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转录组学分析流程及常用软件介绍

有参考基因组的转录组生物信息分析

一、生物信息分析流程 获得原始测序序列(Sequenced Reads)后,在有相关物种参考序列或参考基因组的情况下,通过如下流程进行生物信息分析: 二、项目结果说明 1 原始序列数据 高通量测序(如illumina HiSeq TM2000/MiSeq等测序平台)测序得到的原始图像数据文件经碱基识别(Base Calling)分析转化为原始测序序列(Sequenced Reads),我们称之为Raw Data或Raw Reads,结果以FASTQ(简称为fq)文件格式存储,其中包含测序序列(reads)的序列信息以及其对应的测序质量信息。 FASTQ格式文件中每个read由四行描述,如下: @EAS139:136:FC706VJ:2:2104:15343:197393 1:Y:18:ATCACG GCTCTTTGCCCTTCTCGTCGAAAATTGTCTCCTCATTCGAAACTTCTCTGT + @@CFFFDEHHHHFIJJJ@FHGIIIEHIIJBHHHIJJEGIIJJIGHIGHCCF 其中第一行以“@”开头,随后为illumina 测序标识符(Sequence Identifiers)和描述文字(选择性部分);第二行是碱基序列;第三行以“+”开头,随后为illumina 测序标识符(选择性部分);第四行是对应序列的测序质量(Cock et al.)。 illumina 测序标识符详细信息如下:

第四行中每个字符对应的ASCII值减去33,即为对应第二行碱基的测序质量值。如果测序错误率用e表示,illumina HiSeq TM2000/MiSeq的碱基质量值用Q phred 表示,则有下列关系: 公式一:Q phred = -10log 10 (e) illumina Casava 1.8版本测序错误率与测序质量值简明对应关系如下: 2 测序数据质量评估 2.1 测序错误率分布检查 每个碱基测序错误率是通过测序Phred数值(Phred score, Q phred )通过公式1转化得到,而Phred 数值是在碱基识别(Base Calling)过程中通过一种预测碱基判别发生错误概率模型计算得到的,对应关系如下表所显示: illumina Casava 1.8版本碱基识别与Phred分值之间的简明对应关系 测序错误率与碱基质量有关,受测序仪本身、测序试剂、样品等多个因素共同影响。对于RNA-seq技术,测序错误率分布具有两个特点: (1)测序错误率会随着测序序列(Sequenced Reads)的长度的增加而升高,这是由于测序过程中化学试剂的消耗而导致的,并且为illumina高通量测序平台都具有的特征(Erlich and Mitra, 2008; Jiang et al.)。 (2)前6个碱基的位置也会发生较高的测序错误率,而这个长度也正好等于在RNA-seq 建库过程中反转录所需要的随机引物的长度。所以推测前6个碱基测序错误率较高的原因为随机引物和RNA模版的不完全结合(Jiang et al.)。测序错误率分布检查用于检测在测序长度范围内,有无异常的碱基位置存在高错误率,比如中间位置的碱基测序错误率显着高于其他位置。一般情况下,每个碱基位置的测序错误率都应该低于0.5%。 图2.1 测序错误率分布图

转录组学主要技术与应用研究

转录组学主要技术及其应用研究 姓名:梁迪 专业:微生物学 年级:2013 学号:3130179 二零一四年六月十五日

转录学主要技术及其应用研究 摘要:转录组(transcriptome)是特定组织或细胞在某一发育阶段或功能状态下转录出来的所有RNA的集合。转录组学研究能够从整体水平研究基因功能以及基因结构,揭示特定生物学过程以及疾病发生过程中的分子机理。目前,转录组学研究技术主要包括两种:基于杂交技术的微阵列技术(microarray)和基于测序技术的转录组测序技术,包括表达序列标签技术(Expression Sequence Tags Technology,EST)、基因表达系列分析技术(Serial analysis of gene expression,SAGE)、大规模平行测序技术(Massively parallel signature sequencing,MPSS)、以及RNA 测序技术(RNA sequencing,RNA-seq)。文章主要介绍了以上转录组学主要研究技术的原理、技术特点及其应用,并就这些技术面临的挑战和未来发展前景进行了讨论,为其今后的研究与应用提供参考。 关键词:转录组学;微阵列技术;转录组测序技术;应用 Study on the main technologies of transcriptomics and their application Abstract: The transcriptome is the complete set of transcripts for certain type of cells or tissues in a specific developmental stage or physiological condition. Transcriptome analysis can provide a comprehensive understanding of molecularmechanisms involved in specific biological processes and diseases from the information on gene structure and function. Currently, transcriptomics technology mainly includes microarry -based on hybridization technology and transcriptome sequencing-based on sequencing technology, involving Expression sequence tags technology, Serial analysis of gene expression, Massively parallel signature sequencing and RNA sequencing. The detailed principles, technical characteristics and applications of the main transcriptomics technologies are reviewed here, and the challenges and application potentials of these technologies in the future are also discussed. This will present the useful information for other researchers. Keywords: transcriptomics ; microarray ; transcriptome sequencing; application 随着后基因组时代的到来,转录组学、蛋白质组学、代谢组学等各种组学技术相继出现,其中转 录组学是率先发展起来以及应用最广泛的技术[1]。

常用办公软件测试题汇编

常用办公软件测试题 一、综合部分 1.对于Office XP应用程序中的“保存”和“另存为”命令,正确的是___。 A.文档首次存盘时,只能使用“保存”命令 B.文档首次存档时,只能使用“另存为”命令 C.首次存盘时,无论使用“保存”或“另存为”命令,都出现“另存为”对话框 D.再次存盘时,无论使用“保存”或“另存为”命令,会出现“另存为”对话框 2.对于Office XP应用程序中的“常用”工具栏上的“新建”命令按钮和“文件”菜单下的“新建”命令项,不正确的是___。 A.都可以建立新文档 B.作用完全相同 C.“新建”命令按钮操作没有“模板”对话框,使用空白模板 D.“文件”后“新建”命令可打开“模板”对话框,可以选择不同的模板 3.不能在“另存为”对话框中修改文档的___。 A.位置B。名称 C.内容D。类型 4.Office XP应用程序中的“文件”菜单底端列出的几个文件名表示___。 A.用于切换的文件B。已打开的文件 C.正在打印的文件D。最近被该Office XP应用程序处理过的文件 5.在文本编辑状态,执行“编辑”到“复制”命令后,___。

A.被选定的内容复制到插入点 B.被选定的内容复制到剪贴板 C.被选定内容的格式复制到剪贴板 D.剪贴板的内容复制到插入点 6.当“编辑”菜单中的“剪切”和“复制”命令呈浅灰色而不能被选择时,表示___。A.选定的内容太长,剪贴板放不了 B.剪贴板里已经有信息了 C.在文档中没有选定任何信息 D.选定的内容三图形对象 7.Office XP应用程序中的工具栏可以___。 A.放在程序窗口的上边或下边 B.放在程序窗口的左边或右边 C.作为一个窗口放在文本编辑区 D.以上都可以 8.可以从___中选择Office XP应用程序中的命令。 A.菜单B。工具栏 C.快捷菜单D。以上都可以 9.Office XP应用程序中使用鼠标进行复制操作应___。 A.直接拖动B。按住键拖动 10.使用“剪贴板”进行移动操作应选择___命令。 A.“剪切” B。“复制”

转录组RNAseq术语解释

RNA-Seq名词解释 1.index 测序的标签,用于测定混合样本,通过每个样本添加的不同标签进行数据区分,鉴别测序样品。 2.碱基质量值 (Quality Score或Q-score)是碱基识别(Base Calling)出错的概率的整数映射。碱基质量值越高 表明碱基识别越可靠,碱基测错的可能性越小。 3.Q30 碱基质量值为Q30代表碱基的精确度在99.9%。 4.FPKM(Fragments Per Kilobase of transcript per Million fragments mapped) 每1百万个map上的reads中map到外显子的每1K个碱基上的fragment个数。计算公式为 公式中,cDNA Fragments 表示比对到某一转录本上的片段数目,即双端Reads数目;Mapped Reads(Millions)表示Mapped Reads总数, 以10为单位;Transcript Length(kb):转录本长度,以kb个碱基为单位。 5.FC(Fold Change) 即差异表达倍数。 6.FDR(False Discovery Rate) 即错误发现率,定义为在多重假设检验过程中,错误拒绝(拒绝真的原(零)假设)的个数占所有被拒绝 的原假设个数的比例的期望值。通过控制FDR来决定P值的阈值。 7.P值(P-value) 即概率,反映某一事件发生的可能性大小。统计学根据显著性检验方法所得到的P 值,一般以P<0.05 为显著,P<0.01为非常显著,其含义是样本间的差异由抽样误差所致的概率小于0.05或0.01。 8.可变剪接(Alternative splicing)

写论文常用工具简介

写论文,常用工具简介 [阅读制作]Visual CHM-制作CHM文件的工具[阅读制作]SSReader 3.8简体中文 增强版 3.8[阅读制作]SSReader 3.8简体中文标准版 3.8[制图软件]数学公式编辑器MathType V5.2[综合工具]NoteExpress文献管理系统 V1.0.5[综合工具]电子新华字典 2.1[制图软件]抓图工具HyperSnap-DX V5.62.05 [阅读制作]Adobe Acrobat Professional v7.[制图软件]SmartDraw(论文制图) 7.10.301[阅读制作]Adobe Reader 7.0(PDF浏览器) 7.Visual CHM-制作CHM文件的工具 2005-7-5 1580 K 共享资 源·Visual CHM 是一个非常便利的制作CHM文件的工具,完全的可视化操作。多种编译属性,可以使制作出的CHM文件具有非常的专业感。喜欢做电子书,喜欢收集网络文章的朋友,非常值得下载试用。运行环境:Win9x/NT/2000/XP/rar格式/exe格式/ 软件类别:工程软件下载次数:20 SSReader 3.8简体中文增强版3.8 2005-7-2 0 K 共享资源★★★★ · SSReader 3.8主要改进改进文本PDG图书打开效率改进打开新文本PDG的显示方式,默认为自动调节显示比例选取文字以及文字复制,同时选取分为两种方式 --a)按字选取文字 --b)栏选(只标记在鼠标选择区域内的文字) --c)双击选择页面全部文字运行环境:Win9x/NT/2000/XP/ 软件类别:工程软件下载次数:14 SSReader 3.8简体中文标准版3.8 2005-7-2 0 K 共享资源★★★★ · SSRea der 3.8主要改进改进文本PDG 图书打开效率改进打开新文本PDG的显示方式,默认为自动调节显示比例选取文字以及文字复制,同时选取分为两种方式 --a)按字选取文字 --b)栏选(只标记在鼠标选择区域内的文字) --c)双击选择页面全部文字运行环境:Win9x/NT/2000/XP/ 软件类别:工程软件下载次数:12 Adobe Acrobat Professionalv7.0 2005-5-31 206145 K 共享资源 ★★★★ ·Adobe Acrobat 产品家族以其发送文档的智能手段,帮助商业人士、创意人员和技术人员灵活自如地完成工作。此外,用户还能创建交换文档,收集比较批注,并因地制宜地对文档进行安全控制,从而分发出可靠的、经过精心修饰的 Adobe PDF 文档。运行环境:Win9x/NT/2000/XP/ 软件类别:工程软件下载次数:308 Adobe Reader 7.0(PDF 浏览器)7.0 2005-5-16 30000 K 免费资源★★★ ·PDF (Portable Document Format) 文件格式是电子发行文档的事实上的标准,Adobe Acrobat Reader 是一个查看、阅读和打印 PDF 文件的最佳工具。而且它是免费的。新版增加了两个 Acrobat plugs-ins (Acrobat Search and AutoIndx),它可以在硬盘、CD 和局域网中搜索用 Acrobat Catalog tool 创运行环境:Win9x/NT/2000/XP/ 软件类别:工程软件下载次数:1041

软件测试常用术语表

第119贴【2004-10-12】:常见测试术语一 Acceptance Testing--可接受性测试 一般由用户/客户进行的确认是否可以接受一个产品的验证性测试。 actual outcome--实际结果 被测对象在特定的条件下实际产生的结果。 Ad Hoc Testing--随机测试 测试人员通过随机的尝试系统的功能,试图使系统中断。algorithm--算法 (1)一个定义好的有限规则集,用于在有限步骤内解决一个问题;(2)执行一个特定任务的任何操作序列。 algorithm analysis--算法分析 一个软件的验证确认任务,用于保证选择的算法是正确的、合适的和稳定的,并且满足所有精确性、规模和时间 方面的要求。 Alpha Testing--Alpha测试 由选定的用户进行的产品早期性测试。这个测试一般在可控制的环境下进行的。 analysis--分析 (1)分解到一些原子部分或基本原则,以便确定整体的特性;(2)一个推理的过程,显示一个特定的结果是假 设前提的结果;(3)一个问题的方法研究,并且问题被分解为一些小的相关单元作进一步详细研究。 anomaly--异常 在文档或软件操作中观察到的任何与期望违背的结果。

application software--应用软件 满足特定需要的软件。 architecture--构架 一个系统或组件的组织结构。 ASQ--自动化软件质量(Automated Software Quality) 使用软件工具来提高软件的质量。 assertion--断言 指定一个程序必须已经存在的状态的一个逻辑表达式,或者一组程序变量在程序执行期间的某个点上必须满足的 条件。 assertion checking--断言检查 用户在程序中嵌入的断言的检查。 audit--审计 一个或一组工作产品的独立检查以评价与规格、标准、契约或其它准则的符合程度。 audit trail--审计跟踪 系统审计活动的一个时间记录。 Automated Testing--自动化测试 使用自动化测试工具来进行测试,这类测试一般不需要人干预,通常在GUI、性能等测试中用得较多。 第120贴【2004-10-13】:常见测试术语二 Backus-Naur Form--BNF范式 一种分析语言,用于形式化描述语言的语法 baseline--基线

部分行业常用软件介绍

HydroComp.NavCad.2004.v5.08 用于对船舶航速和动力性能的预测和分析 HydroComp.PropExpert.2004.v5.03用于对工作船和游艇的推进系统进行选择和分析 PROTEUS.ENGINEERING.MAESTRO.V8.7 船舶制造业设计软件 Shape3d.V6.10 根据海浪和帆板的概念,用计算机数控机器设计帆板等3d图形的专业工具。 通用前后处理Samcef Field GT PRO 联合循环和热电联产燃机电厂设计软件 STEAM PRO火电厂设计软件 Steam-MASTER 常规电厂仿真软件 THERMOFLEX通用热能系统设计和仿真软件 常规火力发电STEAM软件 线性分析Samcef Linear, 非线性分析Samcef Mecano 热分析Samcef Thermal 显式分析软件EUROPLEXUS 转子动力学分析Samcef for rotor 机床静动力学仿真分析软件Samcef for Machine Tools 空间展开结构仿真分析软件Samcef for Deployable Structures 充气展开结构仿真分析软件Samcef for Inflatable Structures 断裂力学分析软件Samcef for Fracture Mechanics 复合材料分析软件Samcef for Composite 振动噪声分析软件OOFELIE Vibroacoustics 压电材料分析软件OOFELIE Piezoelectric materials 高压电缆分析软件Samcef HVS 过程管理和多学科优化分析软件Boss Quattro 地层孔隙压力破裂压力预测软件DrillWorks 机械动力学分析软件LMS Virtual Lab 分子动力模拟可视化软件gdpc

转录组测序技术的应用及发展综述

转录组测序技术的应用及发展综述 摘要:转录组测序(RNA-Seq)作为一种新的高效、快捷的转录组研究手段正在改变着人们对转录组的认识。RNA-Seq利用高通量测序技术对组织或细胞中所有RNA 反转录而成cDNA文库进行测序,通过统计相关读段(reads)数计算出不同RNA的表达量,发现新的转录本;如果有基因组参考序列,可以把转录本映射回基因组,确定转录本位置、剪切情况等更为全面的遗传信息,已广泛应用于生物学研究、医学研究、临床研究和药物研发等。文章主要比较近年来转录组研究的几种方法和几种RNA-Seq的研究平台,着重介绍RNA-Seq的原理、用途、步骤和生物信息学分析,并就RNA-Seq技术面临的挑战和未来发展前景进行了讨论及在相关领域的应用等内容,为今后该技术的研究与应用提供参考。 关键词: RNA-Seq;原理应用;方法;挑战;发展前景 Abstract:Transcriptome sequencing (RNA-Seq) is a kind of high efficiency, quick transcriptome research methods are changing our understanding of transcriptome. RNA-Seq to use high-throughput sequencing of tissues or cells of all RNA reverse transcription into cDNA library were sequenced, through statistical correlation read paragraph (reads) numbers were calculated from the expression of different RNA transcripts, find new; if the genome reference sequence, the transcripts mapped to genomic, determine the position of the transcription shear condition, more genetic information, has been widely used in biological research, medical research, clinical research and drug development. This paper compared several methods of platform transcriptome studies and several kinds of RNA-Seq in recent years, RNA-Seq focuses on the principle, purpose, steps and bioinformatics analysis, and discusses the RNA-Seq technology challenges and future development prospect and the application in related field and other content, provide the reference for the research and application of the technology future. Key word:RNA-Seq ;application; principle; method; challenge; development prospects

常用通讯测试工具使用

常用通讯测试工具 鉴于很多MCGS用户和技术人员对通讯测试工具并不很熟悉,本文档将针对实际的测试情况,对串口、以太网通讯调试过程中所涉及到的常用的测试软件进行相关的讲解。 1. 串口测试工具: 串口调试工具:用来模拟上下位机收发数据的串口工具,占用串口资源。如:串口调试助手,串口精灵,Comm等。 串口监听工具:用来监听上下位机串口相关操作,并截获收发数据的串口工具。不占用串口资源。如:PortMon,ComSky等。 串口模拟工具:用来模拟物理串口的操作,其模拟生成的串口为成对出现,并可被大多数串口调试和监听软件正常识别,是串口测试的绝好工具。如:Visual Serial Port等。 下面将分别介绍串口调试助手、Comm、PortMon和Visual Serial Port的使用。

1.1. 串口调试助手: 为最常用的串口收发测试工具,其各区域说明及操作过程如下: 串口状态 打开/关闭串口 十六进制/ASCII 切换 串口数据 接收区 串口参数 设置区 串口数据 发送区 串口收发计数区 发送数据功能区 保存数据功能区 操作流程如下: ? 设置串口参数(之前先关闭串口)。 ? 设置接收字符类型(十六进制/ASCII 码) ? 设置保存数据的目录路径。 ? 打开串口。 ? 输入发送数据(类型应与接收相同)。 ? 手动或自动发送数据。 ? 点击“保存显示数据”保存接收数据区数据到文件RecXX.txt。 ? 关闭串口。 注:如果没有相应串口或串口被占用时,软件会弹出“没有发现此串口”的提示。

1.2. PortMon 串口监听工具: 用来监听上下位机串口相关操作,并截获收发数据的串口工具。不占用串口资源, 但在进行监听前,要保证相应串口不被占用,否则无法正常监听数据。 连接状态 菜单栏 工具栏 截获数据显示区 PortMon 设置及使用: 1). 确保要监听的串口未被占用。 如果串口被占用,请关闭相应串口的应用程序。比如:要监视MCGS 软件与串口1设备通讯,应该先关闭MCGS 软件。 说明:PortMon 虽不占用串口资源,但在使用前必须确保要监听的串口未被占用,否则无法进行监视。 2). 运行PortMon,并进行相应设置。 ? 连接设置: 在菜单栏选择“计算机(M)”->“连接本地(L)”。如果连接成功,则连接状态显示为“PortMon 于\\计算机名(本地)”。如下图:

一步一步教你做转录组分析(HISAT, StringTie and Ballgown)

一步一步教你做转录组分析(HISAT, StringTie and Ballgown) 该分析流程主要根据2016年发表在Nature Protocols 上的一篇名为Transcript-level expression analysis of RNA-seq experiments with HISAT, StringTie and Ballgown 的文章撰写的,主要用到以下三个软件:HISAT (https://www.sodocs.net/doc/bc15504759.html,/software/hisat/index.shtml)利用大量FM 索引,以覆盖整个基因组,能够将RNA-Seq的读取与基因组进行快速比对,相较于STAR、Tophat,该软件比对速度快,占用内存少。 StringTie(https://www.sodocs.net/doc/bc15504759.html,/software/stringtie/)能够应用流神经网络算法和可选的de novo组装进行转录本组装并预计表达水平。与Cufflinks等程序相比,StringTie实现了更完整、更准确的基因重建,并更好地预测了表达水平。Ballgown (https://https://www.sodocs.net/doc/bc15504759.html,/alyssafrazee/ballgown)是R语言中基因差异表达分析的工具,能利用RNA-Seq实验的数据(StringTie, RSEM, Cufflinks)的结果预测基因、转录本的差异表达。然而Ballgown并没有不能很好地检测差异外显子,而DEXseq、rMATS和MISO可以很好解决该问题。 一、数据下载Linux系统下常用的下载工具是wget,但该工具是单线程下载,当使用它下载较大数据时比较慢,所以选

转录组学领域研究进展一览(!!!)

转录组学领域研究进展一览 关键词:Transcriptomics;RNA;RT-PCR;Profiling;Synthesis;Sequencing;Purification;Micro arrays;Extraction 转录组学(tranomics),是一门在整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律的学科,也就是说,转录组学是从RNA水平来研究基因的表达情况。转录组即一个活细胞所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。 本文中,小编对近年来转录组学领域的相关研究进行了盘点,分享给各位!【1】北大教授开发单细胞全转录组测序新技术 2014年4月29日,北京大学生物动态光学成像中心黄岩谊、汤富酬课题组在《美国科学院院刊》(PNAS)上发表题为“Microfluidic single-cell whole-tranome sequencing”的论文。该研究利用微流控芯片技术实现了高质量单细胞的全转录组测序样品准备,全面提高了单细胞全转录组分析的准确性和可靠性。 细胞是生命活动的基本功能单位,而在生物体内没有任何两个细胞是完全相同的。传统的生命科学与医学研究,绝大多数情况下都是针对混合的大量细胞进行的,无法观察到单个细胞之间细微的差别。近年来不断发展的实验技术,提供了更加定量与客观的证据,表明在许多关键生命过程例如胚胎发育、细胞分化、疾病发生与发展等过程中,特定的单个细胞行为,以及其间的个体化差异与异质性,导致了极其重要甚至是决定性的结果。而之前基于大量细胞平均测量所获得的结果并无法正确反映复杂生物体系的全面真实信息,严重掩盖了独立个体样本的行为以及生命现象中大量存在的随机行为。针对单个细胞的研究,是细胞生命分析技术所追求的极限状态,是对传统技术极大的挑战。 【2】doi:10.1126/science.aaf2403 在一项新的研究中,来自瑞典卡罗琳斯卡研究所和皇家理工学院等机构的研究人员开发出一种新的被称作空间转录组学(spatial tranomics)的高分辨率方法研究一种组织中哪些基因是有活性的。这种方法能够被用于所有类型的组织中,而且在临床前研究和癌症诊断中是有价值的。相关研究结果发表在2016年7月1日那期Science期刊上,论文标题为“Visualization and analysisof gene expression

转录组ref流程工作手册

转录组ref流程工作手册 一、Reference 流程生物学原理 1.1 实验流程 图一:转录组实验流程 当我们得到样品时,必须对其测序,才能得到分析所需的数据。测序基本过程:提取样品总RNA后,用带有Oligo(dT)的磁珠富集真核生物mRNA(若为原核生物,则用试剂盒去除rRNA后进入下一步)。加入fragmentation buffer将mRNA打断成短片段,以mRNA为模板,用六碱基随机引物(random hexamers)合成第一条cDNA链,然后加入缓冲液、dNTPs、RNase H 和DNA polymerase I 合成第二条cDNA链,在经过QiaQuick PCR试剂盒纯化并加EB缓冲液洗脱之后做末端修复并连接测序接头,然后用琼脂糖凝胶电泳进行片段大小选择,最后进行PCR扩增,使用建好的测序文库进行测序。 得到RNA的序列后,又可以找到它的参考序列(物种本身的基因、基因组)

时,可以用reference流程对数据进行详细的分析。Reference后面所有的流程都是基于参考序列进行的,所以选择正确的参考序列十分重要。 1.2信息分析流程 得到测序序列后,即可利用比对软件,将所测序列比对到参考基因或基因组上,并进行后续分析,信息分析流程图如下: 图二:转录组信息流程 1.2.1原始fq序列简介 测序得到的原始图像数据经base calling转化为序列数据,我们称之为raw data或raw reads,结果以fastq文件格式存储,fastq文件为用户得到的最原始文件,里面存储reads的序列以及reads的测序质量。在fastq格式文件中每个read 由四行描述: @read ID TGGCGGAGGGATTTGAACCC

常用工具软件测试题及答案

一、判断题 1. Realone Player不支持多节目连续播放。(N) 2. 网际快车可以上传和下载文件。(N) 3. 天网防火墙的拦截功能是指数据包无法进入或出去。(Y) 4. SnagIt可以捕获DOS屏幕,RM电影和游戏等画面。(Y) 5. Adobe Acrobat Reader可以解压缩文件。(N) 6. 金山词霸2002支持Windows XP,但不支持office XP系统。(N) 7. 在用Ner-Burning Room刻录CD音乐时,若误将数据文件从本地资源管理器中拖入刻录机虚拟资源管理器中时,该文件将被添加到音乐CD中。(N) 8. Symantec Ghost 可以实现数据修复。(N) 9. Easy Recovery 可以恢复任何被从硬盘上删除的文件。(N) 10. Ctrem软件具有防发呆功能。(Y) 二.选择题(每小题2分,共40分) 1、下列不属于金山词霸所具有的功能的是:(C ) A、屏幕取词 B、词典查词 C、全文翻译 D、用户词典 2、东方快车提供了(C )种语言翻译。 A、1种 B、2种 C、3种 D、4种 3、:Vintual CD 中的Creat按钮的功能为(B ) A、编辑映像文件 B、创建光盘的映像文件 C、映像文件的显示方式 D、将映像文件插入虚拟光驱 4、下列哪一个软件属于光盘刻录软件(A ) A、Nero-Buring Room B:Virtual CD C: DAEMON Tools D:Iparmor 5、下列不属于媒体播放工具的是(D ) A、Winamp B、超级解霸 C、Realone Player D:WinRAR 6、下列媒体播放器可以自由截取单个画面或整段电影的是非曲直(B ) A、Winamp B、超级解霸 C、Realone Player D、音频解霸 7、下列哪一个不是网际快车为已下载的文件设置的缺省创建类别( D) A、软件 B、游戏和mp3 C、驱动程序 D、电影 8、CuteFTP具有网际快车不具备的功能是( A) A、上传文件 B、下载文件 C、断点续传 D、支持多线程下载 9、如果在天网防火墙的ICMP规则中输入( B)则表示任何类型代码都符合本规则。 A、254 B、255 C、256 D、253 10、Norton Antivirus的安全扫描功能包括(D ) ①自动防护②电子邮件扫描③禁止脚本④全面系统扫描 A、①②③ B、①②④ C、①③④ D、①②③④ 11、ACDSee不能对图片进行下列哪种操作(C ) A、浏览和编辑图像 B、图片格式转换 C、抓取图片 D、设置墙纸和幻灯片放映 12、SnagIt捕获的图片可被存为下列哪些格式(D ) ①BMP ②PCX ③TGA ④RSB A、①②③ B、①②④ C、①②③④ D、①② 13、WinRAR不可以解压下列哪些格式的文件( D)

电子设计常用软件介绍

电子设计常用软件介绍: 电子设计常用软件介绍: 随着计算机在国内的逐渐普及,EDA软件在电子行业的应用也越来越广泛,但和发达国家相比,我国的电子设计水平仍然存在着相当大的差距,而中国已走到了WTO的门口,随着加入WTO,电子行业将会受到较大的冲击,许多从事电子设计工作的人员对EDA软件并不熟悉,笔者因此作此文以让这些同业者对此有些了解,并以此提高他们的电子设计在电脑方面应用的水平。以下是一些国内最为常用的EDA软件。 PROTEL:PROTEL是PORTEL公司在80年代末推出的EDA软件,在电子行业的CAD软件中,它当之无愧地排在众多EDA软件的前面,是电子设计者的首选软件,它较早就在国内开始使用,在国内的普及率也最高,有些高校的电子专业还专门开设了课程来学习它,几乎所有的电子公司都要用到它,许多大公司在招聘电子设计人才时在其条件栏上常会写着要求会使用PROTEL。早期的PROTEL主要作为印制板自动布线工具使用,运汹DOS环境,对硬件的要求很低,在无硬盘286机的1M内存下就能运行,但它的功能也较少,只有电路原理图绘制与印制板设计功能,其印制板自动布线的布通率也低,而现今的PROTEL 已发展到PROTEL99(网络上可下载到它的测试板),是个庞大的EDA软件,完全安装有200多M,它工作在WINDOWS95环境下,是个完整的板级全方位电子设计系统,它包含了电原理图绘制、模拟电路与数字电路混合信号仿真、多层印制电路板设计(包含印制电路板自动布线)、可编程逻辑器件设计、图表生成、电子表格生成、支持宏操作等功能,并具有Client/Server (客户/服务器)体系结构,同时还兼容一些其它设计软件的文件格式,如ORCAD,PSPICE,EXCEL等,其多层印制线路板的自动布线可实现高密度PCB的100%布通率。在国内PROTEL软件较易买到,有关PROTEL软件和使用说明的书也有很多,这为它的普及提供了基础。想更多地了解PROTEL的软件功能或者下载PROTEL99的试用版,可以在INTERNET上访问它的站点:https://www.sodocs.net/doc/bc15504759.html, ORCAD:ORCAD是由ORCAD公司于八十年代末推出的EDA软件,它是世界上使用最广的 EDA软件,每天都有上百万的电子工程师在使用它,相对于其它EDA软件而言,它的功能也是最强大的,由于ORCAD软件使用了软件狗防盗版,因此在国内它并不普及,知名度也比不上PROTEL,只有少数的电子设计者使用它,它进入国内是在电脑刚开始普及的94年,记得笔者当时的电脑还是40M硬盘2M 内存的386,而ORCAD4.0却占据了20多M的硬盘空间,使笔者不得不忍痛删掉它。早在工作于DOS环境的ORCAD4.0,它就集成了电原理图绘制、印制电路板设计、数字电路仿真、可编程逻辑器件设计等功能,而且它的介面友好且直观,它的元器件库也是所有EDA软件中最丰富的,在世界上它一直是EAD软件中的首选。ORCAD公司在今年七月与CADENCE公司合并后,更成为世界上最强大的开发EDA软件的公司,它的产品ORCAD世纪集成版工作于WINDOWS95与WINDOWSNT环境下,集成了电原理图绘制,印制电路板设计、模拟与数字电路混合仿真等功能,它的电路仿真的元器件库更达到了8500个,收入了几乎所有的通用型电子元器件模块,它的强大功能导致了它的售价不菲,在北美地区它的世纪加强版就卖到了$7995(看清了是$而不是¥,我仿佛看到了比尔盖茨流下的口水,一套ORCAD可是等于100套WINDOWS98啊),对ORCAD有兴趣的读者可以去访问它的站点:https://www.sodocs.net/doc/bc15504759.html,或

常用工具软件测试题及答案

、判断题 1. Realo ne Player不支持多节目连续播放。 (N ) 2. 网际快车可以上传和下载文件。(N ) 3. 天网防火墙的拦截功能是指数据包无法进入或出去。(Y ) 4. Snagit可以捕获DOS屏幕,RM电影和游戏等画面。(Y ) 5. Adobe Acrobat Reader 可以解压缩文件。 (N ) 6.金山词霸2002支持Windows XP,但不支持office XP 系统。 (N ) 7. 在用Ner-Burning Room 刻录CD 音乐时,若误将数据文件从本地资源管理器中拖入刻录机虚拟资源管理器中时,该文件将被添加到音乐CD 中。(N ) 8. Symantec Ghost 可以实现数据修复。 (N ) 9. Easy Recovery 可以恢复任何被从硬盘上删除的文件。(N ) 10. Ctrem 软件具有防发呆功能。 (Y ) 二.选择题(每小题2分,共40 分) 1、下列不属于金山词霸所具有的功能的是:(C ) A、屏幕取词 B、词典查词 C、全文翻译 D、用户词典 2、东方快车提供了(C )种语言翻 译。 1种B、2种C、3种D、4种 3、:Vintual CD 中的Creat 按钮的功能为 (B ) 编辑映像文件B、创建光盘的映像文件 映像文件的显示方式D、将映像文件插入虚拟光驱 4、下列哪一个软件属于光盘刻录软件(A ) A 、Nero-Buring Room B:Virtual CD C: DAEMON Tools D:iparmor 5、下列不属于媒体播放工具的是(D ) A、Winamp B、超级解霸 C、Realone Player D:WinRAR

转录组ref流程工作手册

转录组ref流程工作手册

转录组ref流程工作手册 一、Reference 流程生物学原理 1.1 实验流程 图一:转录组实验流程 当我们得到样品时,必须对其测序,才能得到分析所需的数据。测序基本过程:提取样品总RNA后,用带有Oligo(dT)的磁珠富集真核生物mRNA(若为原核生物,则用试剂盒去除rRNA后进入下一步)。加入fragmentation buffer 将mRNA打断成短片段,以mRNA为模板,用六碱基随机引物(random hexamers)合成第一条cDNA链,然后加入缓冲液、dNTPs、RNase H 和DNA polymerase I合成第二条cDNA链,在经过QiaQuick PCR试剂盒纯化并加EB 缓冲液洗脱之后做末端修复并连接测序接头,然后用琼脂糖凝胶电泳进行片段大小选择,最后进行PCR扩增,使用建好的测序文库进行测序。 得到RNA的序列后,又可以找到它的参考序列(物种本身的基因、基因组)

时,可以用reference流程对数据进行详细的分析。Reference后面所有的流程都是基于参考序列进行的,所以选择正确的参考序列十分重要。 1.2信息分析流程 得到测序序列后,即可利用比对软件,将所测序列比对到参考基因或基因组上,并进行后续分析,信息分析流程图如下: 图二:转录组信息流程 1.2.1原始fq序列简介 测序得到的原始图像数据经base calling转化为序列数据,我们称之为raw data或raw reads,结果以fastq文件格式存储,fastq文件为用户得到的最原始文件,里面存储reads的序列以及reads的测序质量。在fastq格式文件中每个read由四行描述: @read ID TGGCGGAGGGATTTGAACCC

常用办公软件测试题

常用办公软件测试题一、综合部分 1对于Ofice XP应用程序中的保存”和另存为”命令,正确的是 _。 A. 文档首次存盘时,只能使用保存”命令 B. 文档首次存档时,只能使用另存为”命令 C. 首次存盘时,无论使用保存”或另存为”命令,都出现另存为”对话框 D. 再次存盘时,无论使用保存”或另存为”命令,会出现另存为”对话框 2 .对于Office XP应用程序中的常用”工具栏上的新建”命令按钮和文件”菜单下的新建命令项,不正确的是 ____ 。 A. 都可以建立新文档 B. 作用完全相同 C. 新建”命令按钮操作没有模板”对话框,使用空白模板 D. 文件”后新建”命令可打开模板”对话框,可以选择不同的模板 3 ?不能在另存为”对话框中修改文档的—。 A. 位置B。名称 C.内容D。类型 4 . Office XP应用程序中的文件”菜单底端列出的几个文件名表示—。 A. 用于切换的文件B。已打开的文件 C.正在打印的文件D。最近被该Ofice XP应用程序处理过的文件 5?在文本编辑状态,执行编辑”到复制”命令后,—。

A.被选定的内容复制到插入点 B. 被选定的内容复制到剪贴板 C. 被选定内容的格式复制到剪贴板 D. 剪贴板的内容复制到插入点 6 . 当编辑”菜单中的剪切”和复制”命令呈浅灰色而不能被选择时,表示。 A. 选定的内容太长,剪贴板放不了 B. 剪贴板里已经有信息了 C. 在文档中没有选定任何信息 D. 选定的内容三图形对象 7 . Office XP应用程序中的工具栏可以。 A. 放在程序窗口的上边或下边 B. 放在程序窗口的左边或右边 C. 作为一个窗口放在文本编辑区 D. 以上都可以 8 . 可以从中选择OfficeXP应用程序中的命令。 A. 菜单B。工具栏 C. 快捷菜单D。以上都可以 9 . Office XP应用程序中使用鼠标进行复制操作应。 A. 直接拖动B。按住<Shift〉键拖动 C. 按住<Ctrl〉键拖动D。按住<Alt>键拖动 10 ?使用剪贴板”进行移动操作应选择命令。 A.剪切” B。复制”

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