绍。 Related Resources Order Documents提供一种收费性质服务,可以使用户在当地得到文献的全文拷贝(费用与发送方式各不相同)。 Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系统的链接。Grateful Med 也提供MEDLINE的接入,并且还有一些其他的数据库如AIDSLINE、HISTLINE等等。 Consumer Health提供与MEDLINE plus的链接,MEDLINE plus是与消费者健康信息相关的国家医学图书馆的网络节点。 Clinical Alerts此部分的目的是加快NIH资助的临床研究成果的发布。 2. 主页面底部的介绍 Disclaimer 在这里可以得到版权的相关信息,不承诺责任与担保的声明,与NLM下载的相关政策。 Write to the Help Desk发e-mail给NLM消费者服务部。

Pubmed检索攻略

PUBMED简介 一、何为PUBMED? PUBMED是美国国立卫生研究所(NIH)下属美国国立医学图书馆(NLM)开发的因特网检索系统,建立在国立生物医学信息中心(NCBI)平台上。PUBMED主要提供基于WEB的MEDLINE数据库检索服务,其中包括医学文献的定购、全文在线阅读的链接、专家信息的查询、期刊检索以及相关书籍的链接等。 二、PUBMED与图书馆光盘版本的MEDLINE有何不同? PUBMED与光盘版本MEDLINE的不同之处在于:由于互联网的及时性,PUBMED的更新速度快于光盘版,光盘版本的更新周期是3个月,而PUBMED的更新周期是1天,PUBMED包含了一些尚未收录入光盘版MEDLINE的最新文献信息,因此PUBMED享有PRE-MEDLINE的美誉。 三、如何进入PUBMED检索系统? 在浏览器地址栏中输入网址:https://www.sodocs.net/doc/b813153081.html,/pubmed/ 四、PUBMED主页的基本组成? PUBMED的检索系统大致由三个板块组成:页面上方的检索框和功能按钮(Limit、Preview/Index、History、Clipboard、Details)。在检索框"for"后面的空格中输入需要查询的关键词,点击"go"会出现相关的文献。每个功能按钮的具体功能下面会逐项介绍。左面的导航条指向PUBMED的一些其它功能板块,如MeSH Browser、Journal Browser等。剩下的右下方大片空间便是显示检索结果的空间。

五、PUBMED的主要功能按钮组成? PUBMED的主要功能按钮有五种:Limit按钮、Preview/Index按钮、History按钮、Clipboard按钮和Details按钮。 六、LIMIT 按钮的主要功能? 当点击Limit按钮,将出现以下界面: 各下拉框的基本作用如下: All Field:下拉可选择搜索的范围,如作者名、关键词等 Publication Types:下拉可选择所查文献的类型,如临床试验、荟萃分析等 Ages:下拉可选择所查文献研究对象的不同年龄组 Entrez Date:下拉可选择所查文献距离现在不同时间范围 Publication Date:下拉可选择限定所查文献发表日期 Language:下拉可选择所查文献的语种 Human or Animal:下拉可选择所查文献的研究对象:人或动物 Subset:下拉选择不同的医学网络系统,可查询特殊领域的文献AIDS, TOXICITY 七、Preview/Index按钮的功能? 点击Preview按钮,可以预览检索的结果,此预览功能使我们浏览结果前,先知道查询的结果数量,从而可估计是否有必要进一步修改检索式以缩小或扩大检索范围,避免每次因传输大量的无用数据而浪费时间。 Index按钮的功能则使我们在输入一个检索词之后知道这个检索词将导出多少篇文献,同时其特有的允

外文数据库PubMed检索实习题

外文数据库PubMed检索实习题 PubMed网址为:https://www.sodocs.net/doc/b813153081.html,/pubmed 要求: 1、请新建一个文档,以“班级-学号-姓名”格式命名保存。将答案 做在新建的文档里,标清楚题号。 2、完成后在第二周周一下午4点前由班长或学委统一打包压缩(文件名称为所在班级名称) 发送至397039098@https://www.sodocs.net/doc/b813153081.html,。 3、每题要求写出检索途径、检索式、检索的篇数,以及其中一篇相关文献的题录信息。 1、检索近5年来发表在BMJ杂志上的有关乳腺癌(breast cancer)方面的文献。 2、检索SARS(severe acute respiratory syndrome)流行病学(epidemiology)方面的文 献。 3、检索期刊J Allergy Clin Immunol近五年来收录的综述文献。 4、检索作者Bishop B.近5年来发表在J Biol Chem.期刊上的文献。请写出检索步骤。 5、检索1990年以来有关艾滋病(AIDS)方面的文献。 6、检索有关肺癌(lung cancer)与吸烟(smoke)的关系方面的文献。 1.检索途径:Text Word Publication Date Journal 检索式:((breast cancer[Text Word]) AND "2006"[Publication Date] : "2010"[Publication Date]) AND "BMJ "[Journal] 检索的篇数:Results: 1 to 20 of 75 相关文献的题录信息:Fall in breast density is linked with lower risk of breast cancer, studies say. Tanne JH. BMJ. 2010 Apr 27;340:c2285. doi: 10.1136/bmj.c2285. No abstract available. PMID: 20423970 [PubMed - in process]Related citations 2.检索途径:Title ALL FIELDS 检索式:(severe acute respiratory syndrome[Title]) AND epidemiology 检索的篇数:Results: 1 to 20 of 656

Pubmed全攻略使用教程

PubMed检索系统简介 PubMed系统是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)开发的用于检索MEDLINE、PreMED-LINE 数据库的网上检索系统。MEDLINE是美国国立医学图书馆(U.S.National Library of Medicine)最重要的书目文摘数据库,内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。收录了全世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊,现有书目文摘条目1000万余条,时间起自1966年。 PreMEDLINE是一个临时性医学文献数据库。它每天都在不断地接受新数据,可为用户提供基本的文献条目和文摘,其文献条目在标引和加工后每周向MEDLINE移加一次。 PubMed还通过电子通讯方式接受出版商提供的文献条目数据,这种条目带有[MEDLINE record in process]的说明,并标有[Record as supplied by publisher]的标识。这种条目每天都在不停地向PreMEDLINE数据库中传送,但其中有些条目由于超出了MEDLARS数据库的收录范围,将永远不会被PreMEDLINE或MEDLINE条目所取代,例如在综合性的科学杂志(Science 或Nature)上发表的地理学文章等。 PubMed 系统的主要特点 1.词汇自动转换功能(Automatic Term Mapping) 在PubMed主页的检索提问框中键入检索词,系统将按顺序使用如下4种表或索引,对检索词进行转换后再检索。 (1)MeSH转换表(MeSH Translation Table),包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord 词(题名词和文摘词)进行检索。例如:键入“Vitamin h",系统将其转换成"Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]"后进行检索。 (2)刊名转换表(Journal Tanslation Table),包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN 号。该转换表能把键入的刊名全称转换为“MEDLINE缩写[Journal Name]"后进行检索。如:在检索提问框中键入:“new england journal of medicine", PubMed将其转换为"N Engl J Med [Journal Name]"后进行检索。 (3)短语表(Phrase list)。该表中的短语来自MeSH、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统(UMLS: Unified Medical Language System)和补充概念(物质)名称表[Supplementary Concept (Substance) Name]。如果PubMed 系统在MeSH和刊名转换表中未发现与检索词相匹配的词,就会查找短词表。 (4)著者索引(Author Index)。如果键入的词语未在上述各表中找到相匹配的词,或者键入的词是一个后面跟有1~2个字母的短语,PubMed即查著者索引。如果仍然找不到匹配词,PubMed就会把该词断开后再重复上述自动词汇转换过程,直到找到与键入的词语相匹配词语为止。若仍然没有匹配词,单个词会被联一起(用AND)在全部字段中检索。 如:"single cell",系统就会自动将其分成两个词:“single“和“cell”检索,其检索表达式为:“single AND cell”。要查验检索词的转换情况,可点击“Details”键。

外文数据库预算约5万年

一、外文数据库预算:约4.5万/年。 参数:收录外文生物医学期刊共10000种以上,数据库每日更新与美国pubmed 同步。数据库使用不限并发数,同时在线使用人数不限制,不限使用量。 使用方式外网访问,支持电脑端和手机端。全文保证率95%以上,其他详细参数如下: (1)检索平台收录学科(专业领域)不少于120个,收录各学科期刊总数不少于20000种,数据库可检索到最新的电子优先(Epub ahead of print)文献,也可检索到上世纪六十年代以来的文献,文献量不少于2400万篇。且合同年度内不限量。(2)检索平台能同时在手机端及电脑端检索使用,并且两种检索一致。另外能够提供丰富的检索模式,包括自由词检索、主题词检索、高级检索、联想检索、二次检索、临床查询检索、字段限定检索、逻辑组合检索等,并能在检索结果中揭示与临床相关的循证医学文献,并能方便的查看系统综述、荟萃分析、随机对照试验、F1000等文献;(3)检索平台能够提供投稿指南功能,用户可以根据拟投稿论文的内容(即关键词)选择最佳的拟投稿期刊,也可以按科目浏览和选择期刊,并能提供最佳拟投稿期刊的官方网站以及投稿须知等。(4)数据库能够提供强大的数据分析功能,至少包括高IF论文分析、高TC论文分析以及统计分析(作者、期刊、年份、国家)等;数据库并能提供多方位的过滤分析功能,至少包括影响因子(IF)过滤、文献被引用次数(TC)过滤及分区过滤等;并可以在检索结果界面查看部分文献的参考文献和被引文献列表。(5)数据库能够提供指纹共词矩阵分析功能,对反映文献主题内容的主题词的共现频次进行统计分析,揭示文献内在联系、研究热点和科学结构,并可以将各组共献主题词随时间的演进显示出来。(6)数据库能够提供文献管理功能,能对读者个人申请的文献在系统中进行保存和分类,最大保存数量不少于10000篇,最大文件夹数不少于100个。(7)提供循证医学临床参考数据库,具备专业的PICO检索以及自由词检索,提供简洁而准确的TBL,并可自动过滤或屏蔽DOEs文献以及学术不端或有问题的文献等。(8)提供平台内嵌文献管理工具,不需要将文献发送到邮箱接收。 付款方式:正式签合同使用后付款50%,使用半年后付款50%。

PubMed数据库

PubMed数据库 一.检索Genbacev O 等撰写的关于“胎盘氧张与胎儿生长的关系”的文章。要求写出:①第一篇文章的原文出处,②第一篇原文后附第一篇参考文献中的第一作者的姓名。操作步骤:1.在地址栏中输入https://www.sodocs.net/doc/b813153081.html,/pubmed,进入PubMed 2.在检索栏中输入 placenta growth oxygen genbacev o,点击Go 3.点击题录中作者姓名如: Genbacev O,得到文摘,点击出处下方免费获取全文(free text article)红色按钮。 4.在原文最后找到Reference(参考文献),得到第一篇作者姓名。 二.用MeSH Database 检索肾衰竭饮食疗法的文献。要求:第一作者Rao M的工作单位及E-mail 地址。操作步骤: 1.进入PubMed主页,点击主页左侧中MeSH Database,进入MeSH Database网页 2.在检索栏中输入renal failure, 点击Go 3.在主题词注释页中,点击kidney failure。

4. 选副主题词(subheadings) 中的diet therapy (饮食疗法),选择send to下的Search Box with AND。 5.在返回结果页的检索框中"Kidney Failure/diet therapy"[MESH]后输入Rao M,点击PubMed Search。 三.查找Challis DE作为第一作者发表于Pediatric Research 2000,47(3):309-15上的论文, 并写出其他合著者。操作步骤: 1. 进入PubMed主页,在主页的左侧栏中点击Single Citation Matcher。 2. 按要求输入著者、刊名、卷、年等信息,点击search 按钮。 基因序列获取与同源性对比 一.用NCBI查找人类抗癌基因(human antioncogene)的核酸序列报告,要求:写出序列号和 碱基数,并拷贝原序列(Origen)。操作步骤: 1.进入https://www.sodocs.net/doc/b813153081.html,/entrez,选择Nucleotide 核酸序列库 2.输入human antioncogene 点击Go

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