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生物基因组序列比对分析

2014年生物碱类药物分析考试试题

生物碱类药物分析考试试题 一、X型题(本大题12小题.每题1.0分,共12.0分。以下每题由一个题干和 A、B、C、D、E五个备选答案组成,题干在前,选项在后。要求考生从五个备选答案中选出二个或二个以上的正确答案,多选、少选、错选均不得分。) 第1题 生物碱类药物的测定方法有 A 提取中和法 B 非水溶液滴定法 C 碘量法 D 酸性染料比色法 E 阴离子表面活性剂滴定法 【正确答案】:A,B,D,E 【本题分数】:1.0分 第2题 生物碱常用的含量测定方法有 A 碱量法 B 非水碱量法 C 离子对比色法 D 紫外分光光度法 E 色谱法 【正确答案】:A,B,C,D 【本题分数】:1.0分 第3题 非水滴定法测定硫酸奎宁含量的反应条件为 A 冰醋酸-醋酸为溶剂 B 高氯酸滴定液(0.1mol/滴定

C 1mol的高氯酸与1/3mol的硫酸奎宁反应 D 仅用电位法指示终点 E 溴酚蓝为指示剂 【正确答案】:A,B,C 【本题分数】:1.0分 第4题 提取中和法中所用提取溶剂应具备的条件是 A 与水不相混溶 B 对生物碱及其他物质的溶解度均大 C 与生物碱不起反应 D 与碱化试剂不起反应 E 沸点高,不易挥发 【正确答案】:A,C,D 【本题分数】:1.0分 第5题 非水溶液滴定法测定硫酸奎宁含量的反应条件为 A 冰醋酸-醋酐为溶剂 B 高氯酸滴定液(0.1mol/滴定 C 1mol的硫酸奎宁与3mol的高氯酸反应 D 电位法指示终点 E 溴酚蓝为指示剂 【正确答案】:A,B,C,D 【本题分数】:1.0分 第6题 酸性染料比色法中常用的酸性染料有 A 亚甲蓝

高中生物经典试题解析142

斯氏鼠种类众多,是遗传学研究的常用材料。下图是某种斯氏鼠(2N=44)的一些基因在染色体上的排列情况。该种成年鼠的尾长受三对等位基因A-a、D-d、F-f控制(独立遗传),这三对基因的遗传效应相同,且具有累加效应(AADDFF的成鼠尾最长,aaddff的成鼠尾最短)。请回答下列问题: (1)在该鼠的种群中,与尾长有关的基因型和表现型分别有___________种。用图中亲本杂交获得F1,F1雌雄个体相互交配获得F2。则F2中成鼠尾长与亲本不相同的个体占________。 (2)将斯氏鼠生发层细胞染色体上的DNA用3H标记后(即第一代细胞)转移到无放射性的培养液中培养,在第二代细胞进行分裂的后期细胞中,含放射性的染色体数目是________条。 (3)斯氏鼠的野生型与无毛是一对相对性状,分别由等位基因E、e控制,位于1、2号染色体上。经多次实验,结果表明,上述亲本杂交得到F1后,让F1的雌雄鼠自由交配,所得F2中野生型所占比例是2/5,请推测其原因是_____________________。(4)斯氏鼠的体色由两对基因控制,Y代表黄色,y代表鼠色,B决定有色素,b决定无色素(白色)。已知Y与y位于1、2号染色体上,以纯合黄色鼠做母本,隐性纯合白色鼠做父本设计实验探究另一对等位基因(B、b)是否也位于1、2号染色体上(只考虑体色,不考虑其他性状和交叉互换)。 第一步:父本和母本杂交得到F1: 第二步:___________________________________________________________; 第三步:____________________________________________________________。

【高中生物】跨膜运输的实例(渗透作用)典型例题

1.【不同浓度不同溶质对渗透作用的影响】下图表示以洋葱表皮为实验材料,质量浓度为0.3g/mL的蔗糖溶液,质量浓度为0.5g/mL的蔗糖溶液,质量浓度为0.3g/mL的尿素溶液及清水进行相关实验(时间n表示开始用清水处理洋葱表皮),测得该细胞原生质体积变化,图中代表尿素溶液处理结果的是( ). A. a B. b C. c D. d 2.【重力对渗透作用的影响】下图1表示渗透作用装置,一段时间后液面上升的高度为h,其中半透膜为膀胱膜,装置溶液A、a起始浓度分别用MA、Ma表示,如果A、a均为蔗糖溶液,且开始时Ma>MA,则达到平衡后MA _______ Ma. 【变式】下图为渗透作用实验,开始如图(一),A代表清水,B、C代表蔗糖溶液,过一段时 间后结果如图(二),漏斗管内液面不再发生变化,H1、H2表示漏斗管内液面与清水的高度差。 下列说法错误的是() A.图(一)中B的浓度大于C的浓度 B.图(二)中B的浓度等于C的浓度 C.图(一)中A中水分子扩散到B的速率大于A中水分子扩散到C的速率 D.图(二)中A中水分子扩散到B的速率等于B中水分子扩散到A的速率 3.【判断浓度大小】下表为甲同学用某浓度KNO3溶液进行质壁分离实验时所测得的数据,下图为乙同学用另一浓度的KNO3溶液进行质壁分离实验时所绘制的曲线图,下列分析正确的是 A.甲同学所用溶液浓度要大于乙同学 B.甲同学实验进行到8分钟时质壁分离达到平衡,滴 加清水后发生质壁分离复原 C.乙同学在实验进行到T1时可观察到质壁分离现象,此时细胞液浓度一定小于外界溶液浓度 D.乙同学在实验进行到T2时观察不到质壁分离现象,此时细胞液浓度一定等于外界溶液浓度

高中生物经典例题,很值得一看!

(2013新课标)3.关于植物细胞主动运输方式吸收所需矿质元素离子的叙述,正确的是()A.吸收不同矿质元素离子的速率都相同 B.低温不影响矿质元素离子的吸收速率 C.主动运输矿质元素离子的过程只发生在活细胞中 D.叶肉细胞不能以主动运输的方式吸收矿质元素离子 【答案】C (2013重庆)3.下列与实验相关的叙述,错误的是 A.马铃薯块茎捣碎后的提取液可检测出蛋白质 B.光学显微镜,可用于观察植物细胞的质壁分离现象 C.检测酵母菌培养过程中是否产生 CO2,可判断其呼吸方式 D.在 95%乙醇中加入无水 Na2CO3 后可提高色素的溶解度 【答案】C (2013海南)2.关于细胞代谢的叙述,错误的是 A.无氧呼吸能产生ATP,但没有[H]的生成过程 B.有氧呼吸过程中生成的[H]可在线粒体内氧化生成水 C.某些微生物可利用氧化无机物产生的能量合成有机物 D.光合作用光反应阶段产生的[H]可在叶绿体基质中作为还原剂 无氧呼吸与有氧呼吸的第一阶段是完全相同的,都产生少量的ATP和[H],有氧呼吸的第三阶段是指在线粒体内膜上前两个阶段产生的[H]与氧气氧化生成水,故A项错误、B项正确;硝化细菌可利用氧化环境中氨气产生的能量合成糖类等有机物,故C项正确;光合作用光反应阶段水的光解产生的[H]在暗反应阶段叶绿体基质中作为还原剂还原C3化合物,故D项正确 (2013海南)3.关于温度对酶活性影响的叙述,错误的是 A.不同酶的最适温度可能相同 B.随着温度降低,酶促反应的活化能下降 C.酶活性最高时的温度不适合该酶的保存 D.高温下酶失活是酶空间结构破坏的结果 在某种恒温动物如人体内各种酶的最适温度应为37℃左右,A项正确;随着温度降低,酶的活性下降,酶促反应的活化能不变,B项错误;低温有利于酶的保存,C项正确;高温下酶空间结构破坏导致酶失活,D项正确。 (2013海南)4.关于真核细胞中生命活动与能量关系的叙述,错误的是 A.DNA复制需要消耗能量 B.光合作用的暗反应阶段需要消耗能量 C.物质通过协助扩散进出细胞时需要消耗ATP D.细胞代谢所需的ATP可在细胞质基质中产生 物质通过协助扩散进出细胞的动力是膜内外的浓度差,不需要消耗ATP,C项错误;DNA复制需要消耗的能量由细胞呼吸产生的ATP提供,光合作用的暗反应阶段需要消耗的能量由光反应阶段产生的ATP提供,细胞代谢所需的ATP可在细胞质基质中和线粒体中产生。故A、B、D三项正确。 (2013海南)8.关于叶绿素提取的叙述,错误的是 A.菠菜绿叶可被用作叶绿素提取的材料 B.加入少许CaC03能避免叶绿素被破坏 C.用乙醇提取的叶绿体色素中无胡萝卜素 D.研磨时加入石英砂可使叶片研磨更充分

DNA测序结果分析比对(实例)

DNA测序结果分析比对(实例) 关键词:dna测序结果2013-08-22 11:59来源:互联网点击次数:14423 从测序公司得到的一份DNA测序结果通常包含.seq格式的测序结果序列文本和.ab1格式的测序图两个文件,下面是一份测序结果的实例: CYP3A4-E1-1-1(E1B).ab1 CYP3A4-E1-1-1(E1B).seq .seq文件可以用系统自带的记事本程序打开,.ab1文件需要用专门的软件打开。软件名称:Chromas 软件Chromas下载 .seq文件打开后如下图: .ab1文件打开后如下图: 通常一份测序结果图由红、黑、绿和蓝色测序峰组成,代表不同的碱基序列。测序图的两端(下图原图的后半段被剪切掉了)大约50个碱

基的测序图部分通常杂质的干扰较大,无法判读,这是正常现象。这也提醒我们在做引物设计时,要避免将所研究的位点离PCR序列的两端太近(通常要大于50个碱基距离),以免测序后难以分析比对。 我的课题是研究基因多态性的,因此下面要介绍的内容也主要以判读测序图中的等位基因突变位点为主。 实际上,要在一份测序图中找到真正确实的等位基因多态位点并不是一件容易的事情。一般认为等位基因位点假如在测序图上出现像套叠的两个峰,就是杂合子位点。实际比对后才知道,情况并非那么简单,下面测序图中标出的两个套峰均不是杂合子位点,如图并说明如下:

说明: 第一组套峰,两峰的轴线并不在同一位置,左侧的T峰是干扰峰;第二组套峰,虽两峰轴线位置相同,但两峰的位置太靠近了,不是杂合子峰,蓝色的C峰是干扰峰通常的杂合子峰由一高一略低的两个轴线相同的峰组成,此处的序列被机器误判为“C”,实际的序列应为“A”,通常一个高大碱基峰的前面 1~2个位点很容易产生一个相同碱基的干扰峰,峰的高度大约是高大碱基峰的1/2,离得越近受干扰越大。 一个摸索出来的规律是:主峰通常在干扰峰的右侧,干扰峰并不一定比主峰低。最关键的一点是一定要拿疑似为杂合子峰的测序图位点与测序结果的文本序列和基因库中的比对结果相比较;一个位点的多个样本相比较;你得出的该位点的突变率与权威文献或数据库中的突变率相比较。 通常,对于一个疑似突变位点来说,即使是国际上权威组织大样本的测序结果中都没有报道的话,那么单纯通过测序结果就判定它是突变点,是并不严谨的,因一份 PCR产物中各个碱基的实际含量并不相同,很难避免不产生误差的。对于一个未知突变位点的发现,通常还需要用到更精确的酶切技术。 (责任编辑:大汉昆仑王)

高中生物经典试题解析177

果蝇的眼色由两对独立遗传的基因(A、a和B、b)控制(已知A、a基因位于2号常染色体上),其中A和B同时存在时果蝇表现为红眼,B存在而A不存在时为粉红眼,其余情况为白眼.现选择两只红眼雌、雄果蝇交配,产生的后代如下图所示,请回答: ⑴亲代雌、雄果蝇的基因型分别为___________________________。 ⑵F1雌果蝇中杂合子所占的比例为__________。雄果蝇能产生________种基因型的配子。 ⑶从F1中选出红眼雌蝇和红眼雄蝇各一只进行杂交,所得子代中粉红眼果蝇出现的概率为_________。 ⑷果蝇体内另有一对基因T、t位于X染色体上,当t基因纯合时(X t X t、X t Y均视为纯合)对雄果蝇无影响,但会使雌果蝇性反转成不育的雄果蝇。某次杂交试验中,让纯合红眼雌果蝇与不含T基因的纯合白眼雄果蝇杂交,F1随机交配得F2,发现F2无粉红眼果蝇出现,则亲代雄果蝇的基因型为_____________。F2雌雄个体自由交配,F3雄性个体中,不含Y染色体的个体所占比例为________。 【解析】⑴已知A、a基因位于2号常染色体上,结合柱形图分析果蝇的眼色与性别相关联,故B、b基因应位于X染色体上,

⑵或者F1雌果蝇中杂合子=1-纯合子(1/2×1/2) =1-1/4=3/4。F1中雄果蝇基因型为,故雄果蝇能产生AX B、AX b、aX B、aX b、AY、aY共计6种基因型的配子。 ⑶ ⑷

由交配,F3雄性个体中,不含Y染色体的个体所占比例为 【答案】⑴AaX B X b AaX B Y ⑵3/4 6 ⑶ 7/72 ⑷AAX tb Y 1/9

最新药物分析教案——第十章 生物碱类药物的分析

第十章生物碱类药物的分析 第一节概述 1、定义 生物碱是一类含氮的碱性有机化合物 绝大部分存在于植物体内,有明显生理活性或毒性, 如:利血平→抗高血压药物 阿片→镇痛→存在于罂粟 莨菪碱→解痉→存在于颠茄植物中 麻黄碱→缩血管→存在于麻黄植物中 黄连素→抗菌→存在于小檗碱植物中 2、生物碱地通性 (1)分子中都含有氮原子 (2)显碱性,能和酸成盐 (3)碱性,季铵结构>叔胺>环酰胺 脂肪胺、脂环胺>芳香胺 (4)如分子中同时含有酚羟基或羧基,则具有两性性质 (5)生物碱不溶于水,易溶于有机溶剂中 生物碱盐则不溶于有机溶剂,易溶于水。 3、生物碱鉴别 (1)化学鉴别法 ○1沉淀反应 和生物碱沉淀试剂反应 生物碱沉淀试剂:如碘化汞钾,碘化铋钾,碘-碘化钾,氯化汞等 形成难溶于水的沉淀,沉淀有不同颜色,可用于鉴别。 如:加兰他敏 加碘化汞钾→黄白色沉淀 加碘化铋钾→橙红色沉淀 ○2生物碱显色反应 与生物碱显色试剂反应,生成不同颜色 生物碱显色试剂: 对二甲氨基苯甲醛、香草醛、甲醛硫酸、氧化性试剂(硝酸、溴、氯酸钾等)、三氯化铁○3专属性鉴别反应 托烷类生物碱鉴别反应:加发烟硝酸,醇制KOH,产生深紫色 如:阿托品,山莨菪碱、东莨菪碱 举例:P212,表10-3 (2)熔点测定法 测定生物碱熔点 测定生物碱盐熔点,如形成碘化汞钾、碘化铋钾等不溶性盐,测定熔点 (3)紫外特征吸收 如分子中含有双键或共轭系统,有紫外吸收特征 如硝酸一叶秋碱:7ug/ml水溶液,在256nm波长处有最大吸收 (4)红外光谱 供试品光谱与标准品光谱对照,一致

4、生物碱类药物的检查 (1)杂质检查 生物碱类药物一般都从植物中提取或是半合成的,因此有许多杂质, 检查方法: ○1薄层层析法 供试品溶液和标准杂质品作薄层层析,对照 ○2化学方法 如磷酸可待因中检查吗啡 可待因无酚羟基,而吗啡有酚羟基,因此可用三氯化铁试液检查 ○3高效液相色谱法 抗肿瘤药物长春新碱用高效液相色谱检查杂质 (2)制剂含量均匀度和溶出度测定 (3)溶剂残留量与含醇量的检查 许多生物碱存在于植物体内,用溶剂提取,(有些溶剂有毒,如甲醇,氯仿等),因此必须做检查。 第二节生物碱类药物的含量测定 含量测定方法较多 一、非水碱量法 本类药物含有氮原子显碱性,在冰醋酸-醋酐溶液中可用高氯酸直接滴定。 指示剂:结晶紫 + B.HX+ HClO4 B.HClO4HX 实际上是一个置换滴定,强酸置换出弱酸 在冰醋酸中,酸性大小: HClO4>HBr>H2SO4>HCl>HSO4_>HNO3>有机酸 HBr、HCl酸性虽不及HClO4,但也是一个较强酸,滴定时,容易使终点提前,结果偏低。 所以,在滴定前应加入醋酸汞[Hg(Ac)2]使生成在冰醋酸中难以解离的卤化汞,消除影响。 + B.HX+ Hg(Ac)2 B.HAc HgX2 22 试验注意点: (1)一般生物碱都为一元酸盐,所以滴定比例为1:1 (2)如为生物碱的硫酸盐,硫酸为二元酸,在滴定过程中只能滴定到硫酸氢盐阶段,所以,硫酸盐的生物碱滴定比例为1:1 (BH+)2.SO4HClO4(BH+).ClO4(BH+).HSO4- + + 如:硫酸阿托品药物 (3)硫酸奎宁、硫酸奎尼丁中含有4个氮原子,但只有2个氮原子和硫酸成盐。 因此,用高氯酸滴定的比例为1:3

基因组序列的差异分析

基因组序列的差异分析 ----mVISTA的在线使用说明 当然,除了在线版的,我们还可以在网站上填写信息申请离线的软件。但我试用了一下,需要先自己比对,然后要按照一定的格式来制作文件,当然你还必须得安装java才能运行软件;总之,我感觉没有在线版的方便。 1 将数据放入服务器中 在首页,你将被要求确定你想要分析的基因组序列的数量。输入这个数字之后,点击“提交”,将带你到主提交页面。 mVISTA服务器最多可以同时处理100条序列。 1.1主提交页面必填的内容 E-mail 地址 通过E-mail,我们可以提示你的在线处理已经得到结果。

序列 你可以用2种方式来上传你的序列: 1.使用“Browse”按钮从你的电脑上,上传纯文本的Fasta格式文件。如果是一个作为参 考的生物体的DNA序列必须作为一个contig提交(可以进行一定的定向排列将多个片段合并为一个contig),而其他非参考序列可以在一个或多个contig中提交(draft)。 Fasta格式的示例序列(您可以在NCBI站点上找到关于该格式的更多细节): >mouse ATCACGCTCTTTGTACACTCCGCCATCTCTCTCT … !!!注意:序列里面我们只接受字母CAGTN和X。请确保提交序列是作为一种纯文本格式,而不是Word或HTML文件格式。 如果您以FASTA格式提交序列,我们建议您为它取一个有意义的名称(比如直接是你的物种名之类的),因为这些名称将出现在我们生成的图形中。如果您使用的是一个draft草图序列,那么结果中每个contigs的命名都将按照您在“>”符号后指示的命名进行。 2.您可以给出它的GenBank登录号,系统将自动从GenBank数据库里进行检索序列。 在这两种情况下,序列的总大小都不应超过10M,而且任何一条序列都不应超过2M。 1.2主提交页面选填的内容 这些选项允许您自定义您的VISTA分析。您可以使用独立获得的基因注释,选择合适的Repeat Masker选项,给分析的序列指定名称,并改变序列保存分析的参数。如果您没有填写这些选填选项,我们将使用它们的默认值。 比对程序 根据您分析的具体内容(参见“about”-链接中的详细信息),您可以选择以下比对程序之一:1、AVID----全局两两比对。如果您选择使用这个程序,其中一个序列应该被完成比对,其他 所有序列可以完成或以草图draft格式完成。对于集合中所有已完成的序列,AVID生成所有相对所有成对的比对结果,可以使用任何序列作为基础(参考)来显示。如果某些序列是草图格式,AVID将生成它们与最终序列的比对,这将被用作基础(参考)。这是该服务器上唯一可以处理草图序列的比对程序。 (小知识:草图序列与完整序列DNA sequence, draft: Sequence of a DNA with less accuracy than a finished sequence. In a draft sequence, some segments are missing or are in the wrong order or are oriented incorrectly. A draft sequence is as opposed to a finished DNA sequence.)2、LAGAN----完成完整序列的全局两两比对和多重比对。如果某些序列是草图格式,您的查 询将被重定向到AVID以获得两两比对。多重比对将由VISTA可视化,它将计算并显示序列的保守区,以您指示的任何序列作为参考。这是该服务器上唯一能够产生真正的多重

高中生物必刷经典题专题1.2遗传规律(能力提升)(含解析)(必修2)

遗传规律 1.人的血友病属伴性遗传病,苯丙酮尿症属常染色体遗传病。一对表现正常的夫妇,生下一个两病皆患的男孩,如果他们再生一个女孩,该女孩表现正常的概率是 A.9/16 B.3/4 C.3/16 D.1/4 2.下列有关遗传规律的叙述中,正确的是 A.在减数分裂过程中,非等位基因之间一定能发生自由组合 B.若两对基因可独立遗传,则显性杂合子杂交后代的性状分离比一定是9∶3∶3∶1 C.人类的红绿色盲不遵循基因的分离定律 D.只根据杂交后代出现性状分离比为3∶1,无法确定基因位于何种染色体上 3.一对表现型正常的夫妇生了一个患半乳糖血症的女儿和一个正常的儿子。若这个儿子与一个半乳糖血症携带者的女性结婚,他们所生子女中,理论上患半乳糖血症女儿的可能性是 A.1/12 B.1/8 C.1/6 D.1/3 4.人群中甲病(A/a基因控制)和乙病(B/b基因控制)均为单基因遗传病,其中有一种病为伴性遗传病。已知人群中每100人中有一个甲病患者,下面的系谱图中Ⅱ3无甲病致病基因,下列说法错误的是 A.I1和I2生一个正常女孩的概率为3/8 B.Ⅱ6产生的配子基因组成为AX B的概率为5/11 C.Ⅱ3和Ⅱ4生一个只患一种病的孩子的概率为1/4 D.Ⅲ7和Ⅲ8生一个两病兼患的孩子的概率为1/48 5.某植物花色有白色和蓝色两种,花色由等位基因A/a、B/b控制,其中基因A、a位于常染色体上,基因 B、b位于X染色体上,基因与花色的关系如图所示。基因型为AAX B X B的个体与基因型为aaX b Y的个体杂交 得到F1,F1雌雄个体杂交得到F2,下列说法错误的是 A.两对等位基因的遗传遵循基因的自由组合定律 B.蓝花个体的基因型有aaX B Y、aaX B X B、aaX B X b三种

实验--基因结构预测分析

学院:______ 班级:_______ 学号:_________ 姓名:__________ 成绩:______ 实验五基因结构预测分析 目的: 1、熟悉并掌握从基因组核酸序列中发现基因的方法。 内容: 1、用NCBI的ORF Finder分析原核生物核酸序列或真核生物的cDNA序列中的开放阅读框; 2、使用GENSCAN在线软件预测真核生物基因; 3、使用POL YAH在线预测转录终止信号; 4、使用PromoterScan在线预测启动子区域。 操作及问题: 随着测序技术的不断发展,越来越多的模式生物启动了全基因组测序计划,完成全基因组测序的物种也越来越多,使得基因结构和功能的预测成为可能。同时,通过基因组文库筛选也可得到目的基因所在克隆。获得克隆序列后,同样也需要对目的基因做结构预测以便指导后续功能研究。本实验介绍几种常用的基因预测分析工具,预测核酸序列的开放阅读框、转录终止信号、启动子、CpG岛等信息。 一、开放阅读框(open reading frame,ORF)的识别 ORF是指从核酸序列上5’端翻译起始密码子到终止密码子的蛋白质编码序列。原核生物与真核生物的基因结构存在很大不同,真核生物的ORF除外显子(平均150bp)外,还含有内含子,因此真核生物基因的预测远比原核生物复杂。 (一)利用NCBI ORF Finder预测原核生物核酸序列或真核生物的cDNA序列中的开放阅读框。https://www.sodocs.net/doc/e16949712.html,/gorf/gorf.html 1、在NCBI上查找AC 号为AE008569 的核酸记录。(见实验五中的AE008569.mht) 问题1:这个序列的名称? 问题2:这个序列来源物种所属的生物学大分类?

实验三蛋白序列比对到基因组

实验三蛋白序列比对到基因组(GeneWise and exonerate)实验目的 1)了解基因结构,acceptor, sponsor 等概念 2)理解将蛋白序列比对到基因组的应用 3)掌握利用GeneWise 将蛋白序列定位到基因组上并得到基因结构 实验数据及软件 ftp://172.28.137.55/pub/lab_materia/biosoft/lab03/ 1、Genewise 简介 Genewise 是EBI 的Ewan Birney 和他的同事们开发的一套 软件系统,用来做蛋白质序列和DNA 序列之间的比对,软件比对过程中会考虑剪切位点信息,所以能够定义出intron/exon 结构,同时它和blast 的最大区别是它能够把基因的多个exon 的链接起来,从而得到基因整体的比对情况。Genewise 只能一次进行 一条蛋白序列和一条核酸序列的比对,同等运算量的情况下,运行时间较blast,blat,sim4 等慢,由于进行的是蛋白质水平的比对,所以敏感性比blat,sim4 等要高。 2、下载 可从EBI 网站上下载,下载地址: ftp://https://www.sodocs.net/doc/e16949712.html,/pub/software/unix/wise2/wise2.2.0.tar.gz(FTP 服务器上已经下载有) 3、安装 1)解压缩 2)编译, $ cd src $ make all 3)设置环境变量:WISECONFIGDIR 4、使用语法 genewise genewise –genesf [other options] 参数提示 1.默认情况下,蛋白序列和dna 序列的正链进行比对,即-tfor 参数;如果用户 不确定蛋白质序列是在dna 序列的正链上还是反链上,可以改用-both 参数; 2.当用户需要使用genewise 比对得到的dna 序列时,可以通过添加-cdna 得到;可以通过-trans参数得到对应的氨基酸序列; 应用1—确定基因结构 genewise –both –genesf input-protien3.fa input-dna3.fa > output3.genewise.out 结果(部分)

生物碱类药物的性质

生物碱类药物(重点在鉴别,n的位置,有哪些电效应) 苯烃胺类(盐酸麻黄碱和盐酸伪麻黄碱) 氮原子在侧链上,碱性较一般生物碱强,易与酸成盐。 托烷类(硫酸阿托品和氢溴酸山莨菪碱) 阿托品和山莨菪碱是由托烷衍生的醇(莨菪醇)和莨菪酸缩合而成,具有酯结构。分子结构中,氮原子位于五元酯环上,故碱性也较强,易与酸成盐。 喹啉类(硫酸奎宁和硫酸奎尼丁) 奎宁和奎尼丁为喹啉衍生物,其结构分为喹啉环和喹啉碱两个部分,各含一个氮原子,喹啉环含芳香族氮,碱性较弱;喹啉碱微脂环氮,碱性强。 异喹啉类(盐酸吗啡和磷酸可待因) 吗啡分子中含有酚羟基和叔胺基团,故属两性化合物,但碱性略强;可待因分子中无酚羟基,仅存在叔胺基团,碱性较吗啡强。 吲哚类(硝酸士的宁和利血平) 士的宁和利血平分子中含有两个碱性强弱不同的氮原子,n1处于脂肪族碳链上,碱性较n2强,故士的宁碱基与一分子硝酸成盐。 黄嘌呤类(咖啡因和茶碱) 咖啡因和茶碱分子结构中含有四和氮原子,但受邻位羰基吸电子的影响,碱性弱,不易与酸结合成盐,其游离碱即供药用。 鉴别试验:特征鉴别反应。 1.双缩脲反应系芳环侧链具有氨基醇结构的特征反应。 盐酸麻黄碱和伪麻黄碱在碱性溶液中与硫酸铜反应,cu2+与仲胺基形成紫堇色配位化合物,加入乙醚后,无水铜配位化合物及其有2 个结晶水的铜配位化合物进入醚层,呈紫红色,具有4个结晶水的铜配位化合物则溶于水层呈蓝色。 2.vitali反应系托烷生物碱的特征反应。

硫酸阿托品和氢溴酸山莨菪碱等托烷类药物均显莨菪酸结构反应,与发烟硝酸共热,即得黄色的三硝基(或二硝基)衍生物,冷后,加醇制氢氧化钾少许,即显深紫色。 3.绿奎宁反应系含氧喹啉(喹啉环上含氧)衍生物的特征反应硫酸奎宁和硫酸奎尼丁都显绿奎宁反应,在药物微酸性水溶液中,滴加微过量的溴水或氯水,再加入过量的氨水溶液,即显翠绿色。 4.marquis反应系吗啡生物碱的特征反应。 取得盐酸吗啡,加甲醛试液,即显紫堇色。灵敏度为0.05μg. 5.frohde反应系吗啡生物碱的特征反应。 盐酸吗啡加钼硫酸试液0.5ml,即显紫色,继变为蓝色,最后变为棕绿色。灵敏度为0.05μg. 6.官能团反应系吲哚生物碱的特征反应。 利血平结构中吲哚环上的β位氢原子较活泼,能与芳醛缩合显色。 与香草醛反应。利血平与香草醛试液反应,显玫瑰红色。 与对-二甲氨基苯甲醛反应。利血平加对-二氨基苯甲醛,冰醋酸与硫酸,显绿色,再加冰醋酸,转变为红色。 7.紫脲酸反应系黄嘌呤类生物碱的特征反应。 咖啡因和茶碱中加盐酸与氯酸钾,在水浴上蒸干,遇氨气即生成四甲基紫脲酸铵,显紫色,加氢氧化钠试液,紫色即消失。 8.还原反应系盐酸吗啡与磷酸可待因的区分反应。 吗啡具弱还原性。本品水溶液加稀铁氰化钾试液,吗啡被氧化生成伪吗啡,而铁氰化钾被还原为亚铁氰化钾,再与试液中的三氯化铁反应生成普鲁士蓝。 可待因无还原性,不能还原铁氰化钾,故此反应为吗啡与磷酸可待因的区分反应。 特殊杂质检查: 利用药物和杂质在物理性质上的差异。 硫酸奎宁中“氯仿-乙醇中不溶物”的检查盐酸吗啡中“其它生物碱”的检查旋光性的差异:用于硫酸阿托品中“莨菪碱”的检查对光选择性吸收的差异:利血平生产或储存

高中生物经典试题解析40

烟草是常见的一种经济植物,为雌雄同株,却无法自交产生后代。这是由S基因控制的遗传机制所决定的,S基因位点上有多种基因(S1、S2、S3等)当花粉所含S基因与母本的S基因相同时,花粉管就不能伸长完成受精。其规律如下图所示(注:精子通过花粉管输送到卵细胞所在处,完成受精)。请回答下列问题: (1)烟草的S基因分为S1、S2、S3等15种,它们之间的根本区别是_________,其遗传遵循_________定律。 (2)若二株烟草杂交后代(子一代)的基因型为S1S2和S1S3 ,则母本的基因型为_________,父本的基因型为_________。 (3)已知基因A、a分别控制烟草的红花和黄花,它和S基因均位于2号染色体上。现用两株基因型为aaS1S2 (♀)和AaS2S3(♂)的烟草杂交(减数分裂时不发生交叉互换),预测后代的花色及比例 __________________________________________。

(4)现有2号染色体三体(即2号染色体有三条)的某红花烟草植株,欲用黄花做父本去测定其基因型,则推测可知(要求写出表现型及比例,不考虑S基因): 若后代____________________________,则该个体的基因型为AAA;若后代____________________________,则该个体的基因型为AAa;若后代____________________________,则该个体的基因型为Aaa;【解析】(1)烟草的S1、S2、S3基因是一组复等位基因,是基因突变的结果,它们之间的根本区别是基因中的碱基对的排列顺序不同,遵循基因分离定律。 (2) 根据子一代:S1S2和S1S3则推断亲本基因型可能为S1S2、S1S3和S2S3

第八篇 生物碱类药物分析

第八章生物碱类药物的分析 Pharmaceutical Analysis of alkaloids 一、概述 (一)定义:生物碱是一类存在于生物体内的含氮有机化合物。(二)分类 1.芳烃胺类 硫酸苯丙胺,精神振奋药pK b= 9.9 盐酸麻黄碱,肾上腺受体激动药pK b= 9.6 2.异喹啉类 盐酸吗啡,镇痛药pK b1= 8.0,pK b2= 9.9 磷酸可待因,镇痛镇咳药;盐酸黄连素,抗菌药;度冷丁等3.喹啉类 硫酸奎宁,抗疟药;异构体硫酸喹尼丁,抗心率失常药; pK b1= 5.07,pK b2= 9.7 4.托烷类 硫酸阿托品,抗胆碱药pK b= 9.9 氢溴酸东莨菪碱,抗胆碱药pK b= 7.6; 5.黄嘌呤类 咖啡因,pK b= 14.15(碱性极弱); 茶碱,平滑肌松弛药,含活泼氢酸性; 6.吲哚类 硝酸士的宁,中枢神经兴奋药pK b1= 6.0,pK b2= 11.7(酰胺) 硫酸长春新碱,抗肿瘤药;利血平,抗高血压药; 7.其他类 硝酸毛果芸香碱,缩瞳药。 由上可知,生物碱类药物有如下特点。 (三)特点 1.数量多,绝大多数存在于植物体内; 已发现3000多种,100多种有效,中成药中富含生物碱。 2.生理活性强,但大都有毒性

因此,质量控制和临床应用尤应慎重,许多为特殊管制药物,并已超出药物分析的范畴,体育运动中的兴奋剂问题,世界关注的毒品问题,许多是生物碱类成分。该类药物的质量应严格控制,以保证用药的安全和有效。 我们药物分析学所关注的是其结构特征和利用这些特征,建立相应的鉴别、检查和含量测定。 (四)结构特征和分析方法间的关系 1.碱性:N原子的存在,强弱从N上的取代基是供电子还是吸电子基团,空间位阻两方面考虑。 1)一般情况:季铵>仲铵>伯铵>叔铵>NH3>环酰铵 2)脂肪铵>脂环铵>芳铵 3)个别两性化合物如吗啡有酸性(酚羟基),茶碱只有酸性(活泼氢) 2.存在状态多数以盐的形式存在 1)植物中多与有机酸成盐如吗啡罂粟酸盐,鞣酸奎宁盐; 2)药用多为多为无机酸盐如盐酸、硫酸、磷酸和硝酸盐。 含量测定应考虑上述2个因素,碱性强弱选择滴定溶液和指示剂,成盐的情况在非水滴定时要考虑对滴定的干扰。 3.溶解性 1)共性:游离生物碱易溶于CHCl3等中等极性有机溶剂,难或不溶于水,溶于稀酸溶液;成盐易溶于水; 2)个性:两性和酸性化合物易溶于稀碱溶液(吗啡和茶碱);麻黄碱和咖啡因能溶于水;咖啡因和利血平碱性极弱,不能与酸结合成稳定的盐。 溶解性可以用于提取分离和鉴别时的重要依据。 4.光谱特点 1)旋光性多含不对称碳原子,故有旋光性,药效学研究表明许多手性药物一般效用不同,或药效有强弱、或效价低、或无效,甚至有毒副作用。如今手性合成和分离是药学研究的热点和难点之一; 2)紫外吸收多含不饱和双键。 5.与生物碱沉淀试剂和显色试剂反应 上述是生物碱类药物的一般共性。 6.取代基的性质(个性)

高中生物 生长素典型例题:

生长素典型例题: 例题:观察下图,当燕麦胚芽鞘受单侧光照射时,以下说法不正确的是 ( ) A. 生长素由②处向①处运输 B. 生长素由④处向③处运输 C. 生长素由①处向③处运输 D. ③处生长比④处快 解析:本题考查的知识点是植物的向性运动和生长素的发现, 生长素的生理作用。许多学生在解答这类问题时,感觉到很费 脑筋,费时较多,错误率较高。 要解决好这类问题,必须弄清四个重要问题:感光部位在尖端;弯曲部位在尖端下面一段;生长素的横向运输和极性运输。 1. 为什么说感光部位在尖端? 首先,产生生长素的部位是尖端。在植物体内,生长素主要在叶原基、芽原基、嫩叶和发育中的种子中产生,大多集中在生长旺盛的部位。 其次,生长素在尖端具有横向运输的能力。原因是单侧光引起器官尖端的不同部位产生电位差,向光一侧带负电荷,背光一侧带正电荷,引起弱酸性的吲哚乙酸阴离子向带正电荷的背光一侧移动,所以背光一侧的生长素分布的比较多。所以,在单侧光的照射下,生长素在背光一侧比向光一侧分布多。 2. 为什么弯曲部位会在尖端下面一段? 生长素在植物体内具有极性运输的特性。生长素在植物体内的运输,主要是从植物形态学的上端向下端运输,而不能倒转过来运输。生长素对植物生长的促进作用,与其浓度有很 大关系。 图中①②表示尖端部位(感光部位),③④表示尖端下面一段 (弯曲部位)。当胚芽鞘处于单侧光的照射下,尖端产生的生长素由向光一侧②处向背光一侧①处横向运输,结果①处的生长素多于②处;由于极性运输,③处生长素比④处多,结果③处生长比④处快。 适应性练习: 1.(2000年广19)将燕麦胚芽鞘尖端放在琼脂小块上,正中插入生长素不能透过的云母片,琼脂被分成相等的两部分(见右图)。单侧光照射后,琼脂内生长素含量 A. A. 左右相等 B. B. 左多右少 C. C. 左少右多 D. D. 左右均无 2.(2000年上40)右图4个实验中燕麦胚芽稍能继续伸长生 尖端下部

生物碱类药物的分析

生物碱类药物的分析 一、最佳选择题 1. 非水溶液滴定法测定硫酸奎宁原料药的含量,1摩尔硫酸奎宁可消耗高氯酸的摩尔数为 A.1 B.2 C.3 D.4 E.5 答案:C [解答] 本题考查重点是对生物碱盐用高氯酸滴定液滴定时两者反应分子关系的掌握。 2. 硫酸阿托品中莨菪碱的检查是利用了两者 A.旋光性质的差异 B.溶解度差异 C.酸碱性的差异 D.紫外吸收光谱差异 E.吸附性差异 答案:A [解答] 本题考查重点是药物为外消旋体时,即使有不对称碳原子,也无旋光性。阿托品为莨菪碱的外消旋体,故无旋光性。利用阿托品中引入的莨菪碱具有旋光性的特点,采用旋光度法检查。 3. 具有苯烃胺结构的药物 A.麻黄碱 B.奎宁 C.阿托品 D.可待因 E.吗啡

[解答] 本题考查重点是对生物碱药物结构特点的掌握。麻黄碱具有苯烃胺结构;阿托品属于托烷类生物碱;吗啡和可待因属于异喹啉类生物碱;奎宁为喹啉的衍生物。 4. 硫酸奎宁中其他金鸡纳碱检查采用的方法是 A.PC B.GC C.HPLC D.TLC E.UV 答案:D 5. 能发生绿奎宁反应的药物是 A.盐酸吗啡 B.硫酸李宁 C.盐酸麻黄碱 D.磷酸可待因 E.硫酸阿托品 答案:B [解答] 本题考查重点是对硫酸奎宁的专属鉴别反应的掌握。硫酸奎宁在微酸性水溶液中与溴试液作用生成醌式结构,再与氨试液作用生成翠绿色化合物。该反应为硫酸奎宁的专属鉴别反应。 6. 盐酸吗啡中检查的特殊杂质有 A.阿扑吗啡和罂粟酸 B.阿扑吗啡 C.阿扑吗啡、莨菪碱和其他生物碱 D.阿扑吗啡、罂粟酸和有关物质 E.阿扑吗啡和其他生物碱

[解答] 本题考查重点是对盐酸吗啡特殊杂质检查项目的掌握。特殊杂质的来源与特定药物的生产和贮藏过程有关。 7. 硫酸阿托品注射液含量测定的《中国药典》方法是 A.紫外分光光度法 B.有机溶剂提取后采用紫外分光光度法 C.可见分光光度法 D.双波长法 E.高效液相色谱法 答案:C [解答] 本题考查重点是对硫酸阿托品注射液含量测定方法的掌握。硫酸阿托品属于生物碱类药物,在一定的pH条件下,生物碱类药物与氢离子结合成为生物碱的阳离子,酸性染料解离成为染料阴离子,阴阳离子定量地结合形成有色的离子对,可以定量地用三氯甲烷提取离子对,用比色法测定提取液的吸光度,即可计算出生物碱的含量 8. 取供试品约0.5g,精密称定,加冰醋酸与醋酐各10ml,加结晶紫指示液1~2滴,用高氯酸滴定液 (0.1moL/L)滴定。用此方法测定含量的药物是 A.磺胺嘧啶 B.硫酸阿托品 C.盐酸麻黄碱 D.丙酸睾酮 E.阿司匹林 答案:B 9. 供试品与硝酸共热,得黄色产物,放冷后加醇制氢氧化钾少许,即显深紫色。此反应可鉴别的药物是 A.盐酸麻黄碱

高中生物200个经典题汇总(20200501074802)

高中生物200个经典判断题 第一部分 1.线粒体是有氧呼吸的主要场所,叶绿体是光合作用的场所,原核细胞没有线 粒体与叶绿体,因此不能进行有氧呼吸与光合作用。 2.水绵、蓝藻、黑藻都属于自养型的原核生物。 3.胰岛素、抗体、淋巴因子都能在一定条件下与双缩脲试剂发生紫色反应。 4.组成蛋白质的氨基酸都只含有一个氨基与一个羧基,并且连接在同一个碳原 子上;每一条肽链至少含有一个游离的氨基与一个游离的羧基。 5.具有细胞结构的生物,其细胞中通常同时含有dna与rna,并且其遗传物质都是dna。 6.淀粉、半乳糖以及糖原的元素组成都是相同的。 7.水不仅是细胞代谢所需的原料,也是细胞代谢的产物,如有氧呼吸、蛋白质 与dna的合成过程中都有水的生成。 8.具有一定的流动性是细胞膜的功能特性,这一特性与细胞间的融合、细胞的 变形运动以及胞吞胞吐等生理活动密切相关。 9.细胞膜、线粒体、叶绿体、溶酶体、液泡、细胞核、内质网与高尔基体等都 是膜结构的细胞器。 10.染色质与染色体是细胞中同一物质在不同时期呈现的两种不同形态。 11.当外界溶液浓度大于细胞液浓度时,该细胞没有发生质壁分离,则该细胞一定是死细胞。 12.如果用单层磷脂分子构成的脂球体来包裹某种药物,则该药物应该属于脂溶性的。 13.在做温度影响酶的活性的实验中,若某两支试管的反应速率相同,在其他条件均相同的条件下,可判断这两支试管的所处的环境温度也一定是相同的。

14.如果以淀粉为底物,以淀粉酶为催化剂探究温度影响酶活性的实验,则酶促反应的速率既可以通过碘液检测淀粉的分解速率,也可以通过斐林试剂检测淀粉水解产物的生成速率。 15.竞争性抑制剂与非竞争性抑制剂均会影响酶促反应的速率,竞争性抑制剂会与底物竞争酶的活性部位,非竞争性抑制剂则是与酶活性部位以外部位结合而改 变活性部位的结构,使酶活性下降。据此可判断,在其他条件不变的情况下,随 着底物浓度的增加,抑制作用越来越弱的是加入的竞争性抑制剂。 16.atp在细胞内含量并不高,活细胞都能产生atp,也都会消耗atp。 17.在有氧呼吸过程的第三个阶段,[h]与o2结合生成水,在无氧呼吸过程中,则没有此过程。据此,是否有[h]的产生,可以作为判断有氧呼吸与无氧呼吸的依据。 18.探究酵母菌的呼吸方式时,不能用澄清的石灰水来检测co2的产生,但可以用重铬酸钾来检测乙醇。 19.植物细胞光合作用的光反应在类囊体膜上进行,暗反应(碳反应)在叶绿体 基质中进行;呼吸作用的第一阶段在线粒体基质中进行,第二、三阶段在线粒体内膜上进行。 20.测得某油料作物的种子萌发时产生的co2与消耗的o2的体积相等,则该萌发种子在测定条件下的呼吸作用方式是有氧呼吸。 21.在光合作用的相关实验中,可以通过测定绿色植物在光照条件下co2的吸收量、o2释放量以及有机物的积累量来体现植物实际光合作用的强度。 22.给植物施用有机肥,不仅能为植物提供生命活动所需的无机盐,还能为植物生命活动提供co2与能量。 23.在细胞分裂过程中,染色体数目的增加与dna数量的增加不可能发生在细胞周期的同一个时期;dna数目的减半与染色体数目的减半可以发生在细胞周期 的同一时期。 24.在动植物细胞有丝分裂的中期都会出现赤道板,但只有在植物细胞有丝分裂的末期才会出现细胞板。

生物信息学实验指导—实验三

实验三核酸序列分析 【实验目的】 1、掌握已知或未知序列接受号的核酸序列检索的基本步骤; 2、掌握使用BioEdit软件进行核酸序列的基本分析; 3、熟悉基于核酸序列比对分析的真核基因结构分析(内含子/外显子分析); 4、了解基因的电子表达谱分析; 5、熟悉密码子偏好性分析。 【实验原理】 针对核酸序列的分析就是在核酸序列中寻找基因,找出基因的位置和功能位点的位置,以及标记已知的序列模式等过程。在此过程中,确认一段DNA序列是一个基因需要有多个证据的支持。一般而言,在重复片段频繁出现的区域里,基因编码区和调控区不太可能出现;如果某段DNA片段的假想产物与某个已知的蛋白质或其它基因的产物具有较高序列相似性的话,那么这个DNA片段就非常可能属于外显子片段;在一段DNA序列上出现统计上的规律性,即所谓的“密码子偏好性”,也是说明这段DNA是蛋白质编码区的有力证据;其它的证据包括与“模板”序列的模式相匹配、简单序列模式如TATA Box等相匹配等。一般而言,确定基因的位置和结构需要多个方法综合运用,而且需要遵循一定的规则:对于真核生物序列,在进行预测之前先要进行重复序列分析,把重复序列标记出来并除去;选用预测程序时要注意程序的物种特异性;要弄清程序适用的是基因组序列还是cDNA序列;很多程序对序列长度也有要求,有的程序只适用于长序列,而对EST这类残缺的序列则不适用。 1. 重复序列分析 对于真核生物的核酸序列而言,在进行基因辨识之前都应该把简单的大量的重复序列标记出来并除去,因为很多情况下重复序列会对预测程序产生很大的扰乱,尤其是涉及数据库搜索的程序。 2. 数据库搜索 把未知核酸序列作为查询序列,在数据库里搜索与之相似的已有序列是序列分析预测的有效手段。在理论课中已经专门介绍了序列比对和搜索的原理和技术。但值得注意的是,由相似性分析作出的结论可能导致错误的流传;有一定比例的序列很难在数据库里找到合适的同源伙伴。对于EST序列而言,序列搜索将是非常有效的预测手段。 3. 编码区统计特性分析 统计获得的经验说明,DNA中密码子的使用频率不是平均分布的,某些密码子会以较高的频率使用而另一些则较少出现。这样就使得编码区的序列呈现出可察觉的统计特异性,即所谓的“密码子偏好性”。利用这一特性对未知序列进行统计学分析可以发现编码区的粗略位置。这一类技术包括:双密码子计数(统计连续两个密码子的出现频率);核苷酸周期性分析(分析同一个核苷酸在3,6,9,...位置上周期性出现的规律);均一/复杂性分析(长同聚物的统计计数);开放可读框架分析等。 4. 启动子分析 启动子是基因表达所必需的重要序列信号,识别出启动子对于基因辨识十分重要。有一些程序根据实验获得的转录因子结合特性来描述启动子的序列特征,

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