Lammps单机并行安装

Lammps单机并行安装

第一步：

在Unix操作系统下打开计算机终端，下面在终端里操作。

进入根目录（root）：

su //enter

xjtu02 //password (根据个人电脑而异，一般密码为：000000)

cd /home //enter

cd sun/lammps //enter

第二步：

安装fftw

1解压fftw

2cd fftw-2.1.5/ //enter

3./configure --prefix=/usr/local/fftw215 //enter

4make //enter

5make install //enter

第三步：

安装mpich2

1解压mpich2

2cd mpich2-1.2.1p1/ //enter

3./configure --prefix=/usr/local/mpich2 //enter

4make //enter

5make install //enter

6exit //enter

7su //enter

8xjtu02 //password (根据个人电脑而异，一般密码为：000000)

9gedit /etc/profile //enter

10弹出一个文件，将“export PATH=/usr/local/mpich2/bin:$PATH”添加到文件内容最后面，保存后将文件关闭

11exit //enter

第四步：

1 cd/home/sun(用户名) //enter

2 touch .mpd.conf //enter

3 chmod 600 .mpd.conf //enter

4gedit .mpd.conf //enter

5 弹出一个文件，将“MPD_SECRETWORD=mr45-j9z”添加到文件内容中，保存后将文件关闭

6重新启动

7 cd /usr/local/mpich2/bin //enter

8 which mpd //enter

9 which mpicc //enter

10 which mpiexec //enter

11 which mpirun //enter

12 mpd & //enter

13 cd mpich2/examples/(测试计算，13、14步可省略) //enter

14 mpiexec -n 4 /cpi //enter

第五步：

Lammps安装

1 cd lammps //enter

2 tar xvzf lammps.tar.gz //enter

3 cd lammps** //enter

4 cd src //enter

5将makefile.fedora文件复制到src/make文件中

6 make fedora(在src目录下生成lmp_fedora) //enter

第六步：

运行lammps

1 cd ../bench //enter

2 mpiexec -n 4 ./lmp_fedora

备注：在安装lammps过程中，需要安装gcc(C语言)和g++（C++语言）来完成编译，安装程序：

1 ls //enter

2 yum install gcc //enter

(完整word版)lammps初学者in文件中文解析

Lammps初学者——in文件中文解析 （1）初始化 Units： Units命令是用来设定模拟的原子类型。 Units style（lammps现在提供的有style=LJ、real、metal、si、cgs、electron）LJ是硬球模型 Real是真实的原子模型 Metal是金属原子模型 Si是硅（半导体）原子模型 Cgs Electron是电子模型 Dimension： Dimension命令是用来定义模拟的维度，默认情况为三维。 Dimension N （N=2，3） Boundary： Boundary命令是用来设定模拟的边界条件。 Boundary x y z （x，y，z=p，s，f，m四种类型中的一种或者两种） P是周期性边界条件 S是自由边界条件（但是具有收缩性） F是固定边界条件 M是具有最小值的自由边界条件（但是具有收缩性）

Atom-style： Atom-style定义了模拟体系中的原子属性。 Delete-atoms： Pair-style： Pair-style定义了相互作用力场类型，即势函数。 （2）原子定义 1、 Read-data/read-restart： Read-data或read-restart为从data或restart文件中读取内容来定义原子。2、 Lattice： lattice是用来原子类型构建模型晶格结构。 Lattice style scale keyword values... Style表示点阵类型，点阵类型有none、sc、bcc、fcc、hcp、diamond、sq、sq2、hex、custom。 Scale表示构建的点阵类型的单位长度 Keyword表示后面可以追加0个或者多个关键字，关键字有origin、orient、spacing、a1、a2、a3、basis。 各关键字意思为： Region： Create-box：

电磁门吸工作原理和安装方法

电磁门吸工作原理和安装方法 门吸是我们生活中一个非常不起眼的五金小配件，很多人会忽略这一个细节。今天要和大家来说说电磁门吸，这种门吸常常是和防火门一起使用，又被称为常开防火门电磁门吸。下面我们就来看看到底电磁门吸是什么以及电磁门吸的工作原理和安装方法。 什么是电磁门吸： 电磁门吸就是一种用于自动门的电磁铁，是采用电磁原理产生吸力的门体定位装置，又称为电子门吸。由于其机械结构简单、电磁原理可靠、低压微电流工作，因而其使用寿命可达几十年甚至上百年，与采用永磁铁的普通门吸手控特点不同，它需要提供直流DC24V才能工作，可以现场手控和远程电控，所以被广泛应用于建筑智能门控设施中，目前电磁门吸主要用于建筑物中的防火门，并且必须通过国家消防中心检测合格。 电磁门吸工作原理： 电磁门吸主要有磁铁主体(安装在墙上)、吸板(安装在门扇上)、安装底座或支架三部分组成，带有释放按钮和缓冲垫。电磁门吸的工作原理是由电流转化产生电磁力，吸附住安装固定在防火门背后的

吸板，牢牢地吸住大门，使大门不能关闭，保证消防通道畅通。比如，电磁门吸与防火门控制器组成的常开防火门释放装置，它具有使防火门平时保持常开，火灾时能自动关闭的功能，实现“断电关门”，平时可由市电供电，不占用有限的消防电源资源，不增加消防供电设备与回路成本，发生火灾时正好切断市电供电实现自动关闭，从而保证了平时消防通道的畅通性，火灾时，更好的实现防火门“隔烟阻火”的功效，从而保证了人员及财物的安全性。 电磁门吸分类： 电磁门吸根据不同的安装方式，可以分为墙式、地式、链式三类，地式电磁门吸由墙式电磁门吸和直角地面安装支架组成，链式电磁门吸由墙式电磁门吸和链条扣件组成。一般墙式门吸适用于门扇在最大开启角度时离墙面的距离很近的情况，地式电磁门吸则适用于门扇在开启后背后无墙因而无法使用墙式的情况。链式门吸就比较适合用于门扇在开启后背后有墙但距离较远的情况。所以选择门吸种类的时候，应该根据门与墙之间的距离累确定使用哪一款。 电磁门吸的安装方法： 首先，我们要确定门吸的安装方式以及选择一款合适的门吸产品，之后在门和墙上选择合适的安装位置，然后将吸板正面与电磁体正面对正贴合，不要留有缝隙，否则会影响磁力。再然后，将不干胶贴纸撕下，贴在吸板的背面，将吸板正面与电磁体正面对正贴合，

lammps初学者in文件中文解析.doc

Lammps初学者——in文件中文解析（1）初始化 Units： Units命令是用来设定模拟的原子类型。 Units style（lammps现在提供的有style=LJ、real、metal、si、cgs、electron） LJ是硬球模型 Real是真实的原子模型 Metal是金属原子模型 Si是硅（半导体）原子模型 Cgs Electron是电子模型 Dimension： Dimension命令是用来定义模拟的维度,默认情况为三维。 Dimension N （N=2,3） Boundary： Boundary命令是用来设定模拟的边界条件。 Boundary x y z （x,y,z=p,s,f,m四种类型中的一种或者两种） P是周期性边界条件 S是自由边界条件（但是具有收缩性） F是固定边界条件 M是具有最小值的自由边界条件（但是具有收缩性） Atom-style： Atom-style定义了模拟体系中的原子属性。 Delete-atoms： Pair-style： Pair-style定义了相互作用力场类型,即势函数。 （2）原子定义 1、 Read-data/read-restart： Read-data或read-restart为从data或restart文件中读取内容来定义原子。 2、 Lattice： lattice是用来原子类型构建模型晶格结构。

Lattice style scale keyword values... Style表示点阵类型,点阵类型有none、sc、bcc、fcc、hcp、diamond、sq、sq2、hex、custom。 Scale表示构建的点阵类型的单位长度 Keyword表示后面可以追加0个或者多个关键字,关键字有origin、orient、spacing、a1、a2、a3、basis。 各关键字意思为： Region： Create-box： Create-box命令用于在region box命令指定的区域内创建一个模拟的盒子。 Create_box N region-ID N为使用该原子类型进行模拟 Region-ID为使用区域的ID使用模拟域 Create-atoms： Create-atoms用于在所创建的模拟的盒子中填充某种原子。 Create_atoms type style args keyword values ... （3）设定： 力场系数 Pair-coeff： 模拟参数 Neighbor Neighbor是定义 Neighbor skin style Skin为 Style可取bin、nsq、multi Neighbor-modify： Group： Timestep： Timestep是定义模拟的时间步长。 Timestep dt Dt为时间步长（时间单位）,默认为1ps Reset-timestep： Fix

lammps实例(3)

Project #1 硅的晶格常数和体弹模量的计算 一、平衡晶格常数和内聚能 自然条件下硅为金刚石结构(dc )。计算模拟时，我们可以假定它为各种结构，f cc, bcc, sc, dc. 可以预测，模拟的dc 结构的硅的体系能量最低，也即最稳定。下面我们将运用LAMMPS 来对硅的各种结构进行模拟。 定义晶格能量为Φ， 数密度为 ρ： pot E N Φ= N V ρ= 其中E pot 为势能， N 为体系总原子数，V 为体系的体积。选取 Stillinger-Weber (SW)，以下面命令执行 lammps 运算： 其中，lmp_serial 为 lammps 命令；”<” 符号为读取符；in.Silicon 为输入文件，里面包含运算所需要的各种数据和命令；-log 指定输出文件的名称。 可以看到屏幕上显示出lammps 运行的信息。这个计算量很小，所以很快就结束。接下来以如下命令来查看计算得到的数据： grep 是linux 中一个很重要的命令，用来搜索文本，读取匹配的行并打印出来。这里是搜索 dc.log 文件，将 @ 开头的行打印出来。如下： 晶格参数为5.4305埃,数密度为0.0499540303，每个原子的能量为-4.336599609eV.

下面具体来看刚才给的输入文件，in.Silicon . dc.log 文件中有原子总数的信息， 每个金刚石晶胞中有8个原子，383216?=，所以是216个原子。如下给出各种结构下的体系的原子数：

晶体结构类型 晶胞中的原子数 总原子数 简单立方SC 1 27 体心立方BCC 2 54 面心立方FCC 4 108 金刚石DC 8 216 表1. 不同晶体结构中的原子数 下图是计算模拟得出的各种结构下的数密度与每个原子能量的关系图。 横坐标为数密度， 以金刚石为例，ρ= 8/5.4315^3=0.049926，也即我们直接通过 grep 命令得到的第二项值；纵坐标为每个原子的能量，为第三项值。 金刚石之外，还需计算其他结构。只需对 in.Silicon 做稍微改动： 首先，将in.Silicon 复制成in.fcc : 然后编辑 in. fcc 改动如下几项： 然后如下命令执行： 相应的，如下命令查看log 文件中的数据：

LAMMPS in文件注意事项及详细解释

LAMMPS in文件注意事项及详细解释 lammps做分子动力学模拟时，需要一个输入文件（input script），也就是in文件，以及关于体系的原子坐标之类的信息的文件（data file）。lammps在执行计算的时候，从这个in文件中读入命令，所以对LAMMPS的使用最主要的就是对in文件的编写和使用。 下面介绍一些关于in文件的事项： 1.每一非空行都被认为是一条命令（大小写敏感，但极少有命令或参数大写的）。 2.in文件中各命令的顺序可能会对计算产生影响，但大部分情况下不会有影响。 3.每行后的“&” 表示续行（类似fortran）。 4.“#”表示注释（类似bash）。 5.每行命令中的不同字段由空格或者制表符分隔开来，每个字段可以由字母、数字、下划 线、或标点符号构成。 6.每行命令中第一个字段表示命令名，之后的字段都是相关的参数。 7.很多命令都是在需要修改默认值的情况下才特别设置的。 in文件整体来看分为4个部分 1.Initialization 这一部分包含了关于计算体系最基本的信息，例如： units: 单位系统(units style)，lammps现在提供包括lj、real、metal、si和cgs几种单位系统。 dimension: 定义了两维或者三维模拟（默认是三维）。 boundary: 定义了分子动力学体系使用的边界条件，例如周期性边界条件或者自由边界条件等。 atom_style: 定义模拟体系中的原子属性，这一命令与力场设置的参数中的原子类型（atom type）不同。 pair_style: 相互作用力场类型，例如范德化势或者硬球势等。 bond_style: 键合相互作用势类型。 angle_style: 键角作用势类型。 dihedral_style: 二面角作用势类型。 improper_style: 混合作用势类型。 其他还有一些参数设置，例如newton, processors,boundary, atom_modify等。 2.Atom definition lammps提供3种定义原子方式： 通过read_data或read_restart命令从data或restart文件读入，这些文件可以包含分子拓扑结构信息，这一方法在续算上也很有用。 按照晶格的方式创建原子，这种方式不包含分子拓扑信息，可能会用到例如如下的一些命令：lattice, region, create_box, create_atoms。 对已经设置好的原子可以用replicate命令复制后生成一个更大规模的计算体系。 3.Settings 原子或分子的拓扑信息定义好后，就需要制定一系列的设置，例如力场系数、模拟参数、输出选项等。 力场系数可以通过例如这样的一些命令来定义：pair_coeff, bond_coeff, angle_coeff, dihedral_coeff, improper_coeff, kspace_style, dielectric, special_bonds

木门安装说明指导书指导手册图文介绍(附图)

木门安装指南 一、门洞的测量方式 1．门洞的高度：垂直测量门洞上端至地板完成面的距离（若未铺装地板，则必须预留出地面铺装材料的厚度尺寸），选取左右两端两个点进行测量；取其中最小值为门洞的高度尺寸； 2、门洞的宽度：水平测量门洞左右的距离，选取三个以上的点进行测量，取其中最小值为门洞的宽度尺寸。 3、门洞墙体厚度：水平测量墙体厚度，左右各取三个以上的点进行测量；取其中最大值加最小值除以2即为墙体厚度尺寸；若最大值与最小值相差20mm以上，则应修正墙体偏差，达到规定值，如果墙面需要装修，则门洞墙体厚度应附加装饰材料完成面的厚度。 二、安装条件 1、必须采用预留洞口的安装方法，严禁边安装边砌口做法。 2、须在门口地面工程(如地砖、石材)安装完毕后，方可进行安装作业，若遇墙体潮湿应用隔潮材料隔离。

三、安装工具电锤、木头榔头、平锉、边刨、细齿锯(钢锯)、螺丝刀、角尺、卷尺、吊线锤、电钻、开孔器、戳子、相应规格钻头。 四、安装材料自攻螺丝、木牙螺丝、发泡胶、毛巾、小木条、胶水、门锁、合页、门吸、墙体隔潮材料。 五、安装前的准备 1、门扇、门套运到安装现场后，应把门扇、门套、用垫板或木枋纵向垫平放开放置，若需靠墙放置，倾角不得大于15度。 2、若不能及时安装，严禁与酸碱物一起存放，更勿在其产品上放置重物，室内应干燥、通风，并与热源隔开，以免受热变形。 3、检查现场情况，整理并清洁好工作区域，检查门洞或门套的预留尺寸是否符合设计要求。 4、确认安装尺寸、产品型号、清点产品及配件。 5、准备安装工具，详细阅读安装说明书。

六、安装步骤 1、把门套各个部分进行模拟组合，调整门套固定部位的垂直和水平位置，用自攻钉或直钉将其固定。 2、把整体门套置入洞口校正，在门套左右顶端与洞口处用斜型木块嵌入，将其左右竖套板与地面紧密配合。 3、门套两面要与墙体在同一平面上，然后检查门套整体与地面是否垂直，门套顶板与

LAMMPS手册-中文版讲解

L A M M P S手册-中文版 讲解 https://www.sodocs.net/doc/cc17209483.html,work Information Technology Company.2020YEAR

LAMMPS手册-中文解析 一、简介 本部分大至介绍了LAMMPS的一些功能和缺陷。 1．什么是LAMMPS? 2． LAMMPS是一个经典的分子动力学代码，他可以模拟液体中的粒子，固体和汽体的系综。他可以采用不同的力场和边界条件来模拟全原子，聚合物，生物，金属，粒状和粗料化体系。LAMMPS可以计算的体系小至几个粒子，大到上百万甚至是上亿个粒子。 LAMMPS可以在单个处理器的台式机和笔记本本上运行且有较高的计算效率，但是它是专门为并行计算机设计的。他可以在任何一个按装了C++编译器和MPI的平台上运算，这其中当然包括分布式和共享式并行机和Beowulf型的集群机。 LAMMPS是一可以修改和扩展的计算程序，比如，可以加上一些新的力场，原子模型，边界条件和诊断功能等。 通常意义上来讲，LAMMPS是根据不同的边界条件和初始条件对通过短程和长程力相互作用的分子，原子和宏观粒子集合对它们的牛顿运动方程进行积分。高效率计算的LAMMPS通过采用相邻清单来跟踪他们邻近的粒子。这些清单是根据粒子间的短程互拆力的大小进行优化过的，目的是防止局部粒子密度过高。在并行机上，LAMMPS采用的是空间分解技术来分配模拟的区域，把整个模拟空间分成较小的三维小空间，其中每一个小空间可以分配在一个处理器上。各个处理器之间相互通信并且存储每一个小空间边界上的”ghost”原子的信息。LAMMPS(并行情况)在模拟3维矩行盒子并且具有近均一密度的体系时效率最高。 3．L AMMPS的功能 总体功能： 可以串行和并行计算 分布式MPI策略 模拟空间的分解并行机制 开源 高移植性C++语言编写 MPI和单处理器串行FFT的可选性（自定义） 可以方便的为之扩展上新特征和功能 只需一个输入脚本就可运行 有定义和使用变量和方程完备语法规则 在运行过程中循环的控制都有严格的规则

lammps实例(4)

Project #2 金属中的点缺陷：空位和间隙原子 一、空位 从晶体中移去一个原子，即可形成空位。本例将运用 LAMMPS 计算空位形成能, E v. LAMMPS 输入文件为in.vacancy 1) 在 fcc 结构的完整Cu晶体中引入一个空位 沿<100>方向构造一个 4 ×N×N×N 的晶体。N为input 文件中lattice命令指定的个方向上的晶胞重复单元数。 2) 弛豫 当一个原子从晶体中移走之后，周围的原子将相应地调整位置以降低体系势能。为得到稳定的构型，需要对体系进行弛豫，relaxation. LAMMPS提供两种能量最小化方式，cg 和 sd。本例中选用 sd 方式进行能量最小化。 如下是输入文件，in.vacancy:

3) 运行lammps 4) 计算空位形成能 空位浓度由下式给出： [n ] = exp( ? F v / k B T ). 其中 F v = E v ? TS v 为形成一个空位所需要的Helmholtz 自由能. 忽略熵S v , 空位浓度公式简化为 [n ] = exp( ?E v / k B T ). 设 E 1 为完整晶体能量，含N 个原子；E 2 为弛豫后的晶体能量，含N – 1个原子。空位形成能 E v 为： 211v N E E E N -≡- 或 ()21v coh E E N E ≡--, 其中 E coh = E 1 / N , 为完整晶体的内聚能。 本例中以EAM 模型计算4×(20×20×20)=32000个原子的体系，得到空位形成能E v ~ 1.26 eV ，文献中的实验值为~1.28 eV ，符合较好。 另由上式计算得到，300K 温度下的空位浓度为~ 7.59×10-22 ，1350 K (T m ) 时的空位浓度~ 2.2×10-5（文献中的实验值为~2×10-4 ）。换算时注意(1 eV/k B = 1.1604×10?4 K) 图1. 空位处于4×(6×6×6) 的 FCC 晶体中心，106c a =,206c a =,306c a =. 颜色依据原子势能标注。

木门安装工艺流程图

木门安装工艺流程图 说明： 1 、现场质检：产品运到现场放置于安装位置时，由安装队负责人、设计人员及安装师共同对门的状况进行检验，确认无误后方可进行安装； 2 、门套组装：按照门扇及洞口尺寸在铺有保护垫或光滑洁净的地面进行门套组装； 3 、配件定位：按照标准、设计或订购方要求确定合页、门锁的位置，进行开槽打孔；标准门合页为每扇三个，门锁中心距门扇底边距离： 900mm__1000mm ； 4 、复核洞口：确定洞口的尺寸偏差是否影响安装或有否改动； 5 、临时固定门套：将门套放予门洞口内，用木楔进行临时固定，临时固定点主要为门套左右两上角位置； 6 、安装门扇：将门扇与门套用合页连接固定； 7 、调整：运用木撑或专用工具在门套内侧进行横向和竖向支撑，进行门扇边缝等细部调整；运用垂线及其他工具进行垂直度调整， 8 、胶结固定：使用发泡胶结材料对已调整标准的成套门进行最终固定，将发泡胶注入门套与墙体之间的结构空隙内，填充密实度达百分之八十五以上；在四小时内不得有外力影响，以免发生改变；

9 、锁具安装； 10 、门脸线安装；在发泡胶结材料注入四小时以后，进行门脸线的安装； 11 、密封条安装； 12 、安装验收：分自检和甲方验收两部分，在自检合格后由甲方进行最后验收。

木门安装详细要求与工艺说明 木门安装流程示意图 一、安装条件 1、木门必须采用预留洞口的安装方法，严禁边安装边砌口做法。 2、木门须在门口地面工程（如地砖、石材）安装完毕后，同时在墙面乳胶漆作业最后一道工序之前，方可进行安装作业，若遇墙体潮湿应用隔潮材料隔离。 二、安装工具 电锤、木工榔头、平锉、边刨、细齿锯（钢锯）、螺丝刀、角尺、卷尺、吊线锤、电钻、开孔器、戳子、相应规格钻头。 三、安装材料 60铁钉、自攻螺丝（40、25）、502胶、毛巾、木钉、小木条、发泡胶、地板胶、门锁、合页、门吸、墙体隔潮材料。 四、安装程序 首先检查门各部件是否齐全，各部件尺寸是否正确，分配各套门到相应安装的位置是否与门洞尺寸相符。 1、装门套 （1）组合门套板：根据墙的厚度，调整好相应的门套板宽度，在门套板背面用25mm自攻螺丝将采口板和调节板紧固，螺丝之间的间距≤250mm，组合好后采口板与调节板间隙应小于0.2mm。 （1）锯立套板顶端组装缺口： ①先将组装好的立套板顶端锯成同一平面，且与立套板成90度直角。 ②在立套板的顶部锯凹口，凹口位置及尺寸应刚好合符。顶套板凸出的挡门块部份，要求切口必须平直，用平锉打磨光滑、平整、不能有毛口边。 （2）门套顶板与立板组合，将顶套板盖压在立套板上，顶套板的凸出挡门块部分镶入立套板切锯的凹下部分，两端各用3或4颗40mm的木螺丝将三块紧固，要求三块采口在同一平面，门套内侧立套板与顶套板连接处缝隙小于0.2mm，两立套板与顶套板必须是90度。门套采口部位内空尺寸：宽为门扇宽＋7mm，高为门扇高＋13mm。 2、安装门套： （1）用电锤在门洞口上打两排孔（略向内倾斜），间距约为300MM，用与之相应大小的木针敲击在里面使之填满。

lammps输入文件命令中文详解

作者: 御剑江湖收录日期: 2011-03-31 发布 日期: 2011-03-24 Commands 描述了lammps输入文件的格式和在定义lammps模拟所需要的命令. 1.1 LAMMPS input script 我们用lammps做分子动力学模拟, 需要一个输入文件. lammps在执行计算的时候, 从这个文本文件中逐行读入命令. 大多数情况, lammps输入文件中各个命令的顺序并不是很重要. 但是你要注意以下

几点: (1) lammps并不是将你的输入文件全部读入之后才开始进行计算的, 或者说, 每条命令在它被读入之后就会起作用了. 注意, 下面两组命令的执行效果是不相同的. timestep 0.5 run 100 run 100 和 run 100 timestep 0.5

run 100 (2) 有些命令只有在另一些命令已经被定义的情况下才有效. 例如如果你要设定一组原子的温度, 那么用group命令定义哪些原子属于这个组才行. (3) 还有一种情况就是: 命令B要用到命A 设置的一些数值, 这样你也不能颠倒这两个命令的顺序. 每个命令的详细介绍中的Restrictions部分会说明要使用该命令定义的时候哪些命令必须要被预先定义. 如果你的输入文件书写的格式有问题,

lammps在执行的时候会提示ERROR或者WARNING , 出现类似信息时, 你可以到手册的第九章中查询原因. 1.2 Parsing rules 输入文件中的每一非空行都被认为是一条命令. lammps中命令的书写是对大小写敏感的, 不过一般的命令和参数都是小写的, 大写字母用于极少数的情况. (1) 命令行后的& 表示这一行跟下一行是同一条命令. 这一点跟FORTRAN很像. (2) 命令行最开始的# 表示这一行在执行

lammps实例(2)

Project #4 表面与界面能 铜的表面能 当物体形成表面时，表面上的原子键发生断裂，接近表面的几层原子不再如之前处于平衡状态，从而导致能量的升高，升高的温度便是物体的表面能。 利用LAMMPS 做出 20*20*40 fcc 的盒子，删去边缘的原子制造出一段真空层；算出此时体系的总能量0E ，然后从中间把盒子切成两半并移至足够远的距离，此时的体系总能量为E final ， 从而表面能： 02final surface E E A γ=? A 为表面的面积 (100) 面与 (111) 面 如下是输入文件in.surface_Cu_100 # LAMMPS Cu _Surface_100 units metal boundary p p p atom_style atomic lattice fcc 3.61 region box block 0 20 0 20 0 40 create_box 1 box create_atoms 1 box timestep 0.005 thermo 5 pair_style eam/alloy pair_coeff * * jin_copper_lammps.setfl Cu region boundary1 block INF INF INF INF 29.9 INF region boundary2 block INF INF INF INF INF 9.9 group boundary1 region boundary1 group boundary2 region boundary2 group boundary union boundary1 boundary2

3D木门安装流程

3D木门安装流程 (点击:177) 3D小生 2007-11-16 10:40:20 发表于焦点装修家居网-装修总论坛-3D木门论坛 标签:3D木门3D3D门 第一步、张贴安装告示牌，位置在明显之处。 第二步、清理。安装人员到达现场后，必须清理现场，留有足够的空间摆放门料和安装，清理的物品在征询业主的意见后存放到指定的位置，地面保持平整、干净。把垃圾放在垃圾袋内。 第三步、拆装、摆放、验料、量尺。 步骤1、门扇拆装。用裁纸刀在门边3处划开3处。将门立与门夹之内，在靠墙，门底部和门与门之间用防护角防护立稳。同时检查门扇的质量，包括：弯曲度、划伤、清点数量是否与量尺单位相符等。 步骤2、清理包装。把拆开的包装膜叠好或放在垃圾袋中。 步骤3、辅料拆装。把包装膜先平整铺在地面，然后对套版、口线、档板、封边用裁纸刀划开，口线8支一组叠放在平放的地面，对档板、套板、封边分组平放地面，面对面上下放好，摆放整齐。同时清点数量是否与量尺单相符。 步骤4、清理包装膜。 步骤5、五金件拆装。对五金件拆装同时清点各部件和检查质量。摆放整齐。 步骤6、工具箱摆放离开墙面10cm位置，把各类胶摆放整齐，禁止靠在墙面，离开10cm 左右。 第四步、测量。测量的有关事项与验料项同步进行。 步骤1、门扇测量与量尺单核对，测量包括：门扇的型号，高、宽和垂直度的尺寸。 步骤2、门洞测量，包括：门洞的高、宽和墙壁厚度及垂直度，并做好记号。 步骤3、套板测量。套板的宽与墙体的厚度是否相符，套板的宽度和墙体的高度是否相符。 第五步、打眼。 步骤1、在门洞左右墙壁测量垂直度后，在同一直线上个选择7个点，上访选1-2点，用冲击钻打眼。 步骤2、墙壁掉下来的灰尘及时清理装入垃圾袋中。

LAMMPS手册中文讲解

LAMMPS手册-中文解析 一、简介 本部分大至介绍了LAMMPS的一些功能和缺陷。 1．什么是LAMMPS? LAMMPS是一个经典的分子动力学代码，他可以模拟液体中的粒子，固体和汽体的系综。他可以采用不同的力场和边界条件来模拟全原子，聚合物，生物，金属，粒状和粗料化体系。LAMMPS可以计算的体系小至几个粒子，大到上百万甚至是上亿个粒子。 LAMMPS可以在单个处理器的台式机和笔记本本上运行且有较高的计算效率，但是它是专门为并行计算机设计的。他可以在任何一个按装了C++编译器和MPI的平台上运算，这其中当然包括分布式和共享式并行机和Beowulf型的集群机。 LAMMPS是一可以修改和扩展的计算程序，比如，可以加上一些新的力场，原子模型，边界条件和诊断功能等。 通常意义上来讲，LAMMPS是根据不同的边界条件和初始条件对通过短程和长程力相互作用的分子，原子和宏观粒子集合对它们的牛顿运动方程进行积分。高效率计算的LAMMPS通过采用相邻清单来跟踪他们邻近的粒子。这些清单是根据粒子间的短程互拆力的大小进行优化过的，目的是防止局部粒子密度过高。在并行机上，LAMMPS采用的是空间分解技术来分配模拟的区域，把整个模拟空间分成较小的三维小空间，其中每一个小空间可以分配在一个处理器上。各个处理器之间相互通信并且存储每一个小空间边界上的”ghost”原子的信息。LAMMPS(并行情况)在模拟3维矩行盒子并且具有近均一密度的体系时效率最高。 2．LAMMPS的功能 总体功能：

可以串行和并行计算 分布式MPI策略 模拟空间的分解并行机制 开源 高移植性C++语言编写 MPI和单处理器串行FFT的可选性（自定义） 可以方便的为之扩展上新特征和功能 只需一个输入脚本就可运行 有定义和使用变量和方程完备语法规则 在运行过程中循环的控制都有严格的规则 只要一个输入脚本试就可以同时实现一个或多个模拟任务粒子和模拟的类型： （atom style命令） 原子 粗粒化粒子 全原子聚合物，有机分子，蛋白质，DNA 联合原子聚合物或有机分子 金属 粒子材料 粗粒化介观模型 延伸球形与椭圆形粒子 点偶极粒子

什么是铝合金门门吸-铝合金门门吸如何安装-

什么是铝合金门门吸?铝合金门门吸如何安 装? 导读:本文介绍在房屋装修，主材选购的一些知识事项，如果觉得很不错，欢迎点评和分享。 门吸是日常生活中常见的工具,使用门吸可以避免因为一些外界的干扰而不小心关闭门,或者由于不小心的触碰而不小心关闭门。铝合金门是一种常见的大门的种类,那么什么是铝合金门门吸?铝合金门门吸如何安装?下面和小编一起来了解一下吧。 什么是铝合金门门吸? 1、顾名思义,铝合金门门吸就是安装在铝合金材质门上的门吸。门吸也俗称门碰,也是一种门页打开后吸住定位的装置,以防止风吹或碰触门页而关闭。门吸分为永磁门吸和电磁门吸二种,永磁门吸一般用在普通门中,只能手动控制;电磁门吸用在防火门等电控门窗设备,兼有手动控制和自动控制功能。 2、普通永磁门吸按安装形式分墙装式、地装式,按材质分塑料型、金属型;电磁门吸按不同的安装方式产品分为CT-01墙式、CT-02地式、CT-03链式三大类,墙式电磁门吸根据结构不同又分为标准型、增高型、加长型、盒装型、暗

装型、长臂型等;地式电磁门吸由CT-01墙式电磁门吸和直角地面安装支架组成;链式电磁门吸由CT-01墙式电磁门吸和链条扣件组成;由于CT-01墙式、CT-02地式、CT-03链式电磁门吸主体互相通用,方便用户根据使用现场安装条件来选用。 3、普通永磁门吸按安装形式分墙装式、地装式,按材质分塑料型、金属型;电磁门吸按不同的安装方式产品分为CT-01墙式、CT-02地式、CT-03链式三大类,墙式电磁门吸根据结构不同又分为标准型、增高型、加长型、盒装型、暗装型、长臂型等;地式电磁门吸由CT-01墙式电磁门吸和直角地面安装支架组成;链式电磁门吸由CT-01墙式电磁门吸和链条扣件组成;由于CT-01墙式、CT-02地式、CT-03链式电磁门吸主体互相通用,方便用户根据使用现场安装条件来选用。 铝合金门门吸如何安装? 1、首先要和业主确认门吸安装方式,是安装在地面上,还是安装在墙面上。因为这是卫浴间,业主决定门吸直接安装在地砖上,门后留置物空间。 2、第二步将门打开至需要的大位置,测试门吸作用是否合理,门吸在门上的距离是否合适定位门的位置,大致定位好之后,将门打开,试试实际操作是否合理,包括门吸是进去一点,还是出来一点,门吸的具体角度怎么样。

LAMMPS手册-中文版讲解

LAMMPS手册-中文解析一、简介 本部分大至介绍了LAMMPS的一些功能和缺陷。 1．什么是LAMMPS? LAMMPS是一个经典的分子动力学代码，他可以模拟液体中的粒子，固体和汽体的系综。他可以采用不同的力场和边界条件来模拟全原子，聚合物，生物，金属，粒状和粗料化体系。LAMMPS可以计算的体系小至几个粒子，大到上百万甚至是上亿个粒子。 LAMMPS可以在单个处理器的台式机和笔记本本上运行且有较高的计算效率，但是它是专门为并行计算机设计的。他可以在任何一个按装了C++编译器和MPI 的平台上运算，这其中当然包括分布式和共享式并行机和Beowulf型的集群机。LAMMPS是一可以修改和扩展的计算程序，比如，可以加上一些新的力场，原子模型，边界条件和诊断功能等。 通常意义上来讲，LAMMPS是根据不同的边界条件和初始条件对通过短程和长程力相互作用的分子，原子和宏观粒子集合对它们的牛顿运动方程进行积分。高效率计算的LAMMPS通过采用相邻清单来跟踪他们邻近的粒子。这些清单是根据粒子间的短程互拆力的大小进行优化过的，目的是防止局部粒子密度过高。在并行机上，LAMMPS采用的是空间分解技术来分配模拟的区域，把整个模拟空间分成较小的三维小空间，其中每一个小空间可以分配在一个处理器上。各个处理器之间相互通信并且存储每一个小空间边界上的”ghost”原子的信息。LAMMPS(并行情况)在模拟3维矩行盒子并且具有近均一密度的体系时效率最高。 2．LAMMPS的功能 总体功能： 可以串行和并行计算 分布式MPI策略 模拟空间的分解并行机制 开源 高移植性C++语言编写 MPI和单处理器串行FFT的可选性（自定义） 可以方便的为之扩展上新特征和功能 只需一个输入脚本就可运行 有定义和使用变量和方程完备语法规则 在运行过程中循环的控制都有严格的规则 只要一个输入脚本试就可以同时实现一个或多个模拟任务 粒子和模拟的类型： （atom style命令）原子粗粒化粒子DNA 全原子聚合物，有机分子，蛋白质，联合原子聚合物或有机分子金属粒子材料粗粒化介观模型延伸球形与椭圆形粒子点偶极粒子刚性粒子所有上面的杂化类型力场：）（命令：pair style, bond style, angle style, dihedral style, improper style, kspace style, tabulated.

室内套装门安装方法

室内套装门安装方法 1、室内套装门安装目的： 正确恰当的使用本安装方法和技巧，保障门业所有产品的品质。 2、了解室内套装门安装材料： （1）门扇: 国家标准规格： 宽800mm*高2000mm*厚40mm，其他大于或者小于本标准的尺寸为非标门,门扇的正反面因款式而定。 （2）、门框: 左、右边板、门顶板三件组合，配套门扇规格。门框用材料因门扇而定，门框材料厚度根据设计而定，一般是10-45 mm厚，分实心或空心两种；国家标准墙厚： 单砖墙120 mm加批灰左右各10-20 mm，所以单砖厚度一般为140-160 mm；18墙厚度为200-230 mm；24墙为260-280 mm；水泥砖为110-130 mm （3）线条分类： 木塑线条、高分子线条。线条规格： 宽度40-100 mm，长度2150-3000 mm不等，表面颜色根据门扇而定。 （4）门的相关术语： A、套装门： 门扇＋门框＋线条叫“套”； B、门扇叫“扇”、单独称作门扇； C、标准套叫“樘”，为门厅装饰套、等未来安装门，要留装门位置；

D、双边套叫“双”，即门的双边套。不用装门的叫哑口、两边装线条为双边套； E、单边套叫“个”，防盗门、卫生间门及厨房门的单边包线条的套； F、窗口装饰套叫“窗”，专做窗口单边包线条的套; G、线条称为“付”，每付5条，适合安装一套门。 （5）室内套装门安装工具： 手工木工锯、铝合金切割机，木工电锯、角磨机、打气机、直钉枪（15直钉）、码钉枪（1031码钉）、15米电板、铁锤、胶钳、螺丝刀（十字和一字）、冲击钻（8厘、10厘、12厘钻头）、手电钻（ 3、" 5、 6、" 8、10厘钻嘴）、铁扁锉、木工凿、角尺、5米卷尺、墙纸刀（刀片）、手巾、502胶水、万能胶水、6公分铁钉。 （6）室内套装门安装材料： 直钉、码钉、80mm铁钉、4*20自攻螺丝钉、502胶水、黑、红、蓝、绿蜡笔、黑红白灰膏、毛巾、掉膏。 （7）、收货、验货程序： A、接到货运通知后，首先按照自己所定货清单在货运部拆门扇角落清数量跟颜色及我厂流水单的尺寸是否对数，拆门框长条两边清点门框及线条数目，如符合方可接货，如有问题，请与我厂联系，以免误了贵方的时间，接货时要特别注意物流损坏，如为物流损坏，只能由物流公司承担损失，我厂不承担赔偿。 B、安装前在铺面最好拆包，二次检查核对门扇、门框、线条颜色、款式、规格、数量、质量方可到客户家中安装，以免发生不应该的错误费用。

暗门门锁的安装方法

暗门门锁的安装方法： 推拉式的隐形门一般不需要加锁，开合型的隐形门的锁这样来装。 我总结了以下四种方式： 要达到隐形效果的那一面完全没有东西，隐性效果最好。如果要想达到这样的效果，那就是说门肯定是往里面推，用手直接推，那么就要考虑到这个门推入到房间以后，从房间出来如何合上的问题。 可以使用的方法有两个：第一，在门背面装一个闭门器，闭合器的作用是当你推入以后，手松开，闭合器就会将门缓缓合上。不需要你去拉上。也就是说平时这个门一直是合上的。但是有的家会希望门有时候敞开着能通通风，这个时候就需要去买定位型的闭合器，就是门推到90度或者以上的时候能够自动定位，保持开着的状态。并且最好装上门吸，据说这样的话对闭合器也比较好。比较省力吧。这样，就解决了从外往里推门时候的状况。那么从里往开拉门的情况，就需要在不隐形的一面装上一个拉手。有专门的门拉手，注意，和一般的橱柜拉手不一样，那些橱柜拉手是要打穿门板的，在内部固定的，而我们的门朝外的那面上保持啥也没有，所以选择的时候要注意，申明是专门的房门拉手。但是一般房门里面如果是卧室的话，就要考虑到一个私密性的问题，因为不装门锁的话就不能锁，所以还要记得在内部装一个暗插销。当然，你装明的插销也是可以的，就是不好看啦。暗插销就类似于一般锁的保险，你一转，门就关上了。外面是开不了的。就是可能会造成儿童或老人不小心把自己锁在里面。一般来说问题不大。 说了这么多，总结一下，要制作在外面看完全隐形的门，那么可以在背面装一个暗插销，一个闭门器，一个拉手（如果觉得用暗插销当拉手来开门可以的话，也可以不买拉手）以及一个门吸（这个也可以省去）。这样的优点是从门外看不见任何

Lammps 石墨烯实例

一、简介 1.SiC热分解制备石墨烯 自2004年Novoselov、Geim和合作者们从石墨上剥离出世界上第一种二维材料——单层石墨：石墨烯（Graphene）以来，石墨烯就受到了科技界的广泛重视[1]。Novoselov 和Geim两人因此在2010年获得了诺贝尔物理学奖。因为石墨烯的独特特性，在许多技术领域例如光电子学上它都被寄予厚望。研究石墨烯这种材料相关的物理化学特性和发展大面积、高质量生长石墨烯的技术，同时将其与器件物理学联系起来是我们研究和应用石墨烯的必由途径。 石墨烯是由碳元素组成的二维六边形材料，其在光学、电学、热学、力学等性质十分优异。它有可能在后摩尔定律时代成为硅（Silicon）的继任者，在单分子气体传感器[2]、自旋电子学[3]、量子计算[4]、太赫兹振荡器[5]等等领域发挥重要作用。如今，从石墨上剥离出石墨烯仍然是一种重要的石墨烯制备方方法。然而，这种方法产生的石墨烯大小通常不超过1000 μm2，只适合实验室研究，尚不能在工业上大规模应用。科学家发展了其他的石墨烯制备方法，包括将石墨烯视作一种薄膜来生长的化学气相沉积（Chemical Vapor Deposition, CVD）法、热分解碳化硅法（SiC thermal decomposition）、氧化石墨烯还原法（Graphene oxide reduction）等。 CVD法通过使含碳气源在有催化作用的金属表面分解或者使溶入到这些有催化作用的金属中的碳（C）发生表面偏析，使得在金属表面生成石墨烯或者多层石墨烯（Few-Layer Graphene, FLG）。能否直接在半导体/绝缘体上生长石墨烯呢？碳化硅热分解成功的解决了这一问题。最早试图使六方晶系的SiC晶体石墨化的研究报告见于1961年，Badami在高温和真空环境下得到了发生了一定石墨化的SiC[6]。在一定的退火条件下，SiC晶体表面发生热分解，Si原子发生解吸附，而C原子留下来重新排列和组合可以生长成外延型的石墨烯层[7]。更细致的研究发现用热退火的方法在六方SiC的Si面上生长的石墨烯比C面有更好的可控性，例如：可以更好的控制石墨烯的层数。Si面上生长的石墨烯生长方向与基底晶体结构有密切关系，这样提供了在基底上均匀覆盖和特定方向生长石墨烯的可能性。特别地，石墨烯直接生长在半导体SiC上使得我们无

木作安装操作规范

目的：为了保证内门产品品质，减少由于安装不规范产生的投诉。 适用范围：内门产品安装。 内容： 1、内门安装操作规范： 1. 1门洞的复尺 产品到达现场后，安装工人对照设计图纸分别将门洞的宽、高及墙体厚度进行复尺，确保没有问题后开始安装，如有问题第一时间与设计师或调度联系，等待解决方案。 门洞宽度的测量： 水平测量门洞左右的距离，选取五个以上的测量点进行测量，其中最小值（减门框调整余量）为门框外延尺寸；公差为 -15mm — +15mm范围内；若五个点的实测值误差大于20mm（即筒子板和门洞之间间隙不大于35mm)，则应要求用户对洞口进行修整，卫生间内门安装测量时，水平方向测量应注意反水（即地面放坡）。 门洞高度的测量： 垂直测量门洞上下距离，选取三个以上的测量点进行测量，其中最小值（减门框调整余量）为门框外延尺寸；公差为-5mm — +10mm；若三个点的实测值误差大于10mm(即筒子板和墙体间间隙不大于35mm)，则应要求用户对洞口进行修整。 门洞墙体厚度的测量： 水平测量墙体厚度，选取五个以上的测量点进行测量，其中最大值为墙体厚度，如果墙面需要装修，则门洞墙体厚度需附加装修材料的厚度，公差为0 — +10mm范围内。 墙体可允许的误差： 洞口墙体平面垂直度≤2㎜ 洞口墙体侧面垂直度≤10㎜ 洞口墙体水平度≤5㎜ 洞口地面水平度≤2㎜ 套板的外形尺寸与安装洞口尺寸允许误差 5㎜～20㎜ 以上确认无误后方可安装。 安装门套和墙体的固定 主套线和筒子板的连接： a．将合页安装在筒子板上。 b．用外角码将横竖筒子板连接牢固，横竖筒子板及套线45°处缝隙要严密、平整、无错位；横竖筒子板需成90度直角。 c．再将主套线安装在主筒子板的槽内，平板套线横竖直拼处用木榫连接背面用双头黑色连接件紧固；造型套线背面用双头黑色连接件紧固。并用自攻钉将套线固定在筒子板上。

石墨烯拉伸的in文件

单层石墨烯拉伸in文件（lammpstrj） Data文件：直接可以自己在VMD中生成石墨烯模型，保存为data格式即可# 3d relax simulation dimension 3 boundary s s s units metal atom_style atomic neighbor 2.0 bin neigh_modify every 1 delay 0 check yes read_data my.data group g-1 type 1 group g-2 type 2 group g-3 type 3 pair_style airebo 3.0 1 1 pair_coeff * * CH.airebo C C C compute 1 g-2 stress/atom compute 1x g-2 reduce sum c_1[1] compute 1y g-2 reduce sum c_1[2] compute 1z g-2 reduce sum c_1[3] velocity g-2 create 300 4928459 mom yes rot no velocity g-1 set 0.0 0.0 0.0 units box velocity g-3 set 0.0 0.0 0.0 units box timestep 0.001 fix 1 g-2 nve fix 2 g-2 langevin 300.0 300.0 0.08 48279 fix 3 g-1 rigid single force 1 off off off torque 1 off off off fix 4 g-3 rigid single force 1 off off off torque 1 off off off