口腔生物学复习(全新版整理)

口腔生物学复习资料整理

第一章口腔微生物学

（名解）

生态系：生物之间、生物与其环境之间的相互关系。

生态学：研究生物与其环境的相互依赖和相互制约的科学。

微生态学：细胞水平或分子水平的生态学。

生态连续：生物体栖息在一个变化的环境中的过程。

小生境（niches）：生物生活、居住的微小范围的环境。小生境的种类、数目是决定在生境中生活的物种数的主要因子。生境或群落的结构愈复杂，其含有的生物种类愈多

极期群落（climax community）：生物体（或细菌）栖息在一个变化的环境中的过程称生态延续，在一个小生境中延续演化组成多种多样复杂的生物群（菌群），环境条件趋于稳定，菌属数和组成的无明显改变，这种群体称极期群落。

口腔生态系：口腔正常菌丛之间以及它们与宿主之间的相互作用，许多正常菌丛和其宿主之间呈动力的平衡状，这种平衡状态对于保持宿主的健康是重要的。

嗜温微生物：为在25-37℃中适宜生长的微生物。

绝对厌氧菌：在无氧环境中发酵生长，氧可抑制或杀灭的细菌。

兼性厌氧菌：在合适的碳或其他能源存在时可在有氧或无氧中生长的细菌。

微嗜氧菌：这类细菌的生长需氧，但所需氧的浓度比正常低，对需氧菌生长合适的浓度，对这类细菌抑制。

牙菌斑（老概念）：堆积在牙表面或其他硬的口腔结构上，不能被中度水喷冲去的细菌团块。牙菌斑（新概念）：在牙和修复体上软而未矿化的细菌沉积物，非白垢，它是能够容纳多种多样菌丛生存的生物膜。

生物膜（biofilm）：牙面清洁后，唾液的一些成分会很快地吸附于其上而形成一层均匀无细胞的薄膜，厚度约1～10um，龈缘区较厚而牙尖区较薄，成分大致与唾液相似，对细菌有选择性吸附能力。

点隙裂沟菌斑：存在于牙硬组织沟窝点隙内的菌斑。

附着性龈下菌斑：附着于牙根面或牙结石表面，可能系龈上菌斑在龈沟或牙周袋内的延续。非附着性龈下菌斑：不附着于牙面或牙根面，却与结合上皮和龈沟上皮直接接触的菌斑。固有菌丛（indigenous flora）：包含常以高数量（大于1%）存在于某个特殊部位上的菌属，如在龈上菌斑或舌表面。

增补菌丛（supplemental flora）：包含常居的，但是以低数量（小于1%）存在的菌属，当环境改变时可以成为固有菌。

暂时菌丛（transient flora）：是指口腔中的过路细菌。

（填空）

口腔四个主要生态系：颊上皮生态系、舌背部生态系、龈上牙菌斑生态系、龈下牙菌斑生态系

口腔生态系影响因素：物理化学因素、宿主因素、细菌因素、宿主可控制因素

口腔菌丛的主要成员：微需氧菌、兼性厌氧菌、厌氧菌

菌斑成熟的标志是栅栏状结构，约出现在菌斑形成的第5-6天，并可看到谷穗样结构。

口腔链球菌属包括特有的三种：变形链球菌群、唾液链球菌群、血链球菌

（简答）

【生物膜发育5个阶段】

①形成条件薄膜，存有某些微生物的特异性受体，可选择性地接纳某些微生物。

②细菌分子对宿主表面的吸附；

③同种细菌间的聚集和异种细菌间的共聚集；

④各菌属、种的繁殖；

⑤细菌从生物膜脱附着，传播或定植到其他部位。

【成熟菌斑三层结构】

①基底层：均质，无结构。

②细菌层：位于中间地带，含杆菌、球菌、丝状菌，呈栅栏状。

③表层：G -、G+球菌、短杆菌、上皮、食物残渣、衰亡细胞

【口腔正常菌丛的来源和成立】

①刚出生：来源于母亲，如大肠杆菌和链球菌

②随着对婴儿的喂养和看护：来源于母亲和近亲

③小于1岁：口腔菌丛可有葡萄球菌、链球菌、奈瑟菌等

④学龄前：组成基本与成人相近似，少有产黑色素拟杆菌

⑤13-16岁：产黑色素拟杆菌增多

⑥成年期：主要为血链球菌、链球菌

⑦老年期：血链菌、变链菌逐渐减少

【龈沟液采集】

①沟内法：采集前刮除龈上菌斑、软垢、牙石，漱口，隔湿。先将滤纸前端轻插于龈沟入口处，当感到阻力时再向龈沟深部插入，约5秒钟后取出，放入含预还原传送培养基的带盖小瓶中，加盖灭菌液状石蜡后送检。缺点为：易使龈沟内壁擦伤、出血，而使龈沟液与血液混合。

②沟外法：此法适用于牙周袋较浅时，采集前同沟内法刮治龈上菌斑等诸项处理，然后以短的滤纸片紧贴于牙面、龈缘和附着龈上，使龈沟液慢慢渗至滤纸上。优点为：避免对龈沟内壁物理性刺激，减少出血。

第二章口腔生物化学

（名解）

胶原酶（collagenase）：存在正常牙龈和龈沟液中，随炎症程度加剧增加，其活性随牙龈炎症、牙周袋深度和骨丧失程度增加而增加。

组织蛋白酶（cathepsin）：是一组细胞内半胱氨酸蛋白酶，当释放入细胞外间隙能分解包括胶原在内的细胞外间质成分。

碱性磷酸酶（alkaline phosphatase）：其活性与骨代谢和嗜中性白细胞脱颗粒密切相关。

生物矿化（biomineralization）：是指生物体内的钙磷等无机离子在多种生物因子的调控下通过化学反应产生难溶性盐与有机基质结合，形成机体矿化组织。

生理性矿化：机体生长发育成熟过程中，无机离子在生物调控下在机体的特定部位与有机基

质中的生物大分子结合形成具有一定结构的矿化组织。

病理性矿化：由于机体对生物矿化调控作用失衡，无机离子在不该矿化的部位形成异位矿化或异常矿化组织，或造成矿化组织矿化过度或不足。

（填空）

釉质中蛋白水解酶主要有基质金属蛋白酶20（MMP20）和丝蛋白酶。

釉质晶体的化学性质：吸收性、离子交换。

牙周病变过程中，内毒素、胶原酶、巯基复合物参与了胶原的破坏。

胶原纤维的主要结构是一种多肽链，构成其蛋白分子的肽链有两类：α1和α2，其中，α1又分为四型。

唾液中钙以三种方式存在：钙离子、无机复合物、与有机物结合。

唾液中最常见的钙及磷酸盐是磷酸氢钙、磷酸八钙、磷酸钙、羟磷灰石。

唾液内的免疫球蛋白主要有IgA、IgG、IgM，其中分泌型IgA（SIgA）最重要。SigA一般认为是由大小涎腺的浆细胞合成。

唾液诊断口腔疾病包括：涎腺炎症、龋病、牙周病。

生物矿化的机制：成核、晶核成长、集聚、固相转换。

（大题）

【釉质中的氟】

釉质中，氟占重量的0.005%-0.5%，其表面含氟量明显高于釉牙本质界。

其影响因素为：①釉质蛋白②组织液③外环境④生理性磨损

【釉质的硬度和密度】

硬度：牙萌出后硬度逐渐增加，老年恒牙硬度＞年轻恒牙＞成熟乳牙＞不成熟乳牙

密度：①表面釉质密度最高，近釉牙本质界处最低②未萌牙的釉质密度低于已萌牙，乳牙釉质的密度低于恒牙

【牙本质和牙骨质胶原特点】

①胶原原纤维对矿物盐有较大的吸收力②牙本质胶原比软组织胶原稳定

【牙周组织的胶原】

在正常的牙龈结缔组织，Ⅰ型和Ⅲ型胶原是主要的胶原类型，另有少量的Ⅳ和Ⅴ型胶原。牙周膜以Ⅰ型和Ⅲ型胶原为主，另有少量Ⅴ型胶原。牙槽骨主要为Ⅰ型胶原。牙骨质为Ⅰ型胶原和少量Ⅲ型胶原。

【牙周病变过程中胶原类型的变化】

①Ⅴ型胶原的含量明显上升②出现Ⅰ型胶原三聚体③Ⅲ型胶原含量下降

【唾液中的氟】

浓度在0.01-0.05mg/L之间。在牙萌出进一步矿化期间，唾液中的氟可以进入牙，与牙内的羟磷灰石发生置换反应，形成抗酸力强的氟磷灰石，提高牙的抗龋力。

【简述SIgA功能】

①粘膜免疫②抗原调节和免疫排斥③口腔耐受④IgA介导的抗原分泌

【富脯蛋白、富组蛋白、富酪蛋白的特点】

1）富脯蛋白：主要有腮腺分泌，是人类唾液中最大的一族蛋白，约占70%。根据共性可分为酸性、碱性、糖激化型三类。有多种功能：①结合钙离子②参与唾液获得膜的形成③协助细菌粘附

2）富组蛋白：一组阳离子性多功能蛋白质。具有较强抗真菌及抑制细菌作用；与羟基磷灰石有很强的亲和力，吸附于牙釉质表面，参与获得膜形成；抑制磷酸钙结晶形成。

3）富酪蛋白：由腺泡细胞分泌，是富含酪氨酸和脯氨酸的磷蛋白。在结构及生物学功能上与富脯蛋白十分相似。

【两种唾液粘蛋白MGⅠ、MGⅡ比较】

【唾液蛋白质的功能10点】

①保水作用②润滑作用③维持味觉④形成软组织表面膜⑤形成釉质获得膜⑥消化作用⑦软组织修复⑧保护和修复牙组织⑨调节菌斑pH ⑩抑制微生物

第三章口腔疾病分子生物学

（名解）

复制子（replicon）：一个单独的DNA复制单位称为复制子。

复制原点：每一个复制子都含有一个复制起点序列，又称为复制原点，也常含一个末端序列，复制的过程在此终结。

半不连续复制（semidiscontinuous replication）：DNA半保留复制时，5’→3’方向的DNA合成是连续不断的，称为引导链。而3’→5’方向的合成是不连续的，称为滞后链。其过程主要是引物酶在3’→5’链上隔段合成许多RNA作为引物，随后DNA聚合酶仍以5’→3’方向合成许多DNA片段（冈崎片段）。再由DNA多聚酶Ⅰ降解RNA引物并在片段间的空隙处合成DNA，最后由DNA连接酶将各片段连接起来构成一条完整的DNA链。

RNA多聚酶：是一种复合酶，能识别DNA上特定的序列，即RNA合成起始信号。

启动子（promoter）：DNA上的特定起始序列称启动子。

内含子（intron）：即插入序列，它是位于基因的内部，能够被转录的一段DNA。但在转录之后，与之相应的那部分转录产物在拼接中被去掉了。

外显子（exon）：就是基因中与成熟的mRNA相对应的DNA片段，它不仅包括为蛋白质编码的部分，而且包括5’和3’末端不翻译的前导序列和尾随序列。

限制性内切酶（restriction endonuclease）：是一类能识别双链DNA分子中特异核苷酸序列的DNA水解酶，可分为三类。

质粒（plasmid）：是一种细菌细胞内独立于染色体外的环状DNA，它具有自我复制能力。在细胞分裂时可伴随染色体分配至子细胞中去。

转化（transformation）：是指受体菌捕获和表达质粒载体DNA分子的生命过程。

转染（transfection）：专指受体菌捕获和表达噬菌体DNA分子的过程。

转导：利用噬菌体颗粒为媒介，将外源DNA转移至受体菌并得到表达的生命过程。

（填空）

在RNA合成时，作为模板的DNA链称有意义链，非模板链则称为反义链。

质粒由以下几部分组成：ori区、par区、多克隆区、选择因子。

核酸杂交的类型有：点杂交、Southern杂交。

用于PCR的DNA多聚酶，即Taq DNA多聚酶有如下特点：热稳定性、高特异性、适宜较长DNA片段的扩增。

DNA复制的特点：半保留复制、半不连续复制。

（大题）

【DNA结构模型】

①DNA分子是互相旋转的两条长链，为一种双螺旋形式。每一条链主干由相互排列的糖和磷酸组成，两条链的极性相反，为反向平行。

②碱基不是随机配对，A只能与T配对，C只能与G配对。

【DNA多聚酶】

有三种。其中DNA多聚酶Ⅲ是DNA合成与复制中的主要合成酶。DNA多聚酶还需在下列因素的参与下方能合成DNA：①DNA的前体材料，四种脱氧核苷酸②镁离子的存在③一小段DNA或RNA引物④一个DNA模板

【中心法则】

①物种的多样化是由DNA决定的。DNA可进行自我复制并将复制的遗传信息传递给子代，使物种维持高度稳定。

②以DNA序列为模板，“复制”多套mRNA用于蛋白质合成。

③以mRNA序列为氨基酸装配蓝图，合成特定蛋白质，通过后者展示出丰富多彩的生命。

【Ⅱ型限制性内切酶3特征】

①有特定的识别序列，通常为4-6个碱基对。

②切割点位于识别序列内的固定位置上。

③酶切后形成粘性末端或平齐末端。

【核酸分子杂交的原理】

在一定条件下（温度、pH值等）DNA双股螺旋可解开并分离。两股游离的互补核苷酸可自行配对形成双链，而形成双链的两条DNA单链来自不同的生物有机体。

【PCR的原理】

DNA的合成是以一股DNA单链为模板，在引物的存在下，DNA多聚酶沿模板以5'→3'方向延伸引物的过程。PCR是利用DNA合成的原理，合成两个与靶DNA两侧序列互补的引物，在体外进行靶DNA的重复合成。

包括三个步骤：①DNA变性②引物与靶DNA退火③引物延伸

【釉基质蛋白在釉质发育中的作用】

①启动釉质矿化②作为晶体生长的支持相③调节晶体生长

【牙本质有机物的分类】

第五章口腔骨组织生物学

（名解）

束状骨（bundle bone）：含穿通纤维的骨板称为束状骨。

（填空）

牙周膜中存在多种胶原，目前已发现Ⅰ、Ⅲ、Ⅴ、Ⅵ、Ⅶ、Ⅷ型。

牙周膜中的重要细胞成分有：成纤维细胞、未分化干细胞。

骨基质中的其他成分有：骨钙素、骨涎蛋白、骨桥蛋白、骨粘连蛋白、生长因子、骨形成蛋白。

成骨细胞分化成熟分为四个阶段：前成骨细胞、成骨细胞、骨细胞、骨衬里细胞。

组化染色成骨细胞碱性磷酸酶呈强阳性。

骨钙素是骨基质中主要的非胶原蛋白，目前认为是成骨细胞最晚表达的一个标志。

（大题）

【牙槽骨的生物特征】

①70%为矿化物质，22%为蛋白质，8%为水分。有机基质中95%为Ⅰ型胶原，另外5%由蛋白糖原和多种非胶原蛋白构成。在细胞控制下，骨的有机基质由羟基磷灰石的形式沉积。

②骨的形态分为密质骨和松质骨。

③牙槽骨是高度可塑性组织，也是全身骨骼中变化最活跃的部分，受压力侧牙槽骨骨质吸收，牵张侧牙槽骨骨质增。

【骨改建的细胞学基础】

骨组织由四种细胞构成：成骨细胞、破骨细胞、骨衬里细胞、骨细胞。成骨细胞、破骨细胞、骨衬里细胞都存在于骨的表面，而骨细胞则被包埋在钙化的骨基质中。成骨细胞、骨衬里细胞、骨细胞都来源于局部骨组织，而破骨细胞则是由造血组织中的单核细胞融合而成，随血流到达骨改建部位。

【破骨细胞的功能（3点）！！！！】

破骨细胞的主要功能是吸收骨、牙本质和钙化的软骨，是目前发现行使骨吸收功能的唯一细胞。

①破骨细胞的骨吸收过程：与骨表面附着→细胞极性化→形成封闭区→形成骨吸收陷窝→脱离骨面转移到下一个吸收表面或细胞死亡。

电镜下，破骨细胞有两个与其骨吸收功能密切相关的独特结构，即皱褶缘（ruffled border）和清晰区（clear zone）。皱褶缘邻近骨陷窝面，为胞膜高度皱褶形成的区域，突起的远端膨大、伸长。皱褶缘处的胞膜上存在特殊的结构如质子泵（proton pump），可以在此进行特殊的物质交换。皱褶缘为行使骨吸收功能的破骨细胞所特有，当破骨细胞离开骨表面，这一形态就消失。其意义在于扩大了破骨细胞与骨接触的面积，并且在该处进行物质交换。

封闭区胞膜上存在特殊的蛋白质结构，为骨基质蛋白的受体，称之为整合素（lntegrin）。

②破骨细胞对矿物质的降解：只有低pH状态可以溶解羟基磷灰石。骨陷窝的微环境在骨吸收开始时，是通过破骨细胞内的酸性分泌小泡不断与皱褶缘的胞膜融合，同时将胞内酸性物质分泌到骨陷窝内造成的。

③破骨细胞对骨基质中有机质的降解：骨基质中有机质的降解主要通过溶酶体半胱氨酸蛋白酶和金属蛋白酶（MMPs）进行。成骨细胞可以分泌MMP-1（胶原酶）降解骨表面的类骨质。

【破骨细胞的鉴定标准3点】

①细胞表面降钙素受体阳性

②抗酒石酸磷酸酶染色阳性

③可以在骨表面形成骨吸收陷窝

【成骨细胞与破骨细胞的关系3点】

①成骨细胞参与破骨细胞在骨表面附着的调节

②成骨细胞合成破骨细胞骨吸收刺激因子

③成骨细胞参与破骨细胞分化成熟的调节

【各种骨的细胞培养】

①骨髓细胞培养

②牙本质表面观察混合骨细胞培养中破骨细胞的生成及其功能

③成骨细胞的体外培养

第六章口腔细胞培养及其应用

（名解）

细胞培养：就是模拟体内的生理环境，在适当的条件下，使活体组织细胞在体外环境存活、生长增殖，并维持其结构功能。它是指从体内取出组织模仿体内生理环境，在无菌、适当温度和一定营养条件下使其生存生长并维持结构和功能的方法。

贴壁型细胞：这类细胞在培养时能贴附在支持物表面生长。

细胞“一代”：仅指从细胞接种到分离再培养时的一段时间。

指数生长期：这是细胞增殖最旺盛的阶段，细胞分裂相增多。指数生长期细胞分裂相数量可作为判定细胞生长旺盛与否的一个重要标志。

（填空）

细胞培养的体外生长环境：无污染环境、基质、气体环境和氢离子浓度、液相环境。

口腔组织特有的干细胞：牙髓干细胞、脱落乳牙牙髓干细胞、牙周膜干细胞、根尖牙乳头干细胞、唾液腺干细胞

（大题）

【组织培养细胞生命期】

①原代培养期：也称初代培养，即从体内取出组织接种到第一次传代阶段，一般持续1-4周。此期可见细胞分裂，但不旺盛。

②传代期：初代培养细胞一经传代后称作细胞系。一般情况下当传代30-50次后，细胞增殖逐渐缓慢，以致完全停止，细胞进入第三期。

③衰退期：此期细胞仍然生存，但增殖很慢或不增殖；细胞形态轮廓增强，最后衰退凋亡。

【天然培养基、合成培养基】

①天然培养基：以天然成分作为培养液。包括血清、组织提取液、水解乳白蛋白等。其优点是营养成分丰富，培养效果良好，缺点是成分复杂，来源受限。

②合成培养基：根据人和动物体内细胞所需成分模拟合成的，配方恒定的一种较理想的培养基。主要成分包括氨基酸、维生素、糖类、无机离子和一些其他辅助物质。

【组织工程的基本原理】

组织工程学的基本原理和方法是从机体获得少量的活体组织，用特殊酶或其他方法浆细胞从组织中分离出来并在体外进行培养扩增，然后将扩增的细胞与具有良好生物相容性、可降解和可吸收的生物材料按一定的比例混合，使细胞粘附在生物材料上形成细胞-材料复合物，将该复合物植入机体的组织或器官的病损部位，随着生物材料在体内逐渐被讲解和吸收，植入的细胞在体内不断增值并分泌细胞外基质，最终形成相应的组织或器官，从而达到修复创伤和重建功能的目的。

【组织工程支架材料须符合以下要求】

①具有良好的生物相容性②具有生物可降解性③具有良好的表面活性④具有多孔性

⑤具有可塑性

【组织工程学在口腔医学中的应用】

①组织工程学在颌面重建中的作用

②组织工程学在引导口腔组织再生中的作用

③组织工程化黏膜在口腔医学中的应用

④组织工程用于人造涎腺的初步研究

⑤牙组织工程

最新细胞生物学知识点总结

细胞通讯的方式 （1）细胞通过分泌化学信号进行细胞间通讯，这是多细胞生物普遍采用的通讯方式。 （2）细胞间接触依赖性的通讯，指细胞间直接接触，通过与质膜结合的信号分子影响其它细胞。 （3）动物相邻细胞间形成间隙连接以及植物细胞间通过胞间连丝使细胞间相互沟通，通过交换小分子来实现代谢耦联或电耦联。 细胞分泌化学信号可长距离或短距离发挥作用，其作用方式分为： （1）内分泌，由内分泌细胞分泌信号分子到血液中，通过血液循环运送到体内各个部位，作用于靶细胞。 （2）旁分泌，细胞通过分泌局部化学介质到细胞外液中，经过局部扩散作用于邻近靶细胞。在多细胞生物中调节发育的许多生长因子往往是通过旁分泌起作用的。此外，旁分泌方式对创伤或感染组织刺激细胞增殖以恢复功能也具有重要意义。 （3）自分泌，细胞对自身分泌的物质产生反应。自分泌信号常存在于病理条件下，如肿细胞合成并释放生长因子刺激自身，导致肿瘤细胞的持续增殖。 （4）通过化学突触传递神经信号，当神经元接受刺激后，神经信号以动作电位的形式沿轴突快速传递至神经末梢，电压门控的Ca2+通道将电信号转换为化学信号。 通过胞外信号介导的细胞通讯步骤 （1）产生信号的细胞合成并释放信号分子。 （2）运送信号分子至靶细胞。 （3）信号分子与靶细胞受体特异性结合并导致受体激活。 （4）活化受体启动胞内一种或多种信号转导途径。 （5）引发细胞功能、代谢或发育的改变。 （6）信号的解除并导致细胞反应终止。 核被膜所具有的功能

一方面，核被膜构成了核、质之间的天然选择性屏障，将细胞分成核与质两大结构与功能区域，使得DNA复制、RNA转录与加工在核内进行，而蛋白质翻译则局限在细胞质中。这样既避免了核质问彼此相互干扰，使细胞的生命活动秩序更加井然，同时还能保护核内的DNA分子免受损伤。 另一方面，核被膜调控细胞核内外的物质交换和信息交流。核被膜并不是完全封闭的，核质之间进行着频繁的物质交换与信息交流。这些物质交换与信息交流主要是通过核被膜上的核孔复合体进行的。 核被膜的结构组成及特点 （1）核被膜由内外两层平行但不连续的单位膜构成。面向核质的一层膜被称作内（层）核膜，而面向胞质的另一层膜称为外（层）核膜。两层膜厚度相同，约为7。5 nm。两层膜之间有20～40nm的透明空隙，称为核周间隙或核周池。核周间隙宽度随细胞种类不同而异，并随细胞的功能状态而改变。 （2）核被膜的内外核膜各有特点：①外核膜表面常附有核糖体颗粒，且常常与糙面内质网相连，使核周间隙与内质网腔彼此相通。从这种结构上的联系出发，外核膜可以被看作是糙面内质网的一个特化区域。②内核膜表面光滑，无核糖体颗粒附着，但紧贴其内表面有一层致密的纤维网络结构，即核纤层。内核膜上有一些特有的蛋白成分，如核纤层蛋白B受体。③双层核膜互相平行但并不连续，内、外核膜常常在某些部位相互融合形成环状开口，称为核孔，：在核孔上镶嵌着一种复杂的结构，叫做核孔复合体。核孔周围的核膜特称为孔膜区，它也有一些特有的蛋白成分。

生物信息学复习题及答案

生物信息学复习题 名词解释 1. Homology (同源):来源于共同祖先的序列相似的序列及同源序列。序列相似序列并不一定是同源序列。 （直系同源）：指由于物种形成的特殊事件来自一个共同祖先的不同物种中的同源序列，它们具有相似的功能。 （旁系（并系）同源）：指同一个物种中具有共同祖先，通过基因复制产生的一组基因，这些基因在功能上的可能发生了改变。基因复制事件是促进新基因进化的重要推动力。 (异同源)：通过横向转移，来源于共生或病毒侵染而产生的相似的序列，为异同源。 Score：The sum of the number of identical matches and conservative (high scoring) substitutions in a sequence alignment divided by the total number of aligned sequence characters. Gap总是不计入总数中。 6.点矩阵（dot matrix）：构建一个二维矩阵，其X轴是一条序列，Y轴是另一个序列，然后在2个序列相同碱基的对应位置（x，y）加点，如果两条序列完全相同则会形成一条主对角线，如果两条序列相似则会出现一条或者几条直线；如果完全没有相似性则不能连成直线。 7. E值：得分大于等于某个分值S的不同的比对的数目在随机的数据库搜索中发生的可能性。衡量序列之间相似性是否显著的期望值。E值大小说明了可以找到与查询序列（query）相匹配的随机或无关序列的概率，E值越小意味着序列的相似性偶然发生的机会越小，也即相似性越能反映真实的生物学意义，E值越接近零，越不可能找到其他匹配序列。 值：得分为所要求的分值比对或更好的比对随机发生的概率。它是将观测得到的比对得分S，与同样长度和组成的随机序列作为查询序列进行数据库搜索进行比较得到的HSP（高分片段对）得分的期望分布联系起来计算的。通常使用低于来定义统计的显著性。P=1-e-E 9.打分矩阵（scoring matrix）：在相似性检索中对序列两两比对的质量评估方法。包括基于理论（如考虑核酸和氨基酸之间的类似性）和实际进化距离（如PAM）两类方法,是序列相似性分析的基础，其不同的选择将会出现不同的分析结果。 10．空位（gap）：在序列比对时，由于序列长度不同，需要插入一个或几个位点以取得最佳比对结果，这样在其中一序列上产生中断现象，这些中断的位点称为空位。 ：美国国家生物技术信息学中心，属于美国国立医学图书馆的一部分，具有BLAST, Entrez ,GenBank等工具，还具有PubMed文献数据库。另外还具有Genome, dbEST, dbGSS , dbSTS, MMDB, OMIM, UniGene, Taxonomy, RefSeq, etc. 序列格式：是将DNA或者蛋白质序列表示为一个带有大于号（>）开始的核苷酸或者氨基酸序列的新文件，其中大于号后可以跟上序列的相关信息，其他无特殊要求。 13genbank序列格式：是GenBank 数据库的基本信息单位，是最为广泛的生物信息学序列格式之一。该文件格式按域划分为4个部分：第一部分包含整个记录的信息（描述符）；第二部分包含注释，主要包含生物功能或数据库信息；第三部分是feature，对序列的注释；第四部分是序列本身，以“统发生树（Phylogenetic tree ）是研究生物进化和系统发育过程中的一种用树状分支图来概括各种生物之间亲缘关系，是一种亲缘分支分类方法。在树中，每个节点代表其各分支的最近共同祖先，而节点间的线段长度对应演化距离（如估计的演化时间）。是用来研究物种进化与多样性的基础，是相近物种相关生物学数据的来源。17.基因树与物种树：物种树反映一组物种进化历程的系统树，其中每一个内部节点就代表一个物种形成的过程，而基因树则是代表来源于不同物种的单个同源基因的差异构建的系统树，而其内部的一个节点则代表一个祖先基因分化为两个新的独特的基因序列的事件。基因

口腔生物学重点

口腔生物学重点文件排版存档编号：[UYTR-OUPT28-KBNTL98-UYNN208]

第一章口腔微生物学（4T） 1.生态系及其建立的中心原则。（p1） 生态系定义：生物之间、生物与其环境之间的相互关系称为生态系（ ecosystem ） 生态系建立的中心原则——是生物体对其赖以生存环境有影响， 例如：最先定植的菌种为先锋菌，先锋菌定植后改变了环境，给后继定制的细菌创造了定植的条件，，是只能存活于新的环境中。（先锋菌~定植~环境改变~12h后二次细菌定植~达到动态平衡形成新的生态系）（环境变化—物种影响—适者生存—环境变化） 不适者淘汰 2.正常菌丛对机体的双重作用。（p2） （有益）在一定环境中，当机体与正常菌丛之间保持着相互平衡的状态时，正常菌丛显示对宿主起着有益的作用； （有害）但当环境中的某些因素干扰了这个平衡状态时，如放射线照射，过量激素的应用，抗生素的长期使用等而导致菌群失调，这就为正常菌群提供了显示其有害作用的机会，这些原来无致病性的或毒力很弱的细菌，遂成为机会致病菌而引起内源性感染疾病，如：长期服用抗生素所致的葡萄球菌假膜肠炎，口腔中的念珠菌病。 3.口腔生态系的决定因素。（p2） 口腔生态系决定因素定义：决定不同微生物能在不同口腔生态系中生存的因素称为（一）物理化学因素 a．温度

一般细菌可在-5℃ ~55℃环境中生存 口腔食品温度变化幅度± 60o 嗜冷菌 < 25 ℃嗜热菌 > 45 ℃嗜温菌 25 ~ 37 ℃ b．氧张力 绝对需氧菌Obligate aerobes 兼性厌氧菌facultative anaerobes 绝对厌氧菌Obligate anaerobes 耐氧厌氧菌aerotolerant anaerobes 微嗜氧菌microaerophiles d．pH：氢离子浓度反映为pH值 口腔pH以唾液为代表~ e．营养物质的利用 唾液龈沟液血素(hemin) 牙龈卟啉菌生长 酶类透明质酸酶，蛋白酶等 （二）宿主因素（唾液和龈沟液） a．抗体唾液中主要为sIgA 龈沟液中主要为IgG b．蛋白质糖蛋白粘蛋白富脯蛋白富酪蛋白过氧化物酶乳铁蛋白 溶菌酶 （唾液功能：润滑维持口腔粘膜完整性软组织修复维持生态平衡凝集作用抗菌作用） （三）细菌因素 a．细菌附着（钙桥学说，识别系统学说）

口腔生物学第二章练习题汇编

选择题 1．唾液中有一些对细菌有抑制作用的酶，其中一种是：（C） A．果糖基转移酶 B．葡糖基转移酶 C．乳过氧化物酶 D．蔗糖酶 2. 牙齿硬度由硬到软的顺序是（A） A．老年恒牙>年轻恒牙>成熟乳牙>不成熟乳牙 B年轻恒牙>老年恒牙>成熟乳牙>不成熟乳牙C. 老年恒牙>成熟乳牙>不成熟乳牙>年轻恒牙 D 年轻恒牙>成熟乳牙>老年恒牙>不成熟乳牙 以下哪项不是生物矿化的过程 A.成核 B.晶核成长 C.集聚 D.固相转换 E. 修复 答案：E 以下哪个不是口腔中糖转变为丙酮酸的过程 A. EMP B. HMP C. PTS D. PK E. ED 答案：C 1.葡萄糖转变为丙酮酸的EMP途径的关建酶是（A） A.磷酸果糖激酶 B.2-酮-3-脱氧-6-磷酸葡萄糖醛缩酶 C.磷酸乙酮醇酶 D.6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶 2.下面有关水溶性葡聚糖的说法正确的是（C） A.又称变聚糖 B.主要糖苷为α- 1, 3 C.分子分支程度低 D.分子结构为交链 E.人体中最坚硬的组织是c A骨骼B牙本质C釉质D牙骨质 F.牙菌斑内的矿物质转换主要是菌斑与( c )之间的矿物质转换 A牙本质B牙骨质C釉质D唾液 1. 正常的牙龈结缔组织中，主要的胶原类型是：（A） A.Ⅰ和Ⅲ型为主，少量Ⅳ和Ⅴ型 B.Ⅰ和Ⅲ型为主，少量Ⅴ型 C.Ⅰ型 D. Ⅰ型为主，少量Ⅳ和Ⅴ型 E.Ⅰ型为主，少量Ⅲ型 2. 龈沟液的抗菌防御作用是：（E） A.缓冲作用将细菌及其代谢产物带出龈沟 B.灭杀细菌 C.调理趋化吞噬细胞 D.激活补体系统发挥抗菌作用. E.以上全是 生物矿化的有机基质作用为E A控制矿物形核B控制空间组织C修饰机械性能D 辅助矿物稳定E以上都是 牙菌斑内的糖代谢各途径的关键酶，不包括A A葡萄糖激酶B磷酸果糖激酶C6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶D2-酮-3-脱氧-6-磷酸葡萄糖醛缩酶E磷酸乙酮醇酶 1、哪种无机物在釉质中从表面到内层浓度逐渐降低（A） A F B H2O C Na D Mg 2、主要由腮腺分泌的人类唾液中最大的一族蛋白是（C） A 富组蛋白 B 富酪蛋白 C富脯蛋白 D富半胱蛋白 1、唾液中钙以的存在方式不包括：（A） A、钙离子 B、无机复合物

细胞生物学知识点总结

细胞生物学知识点总结 导读：细胞生物学知识点总结 细胞通讯的方式 （1）细胞通过分泌化学信号进行细胞间通讯，这是多细胞生物 普遍采用的通讯方式。 （2）细胞间接触依赖性的通讯，指细胞间直接接触，通过与质 膜结合的信号分子影响其它细胞。 （3）动物相邻细胞间形成间隙连接以及植物细胞间通过胞间连 丝使细胞间相互沟通，通过交换小分子来实现代谢耦联或电耦联。 细胞分泌化学信号可长距离或短距离发挥作用，其作用方式分为：（1）内分泌，由内分泌细胞分泌信号分子到血液中，通过血液 循环运送到体内各个部位，作用于靶细胞。 （2）旁分泌，细胞通过分泌局部化学介质到细胞外液中，经过 局部扩散作用于邻近靶细胞。在多细胞生物中调节发育的许多生长因子往往是通过旁分泌起作用的。此外，旁分泌方式对创伤或感染组织刺激细胞增殖以恢复功能也具有重要意义。 （3）自分泌，细胞对自身分泌的物质产生反应。自分泌信号常 存在于病理条件下，如肿细胞合成并释放生长因子刺激自身，导致肿瘤细胞的'持续增殖。 （4）通过化学突触传递神经信号，当神经元接受刺激后，神经 信号以动作电位的形式沿轴突快速传递至神经末梢，电压门控的Ca2+

通道将电信号转换为化学信号。 通过胞外信号介导的细胞通讯步骤 （1）产生信号的细胞合成并释放信号分子。 （2）运送信号分子至靶细胞。 （3）信号分子与靶细胞受体特异性结合并导致受体激活。 （4）活化受体启动胞内一种或多种信号转导途径。 （5）引发细胞功能、代谢或发育的改变。 （6）信号的解除并导致细胞反应终止。 核被膜所具有的功能 一方面，核被膜构成了核、质之间的天然选择性屏障，将细胞分成核与质两大结构与功能区域，使得DNA复制、RNA转录与加工在核内进行，而蛋白质翻译则局限在细胞质中。这样既避免了核质问彼此相互干扰，使细胞的生命活动秩序更加井然，同时还能保护核内的DNA分子免受损伤。 另一方面，核被膜调控细胞核内外的物质交换和信息交流。核被膜并不是完全封闭的，核质之间进行着频繁的物质交换与信息交流。这些物质交换与信息交流主要是通过核被膜上的核孔复合体进行的。 核被膜的结构组成及特点 （1）核被膜由内外两层平行但不连续的单位膜构成。面向核质的一层膜被称作内（层）核膜，而面向胞质的另一层膜称为外（层）核膜。两层膜厚度相同，约为7。5 nm。两层膜之间有20～40nm的

生物信息学题库

■一、选择题: 1.以下哪一个是mRNA条目序列号： A. J01536■. NM_15392 C. NP_52280 D. AAB134506 2.确定某个基因在哪些组织中表达的最直接获取相关信息方式是：■. Unigene B. Entrez C. LocusLink D. PCR 3.一个基因可能对应两个Unigene簇吗？■可能 B. 不可能 4.下面哪种数据库源于mRNA信息：■dbEST B. PDB C. OMIM D. HTGS 5.下面哪个数据库面向人类疾病构建： A. EST B. PDB ■. OMIM D. HTGS 6.Refseq和GenBank有什么区别： A. Refseq包括了全世界各个实验室和测序项目提交的DNA序列B. GenBank提供的是非冗余序列 ■. Refseq源于GenBank，提供非冗余序列信息D. GenBank源于Refseq 7.如果你需要查询文献信息，下列哪个数据库是你最佳选择： A. OMIM B. Entrez ■PubMed D. PROSITE 8.比较从Entrez和ExPASy中提取有关蛋白质序列信息的方法，下列哪种说法正确：A. 因为GenBank的数据比EMBL更多，Entrez给出的搜索结果将更多B. 搜索结果很可能 一样，因为GenBank和EMBL的序列数据实际一样■搜索结果应该相当，但是ExPASy中的SwissProt记录的输出格式不同 9.天冬酰胺、色氨酸和酪氨酸的单字母代码分别对应于：■N/W/Y B. Q/W/Y C. F/W/Y D. Q/N/W 10.直系同源定义为：■不同物种中具有共同祖先的同源序列B. 具有较小的氨基酸一致性但是有较大的结构相似性的同源序列 C. 同一物种中由基因复制产生的同源序列 D. 同一物种中具有相似的并且通常是冗余的功能的同源序列 11.下列那个氨基酸最不容易突变： A. 丙氨酸B. 谷氨酰胺 C. 甲硫氨酸■半胱氨酸 12.PAM250矩阵定义的进化距离为两同源序列在给定的时间有多少百分比的氨基酸发生改变： A. 1% B. 20%■. 80% D. 250% 13.下列哪个句子最好的描述了两个序列全局比对和局部比对的不同：A. 全局比对通常用于比对DNA序列，而局部比对通常用于比对蛋白质序列B. 全局比对允许间隙，而局 部比对不允许C. 全局比对寻找全局最大化，而局部比对寻找局部最大化■全局比对比对整体序列，而局部比对寻找最佳匹配子序列 14.假设你有两条远源相关蛋白质序列。为了比较它们，最好使用下列哪个BLOSUM和PAM矩阵：■BLOSUM45和PAM250 B. BLOSUM45和PAM 1 C. BLOSUM80和PAM250 D. BLOSUM10和PAM1 15.与PAM打分矩阵比较，BLOSUM打分矩阵的最大区别是：A. 最好用于比对相关性高的蛋白B. 它是基于近相关蛋白的全局多序列比对 ■它是基于远相关蛋白的局部多序列比对D. 它结合了全局比对和局部比对 16.如果有一段DNA序列，它可能编码多少种蛋白质序列： A. 1 B. 2 C. 3 ■. 6 17.要在数据库查询一段与某DNA序列编码蛋白质最相似的序列，应选择： A. blastn B. blastp C. tblastn D. tblastp■blastx 18.为什么ClustalW（一个采用了Feng-Doolittle渐进比对算法的程序）不报告E值：A. ClustalW报告E值■使用了全局比对 C. 使用了局部比对 D. 因为是多序列比对 19.Feng-Doolittle方法提出“一旦是空隙，永远是空隙”规则的依据是：A. 保证空隙不会引物序列加入而填充B. 假定进化早期分歧的序列有较高优先级别■假定最近序列空隙应 该保留 D. 假定最远序列空隙应该保留 20.根据分子钟假说：A. 所有蛋白质都保持一个相同的恒定进化速率 B. 所有蛋白质的进化速率都与化石记录相符合C. 对于每一个给定的蛋白质，分子进化的速率是逐 渐减慢的，就如同不准时的钟■对于每一个给定的蛋白质，其分子进化的速率在所有的进化分支上大致是恒定 21.系统发生树的两个特征是： A. 进化分支和进化节点■树的拓扑结构和分支长度C. 进化分支和树根D. 序列比对和引导检测方法 22.下列哪一个是基于字母特征的系统发生分析的算法：A. 邻位连接法（NJ法）B. Kimura算法■最大似然法（ML）D. 非加权平均法（UPGMA） 23.基于字母特征和基于距离的系统发生分析的算法的基本差异是：■基于字母特征的算法没有定义分支序列的中间数据矩阵 B. 基于字母特征的算法可应用于DNA或者蛋白质序列，而基于距离仅能用于DNA C. 基于字母特征的算法无法运用简约算法 D. 基于字母特征的算法的进化分支与进化时间无关 24.一个操作分类单元（OTU）可指：A. 多序列比对■蛋白质序列C. 进化分支D. 进化节点 25.构建进化树最直接的错误来源是：■多序列比对错误B. 采样的算法差异C. 假设进化分支是单一起源D. 尝试推测基因的进化关系 26.第一个被完整测定的基因组序列是：A. 啤酒酵母的3号染色体B. 流感病毒■ФX174 D. 人类基因组 27.普通的真核生物线粒体基因组编码大约多少个蛋白质：■10 B. 100 C. 1000 D. 10000 28.根据基因组序列预测蛋白质编码基因的算法的最大问题是：A. 软件太难使用■. 假阳性率太高，许多不是外显子的序列部分被错误指定C. 假阳性率太高，许 多不是外显子功能未知 D. 假阴性率太高，丢失太多外显子位点 29.HIV病毒亚型的系统演化研究可以：A. 证实HIV病毒是由牛病毒演化而来■. 用于指导开发针对保守蛋白的疫苗C. 证实哪些人类组织最容易遭受病毒侵染 30.一个典型的细菌基因组大小约为多少bp：A. 20000■. 200000 C. 2000000 D. 20000000

口腔生物学第六章练习题(推荐文档)

选择题 1.关于细胞培养技术叙述错误的是（B） A可用来研究细胞生理和细胞各种功能 B首先用胰蛋白酶将动物或植物组织进行酶解，游离出单细胞后再进行培养 C用小牛血清配制的培养基进行动物细胞培养 D培养过程可用倒置显微镜进行观察 2.贴壁细胞的分裂方式属于 ( B ) A.无丝分裂 B.有丝分裂 C.减数分裂 D.增殖 调节唾液腺细胞增殖、分化和功能的因素，没有以下哪一个：D A.细胞因子 B. 激素 C. 细胞外基质 D. 白介素-8 E. 钙离子 以下哪句话是错误的：B A.牙周膜是致密的结缔组织构成 B.颌面部软骨细胞培养多见于上颌骨髁突软骨培养 C.鳞状细胞癌是口腔最常见的恶性肿瘤 D.成釉细胞是一种常见的良性上皮源性肿瘤，因其易复发、可能恶变等特性，而受到研究 者的广泛关注 E.体外培养的腺泡上皮细胞多成多角形，铺路石样排列 1.牙周膜不具有以下哪种功能：（D） A.分泌功能 B.矿化功能 C.收缩功能 D.防御功能 2.唾液腺细胞不包括以下哪种：（C） A.导管上皮细胞 B.,腺泡上皮细胞 C.唾液腺肿瘤细胞 D.肌上皮细胞 1.从体内去除组织接种培养到第一次传代的阶段称为（A） A.初代培养 B.传代期 C.衰退期 D.以上均不对 2.在特定的时间和特定的空间研究一个完整生物体所表达的全体蛋白质特征称为（A） A蛋白质组学 B蛋白质鉴定 C模式生物学 D生物信息学 1. 按照培养细胞的主要形态，可包括哪些类型:(E) A.上皮型细胞 B.成纤维型细胞 C.游走型细胞 D.多形型细胞. E.以上全是 2复苏是以一定的复温速率将冻存的培养物恢复到常温的过程。在冷冻复苏中应遵循什么原则：（C） A.速冻速溶 B.慢冻慢溶 C.慢冻速溶 D.速冻慢溶. E.以上都不是 组织工程三要素E： A.种子细胞 B.生物支架材料 C.细胞活性因子 D.A和B E.A、B和C 细胞培养一代中，进行各项试验最好的阶段是D A.游离期 B.贴壁期 C.潜伏期 D.指数生长期 E.停滞期 1、有关上皮型细胞说法错误的是（A） A 一定来源于外胚层 B 形态类似体内的上皮细胞 C 生长易相连成片 D 铺路石状 2、那种细胞是悬浮型细胞（D） A 心肌细胞 B 平滑肌细胞 C 成骨细胞 D 白细胞 1、以下哪项不是培养细胞的生长过程：（A） A、分裂期 B、原代培养期 C、传代期 D、衰退期 2、培养细胞的生存环境与条件不包括：（A） A、竞争菌群 B、细胞的营养需要 C、温度条件 D、液相环境 下列哪项不是正常细胞体外培养调解下生存过程的阶段D

医用细胞生物学知识点

医用细胞生物学知识点 细胞生物学 (cell biology )：细胞生物学是以细胞为研究对象，经历了从显微水平到亚显微和分子水平 的发展过程，成为今天在分子层次上研究细胞精细结构和生命活动规律的学科。 医学细胞生物学 (medical cell biology)：医学细胞生物学以揭示人体各种细胞在生理和病理过程中 的生 命活动规律为目的，期望能对人体各种疾病的发病机制予以深入阐明，为疾病的诊断、治疗和预防提 供理论依据和策略。 对细胞概念理解的五个角度： ①细胞是构成有机体的基本单位； ②细胞是代谢与功能的基本单位； ③ 细胞是有机体生长与发育的基础； ④细胞是遗传的基本单位； ⑤没有细胞就没有完整的生命。 生物界划分的三个类型：原核细胞、古核细胞和真核细胞。 原核细胞与真核细胞的比较： p13 表 2-1 生物大分子：是由有机小分子构成的，大约有 3000种，分子量从 10000到 1000000。 核酸 (nucleic acid ) 的基本单位 :核苷酸。 核苷酸：核苷的戊糖羟基与磷酸形成酯键，即成为核苷酸。 DNA 分子的双螺旋结构模型( p18图 2-8)：DNA 分子由两条相互平行而方向相反的多核苷酸链组成， 即一条链中磷酸二酯键连接的核苷酸方向是 5'→3'，另一条是 3'→ 5'，两条链围绕着同一个中心轴 以右手方向盘绕成双螺旋结构。 基因组：细胞或生物体的一套完整的单倍体遗传物质称为基因组。 动物细胞内含有的主要 RNA 种类及功能： p20 表 2-3 核酶 (ribozyme ) :核酶是具有酶活性的 RNA 分子。 蛋白质 ( protein )的基本单 位：氨基酸。 肽键：肽键是一个氨基酸分子上的 羧基 与另一个氨基酸分子上的 氨基经脱水缩合 而成的化学键。 肽 (peptide) ：氨基通过肽键而连接成的化合物称为肽。 蛋白质分子的二级结构： α -螺旋， β-片层。 酶 (enzyme)：酶是由生物体细胞产生的具有催化剂作用的蛋白质。 酶的特性：高催化效率，高度专一性，高度不稳定性。 光学显微镜的种类：普通光学显微镜，荧光显微镜，相差显微镜，暗视野显微镜，共聚焦激光扫描显 微镜。 细胞培养：细胞培养是指细胞在体外的培养技术，即无菌条件下，从机体中取出组织或细胞，模拟机 体内正常生理状态下生存的基本条件，让它在培养器皿中继续生存、生长和繁殖的方法。 细胞膜 (cell membrane ):细胞膜是包围在细胞质表面的一层薄膜，又称质膜 ( plasma membrane ) 生物膜 ( biomembrane ):目前把 质膜 和细胞内膜系统 总称为生物膜。 细胞膜的组成：主要由脂类、蛋白质和糖类组成 磷脂 (phospholipid)可分为两类：甘油磷脂 由于磷脂分子具有亲水头和疏水 尾，故称为 膜蛋白可分为三种基本类型：膜内在蛋白 蛋白 (lipid anchored protein) 。 细胞外被 ( cell coat )：在大多数真核细胞表面有富含糖类的周缘区，称为细胞外被或糖萼。 细胞外被的基本功能： 保护细胞抵御各种物理、化学性损伤 ，如消化道、呼吸道等上皮细胞的细胞外 被有助于润滑、防止机械损伤，保护黏膜上皮不受消化酶的作用。 1． 2． 3． 4． 5． 6． 7． 8． 9． 10． 11 ． 12 ． 13 ． 14 ． 15 ． 16 ． 17 ． 18 ． 19． 20． 21 ． 22 ． 23 ． 24 ． 25 ． 26． 27． 28． (phosphoglycerides )和鞘磷脂 (sphingomyelin,SM) 。 两亲性分子 或兼性分子 。 intrinsic protein )、膜外在蛋白 (extrinsic

生物信息学课后题及答案-推荐下载

生物信息学课后习题及答案 （由10级生技一、二班课代表整理） 一、绪论 1.你认为，什么是生物信息学？ 采用信息科学技术，借助数学、生物学的理论、方法，对各种生物信息（包括核酸、蛋 白质等）的收集、加工、储存、分析、解释的一门学科。2.你认为生物信息学有什么用？对你的生活、研究有影响吗？（1）主要用于： 在基因组分析方面：生物序列相似性比较及其数据库搜索、基因预测、基因组进化和分 子进化、蛋白质结构预测等 在医药方面：新药物设计、基因芯片疾病快速诊断、流行病学研究：SARS 、人类基因组计划、基因组计划：基因芯片。 （2）指导研究和实验方案，减少操作性实验的量；验证实验结果；为实验结果提供更多的支持数据等材料。 3.人类基因组计划与生物信息学有什么关系？ 人类基因组计划的实施，促进了测序技术的迅猛发展，从而使实验数据和可利用信息急剧增加，信息的管理和分析成为基因组计划的一项重要的工作 。而这些数据信息的管理、分析、解释和使用促使了生物信息学的产生和迅速发展。 4简述人类基因组研究计划的历程。 通过国际合作，用15年时间（1990-2005）至少投入30亿美元，构建详细的人类基因组遗传图和物理图，确定人类DNA 的全部核苷酸序列，定位约10万基因，并对其他生物进行类似研究。 1990，人类基因组计划正式启动。 1996，完成人类基因组计划的遗传作图，启动模式生物基因组计划。 1998完成人类基因组计划的物理作图，开始人类基因组的大规模测序。Celera 公司加入，与公共领域竞争启动水稻基因组计划。 1999，第五届国际公共领域人类基因组测序会议，加快测序速度。 2000，Celera 公司宣布完成果蝇基因组测序，国际公共领域宣布完成第一个植物基因组——拟南芥全基因组的测序工作。 2001，人类基因组“中国卷”的绘制工作宣告完成。 2003，中、美、日、德、法、英等6国科学家宣布人类基因组序列图绘制成功，人类基因组计划的.目标全部实现。2004，人类基因组完成图公布。 2.我国自主知识产权的主要基因组测序计划有哪些？水稻（2002），家鸡（2004），家蚕（2007），家猪（2012），大熊猫（2010） 2．第一章 、管路敷设技术通过管线不仅可以解决吊顶层配置不规范高中资料试卷问题，而且可保障各类管路习题到位。在管路敷设过程中，要加强看护关于管路高中资料试卷连接管口处理高中资料试卷弯扁度固定盒位置保护层防腐跨接地线弯曲半径标高等，要求技术交底。管线敷设技术包含线槽、管架等多项方式，为解决高中语文电气课件中管壁薄、接口不严等问题，合理利用管线敷设技术。线缆敷设原则：在分线盒处，当不同电压回路交叉时，应采用金属隔板进行隔开处理；同一线槽内，强电回路须同时切断习题电源，线缆敷设完毕，要进行检查和检测处理。、电气课件中调试对全部高中资料试卷电气设备，在安装过程中以及安装结束后进行 高中资料试卷调整试验；通电检查所有设备高中资料试卷相互作用与相互关系，根据生产工艺高中资料试卷要求，对电气设备进行空载与带负荷下高中资料试卷调控试验；对设备进行调整使其在正常工况下与过度工作下都可以正常工作；对于继电保护进行整核对定值，审核与校对图纸，编写复杂设备与装置高中资料试卷调试方案，编写重要设备高中资料试卷试验方案以及系统启动方案；对整套启动过程中高中资料试卷电气设备进行调试工作并且进行过关运行高中资料试卷技术指导。对于调试过程中高中资料试卷技术问题，作为调试人员，需要在事前掌握图纸资料、设备制造厂家出具高中资料试卷试验报告与相关技术资料，并且了解现场设备高中资料试卷布置情况与有关高中资料试卷电气系统接线等情况，然后根据规范与规程规定，制定设备调试高中资料试卷方案。 、电气设备调试高中资料试卷技术电力保护装置调试技术，电力保护高中资料试卷配置技术是指机组在进行继电保护高中资料试卷总体配置时，需要在最大限度内来确保机组高中资料试卷安全，并且尽可能地缩小故障高中资料试卷破坏范围，或者对某些异常高中资料试卷工况进行自动处理，尤其要避免错误高中资料试卷保护装置动作，并且拒绝动作，来避免不必要高中资料试卷突然停机。因此，电力高中资料试卷保护装置调试技术，要求电力保护装置做到准确灵活。对于差动保护装置高中资料试卷调试技术是指发电机一变压器组在发生内部故障时，需要进行外部电源高中资料试卷切除从而采用高中资料试卷主要保护装置。

口腔生物学课程教学大纲

口腔生物学课程教学大纲 课程简介 一、课程简介 口腔生物学为2001年始新开设的一门口腔基础学科，它是衔接前期医学基础课(生理、生化、微生物、免疫、分子生物学等)与口腔临床学科(口内、口外、口修和正畸等)的一门重要的桥梁学科，包括“口腔微生物”、“口腔免疫学”、“口腔生物化学”、“口腔疾病分子生物学”、“牙周骨组织生物学”和“口腔细胞培养及其应用”六大部分内容，从不同角度阐明口腔疾病的发生、进展和预防。理论大课28学时，考试2学时，要求学生把握口腔生物学的差不多理论、差不多知识和差不多技术，为今后从事口腔医疗、教学和科研打下扎实的基础。 二、总体要求 通过本学科学习，要求学生： 1.把握口腔生态系的阻碍因素，牙菌斑的形成、分类及要紧物质代谢、矿物质转换。 2.把握要紧致龋菌、牙周致病菌的生物学特性、致病机制以及宿主免疫反应在牙周炎发病中的重要作用。 3.把握釉质、牙本质、牙骨质的化学组成。 4.氟在生物矿化中的作用。 5.把握分子生物学研究的要紧方法及在口腔致病菌研究中的应用。 6.把握骨改建的生物学基础 7.把握细胞培养的差不多原理与技术。 8.把握细菌培养、细菌鉴定、毒力检测方法 三、学时分配 四、考核要求 按照把握、熟悉、了解三个层次进行考核。理论考核题型为：名词讲明、填空题、选择题和咨询答题。

学习目的要求 一、把握口腔生态系定义及阻碍因素、牙菌斑的形成及分类、口腔正常菌丛的概念及其成员。 二、熟悉细菌粘附的学讲、正常菌丛的双重作用。 三、了解口腔生物学的内容及意义。 课程内容 一、口腔生物学简介 1.口腔生物学的定义 2.口腔生物学的进展 3.口腔生物学的六个组成部分 二、口腔微生物学概论 1.口腔生态系及其阻碍因素：生态系、生态学、口腔生态系的概念，口腔生态系的阻碍因素 2.口腔正常菌丛：来源和类型 3.牙菌斑：形成、分类、成份 考核知识点 一、口腔生物学的定义、进展 二、口腔生态系的概念及其阻碍因素 三、口腔正常菌丛的概念及来源 四、牙菌斑的形成和分类 考核要求 一、把握口腔生态系定义及阻碍因素、牙菌斑的形成及分类、口腔正常菌丛的概念及其成员。 二、熟悉细菌粘附的学讲、正常菌丛的双重作用。 三、了解口腔生物学的内容及意义。 复习摸索题 一、口腔生态系及其阻碍因素。 二、何谓牙菌斑？ 三、口腔正常菌丛的概念及其双重作用。 第二章牙体微生物及其免疫 学习目的要求 一、把握要紧致龋菌的生物学特性和致病机制 二、熟悉免疫防龋的概念 三、了解防龋疫苗的研究、根尖周病的发病机制 课程内容 一、正常口腔菌丛成员 1.链球菌属 变形链球菌群

医学细胞生物学知识点归纳

线粒体： 1.呼吸链（电子传递链）Respiratory chain一系列能够可逆地接受和释放H+和e-的化学物质所组成的酶体系在线粒体内膜上有序地排列成互相关联的链状。 2.化学渗透假说（氧化磷酸化偶联机制）：线粒体内膜上的呼吸链起质子泵的作用，利用高能电子传递过程中释放的能量将H+泵出内膜外，造成内膜内外的一个H+梯度（严格地讲是离子的电化学梯度），A TP合酶再利用这个电化学梯度来合成A TP。 3.电子载体:在电子传递过程中与释放的电子结合并将电子传递下去的物质称为电子载体。参与传递的电子载体有四种∶黄素蛋白、细胞色素、铁硫蛋白和辅酶Q，在这四类电子载体中，除了辅酶Q以外，接受和提供电子的氧化还原中心都是与蛋白相连的辅基。 4.阈值效应：突变所产生的效应取决于该细胞中野生型和突变型线粒体DNA的比例，只有突变型DNA达到一定数量（阈值）才足以引起细胞的功能障碍，这种现象称为阈值效应。 5.导向序列：将游离核糖体上合成的蛋白质的N-端信号称为导向信号，或导向序列，由于这一段序列是氨基酸组成的肽，所以又称为转运肽。 6.信号序列：将膜结合核糖体上合成的蛋白质的N-端的序列称为信号序列，将组成该序列的肽称为信号肽。 7.共翻译转运：膜结合核糖体上合成的蛋白质通过定位信号，一边翻译，一边进入内质网，由于这种转运定位是在蛋白质翻译的同时进行的，故称为共翻译转运。 8.蛋白质分选：在膜结合核糖体上合成的蛋白质通过信号肽，经过连续的膜系统转运分选才能到达最终的目的地，这一过程又称为蛋白质分选。 核糖体： 1.原核生物mRNA中与核糖体16S rRNA结合的序列称为SD序列(SD sequence) 。 2.核酶：将具有酶功能的RNA称为核酶。 3.N-端规则(N-end rule): 每一种蛋白质都有寿命特征，称为半衰期(half-life)。研究发现多肽链N-端特异的氨基酸与半衰期相关，称为N-端规则。 4.泛素介导途径：蛋白酶体对蛋白质的降解通过泛素(ubiquitin)介导,故称为泛素降解途径。蛋白酶体对蛋白质的降解作用分为两个过程:一是对被降解的蛋白质进行标记,由泛素完成;二是蛋白酶解作用,由蛋白酶体催化。 细胞核： 1.核内膜：有特有的蛋白成份（如核纤层蛋白B受体），膜的内表面有一层网络状纤维蛋白质，即核纤层（nuclear lamina），可支持核膜。 核外膜：靠向细胞质的一层，是内质网的一部分，胞质面附有核糖体 核周隙：内、外膜之间有宽20~40nm的腔隙，与粗面内质网腔相通 核孔复合体：内、外膜融合处，物质运输的通道 核纤层：内核膜内表面的纤维网络，支持核膜，并与染色质、核骨架相连。 2.核孔复合体：是细胞核内外膜融合形成的小孔，直径约为70 nm，是细胞核与细胞质间物质交换的通道。 3.核孔蛋白：参与构成核孔的蛋白质，可能在经核孔的主动运输中发挥作用。 核运输受体：参与物质通过核孔的主动运输。 核周蛋白: 是一类与核孔选择性运输有关的蛋白家族，相当于受体蛋白。 5.输入蛋白：核定位信号的受体蛋白, 存在于胞质溶胶中, 可与核定位信号结合, 帮助核蛋白进入细胞核。 输出蛋白：存在于细胞核中识别并与输出信号结合的蛋白质, 帮助核内物质通过核孔复合

生物信息学试题整理

UTR的含义是（B ） A.编码区 B. 非编码区 C. motif的含义是（D ）。 A.基序 B. 跨叠克隆群 C. algorithm 的含义是（B ）。 A.登录号 B. 算法 C. RGR^ （D ）。 A.在线人类孟德尔遗传数据 D.水稻基因组计划 下列Fasta格式正确的是（B） 低复杂度区域 D. 幵放阅读框 碱基对 D. 结构域 比对 D. 类推 B. 国家核酸数据库 C. 人类基因组计划 A. seql: agcggatccagacgctgcgtttgctggctttgatgaaaactctaactaaacactccctta B. >seq1 agcggatccagacgctgcgtttgctggctttgatgaaaactctaactaaacactccctta C. seq1:agcggatccagacgctgcgtttgctggctttgatgaaaactctaactaaacactccctta D. >seq1agcggatccagacgctgcgtttgctggctttgatgaaaactctaactaaacactccctta 如果我们试图做蛋白质亚细胞定位分析，应使用（D） A. NDB 数据库 B. PDB 数据库 C. GenBank 数据库 D. SWISS-PROT 数

据库 Bioinformatics 的含义是（A ）。 A. 生物信息学 B. 基因组学 C. 蛋白质组学 D. 表观遗传学 Gen Bank中分类码PLN表示是（D ）。 A.哺乳类序列 B. 细菌序列 C.噬菌体序列 D. 植物、真菌和藻类序列 ortholog 的含义是（A）0 A.直系同源 B.旁系同源 C.直接进化 D.间接进化 从cDNA文库中获得的短序列是（D ）o A. STS B. UTR C. CDS D. EST con tig的含义是（B ）o A.基序 B. 跨叠克隆群 C. 碱基对 D. 结构域 TAIR （AtDB）数据库是（C）o A.线虫基因组 B. 果蝇基因组 C. 拟南芥数据库 D. 大肠杆菌基因组ORF的含义是（D ）o A.调控区 B. 非编码区 C.低复杂度区域 D. 幵放阅读框

完整2014口腔生物学复习提纲

1.生态系是什么？建立的中心原则p1 生物之间、生物与环境之间的相互关系称为生态系（ecosystem）。生态系建立的中心原则是生物体对其赖以生存的环境的适应与改建，例如最先定植的菌种为先锋菌，先锋菌定植后改变了环境，为后继定植的细菌创造了定植条件，使之能存活于新环境中。 2.口腔链球菌属有哪些。P16-19 变异链球菌群、唾液链球菌群、咽峡菌组群、轻链球菌群（血链球菌、轻链球菌） 3.Ecosystem 4.临界pH： (来源网上，待商榷) 某种特定的矿物质，如牙釉质，溶于某种溶液刚好达到饱和时的pH值。 5.非附着性菌斑p11 为不附着于牙面或牙根面，却与结合上皮和龈沟上皮直接接触的菌斑，其中主要细菌为G-厌氧菌和螺旋体、新月形单胞菌、二氧化碳噬纤维菌等能动菌属，它们浮游地生活于附着性菌斑外表面和龈沟上皮之间，细菌本身及其代谢产物可直接损伤上皮下结缔组织，引发牙周组织炎症。 6.唾液的主要功能有哪些。P56-57 消化及营养功能（协助咀嚼与吞咽、直接参与消化作用、维持味觉功能、提供各种营养来维持口腔软硬组织的代谢平衡），保护功能（润滑功能、维持黏膜完整、软组织修复、清除作用、调节口腔菌群平衡、维护口腔缓冲能力、维持牙齿矿化）、诊断作用 7.龈沟液的主要组成及功能p57-58 主要组成：细胞成分（细菌、脱落上皮细胞、中性多形核粒细胞、淋巴细胞、单核细胞等）、电解质（钠、钾等）、蛋白质（IgG、IgA、IGM、C3、C4，血浆蛋白包括清蛋白、纤维蛋白等，葡萄糖、葡萄糖己糖胺和糖、醛、酸，酶类） 8.什么是转导、转染、转化。P92-93 转化是指受体菌捕获和表达质粒载体DNA分子的生命过程；转染是专指受体菌捕获和表达噬菌体DNA分子的过程；转导是利用噬菌体颗粒为媒介，将外源DNA转移至受体菌并得到表达的生命过程。 9.PCR的原理是什么。P95-96 DNA合成是以一股DNA单链为模版，在引物存在下，DNA聚合酶沿模版以5’—>3’方向延伸的过程。PCR是利用DNA合成的原理，合成两个与靶DNA两侧序列互补的引物，早体外进行靶DNA的重复合成。PCR扩增包括DNA变性、引物与靶DNA退火、引物延伸三个步骤。 10.什么是细胞增殖、细胞凋亡。P118 细胞增殖：通过细胞分裂增加细胞数量。细胞凋亡：是细胞主动性的程序性死亡，表现为细胞染色体DNA片段化，细胞皱缩分解成凋亡小体，最终为其他细胞豚鼠而清楚。 11.牙髓组织固有免疫成分包括什么p132-133 牙髓组织固有免疫成分包括牙髓低油的免疫成分（成牙本质细胞）、固有免疫细胞（牙髓树突状细胞、巨噬细胞、肥大细胞、中性粒细胞etc）和免疫分子（外流的牙本质液流和管内沉积的免疫球蛋白、神经肽、细胞因子和趋化因子etc） 12.粘膜免疫系统p125 或称共同黏膜免疫系统（CMIS），包括黏膜相关淋巴组织（MALT）和散在的免疫细胞。MALT包括肠相关淋巴组织，韦氏环和支气管相关淋巴组织。CMIS分为诱导部位（MALT）和效应部位（固有层、上皮内的散在免疫细胞核外分泌腺）。黏膜免疫功能特点是产生SIgA和SIgM通过细胞归巢将诱导部位和效应部位相关联，参与局部特异性

细胞生物学复习要点整理

春2周细胞膜 1.细胞膜的化学组成及其特性：膜脂；膜蛋白；膜糖。 2.细胞膜的分子结构模型：流动镶嵌模型，脂筏模型。 3.细胞膜的生物学特性：不对称性；流动性（膜流动性的影响因素）。 1.脂质体（liposome）：当脂质分子被水环境包围时，自发聚集，疏水尾在内， 亲水头在外，出现两种存在形式：球状分子团、形成双分子层，为防止两端尾部与水接触，游离端自动闭合，形成充满液体的球状小泡称为脂质体。 2.细胞外被（cell coat）或糖萼（glycocalyx）：质膜中的糖蛋白和糖脂向外表面 延伸出的寡糖链构成的糖类物质。 3.脂筏（lipid raft）：膜双层内含有特殊脂质和蛋白质组成的微区，微区中富含胆 固醇和鞘脂，其中聚集一些的特定种类的膜蛋白。由于鞘脂的脂肪酸尾部比较长，这一区域比膜的其他部分厚，更有秩序且较少流动，称脂筏。 1.细胞膜的基本结构特征与生理功能？ 1)脂类：包括磷脂、胆固醇、糖脂，构成细胞膜主体，与膜流动性有关。 2)蛋白质：可分为内在蛋白和外在蛋白，是膜功能的主要体现者，如物质运输、 信号转导等。 3)糖类：包括糖脂和糖蛋白，对细胞有保护作用，在细胞识别起作用。 2.影响膜脂流动性的因素？ 1)脂肪酸链的饱和程度（不饱和流动性大）。 2)脂肪酸链的长短（短链流动性大）。 3)胆固醇的双重调节（相变温度以上降低，相变温度以下提高）。 4)卵磷脂和鞘磷脂的比值（比值高的流动性大）。 5)膜蛋白的影响（膜蛋白越多，流动性越差）。 6)极性基团、环境温度、pH、离子强度。 春3、4周细胞内膜系统、囊泡转运 1.细胞内膜系统的概念、组成。 2.粗面内质网功能：蛋白质的合成；蛋白质的折叠装配；蛋白质的糖基化；蛋白 质的胞内运输。 3.滑面内质网的功能：参与脂质物质的合成运输；参与糖原代谢；参与解毒；参 与储存和调节Ca2+；参与胃酸、胆汁的合成分泌（内质网以葡萄糖-6-磷酸酶为标志酶）。 4.信号肽假说：新生肽链N端有独特序列称为信号肽，细胞基质中存在SRP能 识别并结合信号肽，SRP另一端与核糖体结合，形成复合结构，然后向内质网膜移动，与内质网膜上SRP-R识别结合，并附着于移位子上，然后SRP解离，肽链延伸。当肽链进入内质网腔时，信号肽序列会被内质网腔信号肽酶切除，肽链继续延伸至终止。 5.高尔基体是高度动态、具有极性的细胞器，以糖基转移酶为标志酶，主要功能 有：糖蛋白合成；参与脂质代谢；是大分子转运枢纽；加工成熟蛋白。 6.溶酶体酶的形成：①在内质网中合成、折叠和N-连接糖基化修饰，形成N-连 接的甘露糖糖蛋白，运送至高尔基体；②溶酶体酶蛋白在高尔基体中加工时甘露糖残基磷酸化为甘露糖-6-磷酸（M-6-P），为分选重要信号；③溶酶体酶分选并以出芽方式转运到前溶酶体。 7.溶酶体以酸性磷酸酶为标志酶，主要功能为：细胞内的消化作用；细胞营养功 能；机体防御和保护；激素分泌的调控；个体发生和发育的调控。 8.过氧化物酶体（peroxisome）又称微体，特点：①内有尿酸氧化酶结晶，称作 类核体；②模内表面界面可见一条称为边缘板的高电子致密度条带状结构。以过氧化物酶为标志酶。主要功能：清除细胞代谢所产生的H2O2及其他毒物； 对细胞氧张力的调节作用；参与脂肪酸等高能分子物质的代谢。 9.三种了解最多的囊泡：①网格蛋白有被囊泡：来源于反面高尔基体网状结构和 细胞膜，介导蛋白质从反面高尔基网状结构向胞内体、溶酶体和细胞膜运输； 在受体介导的胞吞作用过程中，介导物质从细胞膜向细胞质或从胞内体向从溶酶体运输；②COP Ⅰ有被囊泡：主要产生于高尔基体顺面膜囊，主要负责回收、转运内质网逃逸蛋白返回内质网及高尔基体膜内蛋白的逆向运输；③COP Ⅱ有被囊泡：产生于粗面内质网，主要介导从内质网到高尔基体的物质转运。