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并行安装vasp步骤

intel fortran9.1.036 安装过程

Intel Fortran Compiler这个编译器性能极佳，它在x86 和Itanium 级Linux 主机上会有光明的未来，因为Intel 的编译器组整合了曾在DEC、Compaq 和HP 确立声誉的工程团队。它的发行版有Windows和Linux两种，这2种都分别提供Non-Commercial版免费下载，但不提供技术支持。而性能则与商业版相同。其中Windows版需要Visual Studio的支持才可以使用。

以下是整个的安装过程。

1、登陆intel网站下载Non-commercial版。

登陆https://www.sodocs.net/doc/c418640975.html,/software/products/global/eval.htm ，选择Intel? Fortran Compiler for Linux* 下的第二项Non-Commercial Unsupported Version 点击进入。或者直接登陆https://www.sodocs.net/doc/c418640975.html,/software/products/compilers/flin/noncom.htm，简单的看一下说明，整个下载过程需要好几步，可以慢慢来进行，首先点击“Continue”按钮进入下一页；第二页有个调查表，填好之后进入下一页；第二页有个调查表，填好之后进入下一页；第三页是软件协议页面，可以粗略看一下，选择“Accept”进入下一页；第四页是注册页面，其中Email栏一定要填好，填写之后选择“Submit”进入下一页；这是最后一页，说明已经注册成功，intel会给你发一封电子邮件，并且其中包含一个协议附件。

剩下的工作是收取邮件，然后根据邮件中提供的地址下载软件即可。我这里下载的软件是l_fc_p_9.1.036.tar.gz，大约130M，另外把邮件中的附件另存在刚才下载的软件的同一目录下，我这里的文件名是l_for_******.lic，每个人的文件名可能不同，它是一个协议文件。

下来以root用户进行以下的安装工作，假设前面的2个文件存放在/usr/src/intel目录下，这也是我们的工作目录：

2、解压安装文件

tar xzvf l_fc_p_9.1.036.tar.gz

3、安装并指定协议，我们这里编译器的是安装在/opt/intel_fc_91目录下，协议则在该目录下的*s 文件夹中。最后还要指定*s的位置。

mkdir –p /opt/intel_fc_91/*s

cp /usr/src/intel/*.lic /opt/intel_fc_91/*s

export INTEL_LICENSE_FILE=opt/intel_fc_91/*s

4、装程序进行安装

cd /usr/src/intel/l_fc_p_9.1.036

./install.sh

正确的话，会看到下面的提示：

The following Intel(R) products and related products are

installed.

Intel(R) Fortran Compiler for 32-bit applications, Version 8.0

Linux Application Debugger for 32-bit applications, Version 7.3.1

Which of the following would you like to install?

1. Intel(R) Fortran Compiler for 32-bit applications, Version 8.0

2. Linux Application Debugger for 32-bit applications, Version 7.

3.1

x. Exit

先选择 1 安装Intel Fortran Compiler ，默认安装即可，默认目录就是/opt/intel_fc_91。

安装编译器完成之后，继续可以安装Linux Application Debugger for 32-bit applications, Version 7.3.1，选择2即可，它默认安装在/opt/intel_idb_73下。最后选择x 退出安装程序。

5、现在安装完成，可以删掉安装文件l

cd /usr/src

rm –rf intel

6、退出root用户的登陆，然后以一个个人用户登陆，登陆以后修改用户根目录下的.bash_profile文件，在最后一行加入这么一行：

. /opt/intel/fc/bin/ifortvars.sh

注：其中点号之后有空格。

然后重新登陆或者：

source .bash_profile

这样一切安装与配置就完成了，可以简单的测试一下。编辑一个简单的源文件first.f90。(在终端输入vi first.f90 编辑源代码esc键，shift : wq保存退出)

program first

print *, “Hello World!

print *, sin(123.4)

end program first

下来编译，编译命令与以前版本的Intel Fortran Compiler不同，以前采用的是ifc命令，从这个版本开始将使用ifort命令

ifort first.f90 –o first

运行./first

将显示

Hello World!

-0.7693915

这说明一切OK，可以正常使用该编译器了。

ifort的具体使用可以用ifort –help 获得详细帮助，一般用法类似于g77和gcc。在/opt/intel_fc_91/doc下有详细的使用文档，有pdf格式文档也有htm格式网页文档。

标题: ifc和mpich并行编译vasp(个人经验)

（inter fortran10.1.018,mpich-2,fftw3.1.12，GOTOBlas1/24,vasp4.6并行编译（parral complice））

我是在Redhat 7.3 和8.0的机器上，用ifc

6.01版本，mpich-1.2.5.2，编译vasp4.6版本。

BLAS:采用libgoto_p4_512-r0.94.so

LAPACK:采用vasp.4.lib中的lapack_double.o

大致步骤如下：

这里不再讲述ifc的安装，假设ifc已经安装好了。

1、下载mpich-1.2.5.2，并安装。

从https://www.sodocs.net/doc/c418640975.html,/mpi/mpich/downloads/mpich.tar.gz下载。

使用命令tar xzvf mpich.tar.gz 来解压它。

得到mpich-1.2.5.2目录。

进入该目录，以此使用下面的命令：

a) ./configure --prefix=/usr/local/mpich -rsh=ssh --with-cflags=-O \

-f90="ifc -FR -lowercase" --with-f77flags=-O --without-romio -fc=ifc

还是：-f90="ifort -FR -lowercase" --with-f77flags=-O --without-romio -fc=ifort

b) make

c)改用root帐号，进入改目录进行安装。

make install

则把mpich安装到/usr/local/mpich目录。

2、设置与mpich有关的环境变量

在主目录下把下面的几行加入.bash_profile文件中

export PATH=$PATH:/usr/local/mpich/bin

export MPI_USEP4SSPORT=yes

export MPI_P4SSPORT=22

export P4_RSHCOMMAND=ssh

然后采用下面的命令更新该文件

. .bash_profile或source .bash_profile

3、采用mpif90来编译vasp

这里假设把libgoto_p4_512-r0.94.so放在/usr/local/lib目录中。

a)进入vasp.4.lib目录中，

1.编辑gotoblas（GotoBLAS的安裝過程(Core2Duo)與如何加入V ASP進行編譯）

把/usr/local/gotoblas/include/ libgoto.a libgoto_core2p-r1.14.a libgoto_core2p-r1.14.so系統會自動依你的CPU型式來取名

將所得到的3個重要函式庫其中之一，丟進vasp.4.lib內

2.把makefile.linux_ifc_P4拷贝成makefile

修改makefile中FC=ifort

键入make命令，开始编译得到libdmy.a

b)进入vasp.4.6目录中，

1.并行编译fftw3（详见fftw安装指南）

并行编译./configure --prefix=/home/tlu --with-gcc --disable-fortran --enable-mpi

拷贝/usr/local/fftw/include/fftw3.f(fftw3.h fftw3.mpi)

把makefile.linux_ifc_P4拷贝成makefile

把第50行的FC=ifc前加上注释号，也就是#

第80行至82行的CPP有关内容加上注释号，改成下面的

#CPP = $(CPP_) -DHOST=\"LinuxIFC\" \

# -Dkind8 -DNGXhalf -DCACHE_SIZE=12000 -DPGF90 -Davoidalloc \

# -DRPROMU_DGEMV -DRACCMU_DGEMV

把第136行的BLAS

BLAS= /opt/libs/libgoto/libgoto_p4_512-r0.6.so

该成如下的内容：

BLAS= /usr/local/lib/libgoto_p4_512-r0.94.so

我的为：BLAS= /vasp/src/vasp.4.lib/libgoto_core2p-r1.14.so

把第166行和167行有关FFT3D的行前加上注释号，如下面的

#FFT3D = fft3dfurth.o fft3dlib.o

#FFT3D = fftw3d.o fft3dlib.o /opt/libs/fftw-3.0.1/lib/libfftw3.a

把202行和203行的FC等改为如下的内容：

FC=mpif90

FCL=$(FC)

把212行有关CPP的行前的注释号去掉，改成如下的内容：

CPP = $(CPP_) -DMPI -DHOST=\"LinuxIFC\" -DIFC \

-Dkind8 -DNGZhalf -DCACHE_SIZE=4000 -DPGF90 -Davoidalloc \

-DMPI_BLOCK=500 \

-DRPROMU_DGEMV -DRACCMU_DGEMV

把226和227行有关SCA的行，加上注释号，改成如下的

#SCA= $(SCA_)/libscalapack.a \

#$(BLACS)/LIB/blacsF77init_MPI-LINUX-0.a

$(BLACS)/LIB/blacs_MPI-LINUX-0.a

$(BLACS)/LIB/blacs F77init_MPI-LINUX-0.a

表示不用scalapack库。

把239和243行有关FFT3D的行，改成如下的内容：

# FFT: fftmpi.o with fft3dlib of Juergen Furthmueller

FFT3D = fftmpi.o fftmpi_map.o fft3dlib.o

# fftw.3.0.1 is slighly faster and should be used if available

#FFT3D = fftmpiw.o fftmpi_map.o fft3dlib.o

/opt/libs/fftw-3.0.1/lib/libfftw3.a

我的为

# FFT: fftmpi.o with fft3dlib of Juergen Furthmueller

#FFT3D = fftmpi.o fftmpi_map.o fft3dlib.o

# fftw.3.0.1 is slighly faster and should be used if available

FFT3D=fftmpi.o（原软件为：fftmpiw.o因vasp此处报错所以修改）fftmpi_map.o fft3dlib.o /opt/libs/fftw-3.0.1/lib/libfftw3.a

把这些都修改后，保存。

再make。就好了。

GotoBLAS的安裝過程(Core2Duo)與如何加入V ASP進行編譯

下載位置：https://www.sodocs.net/doc/c418640975.html,/resources/software/software.php?

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現在最新版本是2007.03.21釋出的GotoBLAS-1.14.tar.gz，已完全支援Core 2 Duo係列

其中新版安裝方式非常人性化，與在Linux的source code使用configure方式略有不同

對Linux底下使用x86和x86_64 CPU者，提供一個快速安裝的script，可快速簡測你的SMP和編譯器種類，至於支援的編譯器種類依此順序為依據PathScale→PGI→Intel→gfortran→g95→g77

Step 1：解壓縮

tar –zxvf GotoBLAS-1.14.tar.gz

Step 2：安裝GotoBLAS，在32 bit和64 bit的安裝分別如下

For 32 bit安裝：./quickbuild.32bit

For 64 bit安裝：./quickbuild.64bit

安裝完後，即會把函式庫建在剛剛解壓縮後的資料夾內

以Core 2 Duo為例，會主要產生3個檔案

libgoto.a

libgoto_core2p-r1.14.a 系統會自動依你的CPU型式來取名

libgoto_core2p-r1.14.so

若為特殊機器，則需藉由改寫getarch.c和Makefile.rule，將符合本身機器的參數前面註釋拿掉，並重新編譯即可產生函式庫，主要安裝過程請詳閱Quickinstallat.txt

------------------------------------------------------

Note: (安装完后的提示如下)

Done. This library is compiled with following conditions.

Binary ... 64bit

Fortran ... INTEL

SMP ... Enabled. You have to link library with -lpthread option.

-------------------------------------------------------

裝設GotoBLAS無非就是想讓vasp的執行速度加快，如何修改Makefile？步驟如下

Step 1：將所得到的3個重要函式庫其中之一，丟進vasp.4.lib內，或另設資料夾將其置入

/vasp/src/vasp.4.lib/libgoto_core2p-r1.14.so

Step 2：修改Makefile的BLAS路徑，先將全部舊有的BLAS路徑以#符號注釋起來，而後加入新的BLAS路徑

BLAS= ../vasp.4.lib/libgoto_core2p-r1.14.so

可參考量化網頁相關文章：

/Experience/CommonSoftwares/V ASP/CompileInstallation/200512/27.html

Step 3：重新編譯Makefile即可

By 阿達仔國立成功大學

FFTW安装指南

FFTW（the Fastest Fourier Transform in the West）库是由MIT(Massachusetts Institute of Technology)的Matteo Frigo和Steven G. Johnson开发的，用于一维和多维实数或复数的离散傅里叶

变换。

1. 下载fftw-2_1_3_tar.gz （https://www.sodocs.net/doc/c418640975.html,, or https://www.sodocs.net/doc/c418640975.html,）

2. tar zxvf fftw-2_1_3_tar.gz

展开压缩文件

3. 在Linux中安装FFTW:

a. ./configure --enable-type-prefix --prefix=/usr/local/fftw --with-gcc --disable-fortran --enable-i386-hacks

并行编译./configure --prefix=/home/tlu --with-gcc --disable-fortran --enable-mpi

其中，--enable-type-prefix参数是为了同时使用single precision(单精度)和double precision（双精度），如果不使用它，最后只有以rfftw开头的文件被安装（real fftw）；

--prefix= 参数是设定安装目录；--with-gcc使用gcc编译器；

--disable-fortran参数为了不包含Fortran调用的机制；--enable-i386-hacks为Pentium和

x86以后的CPU优化gcc的编译速度。

b. make

编译

c. make install

安装，这一次安装完后，在安装目录中存在以dfftw和drfftw开头文件，但没有sfftw开头的文件

d. make clean

还需要安装一次，先清除

e. ./configure --enable-float --enable-type-prefix --prefix=/usr/local/fftw --with-gcc --disable-fortran --enable-i386-hacks

其中，--enable-float为了生成单精度计算的头文件和库文件，即以sfftw开头的文件。

f. make

重新编译

g. make install

再一次安装，安装完后，目录中便会同时存在sfftw和dfftw开头的文件(用于复数函数/complex function的FFT变换)和srfftw与drfftw开头的文件（用于实数函数的FFT变换）

例如，如果需要用到双精度的实数FFT变换/FFTs，那么在编译的链接命令中需要按如下顺序加入

-ldrfftw -ldfftw参数

V ASP4.4.6编译过程

1、所需文件和程序

V ASP源代码：vasp.4.4.6.tar.gz和vasp.4.lib.tar.gz

数学库：ATLAS (https://www.sodocs.net/doc/c418640975.html,/)

Fortran编译器：ifc_9.1.036 fortran 可以从网站下载到免费的版本。

2、这里已经安装好了fortran编译器，所有文件都放在/home/xxx/V ASP目录下，机器

的操作系统是Linux: Redhat9.0。

a) 用如下命令解压vasp.4.6.tar.gz和vasp.4.lib.tar.gz：

tar xzvf vasp.4.6.tar.gz

tar xzvf vasp.4.lib.tar.gz

解压后分别得到目录vasp.4.6和vasp.4.lib，目录vasp.4.6中文件是vasp的主要源代码，

vasp.4.lib是编译vasp时需要的一些特定的数学库程序，在这两个目录中都有编译时所用的

makefile文件，针对机器和fortran编译器，选择相应的makefile。

b) 从https://www.sodocs.net/doc/c418640975.html,/下载atlas3.6.0_Linux_P4SSE2.tar.gz，并用

如下命令解压：tar xzvf atlas3.6.0_Linux_P4SSE2.tar.gz

解压后得到一个目录Linux_P4SSE2，在此目录下有个lib子目录，该lib子目录中的文件为

libatlas.a, libcblas.a, libf77blas.a, liblapack.a,

这些就是编译vasp时所需要的数学库文件之一, 将lib复制到vasp目录下，并将其中的四个文件复制到vasp.4.lib目录下

我这里安装了fftw-3.1.2.tar 这个东西，(见FFTW安装指南）

完毕后，将/usr/local/fftw/include/下的fftw3.f复制到vasp/vasp4.6.

c) 进入vasp.4.lib目录，选择makefile.linux_ifc_P4，并把它拷贝成makefile，然后键入

make命令开始编译。整个命令如下：

cd vasp.4.lib

cp makefile.linux_ifc_P4 makefile

make

编译成功后，得到libdmy.a文件。

先到安装的ifc 9.1的安装目录中，找到lib目录，里面有个libsvml.a的库文件。

1、比如你的ifc 9.1装在/opt/intel/fc/9.1.036的目录下。

则在.bash_profile文件中加入下面的：

export LD_LIBRARY_PA TH=/opt/intel/fc/9.1.036/lib:$LD_LIBRARY_PA TH:/usr/local/lib:/usr/lib:/lib

2、source .bash_profile

3、在vasp的makefile中，对BLAS或LAPACK后面加上-lvml。

比如:

BLAS=....... -lsvml

其中的.....是你用libgoto库的路径

退出vasp.4.lib目录，进入vasp.4.6目录，选择makefile.linux_ifc_P4，并把它拷贝成

makefile，编辑makefile文件，通过修改LIB变量的赋值而采用基于A TLAS的数学库文件，修

改其中：

ATLASHOME= ../lib

BLAS=-L$(ATLASHOME) -lf77blas -latlas -lsvml

LAPACK= ../vasp.4.lib/lapack_double.o

修改后保存makefile文件，键入make命令开始编译vasp。整个命令为：

cd ..

cd vasp.4.6

cp makefile.linux_ifc_P4 makefile

编辑修改makefile文件

make

编译成功后，就可以得到V ASP的可执行文件vasp。

以root帐号登录机器，把成功编译V ASP后得到的vasp放到/bin目录下，则任何一个普通

用户都可以使用vasp。此时vasp可以当成于一个linux的命令来使用了，不再需要把vasp拷

贝到当前的计算目录下。

2:00-

安装frotran9双核不支持，

安装fortran10 有RPM ERROR 没有libstdc++.so.5 库

3：40-

安装成功见：d：\vasp\安装\并行\f.10.1\

4:30-vasp出错：

进入vasp.4.6目录中，把makefile.linux_ifc_P4拷贝成makefile

Make

2008-8-31

8：50-

又出现问题：make：***[fft3dlib.o]错误 1

解決方式：

將第343行

$(FC) -FR -lowercase -O1 -tpp7 -xW -prefetch- -unroll0 -e95 -vec_report3 -c $*$(SUFFIX)

去掉"-e95"變數改成

$(FC) -FR -lowercase -O1 -tpp7 -xW -prefetch- -unroll0 -vec_report3 -c $*$(SUFFIX)

因為"-e95"變數會把F95編譯F77程式碼產生的警告(warning)改成錯誤(error)型式輸出，造成編譯強迫停止無法忽略跳過！順道一提，若使用Intel Core 2 Duo的處理器，可將以下的-xW變數改成-xT得到優化

第102行：OFLAG=-O3 -xW -tpp7

第343行：$(FC) -FR -lowercase -O1 -tpp7 -xW -prefetch- -unroll0 -vec_report3 -c $*$(SUFFIX)

改成

第102行：OFLAG=-O3 -xT -tpp7

第343行：$(FC) -FR -lowercase -O1 -tpp7 -xT -prefetch- -unroll0 -vec_report3 -c $*$(SUFFIX)

2008-9-2

8：30-计算结果不正确，重新编译vasp

出错：undefined reference to `__svml_trunc2'

Re: Vasp 串行编译出错(22字)－node1，2008年05月04日11:25:31

处理方法：在vasp的makefile中，对BLAS或LAPACK后面加上-lvml

12：23-vasp成功，但还是一个cpu计算，搜索“单机双核运行并行程序”

解决方案1：用虚拟机建立多个虚拟计算机，建立多节点的机群；

https://www.sodocs.net/doc/c418640975.html,/logs/17396382.html

这里将在一台双核的PC上，利用虚拟机及MPICH2建立一个由3台PC节点构成的一个机群行计算环境。

16：50-运行MPI并行程序前输入命令：mpirun –np 16 ./vasp

关键：

串行运行正确，并行运行错误的原因，是傅里叶变换fftw没有进行编译的原因，

带MPI的fftw 3 的安装和使用

2007-10-08 16:26

https://www.sodocs.net/doc/c418640975.html,/motioo/blog/item/d44e6fd32c6ae7033af3cfbc.html

0. 下载程序，解压

下载程序 https://www.sodocs.net/doc/c418640975.html,

http: fftw-3.2alpha2.tar.gz (ftp: fftw-3.2alpha2.tar.gz) (3.1MB)

mkdir -p /home/tlu/proj/

cp fftw-3.2alpha2.tar.gz /home/tlu/proj/

cd /home/tlu/proj/

tar xzvf fftw-3.2alpha2.tar.gz

cd fftw-3.2alpha2

1. configure

后面参数--prefix=/home/tlu表示安装的位置是/home/tlu/include 和/home/tlu/lib/下

--enable-mpi 表示要使用并行的MPI

./configure --prefix=/home/tlu --enable-mpi

2. 编译

make

3. 安装

make install

4. 安装后的头文件和库文件

tlu:~$ ls -rclt include/ lib/

lib/:

总用量 1336

drwxr-xr-x 2 tlu tlu 4096 2007-10-08 16:17 pkgconfig

-rwxr-xr-x 1 tlu tlu 774 2007-10-08 16:17 libfftw3_https://www.sodocs.net/doc/c418640975.html,

-rwxr-xr-x 1 tlu tlu 762 2007-10-08 16:17 https://www.sodocs.net/doc/c418640975.html,

-rw-r--r-- 1 tlu tlu 1238492 2007-10-08 16:17 libfftw3.a

-rw-r--r-- 1 tlu tlu 103388 2007-10-08 16:17 libfftw3_mpi.a

include/:

总用量 32

-rw-r--r-- 1 tlu tlu 16236 2007-10-08 16:17 fftw3.h

-rw-r--r-- 1 tlu tlu 2447 2007-10-08 16:17 fftw3.f

-rw-r--r-- 1 tlu tlu 9342 2007-10-08 16:17 fftw3-mpi.h

5. 只要把 include 和 lib下的文件copy到另一台机器上同样的位置，另一台机器就安装好了。

最终并行编译vasp成功：

我的正确的vasp.4.6中makefile为：

.SUFFIXES: .inc .f .f90 .F

#-----------------------------------------------------------------------

# Makefile for Intel Fortran compiler for P4 systems

# The makefile was tested only under Linux on Intel platforms

# (Suse 5.3- Suse 9.0)

# the followin compiler versions have been tested

# 5.0, 6.0, 7.0 and 7.1 (some 8.0 versions seem to fail compiling the code)

# presently we recommend version 7.1 or 7.0, since these

# releases have been used to compile the present code versions

# it might be required to change some of library pathes, since

# LINUX installation vary a lot

# Hence check ***ALL**** options in this makefile very carefully

#----------------------------------------------------------------------- #

# BLAS must be installed on the machine

# there are several options:

# 1) very slow but works:

# retrieve the lapackage from https://www.sodocs.net/doc/c418640975.html,

# and compile the blas routines (BLAS/SRC directory)

# please use g77 or f77 for the compilation. When I tried to

# use pgf77 or pgf90 for BLAS, VASP hang up when calling

# ZHEEV (however this was with lapack 1.1 now I use lapack 2.0)

# 2) most desirable: get an optimized BLAS

# the two most reliable packages around are presently:

# 3a) Intels own optimised BLAS (PIII, P4, Itanium)

# https://www.sodocs.net/doc/c418640975.html,/software/products/mkl/

# this is really excellent when you use Intel CPU's

# 3b) or obtain the atlas based BLAS routines

# https://www.sodocs.net/doc/c418640975.html,/

# you certainly need atlas on the Athlon, since the mkl

# routines are not optimal on the Athlon.

# If you want to use atlas based BLAS, check the lines around LIB=

# 3c) mindblowing fast SSE2 (4 GFlops on P4, 2.53 GHz)

# Kazushige Goto's BLAS

# https://www.sodocs.net/doc/c418640975.html,/users/kgoto/signup_first.html

#-----------------------------------------------------------------------

# all CPP processed fortran files have the extension .f90

SUFFIX=.f90

#----------------------------------------------------------------------- # fortran compiler and linker

#----------------------------------------------------------------------- FC=ifort

# fortran linker

FCL=$(FC)

#----------------------------------------------------------------------- # whereis CPP ?? (I need CPP, can't use gcc with proper options)

# that's the location of gcc for SUSE 5.3

# CPP_ = /usr/lib/gcc-lib/i486-linux/2.7.2/cpp -P -C

# that's probably the right line for some Red Hat distribution:

# CPP_ = /usr/lib/gcc-lib/i386-redhat-linux/2.7.2.3/cpp -P -C

# SUSE X.X, maybe some Red Hat distributions:

CPP_ = ./preprocess <$*.F | /usr/bin/cpp -P -C -traditional >$*$(SUFFIX)

#-----------------------------------------------------------------------

# possible options for CPP:

# NGXhalf charge density reduced in X direction

# wNGXhalf gamma point only reduced in X direction

# avoidalloc avoid ALLOCATE if possible

# IFC work around some IFC bugs

# CACHE_SIZE 1000 for PII,PIII, 5000 for Athlon, 8000-12000 P4

# RPROMU_DGEMV use DGEMV instead of DGEMM in RPRO (depends on used BLAS) # RACCMU_DGEMV use DGEMV instead of DGEMM in RACC (depends on used BLAS) #-----------------------------------------------------------------------

CPP = $(CPP_) -DHOST=\"LinuxIFC\" \

-Dkind8 -DNGXhalf -DCACHE_SIZE=12000 -DPGF90 -Davoidalloc \

# -DRPROMU_DGEMV -DRACCMU_DGEMV

#-----------------------------------------------------------------------

# general fortran flags (there must a trailing blank on this line)

#-----------------------------------------------------------------------

FFLAGS = -FR -lowercase -assume byterecl

#-----------------------------------------------------------------------

# optimization

# we have tested whether higher optimisation improves performance

# -axK SSE1 optimization, but also generate code executable on all mach.

# xK improves performance somewhat on XP, and a is required in order

# to run the code on older Athlons as well

# -xW SSE2 optimization

# -axW SSE2 optimization, but also generate code executable on all mach.

# -tpp6 P3 optimization

# -tpp7 P4 optimization

#-----------------------------------------------------------------------

OFLAG=-O1 -xW

OFLAG_HIGH = $(OFLAG)

OBJ_HIGH =

OBJ_NOOPT =

DEBUG = -FR -O0

INLINE = $(OFLAG)

#-----------------------------------------------------------------------

# the following lines specify the position of BLAS and LAPACK

# on P4, VASP works fastest with the libgoto library

# so that's what I recommend

#-----------------------------------------------------------------------

# Atlas based libraries

#ATLASHOME= $(HOME)/archives/BLAS_OPT/ATLAS/lib/Linux_P4SSE2/

#BLAS= -L$(ATLASHOME) -lf77blas -latlas

# use specific libraries (default library path might point to other libraries) #BLAS= $(ATLASHOME)/libf77blas.a $(ATLASHOME)/libatlas.a

# use the mkl Intel libraries for p4 (https://www.sodocs.net/doc/c418640975.html,)

# mkl.5.1

# set -DRPROMU_DGEMV -DRACCMU_DGEMV in the CPP lines

#BLAS=-L/opt/intel/mkl/lib/32 -lmkl_p4 -lpthread

# mkl.5.2 requires also to -lguide library

# set -DRPROMU_DGEMV -DRACCMU_DGEMV in the CPP lines

#BLAS=-L/opt/intel/mkl/lib/32 -lmkl_p4 -lguide -lpthread

# even faster Kazushige Goto's BLAS

# https://www.sodocs.net/doc/c418640975.html,/users/kgoto/signup_first.html

BLAS=/vasp/src/vasp.4.lib/libgoto_core2p-r1.14.so

# LAPACK, simplest use vasp.4.lib/lapack_double

LAPACK= ../vasp.4.lib/lapack_double.o

# use atlas optimized part of lapack

#LAPACK= ../vasp.4.lib/lapack_atlas.o -llapack -lcblas

# use the mkl Intel lapack

#LAPACK= -lmkl_lapack

#-----------------------------------------------------------------------

LIB = -L../vasp.4.lib -ldmy \

../vasp.4.lib/linpack_double.o $(LAPACK) \

$(BLAS)

# options for linking (for compiler version 6.X, 7.1) nothing is required LINK =

# compiler version 7.0 generates some vector statments which are located

# in the svml library, add the LIBPATH and the library (just in case)

LINK = -L/usr/local/fc/lib/ -lsvml

#-----------------------------------------------------------------------

# fft libraries:

# VASP.4.6 can use fftw.3.0.X (https://www.sodocs.net/doc/c418640975.html,)

# since this version is faster on P4 machines, we recommend to use it

#-----------------------------------------------------------------------

#FFT3D = fft3dfurth.o fft3dlib.o

FFT3D = fftw3d.o fft3dlib.o /opt/libs/fftw-3.0.1/lib/libfftw3.a

#=======================================================================

# MPI section, uncomment the following lines

# one comment for users of mpich or lam:

# You must *not* compile mpi with g77/f77, because f77/g77

# appends *two* underscores to symbols that contain already an

# underscore (i.e. MPI_SEND becomes mpi_send__). The pgf90/ifc

# compilers however append only one underscore.

# Precompiled mpi version will also not work !!!

# We found that mpich.1.2.1 and lam-6.5.X to lam-7.0.4 are stable

# mpich.1.2.1 was configured with

# ./configure -prefix=/usr/local/mpich_nodvdbg -fc="pgf77 -Mx,119,0x200000" \ # -f90="pgf90 " \

# --without-romio --without-mpe -opt=-O \

# lam was configured with the line

# ./configure -prefix /opt/libs/lam-7.0.4 --with-cflags=-O -with-fc=ifc \

# --with-f77flags=-O --without-romio

# please note that you might be able to use a lam or mpich version

# compiled with f77/g77, but then you need to add the following

# options: -Msecond_underscore (compilation) and -g77libs (linking)

# !!! Please do not send me any queries on how to install MPI, I will

# certainly not answer them !!!!

#=======================================================================

#-----------------------------------------------------------------------

# fortran linker for mpi: if you use LAM and compiled it with the options

# suggested above, you can use the following line

#-----------------------------------------------------------------------

FC=/usr/local/mpich2/bin/mpif90

FCL=$(FC)

#-----------------------------------------------------------------------

# additional options for CPP in parallel version (see also above):

# NGZhalf charge density reduced in Z direction

# wNGZhalf gamma point only reduced in Z direction

# scaLAPACK use scaLAPACK (usually slower on 100 Mbit Net)

#-----------------------------------------------------------------------

CPP = $(CPP_) -DMPI -DHOST=\"LinuxIFC\" -DIFC \

-Dkind8 -DNGZhalf -DCACHE_SIZE=4000 -DPGF90 -Davoidalloc \

-DMPI_BLOCK=500 \

# -DRPROMU_DGEMV -DRACCMU_DGEMV

#-----------------------------------------------------------------------

# location of SCALAPACK

# if you do not use SCALAPACK simply uncomment the line SCA

#-----------------------------------------------------------------------

BLACS=$(HOME)/archives/SCALAPACK/BLACS/

SCA_=$(HOME)/archives/SCALAPACK/SCALAPACK

#SCA= $(SCA_)/libscalapack.a \

# $(BLACS)/LIB/blacsF77init_MPI-LINUX-0.a $(BLACS)/LIB/blacs_MPI-LINUX-0.a $(BLACS)/LIB/blacsF77init_MPI-LINUX-0.a SCA=

#-----------------------------------------------------------------------

# libraries for mpi

#-----------------------------------------------------------------------

LIB = -L../vasp.4.lib -ldmy \

../vasp.4.lib/linpack_double.o $(LAPACK) \

$(SCA) $(BLAS)

# FFT: fftmpi.o with fft3dlib of Juergen Furthmueller

#FFT3D = fftmpi.o fftmpi_map.o fft3dlib.o

# fftw.3.0.1 is slighly faster and should be used if available

FFT3D = fftmpi.o fftmpi_map.o fft3dlib.o /usr/local/fftw/lib/libfftw3.a

#-----------------------------------------------------------------------

# general rules and compile lines

#-----------------------------------------------------------------------

BASIC= symmetry.o symlib.o lattlib.o random.o

SOURCE= base.o mpi.o smart_allocate.o xml.o \

constant.o jacobi.o main_mpi.o scala.o \

asa.o lattice.o poscar.o ini.o setex.o radial.o \

pseudo.o mgrid.o mkpoints.o wave.o wave_mpi.o $(BASIC) \

nonl.o nonlr.o dfast.o choleski2.o \

mix.o charge.o xcgrad.o xcspin.o potex1.o potex2.o \

metagga.o constrmag.o pot.o cl_shift.o force.o dos.o elf.o \

tet.o hamil.o steep.o \

chain.o dyna.o relativistic.o LDApU.o sphpro.o paw.o us.o \

ebs.o wavpre.o wavpre_noio.o broyden.o \

dynbr.o rmm-diis.o reader.o writer.o tutor.o xml_writer.o \

brent.o stufak.o fileio.o opergrid.o stepver.o \

dipol.o xclib.o chgloc.o subrot.o optreal.o davidson.o \

edtest.o electron.o shm.o pardens.o paircorrection.o \

optics.o constr_cell_relax.o stm.o finite_diff.o \

elpol.o setlocalpp.o

INC=

vasp: $(SOURCE) $(FFT3D) $(INC) main.o

rm -f vasp

$(FCL) -o vasp $(LINK) main.o $(SOURCE) $(FFT3D) $(LIB)

makeparam: $(SOURCE) $(FFT3D) makeparam.o main.F $(INC)

$(FCL) -o makeparam $(LINK) makeparam.o $(SOURCE) $(FFT3D) $(LIB)

zgemmtest: zgemmtest.o base.o random.o $(INC)

$(FCL) -o zgemmtest $(LINK) zgemmtest.o random.o base.o $(LIB)

dgemmtest: dgemmtest.o base.o random.o $(INC)

$(FCL) -o dgemmtest $(LINK) dgemmtest.o random.o base.o $(LIB)

ffttest: base.o smart_allocate.o mpi.o mgrid.o random.o ffttest.o $(FFT3D) $(INC) $(FCL) -o ffttest $(LINK) ffttest.o mpi.o mgrid.o random.o smart_allocate.o base.o $(FFT3D) $(LIB) kpoints: $(SOURCE) $(FFT3D) makekpoints.o main.F $(INC)

$(FCL) -o kpoints $(LINK) makekpoints.o $(SOURCE) $(FFT3D) $(LIB)

clean:

-rm -f *.g *.f *.o *.L *.mod ; touch *.F

main.o: main$(SUFFIX)

$(FC) $(FFLAGS)$(DEBUG) $(INCS) -c main$(SUFFIX)

xcgrad.o: xcgrad$(SUFFIX)

$(FC) $(FFLAGS) $(INLINE) $(INCS) -c xcgrad$(SUFFIX)

xcspin.o: xcspin$(SUFFIX)

$(FC) $(FFLAGS) $(INLINE) $(INCS) -c xcspin$(SUFFIX)

makeparam.o: makeparam$(SUFFIX)

$(FC) $(FFLAGS)$(DEBUG) $(INCS) -c makeparam$(SUFFIX)

makeparam$(SUFFIX): makeparam.F main.F

# MIND: I do not have a full dependency list for the include

# and MODULES: here are only the minimal basic dependencies

# if one strucuture is changed then touch_dep must be called

# with the corresponding name of the structure

base.o: base.inc base.F

mgrid.o: mgrid.inc mgrid.F

constant.o: constant.inc constant.F

lattice.o: lattice.inc lattice.F

setex.o: setexm.inc setex.F

pseudo.o: pseudo.inc pseudo.F

poscar.o: poscar.inc poscar.F

mkpoints.o: mkpoints.inc mkpoints.F

wave.o: wave.inc wave.F

nonl.o: nonl.inc nonl.F

nonlr.o: nonlr.inc nonlr.F

$(OBJ_HIGH):

$(CPP)

$(FC) $(FFLAGS) $(OFLAG_HIGH) $(INCS) -c $*$(SUFFIX)

$(OBJ_NOOPT):

$(CPP)

$(FC) $(FFLAGS) $(INCS) -c $*$(SUFFIX)

fft3dlib_f77.o: fft3dlib_f77.F

$(CPP)

$(F77) $(FFLAGS_F77) -c $*$(SUFFIX)

.F.o:

$(CPP)

$(FC) $(FFLAGS) $(OFLAG) $(INCS) -c $*$(SUFFIX)

.F$(SUFFIX):

$(CPP)

$(SUFFIX).o:

$(FC) $(FFLAGS) $(OFLAG) $(INCS) -c $*$(SUFFIX)

# special rules

#-----------------------------------------------------------------------

# these special rules are cummulative (that is once failed

# in one compiler version, stays in the list forever)

# -tpp5|6|7 P, PII-PIII, PIV

# -xW use SIMD (does not pay of on PII, since fft3d uses double prec)

# all other options do no affect the code performance since -O1 is used

#-----------------------------------------------------------------------

fft3dlib.o : fft3dlib.F

$(CPP)

$(FC) -FR -lowercase -O1 -xW -prefetch- -unroll0 -vec_report3 -c $*$(SUFFIX) fft3dfurth.o : fft3dfurth.F

$(CPP)