序列比对正文
一前言
DNA蛋白质序列比对是生物信息学中的基本手段，深入了解比对算法的核心内容是学习掌握生物信息学的必需内容。本专题通过 Perl 程序分别实现动态规划算法与模糊匹配的方式（即字符串相似度算法），处理比较多条序列，从而比较两种算法的区别和优劣。进而通过实际操作（程序运行）了解动态规划算法与其它算法之间的区别，掌握动态规划算法的特点和优势。
二本论
2.1动态规划算法
动态规划解决序列比对问题的基本思想:使用迭代法计算出两个序列的相似分值, 并存入一个得分矩阵中, 根据得分矩阵回溯寻找最优的比对序列.
序列比对是动态规划的一个重要应用。序列比对问题通常是使用编辑操作（替换、插入、删除一个要素等）进行序列转换。每次操作对应不同成本，目标是找到编辑序列的最低成本。可以很自然地想到使用递归解决这个问题，序列A到B的最优编辑通过以下措施之一实现：插入B的第一个字符，对A和B的剩余序列进行最优比对；删去A的第一个字符，对A和B进行最优比对；用B的第一个字符替换A的第一个字符，对A的剩余序列和B进行最优比对。局部比对可在矩阵中列表表示，单元(i,j)表示A[1..i]到b[1..j]最优比对的成本[1]。单元(i,j)的成本计算可通过累加相邻单元的操作成本并选择最优解实现。
两条序列分别作为横坐标和纵坐标放置，组成一个路径矩阵，即得分矩阵, 矩阵元素(i,j)值为比对的得分值。在得分矩阵中到达位置为(i,j)的某一个元素有三种可能的路径：通过位置i- 1,j- 1 的对角方向, 没有空位罚分：通过列 j 的垂直方向, 通过行i 的水平方向, 空位罚分的值取决于插入空格的个数。序列比对序列同源(homology)指的是序列来自相同的祖先, 意味着这些序列具有相同的进化历史, 而序列的相似性(similarity)指的是两序列在某参数条件下的相像, 它可以用相同残基的百分比或是其他的方法来表示[2]。列之间的相似度是可以量化的参数，列是否同源需要有进化事实的验证, 显著的相似性通常意味着同源是运用某种特定的数学模型或算法, 找出两个或多个序列之间的最大匹配碱基或残基数, 比对算法的结果在很大程度上反映了序列之间的相似性程度以及它们的生物学特征。
2.2 动态规划序列比对算法
动态规划算法比较序列相似度程序如下：
open(INFILE, 'C:\Users\Administrator\Desktop\生信比对算法应用专题比对序列.txt) or die "Can't open\生信比对算法应用专题比对序列.txt $!";
o pen(OUTFILE, '>C:\Users\Administrator\Desktop\guozhanqiang.txt') or die "Can't open guozhanqiang.txt: $!";
while(
{ if ( $_ =~ / SEQUENCE1:/ )
{ $_=~s/ SEQUENCE1://g;
@case1=split("",$_); }
if ( $_ =~ / SEQUENCE2:/ )
{ $_=~s/ SEQUENCE2://g;
@case2=split("",$_); }
} close (INFILE);
%HoH=(); #初始化"双维关联数组"
$blosumFile='C:\Users\Administrator\Desktop\BLOSUM62.txt';
&BLOSUM; #从blosum文件，赋值"双维关联数组"%HoH
$lenght=$i; # 得出两个序列的长度
sub dynamicprogramming{ # 动态规划函数
@compare=@_; #将传入的数组赋给compare
for ($t=0; $t<=$lenght; $t++)
{$guo[0][$t]=(-4)*$t; }
for ($j=0; $j<=$lenght; $j++)
{$guo[$j][0]=(-4)*$j;} #初始化得分矩阵
for ($i = 1; $i <= $lenght; $i++)
{ for ($j = 1; $j <=$lenght; $j++)
{ if ($case1[$i-1] eq $compare[$j-1]) #如果两个元素匹配，则斜着走
{ $guo[$i][$j]=$guo[$i-1][$j-1]+$HoH{$case1[$i]}{$compare[$j]};
$b[$i][$j]=1; }
esif ($guo[$i-1][$j-1]>= $guo[$i-1][$j]-4 && $guo[$i-1][$j-1]>= $guo[$i][$j-1]-4 )
{ $guo[$i][$j]=$guo[$i-1][$j-1]+$HoH{$case1[$i]}{$compare[$j]};
$b[$i][$j]=1; }
elsif ($guo[$i-1][$j]-4>=$guo[$i][$j-1]-4)
{ $guo[$i][$j]=$guo[$i-1][$j]-4;
$b[$i][$j]=2; }
else { $guo[$i][$j]=$guo[$i][$j-1]+$HoH{$case1[$i]}{$compare[$j]}-4;
$b[$i][$j]=3; } } }
$guo[$lenght][$lenght];
}
sub BLOSUM{
open(BLOSUM, $blosumFile) or die "Can't open data.txt: $!";
while (
next if /^#/; #忽略所有以 # 开始的行
#然后以空格为标准，劈开每一行，放入双维关联数组
($AA, $A, $R, $N, $D, $C, $Q, $E, $G, $H, $I, $L, $K, $M, $F, $P, $S, $T, $W, $Y, $V, $B, $Z, $X, $m ) = split( ' ' );
$HoH{ $AA }{ 'A' } = $A; $HoH{ $AA }{ 'R' } = $R;
$HoH{ $AA }{ 'N' } = $N; $HoH{ $AA }{ 'D' } = $D; $HoH{ $AA }{ 'C' } = $C; $HoH{ $AA }{ 'Q' } = $Q; $HoH{ $AA }{ 'E' } = $E; $HoH{ $AA }{ 'G' } = $G; $HoH{ $AA }{ 'H' } = $H; $HoH{ $AA }{ 'I' } = $I; $HoH{ $AA }{ 'L' } = $L; $HoH{ $AA }{ 'K' }
时间序列分析方法及应用7
青海民族大学 毕业论文 论文题目：时间序列分析方法及应用—以青海省GDP 增长为例研究 学生姓名：学号： 指导教师：职称： 院系：数学与统计学院 专业班级：统计学 二○一五年月日
时间序列分析方法及应用——以青海省GDP增长为例研究 摘要: 人们的一切活动，其根本目的无不在于认识和改造世界，让自己的生活过得更理想。时间序列是指同一空间、不同时间点上某一现象的相同统计指标的不同数值，按时间先后顺序形成的一组动态序列。时间序列分析则是指通过时间序列的历史数据，揭示现象随时间变化的规律，并基于这种规律，对未来此现象做较为有效的延伸及预测。时间序列分析不仅可以从数量上揭示某一现象的发展变化规律或从动态的角度刻画某一现象与其他现象之间的内在数量关系及其变化规律性，达到认识客观世界的目的。而且运用时间序列模型还可以预测和控制现象的未来行为，由于时间序列数据之间的相关关系（即历史数据对未来的发展有一定的影响），修正或重新设计系统以达到利用和改造客观的目的。从统计学的内容来看，统计所研究和处理的是一批有“实际背景”的数据，尽管数据的背景和类型各不相同，但从数据的形成来看，无非是横截面数据和纵截面数据两类。本论文主要研究纵截面数据，它反映的是现象以及现象之间的关系发展变化规律性。在取得一组观测数据之后，首先要判断它的平稳性，通过平稳性检验，可以把时间序列分为平稳序列和非平稳序列两大类。主要采用的统计方法是时间序列分析，主要运用的数学软件为Eviews软件。大学四年在青海省上学，基于此，对青海省的GDP十分关注。本论文关于对1978年到2014年以来的中国的青海省GDP（总共37个数据）进行时间序列分析，并且对未来的三年中国的青海省GDP进行较为有效的预测。希望对青海省的发展有所贡献。 关键词: 青海省GDP 时间序列白噪声预测
实验3 两条序列比对与多序列比对
实验三：两条序列比对与多序列比对 实验目的： 学会使用MegAlign，ClustalX和MUSCLE进行两条序列和多条序列比对分析 实验内容： 双序列比对是使两条序列产生最高相似性得分的序列排列方式和空格插入方式。两条序列比对是生物信息学最基础的研究手段。第一次实验我们用dotplot方法直观地认识了两条序列比对。但是dotplot仅仅是展示了两条序列中所有可能的配对，并不是真正意义上的序列比对。这里介绍进行两条序列比对的软件-MegAlign。 多序列比对是将多条序列同时比对，使尽可能多的相同（或相似）字符出现在同一列中。多序列比对的目标是发现多条序列的共性。如果说序列两两比对主要用于建立两条序列的同源关系，从而推测它们的结构和功能，那么，同时比对多条序列对于研究分子结构、功能及进化关系更为有用。多序列比对对于系统发育分析、蛋白质家族成员鉴定、蛋白质结构预测、保守模块的搜寻等具有非常重要的作用。我们这节课主要学习多条序列比对的软件-ClustalX, MUSCLE。 一、MegAlign DNASTAR公司的Lasergene软件包是一个比较全面的生物信息学软件，它包含了7个模块。其中MegAlign可进行两条或多条序列比对分析。 1. 两条序列比对 1.1 安装程序 解压DNASTAR Lasergene软件压缩包，双击Lasergene710WinInstall.exe文件，按照默认路径安装软件到自己电脑上。 1.2 载入序列 a.点击开始－程序－Lasergene－MegAlign，打开软件。 我们首先用演示序列（demo sequence）学习软件的使用。演示序列所在位置：C:\Program files\ DNASTAR\ Lasergene\ Demo Megalign\ Histone Sequences\。 b. 点击主菜单File—Enter sequence－选择序列所在文件夹，选择序列tethis21.seq和tethis22.seq，点击Add，这两条序列将出现在右侧selected sequences框中（Figure 3.1），选择完毕点击Done回到程序页面。 Figure 3.1 载入序列
实验2 序列比对
实验二：两条序列比对与多序列比对 实验目的： 学会使用MegAlign，ClustalX和MUSCLE进行两条序列和多条序列比对分析。 实验内容： 双序列比对是使两条序列产生最高相似性得分的序列排列方式和空格插入方式。两条序列比对是生物信息学最基础的研究手段。 多序列比对是将多条序列同时比对，使尽可能多的相同（或相似）字符出现在同一列中。多序列比对的目标是发现多条序列的共性。如果说序列两两比对主要用于建立两条序列的同源关系，从而推测它们的结构和功能，那么，同时比对多条序列对于研究分子结构、功能及进化关系更为有用。多序列比对对于系统发育分析、蛋白质家族成员鉴定、蛋白质结构预测、保守模块的搜寻等具有非常重要的作用。我们这节课主要学习多条序列比对的软件-ClustalX, MUSCLE。 一、MegAlign 用dotplot方法能够直观地认识两条序列比对，但是dotplot仅仅是展示了两条序列中所有可能的配对，并不是真正意义上的序列比对。这里介绍由DNASTAR公司开发的一个比较全面的生物信息学软件包--Lasergene，它包含了7个模块，其中MegAlign可进行两条或多条序列比对分析。 1. 两条序列比对 1.1 安装程序 解压DNASTAR Lasergene软件压缩包，双击Lasergene710WinInstall.exe文件，按照默认路径安装软件到自己电脑上。 1.2 载入序列 a.点击开始－程序－Lasergene－MegAlign，打开软件。 我们首先用演示序列（demo sequence）学习软件的使用。演示序列所在位置：C:\Program files\ DNASTAR\ Lasergene\ Demo Megalign\ Histone Sequences\。 b. 点击主菜单File—Enter sequence－选择序列所在文件夹，选择序列tethis21.seq和tethis22.seq，点击Add，这两条序列将出现在右侧selected sequences框中（Figure 2.3），选择完毕点击Done回到程序页面。 Figure 2.3 载入序列
多序列比对软件Clustalw使用方法
多序列比对软件Clustalw使用方法2011年06月23日星期四 16:44 Clustal的基本思想是基于相似序列通常具有进化相关性这一假设。比对过程中，先对所有的序列进行两两比对并计算它们的相似性分数值，然后根据相似性分数值将它们分成若干组，并在每组之间进行比对，计算相似性分数值。根据相似性分数值继续分组比对，直到得到最终比对结果。比对过程中，相似性程度较高的序列先进行比对，而距离较远的序列添加在后面。作为程序的一部分，Clusal可以输出用于构建进化树的数据。 Clustal程序有许多版本，ClustalW(Thompson等，1994)，根据对亲缘关系较近的序列间空位情况，确定如何在亲缘关系较远的序列之间插入空位。同样，相似性较高的序列比对结果中的残基突变信息，可用于改变某个特殊位置空位罚分值的大小，推测该位点的序列变异性。ClustalW是一种渐进的多序列比对方法，先将多个序列两两比对构建距离矩阵，反应序列之间两两关系;然后根据距离矩阵计算产生系统进化指导树，对关系密切的序列进行加权;然后从最紧密的两条序列开始，逐步引入临近的序列并不断重新构建比对，直到所有序列都被加入为止。 ClustalX是CLUSTAL多重序列比对程序的Windows版本。Clustal X为进行多重序列和轮廓比对和分析结果提供一个整体的环境。 软件下载地址: 使用步骤如下: Step 1: 软件初始化界面
Step 2:选择1 进入如下界面 Step 3:输入序列名1Seq_650_300.txt.txt 进入如下界面
Step 4:选择2 进入如下界面 Step 5:选择9 进入如下界面 Step 6:选择1 进入如下界面
各种序列号
Office 2007 企业版 W2JJW-4KYDP-2YMKW-FX36H-QYVD8 V9MTG-3GX8P-D3Y4R-68BQ8-4Q8VD Office 2007 专业版 JFJH8-28FCP-X2WJC-B73KX-6C7D8 DBXYD-TF477-46YM4-W74MH-6YDQ8 W2JJW-4KYDP-2YMKW-FX36H-QYVD8 MTP6Q-D868F-448FG-B6MG7-3DBKT TT3M8-H3469-V89G6-8FWK7-D3Q9Q DBXYD-TF477-46YM4-W74MH-6YDQ8 Macromedia Dreamweaver 8序列号 分类:默认栏目 WPD800-53735-53632-48591 WPD800-52830-42932-95093 WPD800-50438-43132-60296 WPD800-50438-43132-60296 WPD800-52836-88632-87970 WPD800-50836-81932-91159 WPD800-53735-53632-48591 WPD800-52830-42932-95093 WPD800-50438-43132-60296 WPD800-50438-43132-60296 WPD800-52836-88632-87970 WPD800-50836-81932-91159 WPD800-53735-53632-48591 WPD800-52830-42932-95093 WPD800-50438-43132-60296 WPD800-50438-43132-60296 WPD800-52836-88632-87970 WPD800-50836-81932-91159 WPD800-53735-53632-48591 WPD800-52830-42932-95093 WPD800-50438-43132-60296 WPD800-50438-43132-60296 WPD800-52836-88632-87970 WPD800-50836-81932-91159 WPD800-53735-53632-48591 WPD800-52830-42932-95093 WPD800-50438-43132-60296 WPD800-50438-43132-60296 WPD800-52836-88632-87970 WPD800-50836-81932-91159 WPD800-53735-53632-48591 WPD800-52830-42932-95093 WPD800-50438-43132-60296
功能基因的序列比对方法
功能基因的序列比对 <1>.切除载体和(或)引物 a.打开所有的原始引物序列于一个EditSeq的窗口中 b. export all as one c.保存 d.打开这个保存的文件，开始切除载体和引物 e.选择载体插入点两侧的序列(10-15个的样子)搜索注意：不存在正反向的问题，都是一个
方向，因为测序的时候是选择两个载体上的引物其中的一条来往后测序的！ 切完之后另存为 f. 重新打开这个文件，开始切除引物 方法同切载体，但是要注意正反向的问题。比如mcrA基因，其引物为Forward: 5'-GGTGGTGTMGGATTCACACARTAYGCWACAGC-3' Reverse: 5'-TTCATTGCRTAGTTWGGRTAGTT-3'
先找Forward 5’端，此时只找到的部分序列。切去5’端。 然后再切这些切掉5’端序列的3’端的序列，此时其3’端序列应该是Reverse 的反向互补序列。 切去这个反向互补序列，这样一来这个些序列就已经被切去两端的引物了。 但此时还剩下另一部分未切除任何引物的序列，此时记下这些序列的编号，先切去Reverse 5’
端。 再用Forward 的反向互补序列切去3’端，这样剩下的序列也都被切除两端的引物了。 <2>将所有序列调整为同向序列： a. 选择前面记录编号的序列，将这些序列一个个都转换为其反向互补序列。这样一来所有的序列都成为同向序列了，即在DNA两条反向互补链的其中一条上的比较了。
b. 保存该文件 <3> 生成OTUs Google 搜索”Fastgroup II” 或https://www.sodocs.net/doc/c76232958.html,/fg_tools.htm
绝对精华】MAC各种软件序列号
绝对精华】MAC各种软件序列号！要的快进哦！ Adobe Photoshop 7 1045-0007-2482-5001-9106-7843 1045-0008-6003-1643-7124-0387 1045-0777-5104-8776-1723-5835 (retail) 1045-1780-9400-3871-4044-1306 1045-1442-1943-0773-2578-9918 1045-0203-3247-2217-3566-6177 (Set date back to Feb.2003) 1045-1989-3692-1791-7204-1293 1045-1890-4436-9754-0662-7420 1045-1178-7064-5898-4014-6638 1045-1185-9791-2216-4314-3476 1045-0994-9222-9402-8709-0850 1045-1897-0084-4166-7333-2029 1045-1716-9174-2622-9063-1777 1045-0633-9307-0876-4274-4173 1045-0050-0430-0561-2591-8823 1045-1145-2265-6493-4398-9134 1045-1395-8517-2214-3915-6701 1045-0013-2125-1555-3970-0524 1045-0740-5300-3616-0157-4095 1045-0768-2043-6940-7732-7192 1045-0122-5505-0180-4150-2685 1045-1156-5358-0167-7287-2952 1045-0009-2130-3302-1733-9518 (Upgrade) 1045-0230-6247-6480-7393-2007 (Upgrade)
序列比对及建树步骤
序列比对及建树步骤 1.以细菌、病毒或寄生虫为例，参考分类生物学资料，从GenBank中查询相关序列，详述Blast寻找、CLUSTAL比对、建树及种系发育过程 以隐孢子虫actin基因为例做一叙述： 1.1 Blast: 登录NCBI主页，打开Blast搜索引擎，将测得的一个已知的actin序列输入，下 载了12条隐孢子虫序列，另外下载一条恶性疟原虫actin序列作为外群。所获得的14条序列改为FAST格式，用TXT文件保存。 1.2 cluxtal 比对 用软件clustalx1.83比对软件进行比对。
1.3 比对的精制 对比对结果可以进行一些简单的调整，删去目的序列比对效果最差的开头和结尾部分。可以用word文档打开比对所生成的aln.文件，在word文档下进行剪切。然后将剪切的文档再用ClustalX软件进行比对，并生成Phylip格式文件。
1.4 使用Phylip软件建树 以neighbour-jioning方法为例做一叙述。 1.4.1 先导树 将生成的PHY文件（*.phy）拷贝到Phylip软件包目录下，最好修改成比较简单的文件名，比如修改成1或a等（比较方便下边的输入运行）。运行DNADIST.EXE子软件，输入文件(比如1)，打回车后弹出软件界面，打D可以选择不同的模型，在此选用Kimura 2-parameter模型。生成的outfile文件可以再修改成简单的文件名，比如修改成2。打开neighbor.exe子程序，输入文件2，打回车后运行完毕会生成两个文件，将文件outtree另存为.tre文件格式，即为所生成的先导树。
时间序列分析——最经典的
【时间简“识”】 说明：本文摘自于经管之家(原人大经济论坛) 作者：胖胖小龟宝。原版请到经管之家(原人大经济论坛) 查看。 1.带你看看时间序列的简史 现在前面的话—— 时间序列作为一门统计学，经济学相结合的学科，在我们论坛，特别是五区计量经济学中是热门讨论话题。本月楼主推出新的系列专题——时间简“识”，旨在对时间序列方面进行知识扫盲（扫盲，仅仅扫盲而已……），同时也想借此吸引一些专业人士能够协助讨论和帮助大家解疑答惑。 在统计学的必修课里，时间序列估计是遭吐槽的重点科目了，其理论性强，虽然应用领域十分广泛，但往往在实际操作中会遇到很多“令人发指”的问题。所以本帖就从基础开始，为大家絮叨絮叨那些关于“时间”的故事！ Long long ago，有多long估计大概7000年前吧，古埃及人把尼罗河涨落的情况逐天记录下来，这一记录也就被我们称作所谓的时间序列。记录这个河流涨落有什么意义当时的人们并不是随手一记，而是对这个时间序列进行了长期的观察。结果，他们发现尼罗河的涨落非常有规律。掌握了尼罗河泛滥的规律，这帮助了古埃及对农耕和居所有了规划，使农业迅速发展，从而创建了埃及灿烂的史前文明。
好~~从上面那个故事我们看到了 1、时间序列的定义——按照时间的顺序把随机事件变化发展的过程记录下来就构成了一个时间序列。 2、时间序列分析的定义——对时间序列进行观察、研究，找寻它变化发展的规律，预测它将来的走势就是时间序列分析。 既然有了序列，那怎么拿来分析呢 时间序列分析方法分为描述性时序分析和统计时序分析。 1、描述性时序分析——通过直观的数据比较或绘图观测，寻找序列中蕴含的发展规律，这种分析方法就称为描述性时序分析 描述性时序分析方法具有操作简单、直观有效的特点，它通常是人们进行统计时序分析的第一步。 2、统计时序分析 （1）频域分析方法 原理：假设任何一种无趋势的时间序列都可以分解成若干不同频率的周期波动 发展过程： 1）早期的频域分析方法借助富里埃分析从频率的角度揭示时间序列的规律 2）后来借助了傅里叶变换，用正弦、余弦项之和来逼近某个函数 3）20世纪60年代，引入最大熵谱估计理论，进入现代谱分析阶段 特点：非常有用的动态数据分析方法，但是由于分析方法复杂，结果抽象，有一定的使用局限性 （2）时域分析方法
破解各种软件注册码
一、准备好常用破解工具， 1、查壳工具：PEiD 0.95 2、脱壳调试：OllyICE v1.10（俗称OD，可下载一些OD插件保存在程序文件目录下的plugin文件夹中，启动OD时会自动链接插件） 3、Win32反汇编：WinHex14.2（本帖暂用不着） 4、修复工具：ImportREC V1.6（本帖暂用不着） 5、注册机编写：keymake 够了，初学不宜太多。新手所有的工具在小生工具包里都有（赞下小生同鞋的无私奉献）二、壳的概念：关于壳的介绍文章很多，很多初学者还不知道壳是什么，那么你就暂且这样通俗的去理解：壳就是软件的包装外壳。 三、脱壳：顾名思义，我就不多说了。 四、调试：用OD调试程序的进程，寻找关键（算法）CALL，修改有关汇编语言达到软件注册或破解的目的。 五、有人问：我不懂汇编语言和算法怎么办？我告诉你，没关系，首先你必须从简单的、好欺负的软件入手（初学者千万别找年轻的、经常更新的或高版本的软件），否则，你只会以失败而告终。 六、如果你是第一次学破解，我告诉你一个方法，只要你按如下操作一般都能成功（有的新版本软件除外）： 1、首先注册软件，查看软件弹出的有关注册失败的信息框的内容。 2、查壳：有壳脱壳，无壳用OD载入。 3、手动脱壳基本方法：从OD载入软件程序后弹出是否分析对话框，点“否”，停在程序壳的入口（含有pushad等类似字符）。接下来我们的目的是要寻找第一个popad 。 （1）首先按F8，接下来或近处便是CALL，此时的CALL或是离这里很近的CALL必须按F7，否则你就掉入陷井，后面遇到CALL一旦掉入也没关系，你先记下来，重新载入程序（按CTRL+F2），再遇到这个时就用F7进入。 （2）出现往回跳转时，即红色线显示跳转实现，必须在下一行点左鍵，然后按F4步过，灰色为跳转未实现，可不理它照样F8。 （3）其他全部F8，一路下去必定能找到第一个popad，找到后离此不远必定有一个大的跳转，一旦跳转来到有push ebp字样，说明壳己走完到主程序（OEP），在此用OD插件→ollyDump→Dump debu…→Dump脱壳→保存。 4、破解：OD载入程序、点文件→打开→点击要破解的软件程序（无壳或己脱壳的）。 5、鼠标置左上（反汇编）窗口点右鍵，弹出框选项中选择ultra string reference（过激的字符串参考）中的Find ASCII。 6、在弹出的窗口内查找第一步骤的注册信息内容或有关注册成功和注册失败的字符。如果找不到，建议你放弃，另选其他软件，最好是年纪大些的（一般在2005年及以前的）。 7、找到有关字符后，双击它，回到OD主窗口，在反汇编窗口（左上）中可以看到有关字符，然后就在字符上下附近寻找关键跳转（即跳向注册失败或注册成功处），在该跳转近处必定有一个就是关键CALL。 8、如果用爆破，就修改关键跳转（jnz改为jz，jz改为jnz等）。 9、如果是追注册码就在关键CALL这行下断点（按F2或双击鼠标），然后按F9运行后，会弹出软件注册对话框，随意输入注册信息后确定，这时注意观察右上的寄存器窗口会显示出你输入的假码和软件的真码，真码可以注册，而这个CALL可以用来做注册机。 下面，我给大家找来一个简单的软件演示一下实例： 【软件名称】现代汉语词典
季节性时间序列分析方法
季节性时间序列分析方 法 LG GROUP system office room 【LGA16H-LGYY-LGUA8Q8-LGA162】
第七章季节性时间序列分析方法 由于季节性时间序列在经济生活中大量存在，故将季节时间序列从非平稳序列中抽出来，单独作为一章加以研究，具有较强的现实意义。本章共分四节：简单随机时间序列模型、乘积季节模型、季节型时间序列模型的建立、季节调整方法X-11程序。 本章的学习重点是季节模型的一般形式和建模。 §1 简单随机时序模型 在许多实际问题中，经济时间序列的变化包含很多明显的周期性规律。比如：建筑施工在冬季的月份当中将减少，旅游人数将在夏季达到高峰，等等，这种规律是由于季节性（seasonality）变化或周期性变化所引起的。对于这各时间数列我们可以说，变量同它上一年同一月（季度，周等）的值的关系可能比它同前一月的值的相关更密切。 一、季节性时间序列 1．含义：在一个序列中，若经过S个时间间隔后呈现出相似性，我们说该序列具有以S为周期的周期性特性。具有周期特性的序列就称为季节性时间序列，这里S为周期长度。 注：①在经济领域中，季节性的数据几乎无处不在，在许多场合，我们往往可以从直观的背景及物理变化规律得知季节性的周期，如季度数据（周期为4）、月度数据（周期为12）、周数据（周期为7）；②有的时间序列也可能包含长度不同的若干种周期，如客运量数据（S=12，S=7） 2．处理办法： （1）建立组合模型； （1）将原序列分解成S个子序列（Buys-Ballot 1847）
对于这样每一个子序列都可以给它拟合ARIMA 模型，同时认为各个序列之间是相互独立的。但是这种做法不可取，原因有二：（1）S 个子序列事实上并不相互独立，硬性划分这样的子序列不能反映序列{}t x 的总体特征；（2）子序列的划分要求原序列的样本足够大。 启发意义：如果把每一时刻的观察值与上年同期相应的观察值相减，是否能将原序列的周期性变化消除（ 或实现平稳化），在经济上，就是考查与前期相比的净增值，用数学语言来描述就是定义季节差分算子。 定义：季节差分可以表示为S t t t S t S t X X X B X W --=-=?=)1(。 二、 随机季节模型 1．含义：随机季节模型，是对季节性随机序列中不同周期的同一周期点之间的相关关系的一种拟合。 AR （1）：t t S t S t t e W B e W W =-?+=-)1(11??，可以还原为：t t S S e X B =?-)1(1?。 MA （1）：t S t S t t t e B W e e W )1(11θθ-=?-=-，可以还原为：t S t S e B X )1(1θ-=?。 2．形式：广而言之，季节型模型的ARMA 表达形式为 t S t S e B V W B U )()(= （1） 这里，?? ? ??----=----=?=qS q S S S pS P S S S t d S t B V B V B V B V B U B U B U B U X W 2212211)(1)()(平稳。 注：（1）残差t e 的内容；（2）残差t e 的性质。 §2 乘积季节模型 一、 乘积季节模型的一般形式 由于t e 不独立，不妨设),,(~m d n ARIMA e t ，则有
各种版本的Windows_7序列号(注册码)
各种版本的Windows 7序列号（注册码） 本想直接贴上，无奈，总被评为“文档质量偏低”；无奈，将序列号附在后面 默认安装的序列号: * 旗舰版 - D4F6K-QK3RD-TMVMJ-BBMRX-3MBMV * 专业版 - HYF8J-CVRMY-CM74G-RPHKF-PW487 * 家庭高级版 - RHPQ2-RMFJH-74XYM-BH4JX-XM76F * 家庭普通版 - YGFVB-QTFXQ-3H233-PTWTJ-YRYRV * 初级版 - 7Q28W-FT9PC-CMMYT-WHMY2-89M6G 快捷键 轻松访问 1.按住右Shift八秒钟：启用和关闭筛选键 2.按左 Alt+左 Shift+PrtScn(或 PrtScn)：启用或关闭高对比度 3.按左 Alt+左 Shift+Num Lock ：启用或关闭鼠标键 4.按 Shift 五次：启用或关闭粘滞键 5.按住 Num Lock 五秒钟：启用或关闭切换键 6.Windows 徽标键 + U ：打开轻松访问中心 7.ctrl+Alt+del：显示常见选项 对话框 Alt+Tab 在选项卡上向前移动 Alt+Shift+Tab 在选项卡上向后移动 Tab 在选项上向前移动 Shift+Tab 在选项上向后移动 Alt+加下划线的字母执行与该字母匹配的命令(或选择选项) Enter 对于许多选定命令代替单击鼠标 空格键如果活动选项是复选框，则选中或清除该复选框 箭头键如果活动选项是一组选项按钮，则选择某个按钮 F1 显示帮助 F4 显示活动列表中的项目
Backspace 如果在“另存为”或“打开”对话框中选中了某个文件夹，则打开上一级文件夹 Windows 徽标键 Windows徽标键就是显示为Windows旗帜，或标有文字Win或Windows 的按键，以下简称Win键。 1.Windows 徽标键——打开或关闭「开始」菜单。 2.Windows 徽标键 + Pause——显示“系统属性”对话框。 3.Windows 徽标键 + D——显示桌面 4.Windows 徽标键 + M——最小化所有窗口。 5.Windows 徽标键 + Shift + M ——将最小化的窗口还原到桌面。 6.Windows 徽标键 + E ——打开计算机。 7.Windows 徽标键 + F ——搜索文件或文件夹。 8.Ctrl + Windows 徽标键 + F ——搜索计算机（如果已连接到网络）。 9.Windows 徽标键 + L ——锁定计算机。 10.Windows 徽标键 + R ——打开“运行”对话框。 11.Windows 徽标键 + T——循环切换任务栏上的程序。 12.Windows 徽标键 + 数字——启动锁定到任务栏中的由该数字所表示位置处的程序。如果该程序已在运行，则切换到该程序。 13.Shift Windows 徽标键 + 数字——启动锁定到任务栏中的由该数字所表示位置处的程序的新实例。 14.Ctrl + Windows 徽标键 + 数字——切换到锁定到任务栏中的由该数字所表示位置处的程序的最后一个活动窗口。 15.Alt + Windows 徽标键 + 数字——打开锁定到任务栏中的由该数字所表示位置处的程序的跳转列表。 16.Windows 徽标键 + Tab——使用 Aero Flip 3-D 循环切换任务栏上的程序。 17.Ctrl + Windows 徽标键 + Tab ——通过 Aero Flip 3-D 使用箭头键循环切换任务栏上的程序。 18.Ctrl + Windows 徽标键 + B ——切换到在通知区域中显示消息的程序。 19.Windows 徽标键 + 空格键——预览桌面。 20.Windows 徽标键 + 向上键——最大化窗口。 21.Windows 徽标键 + 向左键——将窗口最大化到屏幕的左侧。 22.Windows 徽标键 + 向右键——将窗口最大化到屏幕的右侧。 23.Windows 徽标键 + 向下键——最小化窗口。 24.Windows 徽标键 + Home ——最小化除活动窗口之外的所有窗口。 25.Windows 徽标键 + Shift + 向上键——将窗口拉伸到屏幕的顶部和底部。
最新常用软件序列号大全
常用软件序列号大全 虚拟机 JK8RT-TF62M-Z816C-4W8ZK SPSS V14 c303cb8461dbc761a029 AE7.0注册机哪有啊,求各位了~ 悬赏分：0 - 解决时间：2007-4-12 19:46 Serial Number: 1064-1285-3155-4684-1851-9989 Activation Number: 6428-4335-1034-2260-5933-5555-1880 Activation Type: Normal 93:-8 Macromedia Dreamweaver V8.0 简体中文破解版下载 序列号： WPD800-50438-28032-39991 真正的官方简体中文版原版 macromedia captivate 软件CAD100-50446-45197-74968 cad https://www.sodocs.net/doc/c76232958.html, SN: Dreamweaver MX 2004 : WPD700-52206-61494-40475 Fireworks MX 2004 : WPD700-52206-61494-40475 Flash MX 2004 : WPD700-52206-61494-40475 ksdb3128611 876656124 FLASH8.0下载.附序列号:WPD800-51139-93932-06077 WINDOWS ME 简体中文正式零售版(序列号） S/N: HJPFQ-KXW9C-D7BRJ-JCGB7-Q2DRJ WINDOWS ME 正式英文零售版 S/N: RBDC9-VTRC8-D7972-J97JY-PRVMG Windows 2000 Server简体中文服务器版（序列号） Windows 2003 Server简体中文版ISO K3&3Oq~to Windows Server 2003 简体中文企业版，真正免激活。^]j++D7g CD-KEY：JB88F-WT2Q3-DPXTT-Y8GHG-7YYQY
常用软件序列号大全
常用软件序列号大全 2007年07月08日星期日 07:39 ● Windows ME 简体中文版SN: B6BYC-6T7C3-4PXRW-2XKWB-GYV33 ● Windows 2000 Professional 英文版SN:PQHKR-G4JFW-VTY3P-G4WQ2-88CTW ● Windows ME 最终简体中文正式零售版序列号： K9KDJ-3XPXY-92WFW-9Q26K-MVRK8 ● Microsoft Office XP FinalSN:FM9FY-TMF7Q-KCKCT-V9T29-TBBBG ● Windows98 简体中文第二版SN:CYCW7-K2CPP-9MX7D-YJTJF-4GWRY 或 KBF3W-6QK8F-HFBTF-RQCHV-J9YJT ● Windows 2000 Server 中文版(431M)sn:QMPH6-VDV79-CRBCX-HQ32P-F84B3 或sn:R7MPM-R36DT-F38FC-RPPCX-XJG7M ● Windows 2000 Professional 中文版SN:PQHKR-G4JFW-VTY3P-G4WQ2-88CTW ● Microsoft Office 2000 简体中文企业版序列号：J2MV9-JYYQ6-JM44K-QMYTH-8RB2W ● cwin98: q99jq-hvjyx-pgycy-68gm3-wxt68bbh2g-d2vk9-qd4m9-f63xb-43c33qrc fx-t2qkg-2xph7-4x98g-yd6hmdc688-det96-5scn7-e5rlk-xl413tdwv9-qqrjf-ytpb4-j2kb3-ghtd8 ● cwin2000:b48h6-mhy9q-4dr3b-xj8kp-729dd ● coffice2000:DT3FT-BFH4M-GYYH8-PG9C3-8K2FJ Windows所有版本
序列比对方法
序列对齐（sequence alignment）的目的是通过两个或多个核酸序列或蛋白质序列进行对齐，并将其中相似的结构区域突出显示。通过比较未知序列与已知序列（尤其是功能和结构已知的序列）之间的同源性，往往可以很容易地预测未知序列的功能。 1、两两对齐分析 国际互联网上序列两两对齐资源有： ①ALIGN（http://genome.eerie.fr/fasta/align-query.html），对用户所提交的两条序列进行优化对齐，允许选择不同的记分矩阵，但是不允许空位罚分。 ②Align（http://www.mips.biochem.mpg.de/mips/programs/aligh.html； http://www.mips.biochem.mpg.de/）只允许对数据库的已有记录进行两两比对，不接受用户所提交的序列。 ③Bl2Seq（https://www.sodocs.net/doc/c76232958.html,/gorf/bl2.htm）可对任意两条序列进行两两对齐，具有Blast软件的所有功能。 2、多重序列对齐分析 国际互联网上多重序列对齐程序有： ①ClustalW/X。最为著名的序列多重对齐软件包。用户可自行下载进行数据分析。接受多种输入格式，包括FASTA、EMBL、SWISS-PROT、PIR、GCG/MSF等，但所有输入序列必须在同一文件中。如果输入序列中的非空格号85%以上为A、C、G、T、U、N，判定为核酸序列，否则作为蛋白质序列计算。但核酸和蛋白质序列不能在同一文件中。 网址：https://www.sodocs.net/doc/c76232958.html,/cgi-bin/newclustalw.pl； https://www.sodocs.net/doc/c76232958.html,/multi-align/multi-align.html； ftp://https://www.sodocs.net/doc/c76232958.html,/pub/software； ②Match-Box。同时考虑序列数据和氨基酸性质进行序列多重对齐分析。 网址：http://www.fundp.ac.be/sciences/biologie/bms/matchbox_submit.html ③BCM服务器。Baylor College of Medicine，BCM launcher。 网址：https://www.sodocs.net/doc/c76232958.html,/multi-align/multi-align.html
多重序列比对及系统发生树的构建
多重序列比对及系统发生树的构建 作者：佚名来源：生物秀时间：2007-12-31 【实验目的】 1、熟悉构建分子系统发生树的基本过程，获得使用不同建树方法、建树材料和建树参数对建树结果影响的正确认识； 2、掌握使用Clustalx进行序列多重比对的操作方法； 3、掌握使用Phylip软件构建系统发生树的操作方法。 【实验原理】 在现代分子进化研究中，根据现有生物基因或物种多样性来重建生物的进化史是一个非常重要的问题。一个可靠的系统发生的推断，将揭示出有关生物进化过程的顺序，有助于我们了解生物进化的历史和进化机制。 对于一个完整的进化树分析需要以下几个步骤：⑴要对所分析的多序列目标进行比对（alignment）。⑵要构建一个进化树（phyligenetic tree）。构建进化树的算法主要分为两类：独立元素法（discrete character methods）和距离依靠法（distance methods）。所谓独立元素法是指进化树的拓扑形状是由序列上的每个碱基/氨基酸的状态决定的（例如：一个序列上可能包含很多的酶切位点，而每个酶切位点的存在与否是由几个碱基的状态决定的，也就是说一个序列碱基的状态决定着它的酶切位点状态，当多个序列进行进化树分析时，进化树的拓扑形状也就由这些碱基的状态决定了）。而距离依靠法是指进化树的拓扑形状由两两序列的进化距离决定的。进化树枝条的长度代表着进化距离。独立元素法包括最大简约性法（Maximum Parsimony methods）和最大可能性法（Maximum Likelihood methods）；距离依靠法包括除权配对法（UPGMAM）和邻位相连法（Neighbor-joining）。⑶对进化树进行评估，主要采用Bootstraping法。进化树的构建是一个统计学问题，我们所构建出来的进化树只是对真实的进化关系的评估或者模拟。如果我们采用了一个适当的方法，那么所构建的进化树就会接近真实的“进化树”。模拟的进化树需要一种数学方法来对其进行评估。不同的算法有不同的适用目标。一般来说，最大简约性法适用于符合以下条件的多序列：i 所要比较的序列的碱基差别小，ii 对于序列上的每一个碱基有近似相等的变异率，iii 没有过多的颠换/转换的倾向，iv 所检验的序列的碱基数目较多（大于几千个碱基）；
时间序列分析法原理及步骤
时间序列分析法原理及步骤 ----目标变量随决策变量随时间序列变化系统 一、认识时间序列变动特征 认识时间序列所具有的变动特征, 以便在系统预测时选择采用不同的方法 1》随机性:均匀分布、无规则分布,可能符合某统计分布(用因变量的散点图和直方图及其包含的正态分布检验随机性, 大多服从正态分布 2》平稳性:样本序列的自相关函数在某一固定水平线附近摆动, 即方差和数学期望稳定为常数 识别序列特征可利用函数 ACF :其中是的 k 阶自 协方差,且 平稳过程的自相关系数和偏自相关系数都会以某种方式衰减趋于 0, 前者测度当前序列与先前序列之间简单和常规的相关程度, 后者是在控制其它先前序列的影响后,测度当前序列与某一先前序列之间的相关程度。实际上, 预测模型大都难以满足这些条件, 现实的经济、金融、商业等序列都是非稳定的,但通过数据处理可以变换为平稳的。 二、选择模型形式和参数检验 1》自回归 AR(p模型
模型意义仅通过时间序列变量的自身历史观测值来反映有关因素对预测目标的影响和作用,不受模型变量互相独立的假设条件约束,所构成的模型可以消除普通回归预测方法中由于自变量选择、多重共线性的比你更造成的困难用 PACF 函数判别 (从 p 阶开始的所有偏自相关系数均为 0 2》移动平均 MA(q模型 识别条件
平稳时间序列的偏相关系数和自相关系数均不截尾,但较快收敛到 0, 则该时间序列可能是 ARMA(p,q模型。实际问题中,多数要用此模型。因此建模解模的主要工作时求解 p,q 和φ、θ的值,检验和的值。 模型阶数 实际应用中 p,q 一般不超过 2. 3》自回归综合移动平均 ARIMA(p,d,q模型 模型含义 模型形式类似 ARMA(p,q模型, 但数据必须经过特殊处理。特别当线性时间序列非平稳时,不能直接利用 ARMA(p,q模型,但可以利用有限阶差分使非平稳时间序列平稳化,实际应用中 d (差分次数一般不超过 2. 模型识别 平稳时间序列的偏相关系数和自相关系数均不截尾,且缓慢衰减收敛,则该时间序列可能是 ARIMA(p,d,q模型。若时间序列存在周期性波动, 则可按时间周期进
2008最新常用软件序列号注册码大全
DVD Mate Deluxe v2.5.11.28 简繁英日注册版 Name: TEAM CAT 2004 Serial : CMAA0EA775TAA ========================================== windows XP 序列号[分享] windows XP 专业版 8XBXH-B6RJD-BP82Y-4XG84-JTQMM V8BF3-WWJDW-FGXR8-WMCDB-FWHYX 6HV6T-T2HCR-QQ6DH-7WHWM-QHVYD M7HXD-TCCF8-HFMKG-RDMF4-KDCVT H4FP7-BRV2C-P74GD-QVFXR-CXM8X GR3MD-PRMY6-3CQJP-2R2VH-KRJHV JKJT2-BDKW6-6T7J4-QGYYB-8RBRF R4TH4-2KF4Y-H4WGT-DMWKX-6PDH2 HM7DT-JBWJ3-QVBJM-RDV34-PP9VK MBTB3-8HCMJ-YPXJD-FCTJM-YJ87Y 66PH2-4J3VQ-4TXJC-CQTCK-XK8BD D7BMY-GKQ3H-MTBJ7-KFHMP-QKWYK PM3P6-8JV48-J7GRD-PXXG2-VDMDB ========================================== windows XP 企业版 CTTC3-J8QWX-JRF2P-YQYF8-4HW7M R4F3T-2QWKG-33M4V-8MJCF-Y6XV7 TDW2D-WXGW2-VWB4H-FCDRM-X6K7P 67YF6-2JX6P-CXMQT-F3MW2-FC6RY B2PB4-T6CGC-YWRCF-TDPCK-2F8HG VCFM8-XPDHK-44J7M-23W7C-JMFPV XJTBM-WTYV7-YHV22-QGKWB-3XT9B HKWFJ-QDXTP-82QFW-2RFC8-PGHBG
功能基因的序列比对方法
<1>.切除载体和(或)引物 a.打开所有的原始引物序列于一个EditSeq的窗口中 b. export all as one c.保存 d.打开这个保存的文件，开始切除载体和引物 e.选择载体插入点两侧的序列(10-15个的样子)搜索注意：不存在正反向的问题，都是一个方向，因为测序的时候是选择两个载体上的引物其中的一条来往后测序的！ 切完之后另存为 f.重新打开这个文件，开始切除引物 方法同切载体，但是要注意正反向的问题。比如mcrA基因，其引物为 Forward: 5'-GGTGGTGTMGGATTCACACARTAYGCWACAGC-3' Reverse: 5'-TTCATTGCRTAGTTWGGRTAGTT-3' 先找Forward 5’端，此时只找到的部分序列。切去5’端。 然后再切这些切掉5’端序列的3’端的序列，此时其3’端序列应该是Reverse 的反向互补序列。 切去这个反向互补序列，这样一来这个些序列就已经被切去两端的引物了。 但此时还剩下另一部分未切除任何引物的序列，此时记下这些序列的编号，先切去Reverse 5’端。 再用Forward 的反向互补序列切去3’端，这样剩下的序列也都被切除两端的引物了。 <2>将所有序列调整为同向序列：
a.选择前面记录编号的序列，将这些序列一个个都转换为其反向互补序列。这样一来所有的序列都成为同向序列了，即在DNA两条反向互补链的其中一条上的比较了。 b.保存该文件 <3>生成OTUs Google 搜索”Fastgroup II” 或grouping--注意勾选的选项) Choose method 里面相似度可以选97%或98% 提交之后出现的窗口如 可以看到被分为了10个OUT 每个OUT都自动选择了一个代表序列。全选将其复制到word中，备用。并把其中的那些代表序列都复制下来粘贴到TXT 保存。 <4>寻找嵌合体:一般是对16S rRNA来说的 两个网站： (或搜decipher chimera) (或搜bellerophon chimera check) <5>翻译 网站： 在保存有OTUs的TXT文件中，一个一个翻译成蛋白质序列。最后保存。 在用Expasy翻译的时候选择第二个选项 点击翻译