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诊断性试验Meta分析

诊断性试验Meta分析
诊断性试验Meta分析

Revman,Stata,Meta-disc在診斷試驗準確性(DTA)

系統評價中的應用

文獻數據摘自《ProGRP與NSE對小細胞肺癌診斷價值的meta 分析》

文中提取數據

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Sun

---

-

--病

10

5016.

3

2

5

1

9

6891

5

6

5

8

Yang 中

國---

-

--病

14

4

4616.

3

4

6

4

91

6

1

7

2

3

7

2

6

5

注:表中 10 個原始研究均使用酶聯免疫吸附測定法檢測陽性界值; TP= 真陽性數; FP= 假陽性數; FN= 假陰性數; TN= 真陰性數a:ProGRP,b: NSE

Revman5.2

新建診斷試驗準確性(DTA)系統評價模板

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添加所有納入研究

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此處對每篇文獻QUADAS2質量特征進行描述,以便探討異質性來源及作表圖

數據分析里面添加所要研究的待評價診斷試驗

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可計算相關指標(似然比及診斷比值比和單獨在干預系統評

價里面作森林圖)

添加分析里面制作SEN和SPE森林圖及SROC曲線,可對數

據進行重新制定

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GAGGAGAGGAFFFFAFAF

Study

Lamy 2000

Molina 2009

Nissan 2009

Schneider 2003

Shibayama 2001

Stieber 1999

Sun 2005

Takada 1996

Yamaguchi 1995

Yang 2005

TP

35

41

134

29

74

117

73

80

25

46

FP

18

9

79

6

11

2

22

6

6

9

FN

16

46

41

8

40

29

28

47

9

17

TN

229

218

548

119

234

97

203

469

60

72

Sensitivity (95% CI)

0.69 [0.54, 0.81]

0.47 [0.36, 0.58]

0.77 [0.70, 0.83]

0.78 [0.62, 0.90]

0.65 [0.55, 0.74]

0.80 [0.73, 0.86]

0.72 [0.62, 0.81]

0.63 [0.54, 0.71]

0.74 [0.56, 0.87]

0.73 [0.60, 0.83]

Specificity (95% CI)

0.93 [0.89, 0.96]

0.96 [0.93, 0.98]

0.87 [0.85, 0.90]

0.95 [0.90, 0.98]

0.96 [0.92, 0.98]

0.98 [0.93, 1.00]

0.90 [0.86, 0.94]

0.99 [0.97, 1.00]

0.91 [0.81, 0.97]

0.89 [0.80, 0.95]

Sensitivity (95% CI)

00.20.40.60.81

Specificity (95% CI)

00.20.40.60.81設置參數

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若用戶對上圖窗口中的統計分析顯示的結果不滿意,可點擊右上角的屬性按鈕); 或依次展开树形目录分支"Data and Analyses→Analyses→ProGRP",选中"ProGRP"并单击右键,选择"Properties … ",弹出属性设置对话框。在图对话框中,可对统计指标(General)、SROC图、森林图和异质性来源的参数进行设置,并点击"Apply"使其生效,见下图。

亚组分析(假如,原文没做)

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ProGRP(高质量)

Study

Lamy 2000

Molina 2009 Nissan 2009 Schneider 2003 Shibayama 2001

TP

35

41

134

29

74

FP

18

9

79

6

11

FN

16

46

41

8

40

TN

229

218

548

119

234

Sensitivity (95% CI)

0.69 [0.54, 0.81]

0.47 [0.36, 0.58]

0.77 [0.70, 0.83]

0.78 [0.62, 0.90]

0.65 [0.55, 0.74]

Specificity (95% CI)

0.93 [0.89, 0.96]

0.96 [0.93, 0.98]

0.87 [0.85, 0.90]

0.95 [0.90, 0.98]

0.96 [0.92, 0.98]

Sensitivity (95% CI)

00.20.40.60.81

Specificity (95% CI)

00.20.40.60.81

ProGRP(低质量)

Study

Stieber 1999

Sun 2005

Takada 1996 Yamaguchi 1995 Yang 2005

TP

117

73

80

25

46

FP

2

22

6

6

9

FN

29

28

47

9

17

TN

97

203

469

60

72

Sensitivity (95% CI)

0.80 [0.73, 0.86]

0.72 [0.62, 0.81]

0.63 [0.54, 0.71]

0.74 [0.56, 0.87]

0.73 [0.60, 0.83]

Specificity (95% CI)

0.98 [0.93, 1.00]

0.90 [0.86, 0.94]

0.99 [0.97, 1.00]

0.91 [0.81, 0.97]

0.89 [0.80, 0.95]

Sensitivity (95% CI)

00.20.40.60.81

Specificity (95% CI)

00.20.40.60.81

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QUADAS-2偏倚表(图)制作

GAGGAGAGGAFFFFAFAF

Patient Selection

14463

Index Test424451 Reference Standard24446 Flow and Timing253

0%25%50%75%100%0%25%50%75%100%

Risk of Bias Applicability Concerns High Unclear Low

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GAGGAGAGGAFFFFAFAF

P a t i e n t S e l e c t i o n

Lamy 2000?Molina 2009

Nissan 2009

+

Schneider 2003?

Shibayama 2001

+Stieber 1999

Sun 2005

+

Takada 1996

?

Yamaguchi 1995

+

Yang 2005

?I n d e x T e s t

?

+

+–

?

+

+R e f e r e n c e S t a n d a r d

?

?

+

+?

?

+

+F l o w a n d T i m i n g

?

?

+

?

?–

?

+

+

Risk of Bias P a t i e n t S e l e c t i o n

––

?

––

?–?

I n d e x T e s t

?

?

?

–?

+

?––

R e f e r e n c e S t a n d a r d

?

?

–?

?

?–?

Applicability Concerns

–High ?Unclear +Low

异质性来源

在DTA系统评价里面不能直接进行似然比、诊断比值比的森林图以及各指标漏斗图制作,但可以改变四个表数据模式或直接计算相关指标,添加入干预性系统评价模板中进行制作及查看异质性、发表偏倚(漏斗图)。

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Stata12

一拟合双变量混合效应模型:midas命令

1.计算所有诊断试验统计学指标(敏感度、特异度、似然比、诊断比值比等)及异质性检验统计量:

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Diagnostic Odds Ratio 39.071 [ 25.251, 60.456]

Diagnostic Score 3.665 [ 3.229, 4.102]Negative Likelihood Ratio 0.316 [ 0.262, 0.381]Positive Likelihood Ratio 12.348 [ 8.245, 18.494]Specificity 0.943 [ 0.913, 0.963]Sensitivity 0.702 [ 0.641, 0.756]Parameter Estimate 95% CI

Inconsistency (I-square): LRT_I2 = 96.39, 95% CI = [93.72-99.06]

Heterogeneity (Chi-square): LRT_Q = 55.419, df =2.00, LRT_p =0.000ROC Area, AUROC = 0.89 [0.86 - 0.92]

Correlation (Mixed Model)= -0.491

Between-study variance(varlogitSPE)= 0.406, 95% CI = [0.133-1.241]

Between-study variance(varlogitSEN) =0.136, 95% CI = [0.041-0.452]

Pretest Prob of Disease =0.279

Reference-negative Subjects = 2417

Reference-positive Subjects = 935

Number of studies = 10

Bivariate Binomial Mixed Model SUMMARY DATA AND PERFORMANCE ESTIMATES

2. 绘制敏感度、 特异度森林图:

SENSITIVITY (95% CI)

0.70[0.64 - 0.76]0.69 [0.54 - 0.81]

0.47 [0.36 - 0.58]0.77 [0.70 - 0.83]0.78 [0.62 - 0.90]0.65 [0.55 - 0.74]0.80 [0.73 - 0.86]0.72 [0.62 - 0.81]0.63 [0.54 - 0.71]0.74 [0.56 - 0.87]0.73 [0.60 - 0.83]STUDY(YEAR)

COMBINED

Q = 39.00, df = 9.00, p = 0.00

I2 = 76.92 [62.83 - 91.01]

Schneider 2003

Stieber 1999Molina 2009Nissan 2009Shibayama 2001

Lamy 2000

Takada 1996Yamaguchi 1995

Sun 2005

Yang 20050.4

0.9

SENSITIVITY

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诊断性meta分析手把教你做临床Meta 分析——诊断试验性 Meta-Disc 分析 导读:诊断性meta分析,手把教你做临床Meta 分析——诊断试验性 meta分析stata诊断性试验meta 手把教你做临床Meta 分析——诊断试验性Meta-Disc 分析 临床治疗的基础首先是需要准确的诊断,准确诊断性Meta 分析是Meta 分析的一个重要部分,本次想向大家推荐的是一款专用于诊断性试验的免费Meta 分析软件,临床医学、临床检验、临床病理、临床科研人员、临床康复科及临床影像科等工作人员可用它写上一篇高大上的诊断准确性试验的Meta 分析文章。 安装软件 Meta-DiSc 是一个免费的下载软件,登录 http://www.hrc.es/investigacion/metadisc_en.htm,下载安装软件,目前最新版本是1.4 版。 运行软件

在试行此软件之前,必须明确和熟悉准确诊断性Meta 分析里结果计算的经典四格表(可能不会在您所纳入的文献中出现,需要研究人自己总结并准确的填写在四格表内,不易混淆而且方便分析)。 TP:True positive 表示真阳性的结果,用数字表示; FP:False positive 表示假阳性的结果,用数字表示; FN:False negative 表示假阴性的结果,用数字表示; TN:True negative 表示真阴性的结果,用数字表示。 1打开软件,可以看到如下界面 Author:第一作者名+ 文章年限,如Rachow 2013; StudyID:纳入文献的排序编号,亦可以按照自己理想的排名排序; 2数据的输入

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FP:False positive 表示假阳性的结果,用数字表示; FN:False negative 表示假阴性的结果,用数字表示; TN:True negative 表示真阴性的结果,用数字表示。 1打开软件,可以看到如下界面 Author:第一作者名+ 文章年限,如Rachow 2013; StudyID:纳入文献的排序编号,亦可以按照自己理想的排名排序; 2数据的输入 有三种方法可以输入,我们掌握其中两种就足够运用,一种是当纳入的文献较多的时候,可以按照软件中表格的形式对应写在Excel 表上,点击复制Ctrl+c,并点击黏贴Ctrl+v,便可以copy 至软件中的表格内;另一种当纳入的文献数量较少时,则可以直接用手动输入到Meta-disc 数据表内,如下图。 3数据的分析 (1)合并统计量的分析运行 如下图点击Analyze,在下拉窗口中选择Tabular Results,并点击向右指示的三角箭头,可出现Sensitivity/Specificity;Likelihood Ratio;Diagnostic OR 和灰色的SROC Area(SROC 面积)。根据操作人的实验需要,可点击需要的分析类型并进行分析。 (2)绘制结果森林图的分析 在Analyze 的下拉窗口中选择Plots...,在Select plot 的下拉框中出现ROC ;Diagnostic OR;Negative LR;Positive LR;Specificity;Sensitivity 。操作者可根据合并统计量结果的分析选择对应的森林图;SROC CurvePlane

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