VASP经典学习教程有用
V ASP学习教程太原理工大学量子化学课题组
2012/5/25 太原
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第一章 Liｎｕｘ命令.......................................... 错误!未定义书签。
１。1 常用命令........................................... 错误!未定义书签。
1.1。１浏览目录?错误!未定义书签。
１。１.2 浏览文件?错误!未定义书签。
1。1.３目录操作?错误!未定义书签。
1。1。4 文件操作..................................... 错误!未定义书签。
1.1．５系统信息?错误!未定义书签。
第二章ＳSH软件使用?错误!未定义书签。
2。１软件界面?错误!未定义书签。
2。2 SSH tranｓｆer的应用............................... 错误!未定义书签。
2．2。１文件传输?错误!未定义书签。
2。2.2 简单应用...................................... 错误!未定义书签。第三章ＶAＳP的四个输入文件?错误!未定义书签。
3.1 IＮCAR?错误!未定义书签。
３。2 KPＯINTS?错误!未定义书签。
3．3 ＰＯSCＡR ........................................... 错误!未定义书签。
3.４ＰOTＣＡＲ?错误!未定义书签。
第四章实例.................................................. 错误!未定义书签。
４。1 模型的构建......................................... 错误!未定义书签。
４.2 ＶASＰ计算.......................................... 错误!未定义书签。
4．2。1 参数测试?错误!未定义书签。
４．2。2 晶胞优化(Cu) ................................ 错误!未定义书签。
4。2。3 Cu(１0０)表面的能量?错误!未定义书签。
4.2。4 吸附分子CO、H、CHＯ的结构优化?错误!未定义书签。
4。2.5 ＣO吸附于Cu100表面H位?错误!未定义书签。
4。2.６ H吸附于Ｃu100表面H位?错误!未定义书签。
4。2.７ CHO吸附于Cu100表面Ｂ位..................... 错误!未定义书签。
4。２。8 CO和H共吸附于Cu10０表面................... 错误!未定义书签。
4。2。９过渡态计算.................................. 错误!未定义书签。
第一章 Lｉnｕx命令
1.1 常用命令
1.1.1 浏览目录
cｄ: 进入某个目录。如：cｄ /home/songluzhｉ/vａsｐ／CＨ4 ｃd 。. 上一层目录；cd / 根目录；
lｓ：显示目录下的文件。
注：输入目录名时,可只输入前3个字母,按Ｔaｂ键补全。
1。１.２浏览文件
cａt:显示文件内容。如：cat ＩＮCＡR
如果文件较大，可用:cat IＮCAR ｜more （可以按上下键查看）
合并文件：ｃat Ａ B 〉Ｃ（A和B的内容合并，A在前，B在后) 1.1.3 目录操作
ｍkｄiｒ:建立目录；rｍｄir:删除目录。
如:mkdｉr T—CH3－Rｈ１1１
1.1.4 文件操作
ｒm:删除文件;vi：编辑文件；cp：拷贝文件
mｖ：移动文件;pwd：显示当前路径。
如：rm ＩNＣAR rm a＊（删除以a开头的所有文件)
rm -ｒf abc （强制删除文件abｃ)
ｔａｒ:解压缩文件。压缩文件？？rａｒ
１。1.5 系统信息
df:分区占用大小.如:df -h
ｄu：各级目录的大小。
top:运行的任务。
ps ax：查看详细任务。
kilｌ:杀死任务。如：ｋiｌl １20５8 （杀死ＰID为1２058的任务）注：PID为top命令的第一列数字。
第二章ＳＳH软件使用
2．１软件界面
SSＨ界面
SSH traｎｓfer
2．２ SSH tｒanｓfｅｒ的应用
2.2．1 文件传输
从本地文件中，把所需的计算文件直接拖到服务器中。一般就是VASP计算的四个文件IＮCAR，ＫPOINＴS,POＳＣAR,ＰOTCAR。
2.2．2 简单应用
在右侧文件夹中可以直接构建文件夹，删除文件,修改文件。
从SＳＨ要cｄ到某个文件夹下时，可先从SＳH transfｅr进入，直接复制路径栏，可快速进入.
第三章 VASP的四个输入文件
3．1 INCAＲ
ＳＹSTEM = nａme
ENＣUT = 400
ＰREＣ= Mｅdium
ＥDIFF = ５E—4
EDＩFFG = -0．１
GＧA = 91
VOSＫWN ＝ 1 ！磁性计算
ISYＭ＝０ ! 对称０无 1 有
LREAL = 。ＦALSE. ！倒空间
ＩSPＩN = 2 ！ 2 磁性计算 1 不进行
ISTARＴ＝ 0 ！ 0初次计算，1再次计算
ICＨARG ＝ 2 ! 2构造原子密度
ISMEAR = 2 ! —5 半导体;DOS 静态计算 0;原胞较大，k
点小于4，单个原子,小分子；1 2金属体系。
SＩGMＡ= 0.１
ＩBRIＯN = 2 ! １ DIＩS, 2 CＧ，５频率,３过渡态
ISIF = 2 ! 2 结构优化， 3 晶胞优化
NSW ＝２０0 ！离子运动步数
PＯTIＭ＝ 0。05 ！步长
NELＭIN ＝ 4 ！最小迭代次数
ＮＥLＭ = 2０0 ！最多迭代次数
ＬWAVＥ＝．FALSE. ! 不输出波函数
LCＨARＧ = .FAＬSＥ。！不输出密度函数
3．2 ＫPＯINTＳ
对于表面
surface
０
Ｍ
5 5 1
0 0 0
对于分子和原子
ａtoｍ or moｌｃulａr
1
Rec
0 0 ０ 1
3.3 POＳCAＲ
在Co100表面Tｏp位的吸附!(名称）
CＨ
4
１．0
５.０12００00839 0。0０000０00００ 0。000００00００0
0。00０0０00000 ５．０12０0０0８3９0。0000000０00
0．0０0０0000０0 0。0000000００0 15。315９999８47
Co H C
1６ 4 1
Ｓ
Diｒｅｃt
０。00００0０00０ 0。00000000０ 0。１０807０００1 T ＴＴ
０.000000000 0。000000000 0.3331４9９９9 T T Ｔ
0．２5000００00 ０.25０00000０ 0.00０000000 F
F F
0.25０010014 0．25０0００0０0 ０。２25１1
９９9３ T T T
0．５0０0０0000 0.0０0０000０0 0。108０６0002 ＴＴT
0。500０0００00 0。00000０000 0。333149999 T T Ｔ
0．75000０00０ 0．2５０000０00 ０。00００0００00 F F F
0。749９８9986 ０.２5000000０ 0。225119９93 T Ｔ T
０.００0000000 0.50000０000 0．1080７0０0１ T ＴT
0．０00０00０00 0.50000０00０ 0。333139986 T T T
0．２5００00０00 0.750０000０0 0.00000000
０Ｆ F F
０。250010０14 0。７50０00000 ０。2２51300０７T T T
0．５000０0000 0。50000000０ 0．10８07０00１ T T T
0。500０00０0０ 0.500000０00 0。3３314999９ T T Ｔ
0。７50000000 0．7５0000000 0。00０0０0000 ＦF F
０．７４９98９9８６０．75０00０0０0 ０。2２5119９93 T T T
０．5０00７9989 0．５0142997５ 0.４5１５1０01２ T T T
０.２9282０００7 ０.5022199７5 0.5466３0025 T T Ｔ
０。６01８9０0２8 0。68０9２0００５ 0.5468
５０026 ＴT T
0．60209０0０1 0.323870003 0.547209９７8 T T T
0．499240011 0．5０21２9972 0。５23０6００24 Ｔ T T
3．4 ＰＯTＣAＲ
从赝势库中找到所需元素的赝势文件,命名规则为：PＯTCAR－Ｃ（元素)。把这几个文件放到一个文件夹下，按照前面ＰＯＳCAＲ中的元素顺序合并在一起。
命令为:caｔ POＴCAR—Co ＰＯＴCＡR-H POTＣAR—C ＞ＰOTCAR
第四章实例
ＣＯ+H—CHＯＣu（100)