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第七章1 生物质谱技术

生物化学教程第二章习题答案(详解)

第二章课后习题答案 1.计算赖氨酸的ε-NH3+20%被解离时的溶液PH。 解:pH = pKa + lg20% pKa = 10.53 pH = 10.53 + lg20% = 9.9 2.计算谷氨酸的γ-COOH三分之二被解离时的溶液pH。 解:pH = pKa + lg((2/3)/(1/3))=4.6 pKa = 4.25 3.计算下列物质0.3mol/L溶液的pH:(a)亮氨酸盐酸盐;(b)亮氨酸钠盐;(c)等电亮氨酸。解:a:pH=2.36+ lg(C(H+)/0.3)=1.46 b: pH=9.60+lg(0.3/C(OH+))=11.5 c:pH=pI=1/2(2.36+9.60)=5.98 4.计算下列氨基酸的pI值:丙氨酸、半胱氨酸、谷氨酸和精氨酸。 解:pI = 1/2(pKa1+ pKa2) pI(Ala) = 1/2(2.34+9.69)= 6.02 pI(Cys) = 1/2(1.71+10.78)= 5.02 pI(Glu) = 1/2(2.19+4.25)= 3.22 pI(Ala) = 1/2(9.04+12.48)= 10.76 5. 向1L1mol/L的处于等电点的甘氨酸溶液加入0.3molHCl,问所得溶液的pH是多少?如果加入0.3mol NaOH以代替HCl时,pH将是多少? 解:pH1=pKa1+lg(7/3)=2.71 pH2=pKa2+lg(3/7)=9.23 6.计算0.25mol/L的组氨酸溶液在pH6.4时各种离子形式的浓度(mol/L)。 解:由pH=pK1+lg(His+/ His2+)=pKr+lg(His0/His+)=pK2+lg(His-/ His0)得His2+为1.87×10-6,His+为0.071,His0为0.179 His-3.0×10-4 7.说明用含一个结晶水的固体组氨酸盐酸盐(相对分子质量=209.6;咪唑基pKa=6.0)和1mol/L KOH配制1LpH6.5的0.2mol/L组氨酸盐缓冲液的方法 解:取组氨酸盐酸盐41.92g(0.2mol),加入352ml 1mol/L KOH,用水稀释至1L。 8. L-亮氨酸溶液(3.0g/50ml 6mol/L HCl)在20cm旋光管中测得的旋光度为+1.81o。计算L-亮氨酸在6mol/L HCl中的比旋。 解:c=3.0/50=0.06g/ml l=2dm. +1.81=[a]*0.06*2 得:[a]= +15.1o 9.甘氨酸在溶剂A中的溶解度为在溶剂B中的4倍,苯丙氨酸在溶剂A中的溶解度为溶剂B 中的两倍。利用在溶剂A和B之间的逆流分溶方法将甘氨酸和苯丙氨酸分开。在起始溶液中甘氨酸含量为100mg ,苯丙氨酸为81mg ,试回答下列问题:(1)利用由4个分溶管组成的逆流分溶系统时,甘氨酸和苯丙氨酸各在哪一号分溶管中含量最高?解:根据逆流分溶原理,可得: 对于Gly:Kd = C A/C B = 4 = q(动相)/p(静相) p+q= (1/5 + 4/5) 4个分溶管分溶3次:(1/5 + 4/5)3=1/125+2/125+48/125+64/125

生物质谱技术在蛋白质组学中的应用

生物质谱技术在蛋白质组学中的应用(北京大学药学院 杨春晖 学号:10389071) 一、 前言[1,2] 基因工程已令人难以置信的扩展了我们关于有机体DNA序列的认识。但是仍有许多新识别的基因的功能还不知道,也不知道基因产物是如何相互作用从而产生活的有机体的。功能基因组试图通过大规模实验方法来回答这些问题。但由于仅从DNA序列尚不能回答某基因的表达时间、表达量、蛋白质翻译后加工和修饰的情况、以及它们的亚细胞分布等等,因此在整体水平上研究蛋白质表达及其功能变得日益显得重要。这些在基因组中不能解决的问题可望在蛋白质组研究中找到答案。蛋白质组研究的数据与基因组数据的整合,将会在后基因组研究中发挥重要作用。 目前蛋白质组研究采用的主要技术是双向凝胶电泳和质谱方法。双向凝胶电泳的基本原理是蛋白质首先根据其等电点,第一向在pH梯度胶内等电聚焦,然后转90度按他们的分子量大小进行第二向的SDS-PAGE分离。质谱在90年代得到了长足的发展,生物质谱当上了主角,蛋白质组学又为生物质谱提供了一个大舞台。他们中首选的是MALDI-TOF,其分析容量大,单电荷为主的测定分子量高达30万,干扰因素少,适合蛋白质组的大规模分析。其次ESI为主的LC-MS 联机适于精细的研究。本文将简介几种常用的生物质谱技术,并着重介绍生物质谱技术在蛋白质组学各领域的应用。 二、 生物质谱技术[3,4] 1.电喷雾质谱技术(ESI)[5] 电喷雾质谱技术( Electrospray Ionization Mass Spectrometry , ESI - MS) 是在毛细管的出口处施加一高电压,所产生的高电场使从毛细管流出的液体雾化成细小的带电液滴,随着溶剂蒸发,液滴表面的电荷强度逐渐增大,最后液滴崩解为大量带一个或多个电荷的离子,致使分析物以单电荷或多电荷离子的形式进入气相。电喷雾离子化的特点是产生高电荷离子而不是碎片离子, 使质量电荷比(m/ z)降低到多数质量分析仪器都可以检测的范围,因而大大扩展了分子量的分析范围,离子的真实分子质量也可以根据质荷比及电荷数算出。 2.基质辅助激光解吸附质谱技术(MOLDI)[5-7] 基质辅助激光解析电离(MOLDI)是由德国科学家Karas和Hillenkamp发现的。将微量蛋白质与过量的小分子基体的混合液体点到样品靶上,经加热或风吹烘干形成共结晶,放入离子源内。当激光照射到靶点上时,基体吸收了激光的能力跃迁到激发态,导致蛋白质电离和汽化,电离的结果通常是基体的质子转移到蛋白质上。然后由高电压将电离的蛋白质从离子源转送到质量分析器内,再经离子检测器和数据处理得到质谱图。TOF质量分析器被认为是与MALDI的最佳搭配,因为二者都是脉冲工作方式,在质量分析过程中离子损失很少,可以获得很高的灵敏度。TOF质量分析器结果简单,容易换算,蛋白质离子在飞行管内的飞行速度仅与他的(m/z)-1/2成正比,因此容易通过计算蛋白质离子在飞行管内的飞

生物化学第二章 核酸的结构与功能试题及答案

第二章核酸的结构与功能 一、名词解释 1.核酸2.核苷3.核苷酸4.稀有碱基5.碱基对6.DNA的一级结构7.核酸的变性8.Tm值9.DNA的复性10.核酸的杂交 二、填空题 11.核酸可分为____和____两大类,其中____主要存在于____中,而____主要存在于____。12.核酸完全水解生成的产物有____、____和____,其中糖基有____、____,碱基有____和____两大类。 13.生物体内的嘌呤碱主要有____和____,嘧啶碱主要有____、____和____。某些RNA分子中还含有微量的其它碱基,称为____。 14.DNA和RNA分子在物质组成上有所不同,主要表现在____和____的不同,DNA分子中存在的是____和____,RNA分子中存在的是____和____。 15.RNA的基本组成单位是____、____、____、____,DNA的基本组成单位是____、____、____、____,它们通过____键相互连接形成多核苷酸链。 16.DNA的二级结构是____结构,其中碱基组成的共同特点是(若按摩尔数计算)____、____、____。 17.测知某一DNA样品中,A=0.53mol、C=0.25mol、那么T= ____mol,G= ____mol。18.嘌呤环上的第____位氮原子与戊糖的第____位碳原子相连形成____键,通过这种键相连而成的化合物叫____。 19.嘧啶环上的第____位氮原子与戊糖的第____位碳原子相连形成____键,通过这种键相连而成的化合物叫____。 20.体内有两个主要的环核苷酸是____、____,它们的主要生理功用是____。 21.写出下列核苷酸符号的中文名称:A TP____、dCDP____。 22.DNA分子中,两条链通过碱基间的____相连,碱基间的配对原则是____对____、____对____。 23.DNA二级结构的重要特点是形成____结构,此结构属于____螺旋,此结构内部是由____通过____相连维持,其纵向结构的维系力是____。 24.因为核酸分子中含有____和____碱基,而这两类物质又均含有____结构,故使核酸对____波长的紫外线有吸收作用。 25.DNA双螺旋直径为____nm,双螺旋每隔____nm转一圈,约相当于____个碱基对。戊糖和磷酸基位于双螺旋____侧、碱基位于____侧。 26、核酸双螺旋结构中具有严格的碱基配对关系,在DNA分子中A对____、在RNA分子中A对____、它们之间均可形成____个氢键,在DNA和RNA分子中G始终与____配对、它们之间可形成____个氢键。 27.DNA的Tm值的大小与其分子中所含的____的种类、数量及比例有关,也与分子的____有关。若含的A-T配对较多其值则____、含的G-C配对较多其值则____,分子越长其Tm 值也越____。 28.Tm值是DNA的变性温度,如果DNA是不均一的,其Tm值范围____,如果DNA是均一的其Tm值范围____。 29.组成核酸的元素有____、____、____、____、____等,其中____的含量比较稳定,约占核酸总量的____,可通过测定____的含量来计算样品中核酸的含量。 30.DNA双螺旋结构的维系力主要有____和____。 31.一般来说DNA分子中G、C含量高分子较稳定,同时比重也较____、解链温度也____。

生物质谱技术

生命科学被誉为21世纪的最前沿科学之一,随着人类第一张基因序列草图的完成和发展,生命科学的研究也将进入一个崭新的后基因组学,即蛋白质组学时代。正如基因草图的提前绘制得益于大规模全自动毛细管测序技术一样,后基因组研究也将会借助于现代生物质谱技术等得到迅猛发展。本文拟简述生物质谱技术及其在生命科学领域研究中的应用。 1.质谱技术 质谱(MassSPectrometry)是带电原子、分子或分子碎片按质荷比(或质量)的大小顺序排列的图谱。质谱仪是一类能使物质粒子高化成离子并通过适当的电场、磁场将它们按空间位置、时间先后或者轨道稳定与否实现质荷比分离,并检测强度后进行物质分析的仪器。质谱仪主要由分析系统、电学系统和真空系统组成。 质谱分析的基本原理 用于分析的样品分子(或原子)在离子源中离化成具有不同质量的单电行分子离子和碎片离子,这些单电荷离子在加速电场中获得相同的动能并形成一束离子,进入由电场和磁场组成的分析器,离子束中速度较慢的离子通过电场后偏转大,速度快的偏转小;在磁场中离子发生角速度矢量相反的偏转,即速度慢的离子依然偏转大,速度快的偏转小;当两个场的偏转作用彼此补偿时,它们的轨道便相交于一点。与此同时,在磁场中还能发生质量的分离,这样就使具有同一质荷比而速度不同的离子聚焦在同一点上,不同质荷比的离子聚焦在不同的点上,其焦面接近于平面,在此处用检测系统进行检测即可得到不同质荷比的谱线,即质谱。通过质谱分析,我们可以获得分析样品的分子量、分子式、分子中同位素构成和分子结构等多方面的信息。 质谱技术的发展 质谱的开发历史要追溯到20世纪初J.J.Thomson创制的抛物线质谱装置,1919年Aston制成了第一台速度聚焦型质谱仪,成为了质谱发展史上的里程碑。

最新第二章 生物化学

考试范围 一、生物大分子的结构与功能 1.蛋白质 2.核酸 3.酶 二、物质代谢 4.糖代谢 5.脂类代谢 6.氨基酸代谢 7.核苷酸代谢 第一节蛋白质的结构与功能 大纲解读: 1.蛋白质的分子组成 (1)蛋白质的平均含氮量 (2)L-α-氨基酸的结构通式 (3)20种L-α-氨基酸的分类 2.氨基酸的性质 3.蛋白质的分子结构 4.蛋白质结构与功能的关系 (1)血红蛋白的分子结构 (2)血红蛋白空间结构与运氧功能关系 (3)协同效应、别构效应的概念 5.蛋白质的性质 一、蛋白质的分子组成 1.蛋白样品的平均含氮量 2.L-α-氨基酸的结构通式 3.20种L-α-氨基酸的分类以及名称 (一)蛋白样品的平均含氮量 1.组成蛋白质的元素及含量

(1 )主要元素:碳(50~55% )、氢(6~8%)、氧(19~24%)、氮(16%)、硫(0~ 4%) (2)其他:磷、铁、锰、锌、碘等(元素组成) 2.蛋白质含量测定(测氮法) (1)蛋白质的平均含氮量为16%,即每克氮相当于6.25克蛋白质。 (2)每克样品中蛋白质的含量=每克样品的含氮量×6.25 A型题: 测得某一蛋白质样品(奶粉)含氮量为0.40克,此样品约含蛋白质()克。 A.2.0 B.2.5 C.3.0 D.3.5 E.4.0 [答疑编号111020801:针对该题提问] 『正确答案』B 『答案解析』每克样品中蛋白质的含量=每克样品的含氮量×6.25= 0.40×6.25=2.5克。 (二)蛋白质的基本组成单位 1.氨基酸是组成蛋白质的基本单位。 2.氨基酸通式: 3.存在自然界中的氨基酸有300余种,但组成人体蛋白质的氨基酸仅有20种,且均属L-氨基酸(甘氨酸除外)。甘氨酸的结构式: 4.特殊氨基酸: 脯氨酸(亚氨基酸)结构式: 5.氨基酸分类: (1)非极性疏水性氨基酸:甘、丙、缬、亮、异亮氨基酸、苯丙、脯氨酸(亚氨基酸)(7种)。

生物质谱

生物质谱 早期有机质谱主要用于测定普通的有机小分子,对多肽、蛋白质及其他生物大分子难测定。 因:1.分子量太大 2.气化高温分解。 80年代后,发明了快原子轰击电离(FAB),电喷雾电离(ESI)和基质辅助激光解吸电离(MALDI)。生物大分子可转变成气相离子。产生了生物质谱。 Biomass Spectrometry 有机质谱的一般应用 1.有机化合物的分子量和结构测定 2.化学反应的鉴别和反应机理的研究 3.石油组分和添加剂的分析 4.化工原料和化工产品的分析 5.毒品分析和中毒病人中毒品的鉴定 6.空气、水和泥土有机污染物的分析 7.香料中组分分析 8.食品中维生素等组分、食油中组分的分析 9.染料、涂料的分析 10.有机聚合物的分析 11.酒中组分的分析 12.植物中有机组分的分析 13.粮食、蔬菜、水果农药残留物的分析 14.烟草中组分的分析 15.禽肉中一些激素的分析 1.天然药物结构测定,合成新药结构确证 2.新药中杂质、药物降解物分析,新药稳定 性研究 3.药代动力学研究和药物代谢物结构分析 4.新药研究中组合化学库中组分的鉴定 5.多肽、蛋白质分子量的测定 6.多肽和重组蛋白一级结构的确定 7.多肽序列的测定 8.蛋白质变异体的检测 9.蛋白质中巯基测定和蛋白质中二硫键的 指定 10.蛋白质翻译后修饰的测定 11.蛋白质高级结构的研究 12.生物分子非共价键相互作用的研究 13.未知蛋白质的鉴定和蛋白质组学研究 14.蛋白质复合物中组分的分析 15.寡核苷酸、DNA片段分子量测定 16.寡核苷酸序列分析 17.SNP研究 18.用模型识别软件快速鉴别微生物 19.结构免疫学研究中的应用 20.细胞生物学中的应用 快原子轰击电离(FAB) 1981原理:在进样探头放样品,溶于底物(甘油或硫化甘油),惰性气体(Ar)电离后,加速,使之具有较高的动能,在原子枪(atom gun)内进行电荷 交换反应:

世界著名的质谱方面网站清单

世界著名的质谱方面网站清单 质谱技术在蛋白鉴定等实验中具有不可忽视的作用,但是,目前的应用还不是特别广泛。那么,有问题了怎么解决呢?本文收集整理了相关的网站,包括世界著名的质谱学会、质谱研究组、质谱软件等。 美国质谱学会(ASMS, American Association for Mass Spectrometry) https://www.sodocs.net/doc/fa4399282.html,/ 南非质谱协会(SAAMS) http://www.saams.up.ac.za/ 欧洲质谱学会(ESMS) https://www.sodocs.net/doc/fa4399282.html,/esms/ 岛津公司:Koichi Tanaka (2002年诺贝尔化学奖获得者) https://www.sodocs.net/doc/fa4399282.html,/about/nobel/ ***高纯度化学研究所 http://www1m.mesh.ne.jp/kojundo/e/index.htm ***质谱学会(MSSJ) http://www.mssj.jp/ 瑞典质谱学会(SMSS) http://www.smss.uu.se/ 瑞士质谱组(SGMS) http://www.sgms.ch/ 生物技术中的质谱仪器相关资源 https://www.sodocs.net/doc/fa4399282.html,/ 以色列巴依兰大学:化学系 http://www.biu.ac.il/ESC/ch/ 印度质谱学会(ISMAS) https://www.sodocs.net/doc/fa4399282.html,/ 英国表面分析论坛 https://www.sodocs.net/doc/fa4399282.html, 英国伦敦大学比克贝克学院生物与化学学院:分析科学研究小组 https://www.sodocs.net/doc/fa4399282.html,/~chm_tgc/ 英国曼彻斯特理工大学化学系:J. Philip Day的研究小组 https://www.sodocs.net/doc/fa4399282.html,/people/academic/jpd.html 英国质谱学会(BMSS) https://www.sodocs.net/doc/fa4399282.html,/index.html 质谱:Mass Spectrometry Database,American Academy of Forensic Sciences (免费) http://www.ualberta.ca/~gjones/mslib.htm

质谱技术在现代生物科学领域中的应用

质谱技术在现代生物科学领域中的应用 (学院:生命科学与技术学院系别:生物工程专业班级:0902 姓名:刘佳) 【摘要】随着科技的进步,现代生物学成为了科学家们的研究热点,研究的重心也由最初的细胞水平转移到蛋白质、分子、基因水平。因此质谱技术成为了现代生物学领域必不可少的研究手段。本文简要综述了质谱技术在蛋白质结构鉴定、蛋白质组学、后基因时代、抗原表位等研究中的应用。 【关键词】质谱技术蛋白质组学抗原表位 Application of Mass-Spectrometric Technique in Modern Biological Terms (ACADEMY: Life Science and TechnologyDEPARTMENT: BioengineeringCLASS: 0902 NAME: Jia Liu) 【Abstract】With the progress of technology, modern biological has been a research hotspot, it now focuses on protein level, molecular level and genetic level from original cellular level. Thus, Mass-Spectrometric Technique becomes a requisite research measure in modern biological. This paper makes a brief summary of application of Mass-Spectrometric Technique in protein structure identification, proteomics, postgenomic era, epitope etc. 【Key words】Mass-Spectrometry proteomics epitope 1.1引言 众所周知,21世纪被科学家及众多学者称为生命科学的世纪,随着科技的 不断进步,在生物学领域不断的深入研究,人们看到了生物学对于人类社会以及整个生物界的影响都是巨大的,因此各国也加快了对生物学领域的研究。随着研究的不断深入,更多的先进技术被应用到生物学中,质谱技术便是这些先进技术中不可缺少的一项技术手段。质谱是带电粒子按质荷比大小顺序排列的图谱,最初主要用来测定元素或同位素的原子量,随着高性能质谱仪器的出现,质谱被越来越多地应用于生命科学研究的许多领域。以基质辅助激光解吸咐飞行时间质谱(MALDITOF)和电喷雾质谱(ESI)为代表的现代生物质谱技术,为蛋白质等生物大分子的研究提供了必要的技术手段。 1.2质谱技术在蛋白质结构研究中的应用 1.2.1 肽指纹图(peptide mass fingerprinting PMF)的测定 PMF测定是将未知蛋白质以特定的蛋白酶或化学水解的方法将蛋白质切成小的

19环境生物技术 第七章 固体废物的生物处理技术

第七章固体废物的生物处理技术 第一节固体废物的概念 ——”放在错误地点的原料“ 人类在生产与生活中产生的,生产者在一定时间和地点不再需要而丢弃的固体、半固体和泥状物质。 并不意味其没有利用价值,事实上,废与不废是一个相对的概念,它与当时的社会发展阶段,技术水平与经济条件等等密切相关。特别是自20世纪中期以来,随着资源的大量消耗而导致的资源枯竭以及环境恶化给人类带来的巨大压力,人们逐渐认识到固体废物的再利用性,所以固体废物又有二次资源(Secondary resourses),再生资源(renewable resourses )等称谓,并将固体废物视作第二矿业(Secondary mining ),固体废物工程也发展成为一门新兴的应用技术型学科,即再生资源工程。 特点:无主性、分散性、危害性、错位性 基本上包括了固废的所有形态 一、固体废物的涵义 Solid waste 描述人类丢弃的东西,一般包括厨余物,垃圾,污泥,有害废物等,但是不包括放射性废物和原位采矿废物 Refuse 垃圾,涵义接近前者,但是一般指生活产生的固废 Residue 一般指生产中产生的固废,也叫废渣 Rubbish 垃圾,一般包括在refuse中,来源于生活家庭,机关,商业等 Garbage 厨余物,特指生的或者熟的食品残余 二、固体废物的来源 固体废物来源于人类的生产与消费活动。来源复杂(各行各业,各种生产和生活活动),种类繁多(几乎包括一切成形物质)。一般将其来源概括为两大类:生产废物和生活废物。生产废物 不能完全利用的资源:最典型的有冶金、化工、电力、煤碳等行业产生的废渣砷渣、 铬渣、铍渣、铊、汞渣、镉渣、铅等。 超过使用寿命的产品:特别是电子垃圾 生活废物 生活活动产生的垃圾(Trash),每年以8-10%速度增加。 ?城市生活垃圾 –1995年己超过1亿t,每年增长10%(全世界平均年增长速度8.42%)。无害化处理的不足10%。 ?污水处理厂干污泥 –每年产生约2 × 105 t,以湿污泥计约为(38~50) ?l05t,且以每年20%的速度增长。 ?农业废弃物 –作物秸秆、草木枝叶、人和畜禽粪便等。作物秸秆每年产量约(5~6)?l08t。 (薪柴、就地焚烧) –集约化畜禽生产,粪便年排放量约18.8×108 t。 三、固体废物的分类 我国目前分为四类:工矿业固体废物,农业固体废物,城市生活垃圾及放射性固废(须专门管理)。一般按来源分为:

生物分子的质谱分析

摘要:生物质谱因其高灵敏度、高准确度、快速、易于自动化等特点,质谱分析技术已经应用于化学、化工、环境、能源、医药、运动医学、刑侦科学、生命科学、材料科学等各个领域,在生命科学领域的应用和研究日益广泛。本文将阐述目前生物质谱技术的类型、原理以及在医学领域中的应用,进而分析质谱技术在未来发展的前景。该文综述了近年来生物质谱在蛋白质、核酸、糖类、药物代谢以及微生物检验等方面的应用及进展。 关键字:质谱,生物质谱,生物分子,新技术,应用 质谱(Mass Spect romet ry) 是带电原子、分子或分子碎片按质荷比(或质量) 的大小顺序排列的图谱。质谱仪是一类能使物质粒子离化成离子并通过适当的电场、磁场将它们按空间位置、时间先后或者轨道稳定与否实现质荷比分离,并检测强度后进行物质分析的仪器。质谱仪主要由分析系统、电学系统和真空系统组成。 最初的质谱仪,主要是用来测定元素或同位素的原子量,但是随着离子光学理论的发展,质谱仪不断改进,其应用范围也在不断扩大。到20 世纪50 年代后期,其已广泛地应用于无机化合物和有机化合物的测定。现今,质谱分析的足迹已遍布各个学科的技术领域,在固体物理、冶金、电子、航天、原子能、地球和宇宙化学、生物化学和生命科学等领域,均有着广阔的应用。质谱技术在生命科学领域中的应用,更为质谱的发展注入了新的活力,形成了独特的生物质谱技术,促使质谱技术在生命科学领域获得广泛应用和发展。 目前商业化的生物质谱仪,其离子化方式主要是:电喷雾电离方式和基质辅助激光解吸电离方式。电喷雾电离方式常采用四极杆质量分析器,其所构成的仪器称为电喷雾(四极杆)质谱仪(ESI-MS)。基质辅助激光解吸电离方式常用飞行时间作为质量分析器,所构成的仪器称为基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪(MALDI-TOF-MS)。ESI-MS 的特点之一是:它可以和液相色谱、毛细管电泳等现代化的分离手段联合使用,从而大大扩展了其在生命科学领域的应用范围,如在药物代谢、临床和法医学等方面的应用等;MALDI-TOF-MS的特点是对盐和添加物的耐受能力高,而且测样速度快,操作简单。此外,可用于生物大分子测定的质谱仪还有离子阱质谱和傅里叶变换离子回旋共振质谱等。而最近面市的最新型的生物质谱仪是液相色谱-电喷雾-四极杆飞行时间串联质谱仪与带有串联质谱功能的MALDI-TOF质谱仪,前者是在传统的电喷雾质谱仪的基础上,采用了飞行时间质量分析器来代替四极杆质量分析器,大大提高了仪器的分辨率、灵敏度和质量范围,其商品名有Q-TOF[4]和Q-STAR[3]等;后者是在质谱中加入了源后降解模式或碰撞诱导解离模式,从而使生物大分子的测序成为可能。 生物质谱技术包括:电喷雾质谱技术(ESI),快原子轰击电离(FAB),基质辅助激光解吸电离(MALDI)。 电喷雾质谱技术,是在毛细管的出口处施加一高电压,所产生的高电场,从而使从毛细管流出的液体,雾化成细小的带电液滴。随着溶剂的蒸发,液滴表面的电荷强度逐渐增大,最后液滴崩解为大量带一个或多个电荷的离子,致使分析物以单电荷或多电荷离子的形式,进入气相。适用于难汽化,极性强的大分子。需注意的是,FAB质谱图中会出现基质分子产生的相应的峰及基质分子与样品分子的结合峰。 电喷雾电离(ESI)于1984年用于质谱。其原理是:样品溶液从毛细管出,电场、气流使成雾状带电液滴,蒸发,液滴变小,离子从液滴出来,通过锥孔,透镜进质谱仪。20世纪90年代中期,ESI出现纳喷雾离子源(nanoelectrospray ionization source),纳升流速,分析灵敏度提高,且少至0.5uL的样品溶液可得到30min稳定喷雾,有充分机会进行质谱参数优化和许多串联质谱分析。 基质辅助激光解吸电离(MALDI)可使热敏感或不挥发的化合物由固相直接得到离子。其原理是:混合物(样品加基质)真空下受激光照,基质分子能有效的吸收激光的能量,

最新基于质谱的蛋白质组学分析word版本

基于质谱分析的蛋白质组学 在21世纪,生命科学的研究进入了后基因组时代,蛋白质组学作为其中的一个重要分支于20世纪90年代中期应运而生。由于蛋白质的复杂性,传统的蛋白质鉴定方法如末端测序等已无法满足蛋白质组学研究中的一系列需要。因此,质谱技术作为蛋白质组学研究的一项强有力的工具日趋成熟,并作为样品制备和数据分析的信息学工具被广泛地应用。质谱技术具有灵敏度、准确度、自动化程度高的优点,能准确测量肽和蛋白质的相对分子质量,氨基酸序列及翻译后修饰、蛋白质间相互作用的检测[1],因此质谱分析无可争议地成为蛋白质组学研究的必然选择。 1.蛋白质组学 蛋白质组学(proteomics)是从整体水平上研究细胞内蛋白质的组成、活动规律及蛋白质与蛋白质的相互作用,是功能基因组学时代一门新的科学。包括鉴定蛋白质的表达、修饰形式、结构、功能和相互作用等。根据研究目的,蛋白质组学可以分为表达蛋白质组学、结构蛋白质组学和功能蛋白质组学。表达蛋白质组学用于细胞内蛋白样品表达的定量研究。以绘制出蛋白复合物的结构或存在于一个特殊的细胞器中的蛋白为研究目的的蛋白质组学称为结构蛋白质组学,用于建立细胞内信号转导的网络图谱并解释某些特定蛋白的表达对细胞的作用[2]。功能蛋白质组学以细胞内蛋白质的功能及蛋白质之间的相互作用为研究目的,通过对选定的蛋白质组进行研究和分析,能够提供有关蛋白质的磷酸化、糖基化等重要信息。 蛋白质组学研究的核心就是能够系地的鉴定一个细胞或组织中表达的每一个蛋白质及蛋白质的性能。蛋白质组学的主要相关技术有双向凝胶电泳、双向荧光差异凝胶电泳、质谱分析等[2]。由于蛋白质的高度复杂性和大量低丰度蛋白质的存在,对分析技术提出了巨大挑战,生物质谱技术则是适应这一挑战的必然选择。 2.生物质谱技术 质谱是带电原子、分子或分子碎片按质量的大小顺序排列的图像。质谱仪是一类能使物质离子化并通过适当的电场、磁场将它们按空间位置、时间先后或轨道稳定与否实现质量比分离,并检测强度后进行物质分析的仪器。质谱仪主要由

济南版八年级生物下册第七章第一章 生活中的生物技术单元测试题

济南版八年级生物下册第七章第一章生活中的生物技术单元测试题 姓名:________ 班级:________ 成绩:________ 一、单选题 1 . 如下图所示,在适宜的温度条件下,下列装置中都放入干酵母(内有活酵母菌),其中适于产生酒精的装置是 A.B.C.D. 2 . 食品安全越来越被人们所重视,如果我们要购买无污染、安全、优质的食品(即绿色食品)需要关注的产品标志是() A.B.C.D. 3 . 发酵后的糯米散发出浓郁的酒香,这是因为酵母菌可将米中的糖类分解为() A.抗生素B.蛋白质C.酒精D.氧气 4 . 在单细胞生物中,在酿酒和制作面包方面有着重要作用的是() A.变形虫B.眼虫C.酵母菌D.草履虫 5 . 大米既可作为主食解决温饱问题,也可以被加工成各种美味食品,以下对大米利用的叙述合理的是()A.稻谷收获后,经适当晾晒可抑制呼吸作用,便于保存 B.在有氧条件下,利用酵母菌发酵可制作米酒 C.发霉的大米经清洗后,可以继续放心做成食品食用 D.大米加工越精细,所含有的营养物质越丰富 6 . 通过隔绝空气来抑制细菌和真菌生长的食品保存方法是 A.腌制法B.巴氏消毒法C.真空包装法D.冷藏法 7 . 在“食物腐败的主要原因”探究实验中,大部分小组都发现弯玻璃管插入的B试管中的肉汤比直玻璃管插

入的 A试管保存的时间要长很多,而某小组却发现该组两个试管中的肉汤保鲜时间没直玻璃管'棉花塞奇玻璃管有 多大区别,其原因可能是 A.试管不洁净B.棉花塞没有塞紧 C.肉汤放进去后没有沸热处理D.前三项都有可能 8 . 在没有氧气的条件下,一些细菌如甲烷菌将秸秆、粪便、污水等其中的有机物通过发酵分解产生一种可用于照明、取暖、做饭的气体,产生的这种气体可能是() A.一氧化碳B.沼气C.氧气D.二氧化碳 二、综合题 9 . 某生物兴趣小组的同学探究了“光照对黄粉幼虫生活的影响”,设计了以下实验方案,将 20只黄粉虫幼虫放入纸盒中央,每分钟统计一次阴暗处和明亮处的黄粉虫数目,统计 10 次,并得到以下的数据,试分析回答: 时间 环 境 12345678910 阴暗13121517161718191819 明亮7853432121 (1)你提出该实验的假设是_____________________。 (2)该实验的变量是_________________________。 (3)如果有 8 个小组同时进行了分组探究实验,但是有一个同学却只取了其中3 组的数值进行平均,可以吗?_____________。为什么?_________________。如果只有一个小组进行实验,为保证实验结论的准确性,应该

生物化学第二章 蛋白质的结构与功能随堂练习与参考答案

生物化学(本科)第二章蛋白质的结构与功能 随堂练习与参考答案 第一节蛋白质的分子组成第二节蛋白质的结构第三节蛋白质的结构与理化性质之间的关系第四节蛋白质的结构与功能的关系第五节蛋白质的分类第六节血浆蛋白质 1. (单选题)测得某一蛋白质溶液N元素的含量为4 g/L,则该溶液中蛋白质含量约为 A.16 g/L B.20 g/L C.25 g/L D.30 g/L E.40 g/L 参考答案:C 2. (单选题)组成蛋白质的氨基酸基本上属于 A.L-β-氨基酸 B.D-β-氨基酸 C.L-α-氨基酸

D.D-α-氨基酸 E.L、D-α-氨基酸 参考答案:C 3. (单选题)属于碱性氨基酸的是 A.精氨酸 B.赖氨酸 C.组氨酸 D.A+B E.A+B+C 参考答案:E 4. (单选题)下列有关肽的叙述,错误的是 A.肽是两个以上氨基酸借肽键连接而成的化合物B.组成肽的氨基酸分子都不完整 C.多肽与蛋白质分子之间无明确的分界线 D.氨基酸一旦生成肽,完全失去其原有的理化性质E.根据N末端数目,可得知蛋白质的亚基数 参考答案:E

5. (单选题)维系蛋白质二级结构稳定的化学键是A.盐键 B.二硫键 C.肽键 D.疏水键 E.氢键 参考答案:E 6. (单选题)蛋白质α-螺旋的特点有 A.多为左手螺旋 B.螺旋方向与长轴垂直 C.氨基酸侧链伸向螺旋外侧 D.肽键平面充分伸展 E.靠盐键维系稳定性 参考答案:C 7. (单选题)有关蛋白质三级结构的描述,错误的是A.具有三级结构的多肽链都有生物学活性B.亲水基团多位于三级结构的表面

C.三级结构的稳定性由次级键维系 D.三级结构是单体蛋白质或亚基的空间结构 E.三级结构是各个单键旋转自由度受到各种限制的结果参考答案:A 8. (单选题)关于蛋白质亚基的描述,正确的是 A.一条多肽链卷曲成螺旋结构 B.两条以上多肽链卷曲成二级结构 C.两条以上多肽链与辅基结合成蛋白质 D.每个亚基都有各自的三级结构 E.以上都不正确 参考答案:D 9. (单选题)蛋白质的空间构象主要取决于 A.肽链氨基酸的序列 B.α-螺旋和β-折叠 C.肽链中的氨基酸侧链 D.肽链中的肽键 E.肽链中的二硫键位置

蛋白质质谱分析的发展历史

蛋白质质谱分析的发展历史 质谱法是准确测定蛋白质质量和表征蛋白质的重要方法,根据各种用途,目前市场上已开发出了多种鉴定方法和鉴定仪器,可应用于包括鉴定蛋白质及其翻译后修饰、蛋白质复合物、它们的亚基和功能的相互作用,以及蛋白质组学中蛋白质的整体测量。质谱法也可用于定位各种细胞器中的蛋白质,并鉴定不同蛋白质之间以及膜脂之间的相互作用。 蛋白质质谱分析步骤图解(图片:百泰派克提供) 质谱法中用于蛋白质电离的两种主要方法是电喷雾电离(ESI)和基质辅助激光解吸/电离(MALDI)。这些电离技术需要与质谱分析仪(例如串联质谱)结合使用。通常,可以通过“自上而下”的方法完整地分析蛋白质或者先将蛋白质分解成片段然后“自下而上”地对蛋白质进行分析。有时分析较大的肽片段也可使用折中的“自中而下”的分析方法。 随着MALDI和ESI的发展,二十世纪八十年代,利用质谱进行蛋白质研究开始普及。这些电离技术在蛋白质表征中发挥了重要作用。基质辅助激光解吸电离(MALDI)是由Franz Hillenkamp和Michael Karas于80年代后期开发的。Hillenkamp,Karas和他们的研究人员通过将氨基酸丙氨酸与氨基酸色氨酸混合并用266 nm脉冲激光照射,使氨基酸丙氨酸离子化。尽管取得了一定进展,但直到1987年田中浩一(Koichi Tanaka)使用了“超细金属加液体基质法”,将大小为34,472 Da的蛋白质羧肽酶-A的生物分子离子化,电离技术才取得突破。 1968年,Malcolm Dole报告了电喷雾离子化法与质谱的首次联合使用。在MALDI普及的同一时期,电喷雾离子化法由开发者John Bennett Fenn公开。由于对生物大分子的鉴定和结构分析方法的研究做出的巨大贡献,John Fenn, 田中浩一及Kurt Wuthrich共同获得了2002年诺贝尔化学奖。这些电离方法极大地促进了用质谱法研究蛋白质的发展。也因为如此,蛋白质质谱在蛋白质表征中起着主导作用。 本文由百泰派克整理编辑。 百泰派克从事蛋白质理化性质分析及结构解析、以质谱技术为基础的蛋白质组学、代谢组学

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