搜档网
当前位置:搜档网 › PCR产物胶回收实验

PCR产物胶回收实验

PCR产物胶回收实验
PCR产物胶回收实验

实验六 PCR产物胶回收实验

一、实验目的

1. 掌握胶回收的常规操作

2. 了解胶回收PCR产物的目的

二、实验原理

利用胶回收试剂盒纯化PCR产物。本试剂盒提供一个从TBE或TAE电泳缓冲液配制的琼脂糖凝胶中提取高质量DNA的简单、快速、有效的技术,适合从浓度≤3%,高,低熔点琼脂糖凝胶中,回收长度为60bp~23Kb的DNA片段,小于100bpDNA片段回收率为10%~55%,0.1~10kbDNA片段回收率最大为99%,大于10kbDNA片段回收率为

20~70%。回收的基因组DNA可以应用到克隆,测序,限制性酶切等各类下游分子生物学实验。

三、试剂及配套设备和材料

3.1 试剂

Extraction buffer Wash buffer Elution buffer

3.2 配套设备和材料

无菌1.5ml离心管各种规格移液器和无菌移液器吸头

无水乙醇异丙醇可能需要3M KAc (pH 5.0) 离心机

四、基本技术参数

五、操作步骤

1. 用干净、锋利的手术刀,将含有目的DNA片段的琼脂糖凝胶切下,并放入1.5或

2.0 ml离心管中。

请尽量切去不包含DNA片段的凝胶。一般情况下,电泳的DNA上样量≥50 ul (50ul为最终洗脱体积)。

2. 按1:3的比例(凝胶质量毫克数:融胶液体积微升数)加入Extraction buffer。

例如:100mg凝胶应加入300ul Extraction Buffer。对于每人份试剂用量,凝胶质量不能超过400mg。

3. 于恒温水浴或金属浴中50℃温育,直到凝胶融化。

一般温育时间为10分钟,温育过程中没隔2-3分钟混匀一次。如果温育后,混合液体颜色变紫,请加入10 ul 3M KAc (pH 5.0),使混合液颜色变回黄色。

4. 可选:按1:1的比例(凝胶质量毫克数:异丙醇体积微升数)加入异丙醇,并混合均匀。

如DNA片段大于500bp/小于4kb,不需要加异丙醇。

5. 将混合液全部转移到Spin column内,于6,000g离心1分钟,并弃去接液管内液体。

如混合液体积大于750ul可先转移750ul,其余的液体待离心弃液后,再转移。6. 向Spin column内加500ul Extraction Buffer,于12,000g离心30~60秒,并弃去接液管内液体。

7. 向Spin column内加750ul Wash Buffer,于12,000g离心30~60秒,并弃去接液管内液体。

如果回收的DNA片段将用于盐浓度敏感的实验,请在加入Wash buffer后静置2~5分钟,再离心。

8. 再次于12,000 rpm离心1分钟,然后将spin column转移到无菌的1.5ml离心管中。

如不进行该步离心,则无法保证离心柱内残液被彻底清除。

9. 向Spin column内加50ul Elution Buffer、水或TE溶液,并于室温静置1分钟。

可根据实验的实际需要决定Elution Buffer用量。但不要低于20ul。

10. 于12,000g离心1分钟,微量离心管内溶液中含有目的DNA片段。

回收的DNA可直接用于各类下游分子生物学实验,如果不立即使用,请保存于-20℃。

六、注意事项

1. 为了保证没有外源DNA的污染,电泳的buffer和gel都是新制的,切胶的台子清理干净,刀片最好洗净灭菌。

2. 为了减少胶的体积,我们可以用相对比较薄的胶来跑电泳,这样可以减少回收试剂引起的一些后续麻烦。

2. 在洗脱前,将洗脱液于30~60℃温浴,可提高提取效率。

七、思考题

1. 简述影响DNA在琼脂糖凝胶中迁移速率的因素。

2. 简述PCR上样缓冲液(loading buffer)的成分及其作用。

胶回收DNA注意事项

胶回收DNA注意事项 ①切胶回收DNA片段是要把整个目的片断所在位置的胶全部回收。所以为了减少胶的体积,我们就可以用相对比较薄的胶来跑电泳,通常只要够点样即可,或是采用薄而宽的梳子来跑胶。这样可减少回收试剂引起的一些后续麻烦。 ②主要还是DNA的浓度, 如果DNA浓度不够, 想胶小点也不可能。 ③紫外灯下切下含待回收DNA的凝胶时,要衬以干净的塑料薄膜,使用无DNA污染的新刀片,其目的在于防止外源DNA的污染。 ④利用凝胶回收试剂盒DNA回收效率较低或者未回收到目的片段可能有以下几个原因:胶块未完全溶解,可适当延长水浴时间,并增加上下颠倒次数辅助溶解;胶块体积太大,应先将其切为小块,分多次回收;电泳缓冲液pH太高,硅基质膜在高盐低pH结合DNA,如pH太高,应作适当调整;漂洗液中未加入无水乙醇。 ⑤可以改用去离子水洗脱。但是实验室所用纯水一般pH偏低,可利用NaOH适当调高其pH 值,以增加洗脱得率。 ⑥洗脱产物含有残留的乙醇会影响后续酶切实验,请确保彻底去除漂洗缓冲液,具体方法参见回收效率低的解决方案。 ⑦不可以使用更小洗脱体积(小于说明书提供的最小洗脱体积)进行洗脱以提高浓度,因为说明书提供的最少洗脱体积是能完全覆盖吸附膜的最小体积,若减少体积则不能将DNA完全洗脱下来。 ⑧电泳检测只有一条目的带,可以选用凝胶回收试剂盒。如果后续实验对片段纯度要求较高,建议即使只有一条带,也可以切胶纯化,

其回收得到片段的纯度可能要比直接回收高一些。 ⑨琼脂糖凝胶胶块不溶可能是下述原因:琼脂糖质量不好;含目的片段的凝胶再空气中放置过久,使胶块失水、干燥,建议切胶后立即进行回收或将胶块保存在4℃或-20℃;制胶的电泳缓冲液浓度过高或陈旧。 关于胶回收切胶的一点注意事项 1. 电泳的buffer和gel都是新制的,切胶的台子清理干净,刀片最好洗净灭菌,总之一句话就是保证切下的带没有外源dna污染。 2. 切胶是要把整个目的片断所在位置的胶全部回收。为了减少胶的体积,可以用相对比较薄的胶来做,只要够点样即可,也可采用薄而宽的梳子来跑胶。 3. 关于防护,在一般有机玻璃后就足够了,戴上防护面具以保护眼睛,如果戴树脂眼镜就可以了。要是非常害怕紫外照射,或者对于胶有特殊要求,例如要求不含EB,可以采用点marker和带刻度的尺子一起照相的方法来确定目的条带在胶上的位置进行切胶。 4. 按照正常程序点marker跑胶,然后切下有marker的胶,EB染色,紫外灯下与带刻度的尺子一起照相。由于要回收的带与marker间的相对位置已知,根据尺子来衡量未染色胶上目的带的位置即可。如果觉得很难判断,可以直接在marker边点少量的样,这样位置就容易确定了。 胶回收

DNA胶回收中常见问题和解答

1、如何计算提取率 1) 回收前样品中,往往含有非目的DNA 片段、引物、dNTP 等,所以不能用测回收前后吸光度的的方法计算回收率; 2) 可将回收前后DNA 片段一起电泳,使用凝胶成像系统拍照后,用配套的软件进行电泳条带灰度对比; 3) 注意,电泳条件及拍摄条件将对灰度对比结果造成很大影响,请仔细操作,以减小误差。 2、如何简易测算提取率 取胶回收后的DNA溶液体积的1/5—1/10,与等体积的回收前的DNA溶液的5-10倍稀释液一起电泳,肉眼观察回收后的条带相对于回收前条带的亮度,粗略测算回收率(如亮度只有一半时,其回收率可粗略为50%)。 3、如何看待提取得率 影响回收率的因素很多,如DNA片段大小、点样量、凝胶种类、电泳缓冲液的缓冲能力、切胶操作、紫外灯照射强度和时间、溶胶是否彻底等等,所以不能单凭1-2次的实验来判断其质量好坏,最好是多做几次实验或用几种不同品牌的产品做平行对照实验,结果相对真实。 4、回收率为什么与点样量和片段大小有关 DNA片断越大,和固相基质的结合力越强,就越难洗脱,回收率就低;DNA的量越少,相对损失越大,回收率越低。 5、用胶回收试剂盒从凝胶中回收DNA得率低是什么原因 1)胶块溶解不完全,可适当延长水浴时间和上下颠倒的次数以及增加溶胶液的比例;

2)胶块体积太大,应使用枪头捣碎,还不能充分溶解则先将其切为小块,分多次回收; 3)紫外灯下切胶时间过长,导致DNA部分降解,应尽量把切胶时间控制在30s以内; 4)洗涤液使用后未及时盖严瓶盖,乙醇挥发,影响回收效率; 5) TAE或TBE电泳缓冲液不新鲜,失去了缓冲能力,导致PH值升高,降低DNA和膜的吸附力,应及时更换电泳缓冲液,最好使用新鲜配制的电泳缓冲液,效果更好; 6)回收前的样品量太少,加大点样量; 7)洗脱前,预先65℃预热洗脱液、延长室温静置时间、增加洗脱次数可以有效提高回收率30%以上。 6、加入溶胶液温浴后,液体仍很粘稠或后续步骤有堵柱子现象 1)胶块溶解不充分,可再补加一些溶胶液或延长水浴时间并增加上下颠倒次数帮助溶胶; 2)胶块体积过大,应尽量切除多余部分,并将其切为小碎块,分几次回收; 3)水浴温度是否达到规定温度65℃,用温度计检测。 7、琼脂糖凝胶块不溶 1)琼脂糖质量不好; 2)含目的片断的凝胶在空气中放置过久,使胶块失水干躁,建议切胶后立即进行回收或将胶块保存于4 ℃或-20℃; 3)制胶的电泳缓冲液浓度过高或陈旧。

胶回收方法全攻略

胶回收方法全攻略 说到电泳凝胶的片断回收,想来在实验室久已的“老手”们都会不屑一顾。确实,一般在各个和分子生物学沾到一点边儿的实验室里,从琼脂糖凝胶中回收DNA,仅仅是一种简单不过的常规实验操作。虽说早期的凝胶电泳片断回收没有1—2个小时是搞不定的,每个实验室也有自己的独门秘诀,可后来各大品牌纷纷推出了了多种不同用途,不同价钱的快速凝胶回收试剂盒,一下子将胶回收的时间缩短到10多分钟,操作也大大简化,胶回收就变成“小菜一碟”了。然而,从bbs逛上一圈下来,发现实际上还是有不少人为胶回收这种看似简单的操作而 烦恼。到底是什么导致了实验新手,甚至是老手在这个已经发展近40年的常规性实验中卡壳?由于胶回收的质量和数量直接影响后继的一系列实验——比如 酶切连接、转化筛选、测序或者PCR 扩增、标记乃至显微注射等等,为大家搜罗各种产品和方法的优缺点,注意事项,做一个胶回收全攻略篇。 一、胶回收的关键参数 胶回收的质量直接影响后继实验的成功与否。要想做好胶回收,无论是自己亲力亲为还是借助目前五花八门的胶回收试剂,最基本的评定标准无外乎这么几个:质量( 回收产物的纯度和浓度),回收效率,操作方便(速度),柱子的载量等等。 回收产物质量:回收产物的质量主要指纯度。常规电泳过程中,普通级别的琼脂糖自带的一些性状不明的多糖,会连同DNA一起从凝胶中抽提出来,会强烈抑制后继的连接、酶切、或者标记、扩增等实验。从凝胶中回收DNA片断,产物的纯度自然是我们考虑的第一要务。对于大片断DNA回收,质量还包括了产物的完整与否,如果机械剪切力使得回收产物大小不一致,后果决不是你希望碰见的。而对于较小片断回收,质量其实还包括了回收产物的浓度。因为产物浓度太小,对后继实验同样也有影响,比如连接、标记实验等等就很不爽,往往不得不再浓缩一次,增加了操作的复杂性。此外,极微量的纯化介质或者是某些试剂混入回收产物中也会对结果产生致命的影响。 回收率:回收得率,是我们考虑的另一个重要参数。由于上电泳的样品量通常都很少,电泳的过程本身也会导致样品的分散和损失,因而尽可能多的回收电泳凝胶条带中的目的片断,提高产物得率,对于后继实验来说是非常重要的。回收率的多少通常和回收产物的大小以及量的多少有关,比如DNA片断越大,和固相基质的结合力越强,就越难洗脱,回收率就低;又比如说,DNA的量越少,相对损失越大,回收率越低。因此,根据情况选择不同的方法是很重要的。值得注意的是,由于样品的大小和多少对回收率都有显著的影响,所以回收率并非是一成不变的。 其他:操作方面,相信大家都会比较喜欢操作简单,快速,应用起来方便的方法或者产品。比如溶胶的缓冲液中添加指示剂,可以指示溶胶的溶液pH值就是很方便的设计;离心过柱就比离心沉淀要简单方便。载量,就是每次回收最多能回收的产物的量。这个自然是越大越好了,因为对于纯化柱或者一定量的纯化介质,过量的产物吸附不了就是被浪费掉的。难免有时你需要回收比较大量的产物,大载量就很有优势——同一个片断你要用2个柱子,多郁闷啊。

琼脂糖凝胶电泳片断回收的常用方法

琼脂糖凝胶电泳片断回收的常用方法 琼脂糖凝胶电泳片断回收的常用方法20世纪70年代是一个奠定现代分子生物学的时代,1973年冷泉港实验室的Joseph Sambroo k和Phillip Sharp发明了利用琼脂糖凝胶分离DNA 和EB染料观测DNA 相结合的技术。现在,琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶电泳是分离、鉴定和纯化核酸和蛋白质片断的标准方法。这里首先介绍的是琼脂糖凝胶电泳片断回收的常用方法: 1.柱回收试剂盒:可谓目前最简单快速的回收方法,只需要将电泳凝胶中的产物条带切下,用溶解Buffer彻底溶解,上包埋有纯化填料的纯化柱,离心,再洗涤一次,离心后用洗脱缓冲液洗脱。全程不过10多分钟,得到的产物溶液可以直接用于后继实验。这个方法几乎不需要什么技巧就能得到稳定的结果,也是目前最多商品化试剂盒选择的方法。但是这个方法不适合用于大片断的回收。 2.玻璃奶/纯化填料胶回收试剂盒:这个方法比前面的方法更为灵活,可以根据每次回收实验时预期回收量来调整纯化填料的量,使得实验不受限于柱子的载量,也不会造成浪费。前面的操作步骤和上者一样,将电泳凝胶的条带切下,Buffer溶解,(区别在于这里)加入纯化填料填料吸附混合,快速离心沉淀去上清,洗涤沉淀后,干燥沉淀,最后用洗脱液纯化介质中吸附的片断释放出来,离心,取上清,

就是回收的产物。这个方法适合各种不同大小的片断,特别是大片断的回收,但是操作就较前者复杂一些,涉及到多次离心沉淀和取上清,有可能会误吸了微量的沉淀;另外干燥的程度也有点技巧,干过了不好洗脱,没干透又影响结果。后来的改进版本有将混合了纯化介质后的凝胶溶解液加入到一种离心过滤柱上,这种柱子不带纯化填料,只有一层过滤膜,离心过滤后,填料在柱子里,溶液被甩掉,这样就避免了上述的问题。 3.低熔点琼脂糖:传统手工操作方法之一,低熔点琼脂糖制备凝胶,电泳后切割目的条带,在TE溶液中65度保温融化,用传统的酚氯仿抽提,乙醇沉淀。这个方法需要用到酚氯仿等有机试剂,由于乙醇沉淀需时较长,现在用的人已经不多了。想当年经费紧张的时候,低熔点琼脂糖贵,不舍得这么浪费的,比较取巧省钱的法子就是常规琼脂糖电泳后,在目的条带前方挖槽,灌入低熔点琼脂糖,凝胶后再电泳一小会儿,等条带进入低熔点琼脂糖区域再将那块家伙切出来,就可以非常非常节约了。除了直接酚抽低熔点琼脂糖凝胶,还有人用琼脂糖酶来消化琼脂糖凝胶,条件也相当温和,只是那酶价格并不便宜(光那酶的成本就至少5-6块,还不算其他的麻烦事),多数的酶只适合用低熔点琼脂糖,问题是我不用酶也可以直接酚抽,费时间还特长,所以,并不觉得特别好用。后来据说T家的琼脂糖酶可以用于常规琼脂糖,前提是你有办法在65度把那胶化了。但那需要极好的耐心。

胶回收

除了选择合适的方法外,实验中还要注意以下几点: (1)防止抽提过程中污染DNA酶 与回收片段接触的试剂与器皿等都应进行灭菌(酶)处理,即使是不能用干热或湿热法灭菌的器皿也要用乙醇浸泡以灭杀活菌与DNA酶,不然可能发生回收片段部分降解的现象,有时甚至一无所获.即使是轻微的降解反应——当发生在粘性末 端时也会导致严重的连接困难. (2)紫外照射选择长波段 回收过程往往需在紫外等监测下进行,与一般观察电泳结果不同的是这时应用长波紫外灯.因为短波紫外线(254nm)会引起DNA的断裂或是形成TT二聚体,前者会使以后的连接与转化等实验失败,后者可能造成基因突变,给克隆工作带来麻烦.即使是使用了长波紫外照射,回收DNA时也要尽量短时照射,避免连续长时间照射. (3)实验操作要轻柔 特别在处理较大片段时应防止机械剪切作用DNA对的破坏,如吸取液体,转动离 心管等操作均应缓慢,轻柔. 综上所述,只有在合适的回收方法基础上注意具体操作步骤是才能有效回收所需片段,为以后的酶切,连接,标记等工作打下良好基础. 3 实验步骤 一、试剂盒法(Kit回收法,以上海申能博彩生物科技有限公司生产的试剂盒为例) (1)从电泳板上切割含目的DNA片段的凝胶块(割胶尽可能的小,提供后续回收效率) (2)凝胶称重后并将其放入1.5ml管中,将其适当切小,加速溶解.每100mg凝胶加入400μl solution SN.(若称重省略,一般加入400μl SN) (3)凝胶溶解:55-60℃,保温5-10分钟,每2分钟混匀一下,使凝胶溶解,胶完全融化后每400μl solution SN中加入solution B 100μl,混匀. (4)将3S柱装入2ml洗管,将上述混合液转移至3S柱,室温放置2min.室温10 000 rpm离心1分钟,稳定45秒. (5)取下3S柱,倒掉收集管中的废液,将3S柱放入同一收集管中,加入600μl Wash Solution,室温10 000 rpm离心1分钟. (6)重复步骤5一次. (7)取下3S柱,倒掉收集管中废液,将3S柱放入同一收集管中,室温10 000 rpm 离心2分钟. (8)将3S柱放入新的离心管中,在3S柱子膜中央加30μl ddH2O,不加盖室温放 置2分钟. (9)盖上离心管,室温10 000 rpm离心1分钟,离心管中的液体即为回收的DNA 片段. 胶回收 一. 提高胶回收量的办法: 1) 增加电泳时的上样量。 2) 电泳缓冲液用新鲜配制的。

琼脂糖凝胶电泳常见问题分析

琼脂糖凝胶电泳常见问题分析

DNA凝胶电泳简介 一、实验原理 DNA电泳是基因工程中最基本的技术,DNA制备及浓度测定、目的DNA片段的分离,重组子的酶切鉴定等均需要电泳完成。根据分离的DNA大小及类型的不同,DNA电泳主要分两类:

1、聚丙烯酰胺凝胶电泳适合分离1kb以下的片段,最高分辨率可达1bp,也用于分离寡核苷酸,在引物的纯化中也常用此中凝胶进行纯化,也称PAGE纯化。 2、琼脂糖凝胶电泳可分离的DNA片段大小因胶浓度的不同而异,胶浓度为0.5~0.6%的凝胶可以分离的DNA片段范围为20bp~50kb。电泳结果用溴化乙锭(EB)染色后可直接在紫外下观察,并且可观察的DNA条带浓度为纳克级,而且整个过程一般1小时即可完成。由于该方法操作的简便和快速,在基因工程中较常用。 二、琼脂糖凝胶 琼脂糖是从琼脂中分离得到,由1,3连接的吡喃型b-D-半乳糖和1,4连接的3,6脱水吡喃型阿a-L-半乳糖组成,形成相对分子量为104~105的长链。琼脂糖加热溶解后分子呈随机线团状分布,当温度降低时链间糖分子上的羟基通过氢键作用相连接,形成孔径结构,而随着琼脂糖浓度不同形成不同大小的孔径。表1给出了不同浓度凝胶对DNA片段的线性分离范围。 表1不同类型琼脂糖分离DNA片段大小的范围 由于琼脂糖凝胶是通过氢键的作用,因此过酸或过碱等破坏氢键形成的方法常用于凝胶的再溶化,象NaClO4能用于凝胶的裂解,一般的凝胶回收试剂盒利用的也是这一原理。 随着实验技术的发展,也针对不同用途开发了各种类型的琼脂糖凝胶:(1)低熔点琼脂糖凝胶,用于DNA片段的回收,且由于该种凝胶中无抑制酶,可在胶中进行酶切、连接等;(2)高熔点凝胶,可分离小于1kb的DNA片段,专用于PCR产物的分析;(3)快速凝胶,电泳速度比普通凝胶中快一倍,可节省实验时间;(4)适用于DNA大片段的分离。(5)其它类型。各生产商还开发很多类型的凝胶,可根据实验要求选择不同类型的,选择原则是考虑合适的机械强度和熔点。

最新切胶回收的步骤

精品好文档,推荐学习交流 切胶回收的步骤 1.琼脂糖凝胶电泳目的基因,紫外灯下切除含有目的基因的琼脂糖,用纸巾吸尽凝胶表面的液体,尽量减少不含目的基因的凝胶量,称重(1mg=1ul) 2.尽量切碎凝胶 3.向离心管中加入3倍体积的NAL溶液,55(视具体胶定)度加热,使凝胶完全融化, 4.按每20ul硅胶树脂结合(树脂使用前要充分混匀)约3ugDNA加入适量比例的硅胶树脂,充分混合,室温放置20min, 5.10000rpm离心1分钟,去上清(上清液暂保存,如回收率不过可重复4) 6.加入800ul清洗液(清洗液加入56ml100%的无水乙醇),振荡混匀后,室温静置10min,10000rpm离心1分钟,去上清 7.重复步骤6,尽量去除上清,完全风干至不残留乙醇味道; 8.加入和硅胶树脂等体积的TEbuffer或灭菌蒸馏水混匀,55度水浴20min 9.10000rpm离心1分钟,吸上清为DNA回收液, 重复8,9初一语文讲义 辨析和修改病句的基本方法 辨析并修改病句是语文实际运用能力的具体表现之一,也是中考中长“考”不衰的常青树。本专题主要就是帮助学生了解句子的致病原因,掌握辨析和修改病句的基本方法,提高“诊断和施治”的能力。 “病句的辨析及修改”是近年来各地中考的重点,也是难点。这类题的主要考查方法有客观题和主观题两种。病句的辨析一般以客观选择题出现。这是一种比较传统的考察题型,它面广量大,仅供学习与交流,如有侵权请联系网站删除谢谢1

精品好文档,推荐学习交流 以思维见长,是近年中考中常见的题型,也是学生最易失分的题目,这就要求同学们复习过程中要重视这一类题的复习和训练。 主观题多指修改性的题目,多用于对句子或文段的修改。不仅要求学生们了解这是病句,是什么样的病句,而且要求知道如何修改,难度更大。目前学生对病句尚处于感性认识的阶段,而且这种认识是分散和不完全的,往往还不能自觉地综合应用,这一专题的复习指导是非常必要的。 一、何为“病句” 如果一个句子文不从,字不顺,不合乎语法规范,那它就有语病。通俗地说就是,凡是读起来不通顺,感觉别扭、含混不清的句子都是病句。 二、如何辨析病句 (1)感读——凭语感,凡是读起来别扭,听起来含混的,就可能有语病。 如:她有一个女儿,同许多年轻的妈妈一样,愿意把孩子打扮的漂亮一些。 10. 仅供学习与交流,如有侵权请联系网站删除谢谢2

DNA胶回收中常见问题和解答

D N A胶回收中常见问题 和解答 TYYGROUP system office room 【TYYUA16H-TYY-TYYYUA8Q8-

1、如何计算提取率? 1) 回收前样品中,往往含有非目的DNA 片段、引物、dNTP 等,所以不能用测回收前后吸光度的的方法计算回收率; 2) 可将回收前后DNA 片段一起电泳,使用凝胶成像系统拍照后,用配套的软件进行电泳条带灰度对比; 3) 注意,电泳条件及拍摄条件将对灰度对比结果造成很大影响,请仔细操作,以减小误差。 2、如何简易测算提取率? 取胶回收后的DNA溶液体积的1/5—1/10,与等体积的回收前的DNA溶液的5-10倍稀释液一起电泳,肉眼观察回收后的条带相对于回收前条带的亮度,粗略测算回收率(如亮度只有一半时,其回收率可粗略为50%)。 3、如何看待提取得率? 影响回收率的因素很多,如DNA片段大小、点样量、凝胶种类、电泳缓冲液的缓冲能力、切胶操作、紫外灯照射强度和时间、溶胶是否彻底等等,所以不能单凭1-2次的实验来判断其质量好坏,最好是多做几次实验或用几种不同品牌的产品做平行对照实验,结果相对真实。 4、回收率为什么与点样量和片段大小有关? DNA片断越大,和固相基质的结合力越强,就越难洗脱,回收率就低;DNA的量越少,相对损失越大,回收率越低。 5、用胶回收试剂盒从凝胶中回收DNA得率低是什么原因?

1)胶块溶解不完全,可适当延长水浴时间和上下颠倒的次数以及增加溶胶液的比例; 2)胶块体积太大,应使用枪头捣碎,还不能充分溶解则先将其切为小块,分多次回收; 3)紫外灯下切胶时间过长,导致DNA部分降解,应尽量把切胶时间控制在30s以内; 4)洗涤液使用后未及时盖严瓶盖,乙醇挥发,影响回收效率; 5) TAE或TBE电泳缓冲液不新鲜,失去了缓冲能力,导致PH值升高,降低DNA和膜的吸附力,应及时更换电泳缓冲液,最好使用新鲜配制的电泳缓冲液,效果更好; 6)回收前的样品量太少,加大点样量; 7)洗脱前,预先65℃预热洗脱液、延长室温静置时间、增加洗脱次数可以有效提高回收率30%以上。 6、加入溶胶液温浴后,液体仍很粘稠或后续步骤有堵柱子现象? 1)胶块溶解不充分,可再补加一些溶胶液或延长水浴时间并增加上下颠倒次数帮助溶胶; 2)胶块体积过大,应尽量切除多余部分,并将其切为小碎块,分几次回收; 3)水浴温度是否达到规定温度65℃,用温度计检测。 7、琼脂糖凝胶块不溶? 1)琼脂糖质量不好; 2)含目的片断的凝胶在空气中放置过久,使胶块失水干躁,建议切胶后立即进行回收或将胶块保存于4 ℃或-20℃;

PCR产物胶回收实验

实验六 PCR产物胶回收实验 一、实验目的 1. 掌握胶回收的常规操作 2. 了解胶回收PCR产物的目的 二、实验原理 利用胶回收试剂盒纯化PCR产物。本试剂盒提供一个从TBE或TAE电泳缓冲液配制的琼脂糖凝胶中提取高质量DNA的简单、快速、有效的技术,适合从浓度≤3%,高,低熔点琼脂糖凝胶中,回收长度为60bp~23Kb的DNA片段,小于100bpDNA片段回收率为10%~55%,0.1~10kbDNA片段回收率最大为99%,大于10kbDNA片段回收率为20~70%。回收的基因组DNA可以应用到克隆,测序,限制性酶切等各类下游分子生物学实验。 三、试剂及配套设备和材料 3.1 试剂 Extraction buffer Wash buffer Elution buffer 3.2 配套设备和材料 无菌1.5ml离心管各种规格移液器和无菌移液器吸头 无水乙醇异丙醇可能需要3M KAc (pH 5.0) 离心机 四、基本技术参数 五、操作步骤 1. 用干净、锋利的手术刀,将含有目的DNA片段的琼脂糖凝胶切下,并放入1.5或 2.0 ml离心管中。 请尽量切去不包含DNA片段的凝胶。一般情况下,电泳的DNA上样量≥50 ul (50ul为最终洗脱体积)。

2. 按1:3的比例(凝胶质量毫克数:融胶液体积微升数)加入Extraction buffer。 例如:100mg凝胶应加入300ul Extraction Buffer。对于每人份试剂用量,凝胶质量不能超过400mg。 3. 于恒温水浴或金属浴中50℃温育,直到凝胶融化。 一般温育时间为10分钟,温育过程中没隔2-3分钟混匀一次。如果温育后,混合液体颜色变紫,请加入10 ul 3M KAc (pH 5.0),使混合液颜色变回黄色。 4. 可选:按1:1的比例(凝胶质量毫克数:异丙醇体积微升数)加入异丙醇,并混合均匀。 如DNA片段大于500bp/小于4kb,不需要加异丙醇。 5. 将混合液全部转移到Spin column内,于6,000g离心1分钟,并弃去接液管内液体。 如混合液体积大于750ul可先转移750ul,其余的液体待离心弃液后,再转移。 6. 向Spin column内加500ul Extraction Buffer,于12,000g离心30~60秒,并弃去接液管内液体。 7. 向Spin column内加750ul Wash Buffer,于12,000g离心30~60秒,并弃去接液管内液体。 如果回收的DNA片段将用于盐浓度敏感的实验,请在加入Wash buffer后静置2~5分钟,再离心。 8. 再次于12,000 rpm离心1分钟,然后将spin column转移到无菌的1.5ml离心管中。 如不进行该步离心,则无法保证离心柱内残液被彻底清除。 9. 向Spin column内加50ul Elution Buffer、水或TE溶液,并于室温静置1分钟。 可根据实验的实际需要决定Elution Buffer用量。但不要低于20ul。 10. 于12,000g离心1分钟,微量离心管内溶液中含有目的DNA片段。 回收的DNA可直接用于各类下游分子生物学实验,如果不立即使用,请保存于-20℃。 六、注意事项 1. 为了保证没有外源DNA的污染,电泳的buffer和gel都是新制的,切胶的台子清理干净,刀片最好洗净灭菌。 2. 为了减少胶的体积,我们可以用相对比较薄的胶来跑电泳,这样可以减少回收试剂引起的一些后续麻烦。

胶回收方法全攻略

生物通技术专题:说到电泳凝胶的片断回收,想来在实验室久已的“老手”们都会不屑一顾。确实,一般在各个和分子生物学沾到一点边儿的实验室里,从琼脂糖凝胶中回收DNA,仅仅是一种简单不过的常规实验操作。虽说早期的凝胶电泳片断回收没有1—2个小时是搞不定的,每个实验室也有自己的独门秘诀,可后来各大品牌纷纷推出了了多种不同用途,不同价钱的快速凝胶回收试剂盒,一下子将胶回收的时间缩短到10多分钟,操作也大大简化,胶回收就变成“小菜一碟”了。然而,从bbs逛上一圈下来,发现实际上还是有不少人为胶回收这种看似简单的操作而烦恼。到底是什么导致了实验新手,甚至是老手在这个已经发展近40年的常规性实验中卡壳?由于胶回收的质量和数量直接影响后继的一系列实验——比如酶切连接、转化筛选、测序或者PCR扩增、标记乃至显微注射等等,生物通编者为大家搜罗各种产品和方法的优缺点,注意事项,做一个胶回收全攻略篇。 一、胶回收的关键参数 胶回收的质量直接影响后继实验的成功与否。要想做好胶回收,无论是自己亲力亲为还是借助目前五花八门的胶回收试剂,最基本的评定标准无外乎这么几个:质量(回收产物的纯度和浓度),回收效率,操作方便(速度),柱子的载量等等。 回收产物质量:回收产物的质量主要指纯度。常规电泳过程中,普通级别的琼脂糖自带的一些性状不明的多糖,会连同DNA一起从凝胶中抽提出来,会强烈抑制后继的连接、酶切、或者标记、扩增等实验。从凝胶中回收DNA片断,产物的纯度自然是我们考虑的第一要务。对于大片断DNA回收,质量还包括了产物的完整与否,如果机械剪切力使得回收产物大小不一致,后果决不是你希望碰见的。而对于较小片断回收,质量其实还包括了回收产物的浓度。因为产物浓度太小,对后继实验同样也有影响,比如连接、标记实验等等就很不爽,往往不得不再浓缩一次,增加了操作的复杂性。此外,极微量的纯化介质或者是某些试剂混入回收产物中也会对结果产生致命的影响。 回收率:回收得率,是我们考虑的另一个重要参数。由于上电泳的样品量通常都很少,电泳的过程本身也会导致样品的分散和损失,因而尽可能多的回收电泳凝胶条带中的目的片断,提高产物得率,对于后继实验来说是非常重要的。回收率的多少通常和回收产物的大小以及量的多少有关,比如DNA片断越大,和固相基质的结合力越强,就越难洗脱,回收率就低;又比如说,DNA的量越少,相对损失越大,回收率越低。因此,根据情况选择不同的方法是很重要的。值得注意的是,由于样品的大小和多少对回收率都有显著的影响,所以回收率并非是一成不变的。 其他:操作方面,相信大家都会比较喜欢操作简单,快速,应用起来方便的方法或者产品。比如溶胶的缓冲液中添加指示剂,可以指示溶胶的溶液pH值就是很方便的设计;离心过柱就比离心沉淀要简单方便。载量,就是每次回收最多能回收的产物的量。这个自然是越大越好了,因为对于纯化柱或者一定量的纯化介质,过量的产物吸附不了就是被浪费掉的。难免有时你需要回收比较大量的产物,大载量就很有优势——同一个片断你要用2个柱子,多郁闷啊。 二:胶回收方法和分类 20世纪70年代是一个奠定现代分子生物学的时代,1973年冷泉港实验室的Joseph Sambrook和Phillip Sharp发明了利用琼脂糖凝胶分离DNA和EB染料观测DNA相结合的技术。现在,琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶电泳是分离、鉴定和纯化核酸和蛋白质片断的标准方法。生物通将在后面另文讨论聚丙烯酰胺凝胶电泳片断回收的方法,这里首先介绍的是琼脂糖凝胶电泳片断回收的常用方法: 1.柱回收试剂盒:可谓目前最简单快速的回收方法,只需要将电泳凝胶中的产物条带切下,用溶解Buffer彻底溶解,上包埋有纯化填料的纯化柱,离心,再洗涤一次,离心后用洗脱缓冲液洗脱。全程不过10多分钟,得到的产物溶液可以直接用于后继实验。这个方法几乎

关于胶回收

胶回收 一. 提高胶回收量的办法: 1)增加电泳时的上样量。 2)电泳缓冲液用新鲜配制的。 3)切胶时尽量只切有条带的胶,减小切胶体积:含目的片断很少的胶就不要要了,不然影响回收率。 4)把切的两块或多块胶融化后,无论多大的体积都用一个管子,转移到同一个柱子上。 5)溶胶时所加的溶液可多一点,这样更有利于DNA与膜的结合,不过一般不要多余750ul。 6)胶回收的关键是通过柱子的溶液的盐浓度、酸碱性(电荷)和疏水性使DNA与柱子结合,因此,若电泳缓冲液的PH偏高,可在溶胶液中加入10ul (PH 5.0,3mol/L的 NaAC);为了使DNA分子更好的拦截在膜上,可以添加30%异丙醇在加热溶解胶后的液体里。

7)加洗脱液之前,将柱子在室温放置几分钟(大约需10分钟),以 使乙醇充分挥发。 8)最后少加些洗脱液,尽量减少回收体积,一般用30-50μl洗脱液 洗脱(不能太少,否则无法浸湿膜反而不利于洗脱);洗脱液滴在膜中央,以充 分洗脱结合在膜上的DNA。 9)可以在加入洗脱液之后,可以在55度水浴5分钟或放在50度水浴 10分钟以上再洗脱,或用封口膜密封4度过夜,第二天再离心回收,效果不错。 10)将离心后的洗脱液加回吸附柱,再次离心。 DNA胶回收实验技术总结 胶回收

一. 提高胶回收量的办法: 1)增加电泳时的上样量。 2)电泳缓冲液用新鲜配制的。 3)切胶时尽量只切有条带的胶,减小切胶体积:含目的片断很少的胶就不要要了,不然影响回收率。 4)把切的两块或多块胶融化后,无论多大的体积都用一个管子,转移到同一个柱子上。 5)溶胶时所加的溶液可多一点,这样更有利于DNA与膜的结合,不过一般不要多余750ul。 6)胶回收的关键是通过柱子的溶液的盐浓度、酸碱性(电荷)和疏水性使DNA与柱子结合,因此,若电泳缓冲液的PH偏高,可在溶胶液中加入10ul(PH 5.0,3mol/L的 NaAC);为了使DNA分子更好的拦截在膜上,可以添加30%异丙醇在加热溶解胶后的液体里。 7)加洗脱液之前,将柱子在室温放置几分钟(大约需10分钟),以使乙醇充分挥发。 8)最后少加些洗脱液,尽量减少回收体积,一般用30-50μl洗脱液洗脱(不能太少,否则无法浸湿膜反

胶回收

1. 使用TAE缓冲液或TBE缓冲液制作琼脂糖凝胶,然后对目的DNA进行琼脂 糖凝胶电泳。2. 在紫外灯下切出含有目的DNA的琼脂糖凝胶,用纸巾吸尽凝胶表面的液体。此时应注意尽量切除不含目的DNA部分的凝胶,尽量减小凝胶体积,提高DNA回收率。注)切胶时请注意不要将DNA长时间暴露于紫外灯下,以防止DNA损伤。3. 切碎胶块。胶块切碎后可以加快操作步骤6的胶块融化时间,提高DNA的回收率。4. 称量胶块重量,计算胶块体积。计算胶块体积时,以1 mg=1 ul进行计算。 5. 向胶块中加入胶块融化液DR-I Buffer。DR-I Buffer的加量如下表: 6. 均匀混合后75℃加热融化胶块(低熔点琼脂糖凝胶只需在45℃加热)。此时应间断振荡混合,使胶块充分融化(约6~10分钟)。注)胶块一定要充分融化,否则将会严重影响DNA的回收率。7. 向上述胶块融化液中加入DR-I Buffer量的1/2体积量的DR-II Buffer,均匀混合。当分离小于400 bp的DNA片段时,应在此溶液中再加入终浓度为20%的异丙醇。8. 将试剂盒中的Spin Column安置于Collection Tube上。9. 将上述操作7的溶液转移至Spin Column中,12,000 rpm离心1分钟,弃滤液。注)如将滤液再加入Spin Column中离心一次,可以提高DNA的回收率。10. 将500 ul的Rinse A加入Spin Column中,12,000 rpm离心30秒,弃滤液。11. 将700 ul的Rinse B加入Spin Column中,12,000 rpm离心30秒,弃滤液。12. 重复操作步骤11。13. 将Spin Column安置于新的1.5 ml的离心管上,在Spin Column 膜的中央处加入25 ul 的灭菌蒸馏水或Elution Buffer,室温静置1分钟。注)把灭菌蒸馏水或Elution Buffer加热至60℃使用时有利于提高洗脱效率。14. 12,000 rpm离心1分钟洗脱DNA。如果实验室备有适合于Spin Column接口的负压装置,可在上述操作步骤7完成以后进行以下操作。8. 将试剂盒中的Spin Column插到负压装置的插口上,将上述操作步骤7的溶液转移到Spin Column中,开启调节负压装置,缓慢吸走Spin Column中的溶液(流速控制在1滴/秒)。9. 将负压调至最大,向Spin Column中加入500 ul的Rinse A,吸尽Spin Column中溶液。10.向Spin Column中加入700 ul的Rinse B,吸尽Spin Column中溶液。11.重复操作步骤10,然后从负压装置上取下Spin Column,将其安置于试剂盒中的Collection Tube上。 12.12,000 rpm离心1分钟。13.Spin Column安置于新的1.5 ml的离心管 上,在Spin Column膜的中央处加入25 ul的灭菌蒸馏水或Elution Buffer,室温静置1分钟。注)把灭菌蒸馏水或Elution Buffer加热至60℃使用时有利于提高洗脱效率。14.12,000 rpm离心1分钟洗脱DNA。 最近在做连接的试验,由于需要多次纯化回收,而胶回收的回收率往往又很低,使得最后目的基因和载体的量非常低,电泳最后跑不出来,非常头疼,在dxy 上也看到很多战友遇到这样的问题,于是对这方面的资料进行了整理,希望对大家有用,并希望各位战友继续对这一问题进行交流与补充。 1. 提高胶回收量的办法: 1) 增加电泳时的上样量。 2) 电泳缓冲液用新鲜配制的。

电泳常见问题

Marker 参考见解:marker有时会出现这样的问题,应该是时间久了。新买时跑胶在点样孔没有,过一段时间就会在点样孔出现亮点。也可能是蛋白,有时DNA提的不纯含有蛋白时就会出现上样孔有条带的现象 琼脂糖凝胶电泳检测DNA时,跑出的带后面出现拖尾现象,什么原因造成的? 参考见解:DNA带模糊??: 1、DNA降解??避免核酸酶污染。 2、DNA上样量过多??减少凝胶中DNA上样量。 3、所用电泳条件不合适??电泳时电压不应超过20V/cm,温度<30℃,巨大DNA链,温度应<15℃,核查所用电泳缓冲液是否有足够的缓冲能力。 4、DNA样含盐过高??电泳前通过乙醇沉淀去除过多的盐。 5、有蛋白污染??电泳前酚抽提去除蛋白。 6、DNA变性,?电泳前勿加热,用20mM NaCl缓冲液稀释DNA。 将从组织提取的DNA进琼行脂糖凝胶电泳,用的1.5%的胶加了EB,80V跑1小时,溴酚蓝已经跑到头了,在紫外灯观察什么带也没有,只见孔里面有橘红色的亮光。好象没跑出来,是怎么回事? 参考见解: 1、根据目的条带长度来调整凝胶浓度,一般1.5%左右,也不一定。 2、紫外灯下没见带,不一定没有出孔,而是量少看不到,可以测一下浓度看一下,或直接试跑一下PCR。

3、最好加一个marker孔,尤其你第一次跑胶时。 4、电泳时间可能过长,一般75v×30min左右,但是具体看溴酚蓝的离孔距离和目的条带离孔距离。 怎样根据目测条带亮度来判断DNA浓度? 参考见解: 1、跑胶时候marker 可以加成定量marker,如1kb、100bp等marker,按说明书的量上样电泳,如加500ng量的DNA marker,电泳完毕后,就可将目的DNA条带和MARKER 条带的亮度做个大致的比较,找出两者最接近亮度的条带。因为marker的各条带都已知所含的DNA浓度(说明书中详细注明),因此根据条带的亮度、大小大致就可推测目的DNA的浓度。 2、在通过目测DNA浓度的时候,最好要把加样量设一个梯度,比如从0。5、2、4、6,因为,如果质粒的量很浓的话,通过简单的对一条条带的目测产生的结果误差是很大的或者利用marker(推荐DL 2000),再用软件做半定量分析。 DNA电泳的MARKER怎么是扭曲的? 参考见解: 1、配制胶时的缓冲液需要和电泳缓冲液不是同时配制的.最好是同时配制.电泳时缓冲液高过液面1-2mm即可。 2、电泳时电压过高,可以在电泳前15分钟用较低电压(3V/cm),等条带出孔后比较漂亮了.然后再调电压。 3、上样时尽量慢慢加样,等样品自然沉降后再加电压。 跑出的DNA带模糊? 参考见解: 1、DNA降解:避免核酸酶污染。 2、电泳缓冲液陈旧:电泳缓冲液多次使用后,离子强度降低,pH值上升,缓冲能力减弱,从而影响电泳效果。建议经常更换电泳缓冲液。 3、所用电泳条件不合适:电泳时电压不应超过20V/cm,温度<30℃;巨大DNA链电泳,温度应<15℃;核查所用电泳缓冲液是否有足够的缓冲能力。 4、DNA上样量过多:减少凝胶中DNA上样量。 5、DNA样含盐过高:电泳前通过乙醇沉淀去除过多的盐。 6、有蛋白污染:电泳前酚抽提去除蛋白。 7、DNA变性:电泳前勿加热,用20mM NaCl缓冲液稀释DNA。 有不规则DNA带迁移? 参考见解: 1、对于λ/Hind III片段cos位点复性:电泳前于65℃加热DNA 5分钟,然后在冰上冷却5分钟。 2、电泳条件不合适:电泳电压不超过20V/cm;温度<30℃;经常更换电泳缓冲液。 3、DNA变性:以20mM NaCl Buffer稀释DNA,电泳前勿加热。 跑出的DNA条带带弱或无DNA带? 参考见解: 1、DNA的上样量不够:增加DNA的上样量;聚丙烯酰胺凝胶电泳比琼脂糖电泳灵敏度稍高,上样量可适当降低。 2、DNA降解:避免DNA的核酸酶污染。

胶回收常见问题

胶回收常见问题 dna回收|dna回收试剂盒|捷瑞dna回收试剂盒|胶回收|胶回收试剂盒|胶回收原理 1、如何计算提取率? 1) 回收前样品中,往往含有非目的DNA 片段、引物、dNTP 等,所以不能用测回收前后吸光度的的方法计算回收率; 2) 可将回收前后DNA 片段一起电泳,使用凝胶成像系统拍照后,用配套的软件进行电泳条带灰度对比; 3) 注意,电泳条件及拍摄条件将对灰度对比结果造成很大影响,请仔细操作,以减小误差。 2、如何简易测算提取率? 取胶回收后的DNA溶液体积的1/5—1/10,与等体积的回收前的DNA溶液的5-10倍稀释液一起电泳,肉眼观察回收后的条带相对于回收前条带的亮度,粗略测算回收率(如亮度只有一半时,其回收率可粗略为50%)。 3、如何看待提取得率? 影响回收率的因素很多,如DNA片段大小、点样量、凝胶种类、电泳缓冲液的缓冲能力、切胶操作、紫外灯照射强度和时间、溶胶是否彻底等等,所以不能单凭1-2次的实验来判断其质量好坏,最好是多做几次实验或用几种不同品牌的产品做平行对照实验,结果相对真实。 4、回收率为什么与点样量和片段大小有关? DNA片断越大,和固相基质的结合力越强,就越难洗脱,回收率就低;DNA的量越少,相对损失越大,回收率越低。 5、用胶回收试剂盒从凝胶中回收DNA得率低是什么原因? 1)胶块溶解不完全,可适当延长水浴时间和上下颠倒的次数以及增加溶胶液的比例; 2)胶块体积太大,应使用枪头捣碎,还不能充分溶解则先将其切为小块,分多次回收; 3)紫外灯下切胶时间过长,导致DNA部分降解,应尽量把切胶时间控制在30s以内; 4)洗涤液使用后未及时盖严瓶盖,乙醇挥发,影响回收效率; 5) TAE或TBE电泳缓冲液不新鲜,失去了缓冲能力,导致PH值升高,降低DNA和膜的吸附力,应及时更换电泳缓冲液,最好使用新鲜配制的电泳缓冲液,效果更好; 6)回收前的样品量太少,加大点样量; 7)洗脱前,预先65℃预热洗脱液、延长室温静置时间、增加洗脱次数可以有效提高回收率30%以上。 6、加入溶胶液温浴后,液体仍很粘稠或后续步骤有堵柱子现象? 1)胶块溶解不充分,可再补加一些溶胶液或延长水浴时间并增加上下颠倒次数帮助溶胶; 2)胶块体积过大,应尽量切除多余部分,并将其切为小碎块,分几次回收; 3)水浴温度是否达到规定温度65℃,用温度计检测。 7、琼脂糖凝胶块不溶? 1)琼脂糖质量不好; 2)含目的片断的凝胶在空气中放置过久,使胶块失水干躁,建议切胶后立即进行回收或将胶块保存于4 ℃或-20℃; 3)制胶的电泳缓冲液浓度过高或陈旧。 8、点样时发现DNA样品有漂出点样孔外的现象? 柱子上的乙醇未完全挥发干净,延长室温下空柱静置时间以确保乙醇完全挥发干净。 9、能否使用去离子水洗脱回收? 可以,但是实验室所用去离子水一般PH值偏低,可用NaOH适当调高PH值>7.0,以增加回收得率。 10、能否使用TE(PH8.0)洗脱?可以。 11、可否使用小于30μl的洗脱液进行洗脱? 不可以。因为说明书提供的最少洗脱体积是能完全覆盖吸附膜的最小体积。 12、关于DNA片段大小与回收率的问题? 100bp-500bp,30-60%;500bp-4kb,80-95%;4kb以上,30-50%。 13、OD值与琼脂糖凝胶中的DNA产量不相符? 从柱子上洗脱下来的痕量杂质增加了A260的值。 14、吸光度纯度测定时应注意哪些问题? 吸光度测量的是未知样品与调零标准之间的相对吸光度,所以请用与洗脱液体相同的液体,对测量样品进行稀释和调零。 15、为什么溶胶不彻底会影响回收结果的纯度? 在电泳过程中,DNA会与大分子的多糖紧密的结合在一起,凝胶的种类和质量不同,DNA与之结合力也不同,只有凝胶充分溶解DNA才能充分释放,否则,凝胶将与DNA一起沉淀下来,洗脱后将影响回收结果的纯度。

DNA凝胶回收方法及常见问题

DNA凝胶回收方法及常见问题 琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶电泳是分离、鉴定和纯化核酸和蛋白质片断的标准方法。聚丙烯酰胺凝胶电泳片段的回收将在以后的文章中介绍,在这里我先介绍一下琼脂糖凝胶电泳片断回收的常用方法,方便大家学习交流。 从琼脂糖凝胶中回收DNA,是一种简单不过的常规实验操作。但是由于胶回收的质量和数量直接影响后继的一系列实验――比如酶切连接、转化筛选、测序或者PCR扩增、标记乃至显微注射等等,所以这一步的操作也显得非常重要。 胶回收的质量好否直接影响后继实验的成功与否。现今除了手工回收方法外,许多公司都开发了方便的回收试剂盒系列,但是无论借助何种方式,最基本的评定标准均包括: 回收产物质量:主要指纯度。常规电泳过程中,普通级别的琼脂糖自带的一些性状不明的多糖,会连同DNA一起从凝胶中抽提出来,强烈抑制后继的连接、酶切、或者标记、扩增等实验。对于大片断DNA回收,质量还包括产物的完整性;而对于较小片断回收,质量还包括回收产物的浓度;此外,极微量的纯化介质或者是某些试剂混入回收产物中也会对结果产生致命的影响。 回收率:由于上电泳样品量通常都很少,电泳过程本身也会导致样品的分散和损失,因而尽可能多的回收电泳凝胶条带中的目的片断,提高产物得率,对于后继实验来说是非常重要的。回收率的多少通常和回收产物的大小以及量的多少有关,比如DNA片断越大,和固相基质的结合力越强,就越难洗脱,回收率就低;又如,DNA的量越少,相对损失越大,回收率越低。因此,根据情况选择不同的方法是很重要的。 其他:操作方面,操作简单,快速,应用方便的方法或产品自然比较受欢迎。如溶胶的缓冲液中添加指示剂,可以指示溶胶的溶液pH值就是很方便的设计;离心过柱就比离心沉淀要简单方便。还有要注意载量问题,因为对于纯化柱或者一定量的纯化介质都有一定的吸附限度,过量的产物吸附不了即被损失掉。 以下是我总结的常见问题,希望对大家有所帮助。 Q1:利用凝胶回收试剂盒DNA回收效率较低或者未回收到目的片段? A1: 可能有以下几个原因: 1. 胶块未完全溶解,溶解凝胶时应置于55℃水浴,可适当延长水浴时间,并增加上下颠倒

相关主题